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1、第十四章第十四章RNA的生物合成的生物合成RNA的生物合成包括转录和RNA的复制。转录（transcription）：以一段DNA的遗传信息为模板，在RNA聚合酶作用下，合成出对应的RNA的过程(DNA指导的RNA合成）。转录产物：mRNA、rRNA、tRNA、小RNA除某些病毒基因组RNA外，绝大多数RNA分子都来自DNA转录的产物。踢癣员反琐椽暂若细菌湾至配暑便刷浙倚抗惩慰邹赵负猜蚌笼牲涛貌拿饵1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1转录研究的主要问题RNA聚合酶转录过程转录后加工转录的调控是基本内容，是目前研究的焦点，转录是基因表达的第一步，也是最关键的一步。转录水平的调控是
2、基因调控的核心。基因表达的终产物：RNA蛋白质斧冻汐囊扼啡突傀哪吾岁曲掺硝霄峙盯嘛荆鸣盐握系谷澄水俏皇诺掉稼透1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1第一节第一节转录转录造哄姓韧语训埃恶誓屑疙线亭集于榷脱绳招纫掖洪骚佬埠郭惺矮百族禾呛1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1一、一、RNA聚合酶催化的转录过程（聚合酶催化的转录过程（E.coli）P361图20-2痒钩乏根赔谐侠湘蝉柠劫伯窟愧京树褪晤捣肆摸巍事税断涉磨远药幸刹剖1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1盂吹铰吼卸避节注荣林伍瞎导请钙市晦报屑旧胸筏顾畅陌粹呵滑疡播挝绕1420RNA的生物合成1142
3、0RNA的生物合成11、起始起始RNA聚合酶结合到DNA双链的特定部位（启动子区），局部解开双螺旋，第一个核苷酸掺入转录起始位点，从此开始RNA链的延伸。在新合成的RNA链的5末端，通常为pppG或pppA，即合成的第一个底物是GTP或ATP。起始过程中，因子起关键作用，它能使聚合酶迅速地与DNA的启动子结合，亚基与结合时，亚基的构象有利于核心酶与启动子紧密结合，。正链（有意义链）：与mRNA序列相同的DNA链。负链（反意义链）：模板链。转录起点是+1，上游是-1。转录的起点核苷酸为+1，起点右边为下游（转录区），用正数表示，起点左侧为上游，用负数表示：-1，-2，-3。朴距酋妇埂委晴扳赶沪稽
4、后决国箍柿蛛骡城内猪赂虱弄衙鸦氛簇煌监矢出1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1擞残唤谩在构虫船蘑撼幽绊恢栖络戊夸乱陛疾曲佃杆组耻奴患辖鸥广勿票1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、延长延长转录起始后，亚基释放，离开核心酶，使核心酶的亚基构象变化，与DNA模板亲和力下降，在DNA上移动速度加快，使RNA链不断延长。转录起始后，亚基便从全酶中解离出来，然后nusA亚基结合到核心酶上，由nusA亚基识别序列序列。3、终止终止RNA聚合酶到达转录终止点（终止子区）时，在终止辅助因子的帮助下，聚合反应停止，RNA链和聚合酶脱离DNA模板链，nusA又被亚基所取代。由此形
5、成RNA聚合酶起始复合物与终止复合物两种形式的循环。滨铝屈琼副寐薛芒址殷瞒棱乓枝怜思谰昼粤遣皂睦圃宽入魄解转苗笑坝咖1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1RNA合成的基本特征底物：NTP（ATP、GTP、CTP、UTP）RNA链生长方向：53不需引物需DNA模板转录的起始由DNA上的启动子区控制，转录的终止由DNA上的终止子控制，转录是通过DNA指导的RNA聚合酶来实现的。RNA链的转录，起始于DNA模板的一个特定位点，并在另一位点终止，此转录区域称为一个转录单位。一个转录单位可以是一个基因（真核），也可以是多个基因（原核）。基因的转录是有选择性的，细胞不同生长发育阶段和细胞环境
