DNA重组及重组DNA技术解读

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1、DNA重组和重组DNA技术 DNA Recombination and Recombinant DNA technology,第二十一章,77,1,DNA重组(DNA recombination)是指不同DNA分子断裂和连接而产生DNA片段的交换并重新组合形成新DNA分子的过程。 重组DNA技术(recombinant DNA technology)是指在体外将两个或两个以上DNA分子重新组合并在适当细胞中增殖形成新DNA分子的过程。,广义上, 任何造成基因型变化的基因交流过程,77,2,DNA重组的意义,发生在生物体内基因的交换或重新组合是生物遗传变异的一种机制。 在进化、繁殖、病毒感染、基

2、因表达以及致癌基因激活等过程中,基因重组都起重要作用。 基因重组也归类为自然突变现象。,77,3,第一节 自然界DNA重组和基因转移是经常发生的 DNA Recombination and Gene Transfer Occur Frequently in Nature,77,4,DNA重组,异常重组,77,5,发生在同源序列间的重组称为同源重组(homologous recombination),又称基本重组(general recombination)。是最基本的DNA重组方式,通过链的断裂和再连接,在两个DNA分子同源序列间进行单链或双链片段的交换。,以E.coli的同源重组为例,了解同

3、源重组机制的Holliday模型。,一、同源重组是最基本的DNA重组方式,77,6,Holliday模型的4个关键步骤:,两个同源染色体DNA排列整齐;,一个DNA的一条链断裂、并与另一个DNA对应的链连接,形成Holliday中间体;,通过分支移动产生异源双链DNA;,Holliday中间体切开并修复,形成两个双链重组体DNA,分别为:,77,7,片段重组体 (见模型图左边产物): 切开的链与原来断裂的是同一条链,重组 体含有一段异源双链区,其两侧来自同一亲本DNA。,拼接重组体(见模型图右边产物): 切开的链并非原来断裂的链,重组体异源双链区的两侧来自不同亲本DNA。,77,8,Holid

4、ay中间体,77,9,5,片段重组体,拼接重组体,77,10,DNA重组,77,11,第二节 重组DNA技术 又称DNA克隆或分子克隆,DNA Recombination Technique is also Called DNA Cloning or Molecular Clone,77,12,重组DNA技术的发展史,1865年 G.J.Mendel的豌豆杂交试验。 1944年 O.T.Avery的肺炎球菌转化实验。 1973年 美国斯坦福大学的科学家构建第一个重组DNA分子。 1977年 美国南旧金山由博耶和斯旺森建立世界上第一家遗传工程公司,专门应用重组DNA技术制造医学上重要的药物。 1

5、980年 开始建造第一家应用重组DNA技术生产胰岛素的工厂。 1997年 英国罗林研究所成功的克隆了多莉。,77,13,77,14,相关概念 DNA克隆 工具酶 目的基因 基因载体 基本原理 重组DNA技术与医学的关系,本节主要内容:,77,15,一、重组DNA技术相关概念,克隆(clone):来自同一始祖的相同副本或拷贝的集合。,获取同一拷贝的过程称为克隆化(cloning),即无性繁殖。,(一) DNA克隆,77,16,技术水平:分子克隆(molecular clone) (即DNA 克隆) 细胞克隆 个体克隆(动物或植物),77,17,应用酶学的方法,在体外将各种来源的遗传物质(同源的或

6、异源的、原核的或真核的、天然的或人工的DNA)与载体DNA接合成一具有自我复制能力的DNA分子复制子(replicon),继而通过转化或转染宿主细胞,筛选出含有目的基因的转化子细胞,再进行扩增提取获得大量同一DNA分子,也称基因克隆或重组DNA (recombinant DNA) 。,DNA克隆,77,18,生物技术工程: 基因工程、蛋白质工程、酶工程、细胞工程等,目的: 分离获得某一感兴趣的基因或DNA 获得感兴趣基因的表达产物(蛋白质),基因工程(genetic engineering) 实现基因克隆所用的方法及相关的工作称基因工程,又称重组DNA工艺学。,77,19,(二)工具酶,限制性

7、核酸内切酶 DNA聚合酶 逆转录酶 T4DNA连接酶 碱性磷酸酶 末端转移酶 Taq DNA聚合酶,77,20,重组DNA技术中常用的工具酶,77,21,限制性核酸内切酶(restriction endonuclease),限制性核酸内切酶(restriction endonuclease, RE)是识别DNA的特异序列, 并在识别位点或其周围切割双链DNA的一类内切酶。,+,Bam H,定义:,77,22,与甲基化酶共同构成细菌的限制修饰系统,限制外源DNA,保护自身DNA。,、(基因工程技术中常用型),分类:酶的组成、所需因子及裂解DNA的方式,作用:,77,23,第一个字母取自产生该酶的

8、细菌属名,用大写; 第二、第三个字母是该细菌的种名,用小写; 第四个字母代表株; 用罗马数字表示发现的先后次序。,命名:,Hin d,Haemophilus influenzae d株 流感嗜血杆菌d株的第三种酶,77,24,类酶识别序列特点 回文结构(palindrome),切口 :平端切口、粘端切口,77,25,Bam H,+,Hind,+,平端切口,粘端切口,77,26,(三)目的基因(target gene),cDNA (complementary DNA) 指经反转录合成的、与RNA (通常指mRNA或病毒RNA)互补的单链DNA。以单链cDNA为模板、经聚合反应可合成双链cDNA。

