微生物的鉴定ppt课件

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1、烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人微生物的鉴定微生物的鉴定烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人借助于现有的微生物分类系统,通过特征测定,确定未知的、或新发现的、或未明确分类地位的微生物所应归属分类群的过程。 微生物的鉴定(微生物的鉴定(identificationidentification): :烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治

2、疗该病人 微生物的鉴定不仅是微生物分微生物的鉴定不仅是微生物分类学的一个重要组成部分,而且也类学的一个重要组成部分,而且也是在具体工作中经常遇到的问题。是在具体工作中经常遇到的问题。例如在筛选菌种时,筛选出菌种以例如在筛选菌种时,筛选出菌种以后,就要给它鉴定取名,这样便于后,就要给它鉴定取名,这样便于记载和交流。记载和交流。烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人学习和掌握微生物的分类鉴定知识,对生产学习和掌握微生物的分类鉴定知识,对生产实践和科学实验有着重要的意义实践和科学实验有着重要的意义:1、能够在较短

3、时间内认识熟悉微生物界全貌,以利进一步开发和利用这一丰富的微生物资源。2、掌握了分类方面的知识,可以减少菌种筛选工作的盲目性,提高工作效率。3、有利于各国微生物学工作者之间的交流。4、有利于对未知菌种的鉴定。 由于微生物形体微小,发育过程简单,种类繁多,缺乏古生物资料,很多微生物的亲缘关系尚未搞清楚。到目前为止,微生物还没有一个统一的、完整的分类系统,而是几个不尽完善的、看法分歧的分类系统。这样的分类系统难免或多或少地带有“人为的因素”。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人一、微生物鉴定的条件一、微生物

4、鉴定的条件鉴定微生物,至少要具备下面鉴定微生物,至少要具备下面3 3个条件:个条件: 1 1待鉴定的微生物一定是纯种待鉴定的微生物一定是纯种 如果微生物不纯,所观察到的现象则是混如果微生物不纯,所观察到的现象则是混合现象,这样自然不会得到正确的结果。因此合现象,这样自然不会得到正确的结果。因此在鉴定之前,首先要将微生物纯化。在鉴定之前,首先要将微生物纯化。 纯化方法,一般有纯化方法,一般有2 2种:平板划线单菌落种:平板划线单菌落分离法和单细胞分离法。前一种操作简便,效分离法和单细胞分离法。前一种操作简便,效果良好,适用范围广。果良好,适用范围广。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行

5、自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人2 2选一本比较好的鉴定手册选一本比较好的鉴定手册鉴定时以此手册为标准,开展鉴定工作。根据多数鉴定时以此手册为标准,开展鉴定工作。根据多数人的经验,我们认为在细菌鉴定方面,使用伯杰氏鉴人的经验,我们认为在细菌鉴定方面,使用伯杰氏鉴定细菌学手册一书较为合适。定细菌学手册一书较为合适。 在具体鉴定时,可参看中国科学院微生物研究所细在具体鉴定时,可参看中国科学院微生物研究所细菌分类组编著的一般细菌常用鉴定方法一书。菌分类组编著的一般细菌常用鉴定方法一书。烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积

6、烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人3 3要有合适的鉴定方法要有合适的鉴定方法微生物种类繁多,特征各异,性状有主次之分。微生物种类繁多,特征各异,性状有主次之分。因此,在鉴定某种微生物时,要选用合适的鉴定方法,因此,在鉴定某种微生物时,要选用合适的鉴定方法,确定主要的测试项目。确定主要的测试项目。例如,鉴定的微生物若是霉菌,则菌落形态观察例如,鉴定的微生物若是霉菌,则菌落形态观察 十分重要;十分重要; 若是酵母菌,有性繁殖的若是酵母菌,有性繁殖的 方式、特征以及生理生化方式、特征以及生理生化 特征中的糖的发酵和同化,特征中的糖的发酵和同化, 硝酸盐的同化就是主要指硝酸盐