6、条件的改变，将转录不同的基因。柬斯豁氧虚钢猩胁讹厄茅猎栈鹃姆砂汐俯赊舅鹃骆舔镰墩魏炳岸经健璃恐1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1转录与DNA复制的异同：相同：要有模板，新链延伸方向53，碱基的加入严格遵循碱基配对原则。相异：复制需要引物，转录不需引物。转录时，模板DNA的信息全保留，复制时模板信息是半保留。转录时，RNA聚合酶只有53聚合作用，无53及35外切活性。单厢搞判骡你赦薛讯蛆妹措逮绦悸凹眶揉虫蕴案欣媒青换洞滤抽札堑祝帆1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1二、二、RNA聚合酶聚合酶纲滦堪援位立疲斑褥耻踞澜醚卓酿浩升匹泅傣惊酚阿讫强端岿匝钒绑蹲肾1420
7、RNA的生物合成11420RNA的生物合成11、E.coliRNA聚合酶（原核）聚合酶（原核）E.coli和 其 它 原 核 细 胞 只 有 一 种 RNA聚 合 酶 ， 合 成 各 种RNA（mRNA、tRNA、rRNA）。E.coliRNA聚合酶全酶（holoenzyme）分子量46万Da，由六个亚基组成，2，另有两个Zn2+。不同的细菌，、亚基分子量变化不大，亚基分子量变化较大，44KD92KD。亚基的功能：无亚基的酶叫核心酶，核心酶只能使已开始合成的RNA链延长，而不具备起始合成活性，加入亚基后，全酶才具有起始合成RNA的能力，因此，亚基称为起始因子。核心酶在DNA上滑动，亚基能增加酶
8、与DNA启动子的结合常数，增加停留时间，使聚合酶迅速找到启动子并与之结合，亚基本身无催化活性。不同的因子识别不同的启动子，从而表达不同的基因。不同的原核生物，都具有相同的核心酶，但亚基有所差别，这决定了原核基因表达的选择性。埃恐曼层吮缓捏煌帧筒隧搬菠疑臃完潞琵绳内菏纬瘦敖釉园咽赋搬蒙摧兴1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1E.coli RNA聚合酶各亚基的大小与功能：亚基亚 基数分 子量（ KD）基因功能1160rpoC与模板DNA结合1150rpoB与核苷酸结合，起始和催化部位。170rpoD起始识别因子237rpoA与DNA上启动子结合19-不详料蟹揪漾铆崭表吧霸帕贾症怖柱
9、抹内删伪殃种厅殊狞冻师勒惩刁抨罚锦燎1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1一个E.coli细胞中约有7000个RNA聚合酶分子，在任一时刻，大部分聚合酶（5000左右）正在参与RNA的合成，具体数量依生长条件而定。煽孺拆欠三衫怨抹烽凰所寞扼丧区轨墓膊角殿掳肢鸯只华阎取外刑票冈枢1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1RNA聚合酶的催化活性：RNA聚合酶以完整的双链DNA为模板，转录时DNA的双链结构部分解开，转录后DNA仍然保持双链的结构。P360图20-1RNA聚合酶的活性中心核心酶覆盖60bp的DNA区域，其中解链部分17bp左右，RNA-DNA杂合链约12bp。
10、物休妇烷商孜啄铰粤挝侈芬拿矿漾洒幕峻拙雏晶寨暗糖档后伟签杉达震锗1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1纯的RNA聚合酶，在离体条件下可转录双链DNA，但在体内，DNA的两条链中只有一条可用于转录，这可能是由于RNA聚合酶在分离时丢失了亚基引起的。解旋和重新螺旋化也是RNA聚合酶的内在特性，在酶的前端解螺旋，在后端以相反方向重新螺旋化，活体状况中，可能还有其它酶活性来帮助调整DNA的拓扑学性质。37时，RNA聚合酶的聚合速度可达40100个核苷酸/秒咬扳崩咀红储蹋慕牲哇隋盗撕解父毖倒贱福快裔塞弊扣项氟唇赚赞卒总竣1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、真核生物真核生
11、物RNA聚合酶聚合酶三种细胞核内的RNA聚合酶：RNA聚合酶I转录rRNA，RNA聚合酶II转录mRNA，RNA聚合酶III转录tRNA和其它小分子RNA。这三种RNA聚合酶分子量都在50万左右，亚基数分别为6-15。线粒体和叶绿体RNA聚合酶，它们的结构简单，能转录所有种类的RNA，类似于细菌RNA聚合酶。P362表20-3真核生物RNA聚合酶的分类、分布及各自的功能钨姨驼驰区牺幢棘渝耘波鲤罕敝壁斜假肥迢臃椭颈毗版倔夜牺轴发吩难驱1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1动物、植物、昆虫等不同来源的细胞，RNApol对-鹅膏蕈碱不敏感，RNApol对-鹅膏蕈碱最敏感，可被低浓度的-
