CMA软件入门指导

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1、C1 CMA介绍 页 1 汇总元分析2.0 程序介绍 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 2 汇总元分析(版本2)是一个为在元分析中使用而开发的程序包.它包括三个模块 数据输入,数据 分析,和高分辨率图形。 利尿剂元分析 我们将通过进行一次元分析来评估利尿剂对于减少子痫前症(PE)风险的能力,PE对于孕妇是 一种潜在的致命危险。病人被随机分配通过利尿剂治疗或控制,研究者跟踪每组中最后发展 成PE的人数。 启动程序 桌面上应该有一个Comprehensive Meta Analysis V2图标 启动程序 选择” Start a blank spreadsheet” 并点击OK 插入一个研究名称列

2、点击 Insert/ Column for/ Study names 插入一个治疗效应列 程序允许您以100种格式中的1种(或更多)来输入治疗效应。比如,您能够输入每组中的事件数和 样本数,或您能够输入比值比(odds ratio)和置信限。既然可用多种格式,那么您需要告诉程序 您正在使用哪种格式(程序同样允许您以不同格式输入数据来用于不同的研究,我们将在后面提 及)。 点击Click Insert/ Column for/ Effect size data 点击两次Next来得到下列窗口 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 3 依次点击 Dichotomous (number of events

3、) Unmatched groups, prospective data (e.g. controlled trials, cohort studies) Events and sample size in each group 点击Finish 程序将允许您命名组 输入“ Treated”和 “ Control”作为组名 输入 “ PE”和 “ Normal”作为输出 点击OK 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 4 这时候电子表单应该看起来类似: 为第一次研究输入数据到第一行的空白单元格中 Study name: Weseley Treated Events 14 Treated Total

4、N 131 Control Events 14 Control Total N 136 屏幕看起来应该是: 输入剩余数据 这次元分析的剩余数据部分显示在下方。您可以手工连续输入数据。或使用” Files” 菜单打 开一份这个文件的拷贝(Diuretic.cma),这个文件应该位于“ C:Program Files ComprehensiveMeta Analysis Version 2” 目 录 下 。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 5 运行分析 点击工具栏上 “ Run Analysis” 程序将显示分析屏幕(上方) 对于每个研究程序显示比值比,下和上限,z值和p值。右方是一个森林图(fo

5、rest plot),在这里 每个研究的比值比用一个点,以及以置信区间为边界来呈现。 在这个图上,比值比为1代表没有治疗效果。对于大部分的研究,比值比落在1.00以下,表明通 过利尿剂治疗的病人更少可能发展成PE。对于少数的研究,比值比落在1.00以上,表明通过利 尿剂治疗的病人更可能发展成PE。 每个研究的置信区间边界框反应了评估的精确性,小规模研究趋向于有更宽的置信区间,大型研 究趋向于有小的置信区间。在这个图形上,我们使用95%的置信区间,因此,如果仅如果置信区 间不包含1.0,研究将是统计意义上显著的(p0.05). 在这个图的底线位置被标注为” Fixed” ,显示了13个研究组合效

6、应,使用固定效应模型。也 就是说,比值比是0.67,95%置信区间是0.56到0.80,z值是-1.45,p值0.000。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 6 创建高分辨率图形 点击工具栏上的“ High-resolution plot”,程序将显示下列界面 可选章节 到这里我们已经对程序有个大概了解。如何输入数据,如何执行分析,以及如何创建高分辨率图 形。 如果您愿意,您可以再次运行这3个基本章节。在下面我们将显示一些可用的选项。 在数据输入界面您可以: 查看公式 自定义显示 使用超过一种格式输入数据 在分析界面您可以: 显示额外统计量 选择计算模型 显示权重 上海卡贝 C1 CMA介绍 页

7、 7 在高分辨率图形界面您可以: 修改用于研究的符号 修改图形宽度 更改颜色方案 导出图形到PowerPoint或Word 数据输入-选项问题 返回到数据输入界面 通过点击右上方的” X” 框来关闭高分辨率图形和分析模块,并返回到数据数据界面。 您的界面应该看起来如下: (如果您是从暂存文件开始的,使用 “ Files”菜单,打开文件“ Diuretic.cma” ,它应该位于 “ C:Program FilesComprehensiveMeta Analysis Version 2” 目录下)。 显示屏幕指导 点击工具栏右手边的 “ Tutorial”图标。这在程序中的每个模块中都有。 查看

8、计算方式 双击黄色列中的任意值 当您输入数据到白色列中,程序计算比值比和对数比值比,并显示到黄色列中。要查看某个值 是如何被计算的,只需要双击一下这个值就可以了。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 8 显示风险率(risk ratio) 右击黄色列,然后选择” “ Customize Display” 默认,程序显示比值比,但您可以修改这些显示。您可以选择显示风险率,风险差异或其他治 疗效应指标。您同样可以选择显示方差和/或标准差。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 9 以一种以上格式输入数据 在运行的示例中,所有研究的数据都是相同的格式(每个研究的事件和样本大小)。如果所有的研 究显示的数据是另