7、的同化就是主要指 标。标。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人二、微生物鉴定方法、微生物鉴定方法 通通常常把把鉴鉴定定微微生生物物的的技技术术分分成成四四个个不不同同水水平平:细细胞胞的的形形态态和和习习性性水水平平,例例如如用用经经典典的的研研究究方方法法,观观察察细细胞胞的的形形态态特特征征、运运动动性性、酶酶反反应应、营营养养要要求求和和生生长长条条件件等等。细细胞胞组组分分水水平平,包包括括细细胞胞组组成成成成分分例例如如细细胞胞壁壁成成分分,细细胞胞氨氨基基酸酸库库,脂脂类类,醌醌类类,光光合

8、合色色素素等等的的分分析析,所所用用的的技技术术除除常常规规实实验验室室技技术术外外,还还使使用用红红外外光光谱谱、气气相相色色谱谱和和质质谱谱分分析析等等新新技技术术。蛋蛋白白质质水水平平,包包括括氨氨基基酸酸序序列列分分析析、凝凝胶胶电电泳泳和和血血清清学学反反应应等等若若干干现现代代技技术术。基基因因或或DNADNA水水平平,包包括括核核酸酸分分子子杂杂交交(DNADNA与与DNADNA或或DNADNA与与RNARNA),G GCmol%Cmol%值值的的测测定定,遗遗传传信信息息的的转转化化和和转转导导,16S 16S rRNArRNA(核核糖糖体体RNARNA)寡寡核苷酸组分分析,以

9、及核苷酸组分分析,以及DNADNA或或RNARNA的核苷酸顺序分析等。的核苷酸顺序分析等。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人 在微生物分类学发展的早期,主要的分类鉴在微生物分类学发展的早期,主要的分类鉴定指标尚停留在细胞的形态和习性水平上,这类定指标尚停留在细胞的形态和习性水平上,这类方法称作经典的分类鉴定方法;从本世纪方法称作经典的分类鉴定方法;从本世纪6060年代年代起,后三个水平的分类鉴定的理论和技术即化学起,后三个水平的分类鉴定的理论和技术即化学分类的开始发展,度为探索微生物的自然分类系分类的

10、开始发展,度为探索微生物的自然分类系统打下了坚实的基础,这些方法再加上数值分类统打下了坚实的基础,这些方法再加上数值分类法,可称为现代的分类鉴定方法。法,可称为现代的分类鉴定方法。烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人(一)、经典分类鉴定方法(一)、经典分类鉴定方法 所谓经典的分类鉴定方法,所谓经典的分类鉴定方法,是相对于现代的分类鉴定方法而是相对于现代的分类鉴定方法而言的,通常指长期以来在常规鉴言的,通常指长期以来在常规鉴定中普遍采用的一些形态、生理、定中普遍采用的一些形态、生理、生化、生态、生活史和血清

11、学反生化、生态、生活史和血清学反应等指标。应等指标。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人1 1形形态学特征学特征(1 1)细胞形态在显微镜下观察细胞外形大)细胞形态在显微镜下观察细胞外形大小、形状、排列等;小、形状、排列等;细胞构造;革兰氏染色反应;能否运动、细胞构造;革兰氏染色反应;能否运动、鞭毛着生部位和数目;有无芽孢和荚膜鞭毛着生部位和数目;有无芽孢和荚膜、芽孢芽孢的大小和位置;的大小和位置;放线菌和真菌的繁殖器官的形状、构造;放线菌和真菌的繁殖器官的形状、构造;孢予的数目、形状、大小、颜色和表面

12、特征等。孢予的数目、形状、大小、颜色和表面特征等。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人(2 2)群体形态特征:)群体形态特征: a.a.在一定的固体培养基上生长的菌落特征,包括外形、大在一定的固体培养基上生长的菌落特征,包括外形、大小、光泽、粘稠度、透明度、边缘、隆起情况、正反面颜色、小、光泽、粘稠度、透明度、边缘、隆起情况、正反面颜色、质地、气味、是否分泌水溶性色素等;质地、气味、是否分泌水溶性色素等; b.b.在一定的斜面培养基上生长的菌苔特征,包括生长程度、在一定的斜面培养基上生长的菌苔特征,包括

