常用化学软件及其应用教材

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1、常用化学软件及其应用 吕维忠 选修说明 1.对全校理工科学生开放,为理科学分。 2. 学分值为2学分。 3.教学为辅,自己上机实练最重要。 4.成绩计算:平时40,考试60 缺勤5次(含)以上,直接计为F. 参考书籍 1 沈勇,张大经,郑康成编著. 现代化学信息基 础教程.广州:中山大学出版社,2000 2 缪强 编著.化学信息学导论.北京:高等教育 出版社,2001 3叶卫平,方安平,于本方. Origin7.0 科技绘 图及数据分析.北京:机械工业出版社.2004 4郝红伟,施光凯. Origin6.0实例教程. 北京: 中国电力出版社,2000 5 吴功宜,吴英编著. Internet

2、基础. 北京: 清华大学出版社,2000 6周剑平编著.精通Origin 7.0.北京:北 京航空航天出版社.2004 7 胡立江等编著. 精通ChemDraw. 北京 :清华大学出版社,2002 10 俞庆森, 朱龙观编著.分子设计导论.北京:高等教育 出版社,2000 8赵文元,王亦军编著.计算机在化学化工 中的应用技术.北京:科学出版社.2001 9 邵学广,蔡文生编著.化学信息学.北京 :科学出版社.2001 绪论 (一)内容与特色 内容重点介绍origin 、chemwindow 、chemsketch、以及ChemOffice( chemdraw、chem3D、chemfinder

3、 )等常用化学图文处理软件及其应用,着 重介绍这些软件的基本功能以及基本使用 技巧。 这些内容是撰写化学论文或相关学科论文 必不可少的计算机应用技术,也是进行计 算机功能分子设计、电子结构与性质分析 的重要基础。 (二)目的要求 1、重点掌握origin 、chemwindow、 chemsketch、chemdraw等常用化学 图文处理软件的使用技术 2.能灵活绘制化学及其它相关学科论文所 需要的各种类型的化学分子式、分子图、 反应式、轨道图、能级图、实验装置图、 化学工艺流程图等;会灵活应用这些软件 进行科学准确的作图,合理的分析和处理 实验数据。 2、学会一些基本的作图方法和作图技巧,

4、进行分子的电子结构与相关性质的计算。 3、综合应用上述软件,进行简单的分子设 计及化学反应机理分析。 4、学会利用国际互联网,对不断新推出的 国内外化学软件进行跟进并进行知识更新 ;善于利用互联网的一切化学网络资源。 第一章 常用化学软件介绍 计算机作为一种化学学习和研究的工具有 着不可替代的作用。化学软件发展迅猛。 本章介绍一些常用的能在PC机上使用的化 学类软件,方便同学们在学习和研究中做 出有效、快速的选择。 化学软件的分类 化学综合软件 化合物结构绘制 图谱分析 化学工程 化学化工计算 分子模型 化学教育 分子绘制,模拟与计算软件 质谱软件 化学贴图软件 化学数据库 层析软件 生物化学

5、 材料科学 普通,有机,合成和分析化学软件 分子绘制,模拟与计算 (Molecular modelling ,drawing) Alchem2000 v.2.0 Tripos公司开发的分子三维结构 模拟与计算软件。 ChemOffice 2002 化学家桌面办公软件,分子结构绘 制,模拟,数据库管理及搜索引擎等。 Chemistry 4-D Draw Standard & Pro 分子结构 (4D)绘制软件。 MolSuite2000 分子三维结构模拟,物理性质计算,统 计学分析,数据库开发及管理。 Molecular Analysis Pro 研究分子生物活性和化学结构 及物理性质之间的关系

6、。 ChemSite 三维分子模拟程序,模拟有机和生物分子的 动力学行为。 ChemSite Pro 除了ChemSite 的全部功能外 ,还增加了晶体创建功能,包括离子型、金属、 共价型和分子型晶体等。 Molecular Modeling Pro 一个先进的分子模拟 程序。 ChemDraw 6.0 化学结构和化学贴图绘制,结 构核磁位移分析等。 Chem3D 6.0 分子3D结构模拟和计算软件。 ChemSketch 5.0 化学画图用软件包,可用于 画化学结构、反应和图形。也可用于设计与化学 相关的报告和演讲材料。 ISIS/Draw 2.4 一个智能的化学绘图软件包。 质谱软件 (M

