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1、慢病毒生产及使用操作手册一、实验流程制备慢病毒穿梭质粒及其辅助包装原件载体质粒，三种质粒载体分别进行高纯度无内毒素抽提，共转染293T细胞，转染后6 h 更换为完全培养基，培养48和72h后，分别收集富含慢病毒颗粒的细胞上清液，病毒上清液通过超离心浓缩病毒。以下内容由汉恒生物科技（上海）有限公司精心整理总结。二、实验材料（一）慢病毒载体、包装细胞和菌株该病毒包装系统为三质粒系统，组成为pspax2, pMD2G, pHBLVTM系列质粒。1、载体信息（见附录）2、细胞株 293T，慢病毒的包装细胞，为贴壁依赖型成上皮样细胞，生长培养基为DMEM(含10% FBS)。贴壁细胞经培养生长增殖形成单
2、层细胞。3、菌株 大肠杆菌菌株DH5。用于扩增慢病毒载体和辅助包装载体质粒。三、包装细胞293T细胞的培养（一） 293T细胞的冻存随着传代的次数增加，293T细胞会出现生长状态下降、突变等。为了防止此类现象的出现，我们需要在开始就对细胞进行大量冻存，以保证实验的稳定性和持续性。在细胞对数生长期进行冻存，增加细胞复苏成活率。1、去掉上清液，加入PBS洗去残留的培养基；2、加入0.25%的胰酶，消化12min后，镜下观察细胞变圆，细胞间间隙加大时，去除胰酶，加入新鲜培养基吹打混匀，移入离心管中。3、细胞计数，将细胞全部晃下，加入 3mL 37 预热的 10 DMEM，用 10mL 移液管进行吹打
3、，较大力吹打 68 次即可，不留死角，之后，将所有细胞吸出，置于15mL 离心管中，取 50ul 混匀后的细胞于 1.5mL eppendorf 管中，加 入 450ul 10 DMEM，即为 10 倍稀释，混匀，取 10ul 细胞于计数板 中计数。计数板上共 4 大格，每大格 16 小格。计数时，4 大格均计 数，总数除以 4（得每大格细胞数），再乘以 10（10 倍稀释），即 为实际 n万/mL 细胞浓度。4、细胞离心，1000rpm，5min。去掉上清。5、根据细胞计数结果加入细胞冻存液（70%完全培养基+20%FBS+10%DMSO）,重悬细胞，密度为3 x 106个/ml。6、分装进
4、细胞冻存管，放入冻存盒中，放入-80超低温冰箱。7、第二天将细胞放于液氮罐中长久保存，并作记录。保存过程中，要不时复苏细胞检测细胞存活率，观察细胞状态等。（二）293T细胞的传代当细胞生长到汇合率达到80%90%时需要对细胞进行传代操作，以扩大细胞数量，维持细胞良好的生长状态。1、消化细胞，方法同细胞冻存。2、细胞离心结束后，加入完全培养基重悬。3、根据具体情况，将细胞分到10cm培养皿中，每个培养皿补足到10ml培养基。4、将培养皿平稳放回37、5%CO2和95%相对湿度的培养箱中培养。（三）293T细胞的复苏当细胞传代次数过多，细胞状态变差时，或者细胞出现污染事故时，需要丢弃并对最初冻存的
5、细胞进行复苏。1、设置温度为3742的水浴。2、查看细胞库记录，根据记录从液氮罐中取出冻存的细胞（需戴上棉手套，防止被冻伤），迅速丢入水浴锅中并快速晃动，尽量在12min内使细胞溶液完全溶解。3、将细胞溶液转移到15ml离心管中，并在其中加上1ml新鲜的完全培养基，混匀后离心，1000rpm，5min。4、去掉上清，加入5ml新鲜的完全培养基，混匀沉淀后，转入6cm培养皿。5、将培养皿平稳放入37、5%CO2和95%相对湿度的培养箱中培养。6、第二天观察细胞存活率。给细胞换一下培养基。以后每天观察细胞生长情况。四、慢病毒包装和浓缩（一）质粒扩增构建好的慢病毒载体和辅助质粒需经过大量抽提，浓度大