9、外一种格式,那您又可以怎么做呢? 在运行的示例中,让我们假定一下最后两个研究,Tervilla 和 Campbell,已经知道比值比和置 信区间。我们需要插入额外的列来适应这个新的格式,我们可以按照前面初始化列的操作来进 行。 因为这个练习的目的,我们需要从数据集中删掉最后两个研究,以便能够为他们重新输入新的格 式。 高亮选择最后两个研究 点击菜单Edit/Delete row 点击菜单 Insert/Column for/ Effect size data 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 10 程序打开下列对话框 注意已经存在的格式(时间和样本大小)被显示成蓝色。 依次点击选择新格式 Dic

10、hotomous (number of events) Computed effect sizes Odds ratio and confidence limits 点击Finish 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 11 界面应该看起来像上面的图片 在屏幕左下方有标签 “ Cohort 2x2 (Events)”和“ Odds ratio” 。 您可以通过点击这两个标签在这两种格式之间切换。 现在新标签(Odds ratio)被选中,所以这种格式的列是可视的(比值比,下限,上限和置信水 平)。 为2个研究输入以下数据. 不需要在“ Data format” 列中输入任何内容,程序会自动填充该列

11、。 Study nameTervila Odds ratio2.971 Lower limit.586 Upper limit15.068 Confidence level0.95 Study nameCampbell Odds ratio1.145 Lower limit0.687 Upper limit1.908 Confidence level0.95 屏幕看起来应该类似: 对于开始的7个研究我们以事件和样本大小输入数据,对于最后两个我们使用比值比和置信限。 在任何的情况下,程序都可以计算用于分析中的比值比和标准误(在黄色列中)。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 12 您想同时看到所有的

12、数据吗? 右击白色列(例如比值比列),选择 “ Show all data entry formats” 对于研究1-7前面几列有数据,后面几列是灰色的。而对于最后2个研究则相反。 返回到正常模式 右击白色列选择“ Show only current data entry format” 为其他变量插入列 第一个没有使用的列是J 双击猎头,程序将显示一个对话框 输入列名 指定列功能为 “ Moderator” 选择类型 (“ Categorical” , “ Integer” , 或 “ Decimal” ) 在这个示例中,我们创建一个名为Study Quality的列,并制定他为分类mode

13、rator (moderator 变量是一个研究特征,可以修改治疗效应估计)。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 13 数据分析-选项部分 恢复保存的文件(就是那个所有研究数据都以事件和样本大小格式输入的文件) 点击菜单File/Opening screen wizard/Open an existing file 选择Diuretic.cma 运行分析 点击工具栏上的“ Run analysis” 屏幕看上去应该类似上方的图形。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 14 显示分配到每个研究的权重 点击工具栏上的 “ Show weights” 注意在分析中分配到Landesman 上的权重 再次点

14、击工具栏来关闭权重。 选择治疗效应的另外一个指标 在工具栏上选择 “ Risk Ratio” 然后选择 log odds ratio 然后选择 odds ratio 来返回默认屏幕 查看统计详细信息 点击工具栏上“ Toggle display” 程序显示一个有着其他统计量的表格,包括不齐性(heterogeneity)统计。 再次点击 “ Toggle display” 来返回到前面的窗口。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 15 选择计算模型 在屏幕左下方有标签 “ Fixed” , “ Random”和“ Both” . 点击 “ Fixed” ,注意点估计和置信区间 点击 “ Rando

15、m” ,注意点估计和置信区间 点击“ Both” 当“ Both models” 被选择后,在图下方有2个黄色行,一个是固定效应,一个是随机效应。在 随机效应下,比值比向左侧偏移,置信区间宽度也增大。 同时显示固定和随机效应的权重 选择 “ Both”作为计算模型,使用工具栏显示权重。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 16 注意比较Tervila在随机和固定效应下的影响。 自定义显示 现在我们要试着自定义显示,只保持那些我们需要使用在高分辨率显示中的列(对于高分辨率图 形,如果我们保持最小的列并且加强对森林图的显示,这将更有效)。 使用工具栏来关闭权重 在odds ratio列上右击并选择 “

16、 Customize basic stats” 移除z-value 和 p-value的选中状态 点击OK 选择“ Both Models”标签 屏幕应该看起来类似下方 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 17 高分辨率图形(选项) 点击工具栏上的“ High-resolution plot” 您的屏幕现在应该显示一个高分辨率图形的草图,您现在可以进行修改。 上海卡贝 C1 CMA介绍 页 18 成比例vs同一大小的符号 注意在固定效应模式下每个研究的权重的符号在大小上是成比例的。例如比较Landesman 对应. Campbell的权重。 . 您能够对所有的研究选择使用同样大小的符号或者使用成比例的比例的权重。

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