7、ass Spectroscopy Software) NIST/EPA/NIH Mass Spectral Database ChemSite Pro for NIST Elemental Formula Calculator Enzyme Kinetics!ProTM GC, GC/MS File ManagerTM Interactive Training - Mass Spec Module Mass Spec CalculatorTM Version 3 MassSpec CalculatorTM Professional Mass Spec ToolsTM Mass Spectrom

8、etrists Periodic Table Isotope Ratio Calculator Elemental Composition Workshop Mass Series Calculator Simple Electrospray Calculator (Chemical Clip Art) ChemArt Deluxe Clip Art 玻璃器具贴图软件,种类齐 全,采用矢量图像,调整图片比例或方向,能保持原图质 量。 ChemArt History Collection 化学历史图片库,有古 代化学家肖像,试验设备,试验场景图片等。 Chemistry Photo Art 化学

9、照片图库,每一个照片都提 供四种分辨率供你选择。 Chrom/PrepTM Clip Art 色谱用器具图片库,如果你 从事色谱研究和教学工作,就应该选择 Chrom/PrepTM Clip Art ! GlasTronixTM Clip Art 实验室器具图片库,用相关玻 璃器件图片可方便地组合成任意一种基础实验装置。 SafetyArtTM Deluxe Clip Art 安全防护图片库,共计 有600幅专业级的图片,全色彩,涉及大多数重要的安全 防护题材。 化学数据库 (Chemical Databases) AgroSynTM Pesticide Synonym Database Ch

10、emical Structure & Information Databases Chem Sources USA Chem Sources-International Gardners Chemical Synonyms & Trade Names Electronic Handbook Juice Products Analytical Database Merck Index Electronic version NutriChemTM Lab Database -Food Nutrient & Chemical Element Database Periodic Table Datab

11、ase Periodic Table Excel Prescription Drug Database SynapseTMChemical Library Adhesive Chemicals and Compounding Ingredients Chemical Manufacturers Electronic Directory of Trade Name Products Fillers, Extenders, and Diluents Electronic Handbook Food Packaging Chemicals and Materials Green Chemicals

12、Electronic Handbook Industrial Chemical Additives Electronic Handbook Industrial Surfactants Electronic Handbook Specialty Chemicals Electronic Source Book Cosmetics & Personal Care Additives Electronic Handbook Food Additives Electronic Handbook Paints & Coatings Raw Materials Electronic Handbook P

13、harmaceutical Additives Electronic Handbook Plastic and Rubber Additives Electronic Handbook 层析软件 (Chromatography Software) CESARTM 毛细管电泳模拟与优化应用软件。 Chromatography EquationsTM 色谱计算软件,包括 气相色谱、液相色谱和离子色谱。 ChromViewTM 把GC和GC-MS高分辨率图片数据输入 到其它 Windows 应用程序,如:MS Word,Excel,或 Powerpoint。 Gas Chromatography S

14、imulation & Optimization Software 气相色谱模拟和优化软件。 GC and GCMS File TranslatorTM 气相色谱和气质联 用色谱文件转换软件。 GC and GCMS File TranslatorTM Professional Version 气相色谱和气质联用色谱文件转换专业版。 HPLC Calculations Assistant & Reference Tools 高 效液相色谱计算助手和相关工具。 HPLC OptimizationTM 高效液相色谱优化软件,用于 优化HPLC条件,如isocrate溶剂和梯度洗脱。 Interac

15、tive TrainingTM 交互式培训软件,包括 以下 几个部分: Atomic Absorption Spectrometry 交互式原子吸收光 谱分析培训软件。 Gas Chromatography 交互式气相色谱培训软件。 Advanced Interactive Gas Chromatography Training 高级交互式气相色谱培训软件。 High Performance Liquid Chromatography 交互式 高效液相色谱分析培训软件。 Inductively Coupled Plasma Spectrometry 交互式 感应耦合等离子体光谱分析培训软件。 Advanced Inductively Coupled Plasma Spectrometry 交互式高级感应耦合等离子体分析培训 软件。 Mass Spectrometry 交互式质谱分析培训软件。 Statistics for Analytical Chemists 适用于分析化学者 的交互式统计学培训软件。 生物化学 (Biochemistry ) Amino Acid DatabaseTM

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