6、于1ug/ul,A260/280在1.7-1.8间方可用以包毒。推荐使用Qiagen大抽试剂盒进行质粒的大量去内毒素抽提。（二）传293T细胞将培养293T细胞T75瓶中的培养基吸净，加入2mL 4度冰箱取出的0.25%胰酶，使其均匀覆盖瓶底，置于37度培养箱中3-5min，取出，摇晃可发现细胞于底部脱离，将其全部晃下，加入3mL 37度水浴中预热的10 DMEM，移液枪用10mL移液管进行吹打，较大力吹打6-8次即可，不留死角，瓶口处较难吹打可将移液管对准培口，小力将培养基打出即可覆盖到接近瓶口的细胞。之后，将所有细胞吸出，置于15mL离心管中，取50ul混匀后的细胞于1.5mL eppen
7、dorf管中，加入450ul 10 DMEM，即为10倍稀释，混匀，取10ul细胞于计数板中计数。计数板上共4大格，每大格16小格。计数时，4大格均计数，总数除以4（得每大格细胞数），再乘以10（10倍稀释），即为实际n万/mL细胞浓度。传代当天记为第一天，若第二天进行转染，铺900-1000万/T75；若第三天转染，铺350-400万/T75。每瓶T75加10mL 10DMEM培养基。转染当天观察细胞密度，80-90满即可进行转染。转染前无需换培养基。（三）做脂转complexDMEM需在37度水浴中预热，LipoFiterTM转染试剂需恢复至室温方可使用，使用前需摇匀。转染每瓶T75的co
8、mplex成分如下：pspax10gPMD2G10gpHBLVTM系列载体10g转染后6h换新鲜培液。注：LipoFiterTM转染试剂为汉恒生物产品，使用说明参考LipoFiterTM说明书。（四）病毒收集转染后48和72h分别两次收集病毒上清(24h收集后置换新鲜培液)，收集后以0.45 m滤器过滤,于40 mL超速离心管中，4，72000g/min离心120分钟；（五）病毒重悬和保存500ul 新鲜培养液重悬病毒沉淀，置于-80度甚至液氮保存。五、感染目的细胞（一）细胞准备将状态良好的目的细胞接种到24孔板，使细胞浓度为1105/ml细胞，接种细胞数量因细胞的生长速度而略有不同，一般是保
9、证第二天进行病毒感染的时候细胞汇合率介于50%至70%直接。（二）病毒感染1.polybrene的选择：Polybrene:是带正电的小分子，与细胞表面的阴离子结合，提高慢病毒对细胞的感染效率，通常加入polybrene能提高感染效率210倍。Polybrene有一定的细胞毒性，有的细胞对polybrene的毒理反应明显，因此细胞感染时是否适合polybrene需要摸索；不同细胞对polybrene的敏感度不同，可以用110g/ml的范围筛选合适的浓度，以24h内细胞无明显毒性反应为佳，可参考文献并进行预实验摸索，polybrene最常用的工作浓度为68g/ml。注： 1）汉恒生物的自产的Po
10、lybrene 产品，用户可用以进行辅助感染。提供的Polybrene母液保存在-20（可保存1年以上），避免反复冻融3次以上，否则活性受影响。4可保存2周。 2）Polybrene预实验请先以对照病毒进行摸索，部分细胞系MOI及Polybrene 的使用参见附表2。2. 感染细胞最佳MOI的测定MOI（Multiplicity of Infection，感染复数）是指每个细胞感染的病毒数，通常MOI越高，病毒整合到染色体的数量以及目的蛋白的表达量越高。对于分裂活跃的细胞，比如Hela、293细胞，MOI=13时，80%以上的细胞均表达目的基因。而对于非分裂细胞，比如原代细胞，感染效率较低。需