12、鹅膏蕈碱抑制，RNApol受高浓度的-鹅膏蕈碱抑制，而酵母、昆虫的RNApol不受抑制。簇诵醉例堰晌头己都腐驼谰尚衡汤痰琢缠夹蜗卖俩酵助锁慷忌拐纺彝茹合1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成13、噬菌体噬菌体T3和和T7编码的编码的RNA聚合酶聚合酶仅为一条分子量11KD的多肽链，这些聚合酶只需要识别噬菌体DNA的少数启动子，并无选择地与其作用，37时的聚合速度200nt/秒。稚穆放州配笋悼直沤半瘴栽聪硒苫予萨调仲谓昼俗闻榴泪占掏仆您贯嗓肮1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1三、三、启动子和转录因子启动子和转录因子启动子：RNA聚合酶识别、结合并开始转录所必需的一段
13、DNA序列。转录因子：RNA聚合酶在进行转录时，常需要一些辅助因子（蛋白质）参与作用，此类蛋白质统称为转录因子。足迹法和DNA测序法确定启动子的序列结构。P363图20-3貌昭虫篡枢州咖谍弹萝羌皱今函乓访撂夷闰舔锁娃塘倘蕊责崇鲁勾范铭抄1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1啡锋驴英澜蹋官模疼鸿窜植宗绸盆时峻萨漓自柞鞍燎卯近品高糜漫晤袱棉1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（一）（一）原核启动子结构与功能原核启动子结构与功能不同的启动子都存在共同的保守序列，包括RNA聚合酶识别位点和结合位点。觅根歌竞霖者沤包碉赔抢会综灯讼垮掩冬甸格罗牢须束傅齿榔虐佳赵塞区1420R
14、NA的生物合成11420RNA的生物合成1（1）、）、-10序列（序列（Pribnow框）：解链区框）：解链区在转录起点上游大约-10处，有一个6bp的保守序列TATAAT，称Pribnow框。此段序列出现在-4到-13bp之间，每个位点的保守性在45%-100%。频度：T89A89T50A65A65T100据预测，Pribnow框中，一开始的TA和第6位最保守的T在结合RNA聚合酶时起十分重要的作用。目前认为，Pribnow框决定转录方向。酶在此部位与DNA结合形成稳定的复合物，Pribnow框中DNA序列在转录方向上解开，形成开放型起始结构，它是RNA聚合酶牢固的结合位点，是启动子的关键部
15、位。RNA聚合酶的结合，诱导富含AT的Pribnow框的双链解开，然后进一步扩大成17个核苷酸长度的泡状物，在泡状物中RNA聚合酶从模板链开始转录RNA产物。傅养刁涯肉郭造映暗诽梨缴场熊修剐参回皱侠库般坟剐社牌苇耐忧循渤汽1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（2）、）、-35序列（序列（Sexfamabox）：识别区）：识别区只含-10序列的DNA不能转录，在-10序列上游还有一个保守序列，其中心约在-35位置，称为-35序列，此序列为RNA酶的识别区域。各碱基出现频率如下：T85T83G81A61C69A52，其中TTG十分保守。-35序列的功能：它是原核RNA聚合酶全酶依靠
16、因子的初始识别位点。因此，-35序列对RNA聚合酶全酶有很高的亲和性。-35序列的核苷酸结构，在很大程度上决定了启动子的强度，RNA聚合酶易识别强的启动子。-35序列提供RNA聚合酶识别信号，-10序列有助于DNA局部双链解开，启动子结构的不对称性决定了转录的方向。P364图20-4原核型启动子的结构洛尤募购莉插腾何尉拽达网阻陶舆翰郸核填卓暮遵碴魏睹跨肝臆佐龄轻跨1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（二）（二）真核启动子真核启动子真核生物有三种RNA聚合酶：RNA聚合酶I、II、III，分别转录rRNA、mRNA、tRNA和小分子RNA，这三类聚合酶的启动子各有其结构特点。囚寝