13、生长程度、形状、边缘、隆起、颜色等没半固体培养基上经穿刺接种后的形状、边缘、隆起、颜色等没半固体培养基上经穿刺接种后的生长情况;生长情况; c.c.在液体培养基中生长情况,包括是否产生菌膜、均匀混在液体培养基中生长情况,包括是否产生菌膜、均匀混浊、还是发生沉淀?有无气泡、培养基的颜色等。浊、还是发生沉淀?有无气泡、培养基的颜色等。如是酵母菌,还要注意是成醭状、环状还是岛状。如是酵母菌,还要注意是成醭状、环状还是岛状。烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人 2 2生理生化反应特征生理生化反应特征(1 1) 利

14、用物质的能力利用物质的能力 a. a. 对各种碳源利用的能力对各种碳源利用的能力( (能否以能否以 COCO2 2为唯一碳为唯一碳源、各种糖类的利用情况等源、各种糖类的利用情况等) ) b. b. 对各种氮源的利用能力(能否固氮、硝酸盐对各种氮源的利用能力(能否固氮、硝酸盐和铵盐利用情况等)和铵盐利用情况等) c. c. 能源的要求(光能还是化能、氧化无机物还能源的要求(光能还是化能、氧化无机物还是氧化有机物等)是氧化有机物等) d. d. 对生长因子的要求(是否需要生长因子以及对生长因子的要求(是否需要生长因子以及需要什么生长因子等)。需要什么生长因子等)。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的

15、健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人(2 2)代谢产物的特殊性)代谢产物的特殊性 这方面的鉴定项目非常之多,例如是否产生H2S、吲哚、CO2、醇、有机酸、能否还原硝酸盐、能否使牛奶凝固、冻化等等。(3 3)与温度和氧气的关系)与温度和氧气的关系 测出适合某种微生物生长的温度范围以及它的最适温度、最低温度和最高温度。 对氧气的关系,是看它好氧、微量好氧、兼性好氧、耐氧还是专性厌氧。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人3.血清学反血清学反应很多细菌有

16、十分相似的外表结构(如鞭毛)或有很多细菌有十分相似的外表结构(如鞭毛)或有作用相同的酶(如乳酸杆菌属内各种细菌都有乳酸作用相同的酶(如乳酸杆菌属内各种细菌都有乳酸脱氢酶)。虽然它们的蛋白质分子结构各异,但在脱氢酶)。虽然它们的蛋白质分子结构各异,但在普通技术下(如电子显微镜或生化反应),仍无法普通技术下(如电子显微镜或生化反应),仍无法分辨它们。然而利用抗原与抗体的高度敏感特异性分辨它们。然而利用抗原与抗体的高度敏感特异性反应,就可用来鉴别相似的菌种,或对同种微生物反应,就可用来鉴别相似的菌种,或对同种微生物分型。分型。 它是用已知菌种、型或菌株制成抗血清,根据它是用已知菌种、型或菌株制成抗血

17、清,根据它是否与待鉴定的对象发生特异性的血清学反应来它是否与待鉴定的对象发生特异性的血清学反应来鉴定未知菌种、型或菌株。鉴定未知菌种、型或菌株。 该法常用于肠道菌、噬菌体和病毒的分类鉴定。该法常用于肠道菌、噬菌体和病毒的分类鉴定。利用此法,已将伤寒杆菌、肺炎双球菌等菌分成数利用此法,已将伤寒杆菌、肺炎双球菌等菌分成数十种菌型。十种菌型。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人4生生态学特征学特征 生态学特征主要包括它与其它生物之间的关系(是生态学特征主要包括它与其它生物之间的关系(是寄生还是共生?寄主范围以

18、及致病的情况)、在自然界寄生还是共生?寄主范围以及致病的情况)、在自然界的分布情况(的分布情况(pHpH情况、水分程度等)、渗透压情况(是情况、水分程度等)、渗透压情况(是否耐高渗、是否有嗜盐性等)否耐高渗、是否有嗜盐性等)。 5.5.对噬菌体的敏感性对噬菌体的敏感性 与血清学反应相似,各种噬菌体有其严格的寄主范围。与血清学反应相似,各种噬菌体有其严格的寄主范围。利用这一特性,可以用某一已知的特异性噬菌体鉴定其相应利用这一特性,可以用某一已知的特异性噬菌体鉴定其相应的寄主,反之亦然。的寄主,反之亦然。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有