11、要进行MOI梯度摸索实验，选择适合的MOI进行实验。3.感染步骤按实验需要将细胞铺板（比如12孔板）。细胞数以第2天密度约50%为宜。37 培养过夜。对于Polybrene可施加的细胞：准备完全培养基和 Polybrene混合物，Polybrene 终浓度为摸索得到的最适终浓度。移去培养基并添加 0.5 ml Polybrene/培养基混合物于每孔中（适用于 24 孔板，其他孔板请相应调整体积。）对于不适用Polybrene的细胞，以上步骤省略，直接进入下面步骤。感染前，从冰箱取出并在37水浴中快速融化病毒，吸去细胞原有培养基，加入1/2体积新鲜培养基，再将病毒原液加入细胞中，轻轻8字混匀。（
12、具体加入的病毒数可参考附表1）37小体积感染4小时，4小时后补齐培养基至正常体积。（感染时培养基体积表格如下）病毒小培养体积感染表培养皿类型表面积/cm2对应细胞培养液体积病毒感染对应细胞培养液体积96-well0.3cm2100ul50ul24-well2cm2500ul250ul12-well4cm21ml500ul6-well10cm22ml1ml60mm 20cm24ml2ml100mm 60cm210ml5ml慢病毒感染4小时后补足至培养体积，感染24小时后换液，腺病毒感染2小时后直接换液感染后第二天（约24小时），吸去含病毒的培养液，换上新鲜的完全培养液，继续37培养。 感染后48
13、小时，对于带GFP报告基因的病毒，可通过荧光显微镜观测GFP表达效率，对于携带Puromycin抗性基因的病毒，换上含适当浓度的Puromycin的新鲜完全培养液，筛选稳定转导的细胞株（详见下方）。注意： 溶化的 shRNA 慢病毒颗粒置于冰上。反复冻溶或长时间将病毒颗粒暴露于常温可使病毒效价降低。4.Puromycin抗性筛选：Puromycin标准的施加终浓度范围为110g/ml，不同细胞puromycin的工作浓度不同，请查找相关文献（部分细胞参考用量见下图），另外请设不感染筛选对照（未经过病毒感染的野生型细胞），加入等量等浓度的puromycin。部分细胞puromycin参考值Cel
14、l lineSpeciesPuromycin (g/ml)293Human3HeLaHuman3B16Mouse1-3PC1.0Hamster10MC3T3-E1Mouse10H9C2Rat1MCF-7Human1-3MDA-MB-Human1-3HepG2Human2HT1080Human1A549Human1.5H1299Human2Human embroyonic stem cells（Human ESCs）Human1更多Puromycin使用浓度更新中，详情请参考公司网站每2-3天换含puromycin的完全培养液一次，至不感染筛选对照组细胞被puromycin杀光，可进行以下两步操
15、作（依照具体实验需要选择）。不挑取单克隆：将感染并筛选后的细胞进行传代，并继续施加puromycin进行维持性筛选培养。连续筛选并传3代后，冻存保重稳定细胞株。挑取单克隆：将感染并筛选后的细胞挑选至少5个克隆进行细胞扩增，并继续施加puromycin进行维持性筛选培养。扩增完毕后western blot或者QPCR检测目的蛋白的表达。挑取表达适中的稳定细胞株，连续筛选并传3代后，冻存保重稳定细胞株。5. 感染悬浮细胞上面介绍的是针对贴壁细胞的感染方法，若是悬浮或半悬浮细胞，则需要通过平角离心转染法，即将适量的病毒液加入细胞培养皿后，封好口，放入平角离心机后，低速（500g-1000g/min）离心1h，然后放入培养箱中正常培养即可。若由于实验条件有限，没有平角离心机，可用离心管代替，将细胞吹打吸入离心管中，进行低速离心，去掉大部分上清，然后加入适量的病毒液，室温放置15min（不能超过半小时），然后将细胞和病毒液同时吸出转入培养皿中继续病毒感染过夜后换液即