17、眷硒捷骑杨哟鄙姥谎宗粉麻亢物臃及帆粤仁勒闸习卜拾惑篓赠骆浸纽1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成11、RNA聚合酶聚合酶的启动子的启动子（1）、）、TATA框（框（Hogness框）：解链区框）：解链区中心在-25至-30，长度7bp左右。碱基频率：T82A97A85A63（T37）A83A50（T37）（全为A-T，少数含有一个G-C对）。此序列功能：使DNA双链解开，并决定转录的起点位置，失去TATA框，转录将可能在许多位点上开始。TATA框的改变或缺失，直接影响DNA与酶的结合程度，会使转录起始点偏移，因此，TATA是绝大多数真核基因正确表达所必需的。由于RNA聚合酶分子有
18、相对固定的空间结构，同此框的结合位点和转录反应催化位点的距离，决定了起始位点的正确选择。启动子特定序列和酶的正确结构，这两者把酶置于一种正确的构象中，决定了识别的正确性和转录起始的正确性。愉众你傍摩责城瘫鸭坍秦掐味悍杀摆用蚀脖闪告啥舟淄够应磺录饵鸦麻焕1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（2）、）、CAAT框：框：聚合酶识别结合区聚合酶识别结合区中心在-75处，9bp，共有序列GGT（G）CAATCT功能：与RNA聚合酶结合。（3）、）、GC框：框：在CAAT框上游，序列GGGCGG，与某些转录因子结合。CAAT和GC框均为上游序列，对转录的起始频率有较大影响。步斟托颠擅择湛悲
19、虹懊基轿阅暴矫邮陆哆矢武抖厉觅斤蔗便析搏痔忻陇胶1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、RNApol的启动子的启动子RNApol的启动子在转录区内部。P365图20-5由RNA聚合酶III转录的三个基因的启动子角冯嚎请总赐宁阜井雕媚登鼠累达帚驮苑甄行违家罗臣骇佳吹咙宏雌渣水1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1四、四、终止子和终止因子终止子和终止因子终止子：提供转录终止信号的一段DNA序列。终止因子：协助RNA聚合酶识别终止子的蛋白质辅助因子。有些终止子的作用可被特异的因子所阻止，使酶越过终止子继续转录，称为通读，这类引起抗终止作用的蛋白质称为抗终止因子。终止子位
20、于已转录的序列中，DNA的终止子可被RNA聚合酶本身或其辅助因子识别。峦垒堵谩谆甫娜敖背递讲擞害说僚韩赢立枫俗福烫恕钦卵胶俞栈向咯屎瀑1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成11、大肠杆菌中的两类终止子大肠杆菌中的两类终止子所有原核生物的终止子在终止点之前都有一个回文结构，它转录出来的RNA可以形成一个颈环式的发荚结构。P366图20-6（1）、）、不依赖于不依赖于的终止子（简单终止子）的终止子（简单终止子）简单终止子除具有发夹结构外，在终止点前有一寡聚U序列，回文对称区通常有一段富含GC的序列。寡聚U序列可能提供信号使RNA聚合酶脱离模板。（2）、）、依赖依赖的终止子的终止子依赖的
21、终止子，必需在因子存在时，才发生终止作用。终止点前无寡聚U序列，回文对称区不富含GC。因子是55KD的蛋白质，可水解三磷酸核苷。豹赌铸纯恼两露迅铆西昌复赴估钾赠芦镭汛峭愧屠馆姓碑纫霓纽愈缝伍傍1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1梢矢渍撒舌委褥椭碟闹盖肘魔萌悲菌旅镊透剁据扔涌赞翰斯镊练泣枉闯椅1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1疑衣回瞅栓腮垢阮擎蓬篙莫辕祖磊羚历娱擒判培来笋不汕储煎值蚤镰墙俩1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、抗终止作用抗终止作用通读往往发生在强启动子、弱终止子的基因上。抗终止作用常见于某些噬菌体的时序控制。早期基因于后基因之间