19、限,请同学们想一想如何来治疗该病人6 6生活史生活史 生物的个体在一生的生长繁殖过程中,经过细生物的个体在一生的生长繁殖过程中,经过细胞数目的变化和不同的发育阶段。这种过程对特定胞数目的变化和不同的发育阶段。这种过程对特定的生物来讲,是重复循环的,常称为该种生物的生的生物来讲,是重复循环的,常称为该种生物的生活周期或生活史(活周期或生活史(life historylife history,life cyclelife cycle)。)。 各种生物都有自己的生活史。在分类鉴定中,各种生物都有自己的生活史。在分类鉴定中,生活史有时也是一项指标。例如粘细菌就是以它的生活史有时也是一项指标。例如粘细菌

20、就是以它的生活史作为分类鉴定的依据的。生活史作为分类鉴定的依据的。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人(二)、(二)、现代分代分类鉴定方法定方法 近年来,随着分子生物学的发展和各项新技术的广泛应近年来,随着分子生物学的发展和各项新技术的广泛应用,促使微生物分类鉴定工作有了飞速发展。对微生物用,促使微生物分类鉴定工作有了飞速发展。对微生物鉴定工作来说,已从经典的表型特征的鉴定深入到现代鉴定工作来说,已从经典的表型特征的鉴定深入到现代的遗传学特性的鉴定、细胞化学组分的精确分析以及利的遗传学特性的鉴定、细胞化

21、学组分的精确分析以及利用电子计算机进行数值分类研究等新的层次上。用电子计算机进行数值分类研究等新的层次上。1.1.微生物遗传型的鉴定微生物遗传型的鉴定 DNADNA是除少数是除少数RNARNA病毒以外的一切微生物的遗传信病毒以外的一切微生物的遗传信息载体。每一种微生物均有其自己特有的、稳定息载体。每一种微生物均有其自己特有的、稳定的的 DNADNA成分和结构,不同微生物间成分和结构,不同微生物间DNADNA成分和结成分和结构的差异程度代表着它们间新缘关系的远近。因构的差异程度代表着它们间新缘关系的远近。因此,测定每种微生物此,测定每种微生物DNADNA的若干重要数据,是微的若干重要数据,是微生

22、物鉴定中极其重要的指标:生物鉴定中极其重要的指标:1.DNA1.DNA碱基比例的碱基比例的测定。测定。2.2.核酸分子杂交法。核酸分子杂交法。3. 16S rRNA3. 16S rRNA寡核苷寡核苷酸编目分析。酸编目分析。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病

23、人烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人2.细胞化学成分的鉴定细胞化学成分的鉴定 除上述核酸成分外的其它化学成分的测定,是除上述核酸成分外的其它化学成分的测定,是微生物化学分类法的重要内容,主要包括:微生物化学分类法的重要内容,主要包括:1.细胞壁的化学成分。细胞壁的化学成分。2.全细胞水解液的糖型。全细胞水解液的糖型。3.磷酸类脂成分的分析。磷酸类脂成分的分析。4.枝菌酸的分析。枝菌酸的分析。5. 醌类的分析。醌类的分析。6.气相色谱技术的应用。气相色谱技术的应用。3.数值分类法数值分类法 数值分类法亦称

24、统计分类法,是在约数值分类法亦称统计分类法,是在约200年前年前与林奈同代人与林奈同代人M.Adanson(17271806,法国植,法国植物学家物学家)发展的分类原理基础上借助于现代的电发展的分类原理基础上借助于现代的电子计算机技术而发展起来的。数值分类的基本子计算机技术而发展起来的。数值分类的基本步骤为:(步骤为:(1)计算两菌株间的相似系数;)计算两菌株间的相似系数;(2)列出相似度矩阵;()列出相似度矩阵;(3)将矩阵图转换成)将矩阵图转换成树状谱。树状谱。 烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人烧伤病人的治疗通常是取烧伤病人的健康皮肤进行自体移植,但对于大面积烧伤病人来讲,健康皮肤很有限,请同学们想一想如何来治疗该病人Thank you!

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