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1、遗传与疾病遗传与疾病人类的某些性状及部分疾病与人体的遗传因素密切相关阐明遗传因素与人体疾病或健康状态的关系有非常重要的意义遗传统计学在这其中起着至关重要的作用遗传与疾病遗传与疾病疾病的易感基因研究疾病的易感基因研究研究的特点研究的特点收集的数据即包含一般的表型数据也包含基因型数据数据分析时需要用到不同的遗传模型需要一些遗传统计特有的分析方法：的计算，家系图的绘制等在遗传统计中的应用在遗传统计中的应用数据整理获取位点的基本信息平衡检验连锁不平衡的计算关联研究常用分析方法家系图的绘制数据整理数据整理中的包专门为基因型数据提供一个新的类中的包专门为基因型数据提供一个新的类 函数是包里最基本的函数，可
2、以将以下四函数是包里最基本的函数，可以将以下四种形式的初始基因型数据转换成便于分析种形式的初始基因型数据转换成便于分析的带有类的数据的带有类的数据1.以一个字符分隔的向量2. (, 3. ,)4. 可以按某一位置分隔的向量5. (,)6. 两个分开的向量7. (,)8. (,)9. (, ). 数据框或矩阵中的两列 ( (,), (,) ($) 或 ( (,), (,) ()获取位点的基本信息获取位点的基本信息多态位点的基本信息包括：位点分型成功率 ( )、等位基因频率、基因型频率、杂合度和多态信息含量 ()一个简单的例子：载入数据() 获取位点的基本信息($) : () : ( ) : ()
3、 . . 定律定律定律是由英国数学家哈迪(. )和德国医生温伯格(. )于年分别独立发现的，也称遗传平衡定律( )该定律可以简单描述为，遗传平衡群体的等位基因频率与基因型频率在世代间维持恒定该定律的适用条件是：随机婚配，群体足够大，没有突变、选择、迁移和遗传漂变平衡检验平衡检验关联研究中平衡检验常被用来评价基因分型的质量。我们通常对病例和对照组分别进行平衡检验如果某一位点在对照组中不符合平衡，我们通常会怀疑该位点的基因型鉴定的质量如果该位点在对照组平衡而在病例组出现不平衡，则该位点可能和疾病有关平衡检验平衡检验包里面提供两种不同的检验方法包里面提供两种不同的检验方法一种是一种是 ，可以用函数进
4、行该检验，另一种，可以用函数进行该检验，另一种是是 ，对应于函数，对应于函数常用于较高、样本量较大的场合；较低的常用于较高、样本量较大的场合；较低的位点建议使用函数位点建议使用函数的计算的计算连锁不平衡则是指人群中两个位点处在同一个单体型的频率比期望值高评价连锁不平衡程度的指标包括、等包提供计算各种指标的函数，并能以文字和图形两种形式显示位点间的连锁不平衡程度的计算的计算用函数计算位点间的 () 首先载入数据 ( () : , , ( () : , , 回归回归. 共显性模型共显性模型 ( , , ):( , , ) : : . () () * * * ( (,) , , ):( (, ) , , ) : : . () () *(, ) * ( (,) , , ):( (, ) , , ) : : . () () *(, ) * *家系图的绘制家系图的绘制() 载入包 () ()() (,)()($, $, $, $, $)()谢谢各位谢谢各位