9、 基因组DNA (genomic DNA) 指代表一个细胞或生物体整套遗传信息(染色体及线粒体)的所有DNA序列。,77,27,(四)基因载体,定义 为携带目的基因,实现其无性繁殖或表达有意义的蛋白质所采用的一些DNA分子。,常用载体 质粒DNA 噬菌体DNA 病毒DNA,77,28,克隆载体(cloning vector) 为使插入的外源DNA序列被扩增而特意设计的载体称为克隆载体。,表达载体(expression vector) 为使插入的外源DNA序列可转录翻译成 多肽链而特意设计的载体称为表达载体。,77,29,质粒 (plasmid),特点: 能在宿主细胞内独立自主复制;带有某些遗传

10、信息, 会赋予宿主细胞一些遗传性状。,77,30,77,31,噬菌体DNA改造系统 gt系列(插入型,适用cDNA克隆) EMBL系列(置换型,适用基因组克隆),噬菌体(phage),M13噬菌体DNA改造系统(含lacZ基因) M13mp系列 pUC系列,77,32,酵母人工染色体 (yeast artificial chromosome, YAC) 细菌人工染色体 (bacterial artificial chromosome, BAC) 动物病毒DNA改造的载体 (如腺病毒,腺病毒相关病毒,逆转录病毒,杆状病毒),其他,77,33,二、重组DNA技术基本原理,基本原理,77,34,重组

11、DNA技术操作过程可形象归纳为:,77,35,(一)目的基因的获取,化学合成法 要求:已知目的基因的核苷酸序列或其产物的氨基酸序列 。 基因组DNA文库(genomic DNA library) cDNA文库(cDNA library) 聚合酶链反应(polymerase chain reaction, PCR) (见第22章),77,36,化学合成法获取目的基因,由已知氨基酸序列推测可能的DNA序列。,77,37,组织或细胞染色体DNA,基因片断,克隆载体,重组DNA分子,含重组分子的转化菌,限制性内切酶,受体菌,基因组DNA文库 存在于转化细胞内由克隆载体所携带的所有基因组DNA的集合,从

12、基因组DNA文库获取目的基因,77,38,用随机切割的真核生物染色体DNA片段构建基因文库,77,39,从cDNA文库获取目的基因,77,40,(二)克隆载体的选择和构建,目的不同,操作基因的性质不同,载体的选择和改建方法也不同。,77,41,(三)外源基因与载体的连接,粘性末端连接,77,42,Bam H切割反应,T4 DNA连接酶 15C,同一限制酶切位点连接,77,43,不同限制酶切位点(非配伍末端)的连接,配伍末端的连接情况和同一限制酶切位点连接相似。,77,44,平端连接,77,45,77,46,同聚物加尾连接,77,47,77,48,人工接头(linker)连接,77,49,人工接

13、头及其应用,77,50,受体菌条件: 安全宿主菌 限制酶和重组酶缺陷 处于感受态(competent),导入方式: 转化 (transformation) 转染 (transfection) 感染 (infection),(四)重组DNA导入受体菌,77,51,(五)重组体的筛选,77,52,(插入失活法) 抗药性标记选择,77,53,互补,利用互补原理筛选重组体pUC18,77,54,重组DNA技术操作的主要步骤,77,55,(六)克隆基因的表达,77,56,标准:选择标志 强启动子 翻译调控序列 多接头克隆位点 E.coli表达体系的不足: 不宜表达真核基因组DNA; 不能加工表达的真核蛋

14、白质; 表达的蛋白质常形成不溶性包涵体(inclusion body) ; 很难表达大量可溶性蛋白。,1. 原核表达体系 (E.coli表达体系最为常用),77,57,优点:可表达克隆的cDNA及真核基因组DNA 可适当修饰表达的蛋白质 表达产物分区域积累 缺点:操作技术难、费时、不经济,转染 将表达载体导入真核细胞的过程,方法:磷酸钙转染 DEAE葡聚糖介导转染 电穿孔 脂质体转染 显微注射,2.真核表达体系(酵母、昆虫、乳类动物细胞),77,58,第三节 重组DNA技术与医学 的关系非常密切并前景远大,DNA Recombination Technique is Closly Relate

15、d with Medicine and has a Good Perspective,77,59,一、疾病基因的发现与克隆,根据基因定位克隆之并研究其性质,而认识疾病的分子机制。,疾病基因发现的两个典型例子:,脆性X综合征,Kallmann综合征,77,60,二、生物制药,77,61,重组DNA医药产品,77,62,基因诊断(genetic diagnosis)是利用分子生物学及分子遗传学的技术和原理,在DNA水平分析、鉴定遗传疾病所涉及基因的置换、缺失或插入等突变。 又称DNA诊断 。,三、基因诊断与治疗,(一)基因诊断的概念,77,63,(二)基因治疗的概念,定义 基因治疗(gene therapy)是向有功能缺陷的细胞补充相应功能的基因,以纠正或补偿其基因的缺陷,从而达到治疗的目的。,方式 体细胞基因治疗 (somatic cell gene therapy) 性细胞基因治疗 (germ line gene therapy),77,64,1. 产前诊断 2. 携带者测试 3. 症候前诊断 4. 遗传病易感性,四、遗传疾病的预防,77,65,

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