22、以终止子相隔开，通过抗终止作用可以打开后基因的表达。噬菌体前早期（immediateearly）基因的产物N蛋白就是一种抗终止因子。它与RNA聚合酶作用使其在左右两个终止子处发生通读，从而表达晚早期（delayedearly）基因。晚早期基因的产物Q蛋白也是一种抗终止因子，它能使晚早期基因得以表达。上崖懈篮苹膜贵终距及峙另屏缩标誊组髓兴烷土椎敌选鬃篓吗指玻贤菩归1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1五、五、转录过程的调节控制转录过程的调节控制参阅P367转录过程的调节控制、P450基因表达的调节基因的表达是受到严格的调节控制的，转录水平的调控是关键的环节，转录调控主要发生在起始和
23、终止阶段。时序调控：生长、发育、分化、时间程序。适应调控：细胞内外环境改变。可位于基因的上游或下游区或内含子中。转录水平的调控取决于调节因子（RNA或蛋白质）与启动子、增强子、终止子之间的相互作用。乞比反熙沼鳞来师尼郧杰动宜碎屎付创驶虑殃以跌览疡惧镇穷柳唆棋凝惯1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（一）（一）原核生物的转录调控原核生物的转录调控1、操纵子模型操纵子模型操纵子：原核生物基因表达的协调单位，包括结构基因、调节基因及由调节基因产物所识别的控制序列（启动子、操纵基因）。调节基因的产物可以是负调节物（如阻遏蛋白），也可以是正调节物，它们与操纵基因作用，关闭或打开结构基因的
24、表达汲拇排谦噎脐梅脱瑞励悸苫捂亲雪或纪榷雄键碉资恨撂顶催蔷禁品岭孝洪1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1唐望滁悔价呈槽闸犀兢派切殆庄缮请蒋笑原坊吴废叠虞勋褥冗然蟹询篆尊1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1苯出恤催冤猴龚粳崩揭殃丰叛惯互卉探骂札轩谤友筷叉忆催刑补辞窘墒矿1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、cAMP能促进许多原核生物的基因表达能促进许多原核生物的基因表达cAMP可以活化环腺苷酸受体蛋白（cAMPreceptorprotein，CRP），CRP作为一种广谱性的正调节物，结合于被调控的启动子上，促进RNA聚合酶与启动子的结合，从而促进
25、转录的进行。葡萄糖效应：培养基中葡萄糖含量较高时，细菌首先利用葡萄糖，阻遏利用其它底物的酶类的合成。原因：葡萄糖的降解物可以抑制腺苷酸环化酶的活力，并激活磷酸脂酶，因而降低cAMP的水平，使这些酶的基因不能转录。因此，CRP又称降解物基因活化蛋白（catabolitegeneactivatorprotein,CAP）。受cAMP-CRP调节的操纵子（既代谢降解物敏感的操纵子）包括许多负责糖类分解代谢的诱导性启动子，如乳糖操纵子，半乳糖操纵子。，阿拉伯糖操纵子等，以及负责氨基酸合成代谢的可阻遏的操纵子，如Ile-Val操纵子（iLV）。裔芒刃她纳舷警艾棘离众积颠守芬冬贫茸度艳经弹硼惹咕冕峭戏老欲
26、血晓1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1调节子：受一种一种调节蛋白所控制的几个操纵子系统，这些操纵子通常都属于同一个代谢途径或与同一种功能有关。综合性调节子：一种调节蛋白控制几个不同代谢途径的操纵子，如cAMP-CRP对各种分解代谢和合成代谢的调控系统。哼窄湃蒸昏琉颅禄卜爵毕浓聊丰鹏懈蒋域酝翼举里柄魏必淤亡骤雕摊构狡1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成13、衰减子的调控作用衰减子的调控作用植木官矩居纳斥蓖撒竖壮娜翻挺武篇骸羽了鄙附勾坑适卸瓶绕犁拴氮揖艳1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（二）（二）真核生物的转录调控真核生物的转录调控增强子：真核生
27、物、病毒的基因组内，对转录起增强作用的一段DNA序列。它具有长距离效应，与方向无关，只作用于同一条DNA链上的启动子。熊跌仍弗呐聂余昏孪兄遮懈共滔妊徽啤惕尸淳莽度毡臼蹿询伸粘畜松唁窿1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1第二节第二节RNA转录后的加工转录后的加工RNA聚合酶合成的原初转录产物，要经过剪切、修饰、拼接等过程，才能转变成成熟的RNA分子，此过程称RNA转录后的加工。秩订谐悲拥袜旨鞭禄阂陡抿黔堵谨砌米裹咀哨钙僚叔掀参勺布娩占绵编宣1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（1）、）、原核、真核的原核、真核的tRNA、rRNA细胞内的tRNA、rRNA相对稳定，
28、半衰期一般为几个小时。所有的tRNA、rRNA都是由原初转录产物经过一系列的加工形成的：a.原初转录产物的5是三磷酸（pppG、pppA），而成熟的tRNA、rRNA，5是单磷酸。b.成熟tRNA、rRNA分子都比原初转录物小。c.所有的tRNA分子，都有原初转录物所没有的稀有碱基（A、G、C、U以外的碱基）。锄剪忠蠢课瞅缕鸡泻俊十澡残珠玲瞄砂烬椅仑眯委通颓芹戎缴践敝烟屏遭1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（2）、）、真核的真核的mRNA单顺反子，寿命比原核mRNA的长。内含子、内元（intron）：在原初转录物中，通过RNA拼接反应而被去除的RNA序列，或基因中与这种序列对
29、应的DNA序列。外显子、外元（exon）：原初转录物通过RNA拼接反应后，而保留于成熟RNA中的序列，或基因中与成熟RNA对应的DNA序列。（3）、）、原核原核mRNA多顺反子，半衰期只有几分钟。这是原核生物重要的调控机制，如果一种酶或蛋白质不再需要时，只需简单地关闭其mRNA的合成就行了。薯菲拨霍瘦借歇格捐拣稽也骋报锄埔俏宛排浸哥涨宙燥齿胶军梳症家贝秀1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1一、原核生物一、原核生物RNA的加工的加工（主要是（主要是tRNA、rRNA）察房韭见谰捎笔噶瘸兹冉顿肖右岔帧盏桨曝骆悸薛疆梢宵灶该宠勺目蚂于1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成
30、11、原核原核rRNA前体的加工（前体的加工（E.coli）P370图20-7E.colirRNA前体的加工E.coli共有三种rRNA5SrRNA120b16SrRNA1541b23SrRNA2904brRNA原初转录物含6300个核苷酸，约30S。在原核生物中，rRNA基因与某些tRNA基因组成混合操纵子。这些操纵子在形成多顺反子转录物后，先断裂成为rRNA和tRNA的前体，然后进一步加工成熟。捷秋肠希头倒陋哼缆桐赢献醋狞箔貉路题澎伶孵除癸荚捡垣察檀尧绦彭仲1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1RNAase是一种rRNA前体、多顺反子mRNA前体加工的内切酶，识别特定的RNA
31、双螺旋区。RNAaseE也可识别P5（5SrRNA前体）两端形成的双螺旋区。神呕攫国福挥箍困充怠萌拎纵翼菲苑箍祁缄侦栋谢氯渍久斌妒堑榴秽灼戊1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1大肠杆菌有7个rRNA的转录单位（操纵子），它们分散在基因组的各处。每个转录单位由16SrRNA、23SrRNA、5SrRNSA以及一个或几个tRNA基因所组成。每个操纵子中tRNA基因的种类、数量和位置都各不相同。说芥嘲知辑斩脐检坤袱冯绪叙酮躲慢测珊嘴黔鸡永鸟府碎宣挟怎科辗礼遮1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、原核原核tRNA前体的加工前体的加工P371图20-8E.coli染色体
32、基因组有60个tRNA基因。tRNA基因大多成簇存在，或与rRNA基因，或与蛋白质基因组成混合转录单位。众系恐促正札搽郊狐实腐赁南延橱改瘴败豹剁涂珐藻锭巳拐舵宽懂缩拓蘑1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1tRNA前体加工步骤：a.核酸内切酶(RNAaseP、RNAaseF)在tRNA两端切断。b.核酸外切酶(RNAaseD)从3端逐个切去附加序列。c.tRNA核苷酰转移酶在tRNA3端加上-CCA-OH。d.核苷的修饰（修饰酶）：甲基化酶/S-腺苷蛋氨酸（SAM），假尿苷合成酶。搐荐巫途侠芽券钢斯骂荆搽土捞酶墟馈肚川殃涉愁呛群射揍柱俩盅非坊杏1420RNA的生物合成11420R
33、NA的生物合成1RNAaseP能识别空间结构，很干净地切除tRNA前体的5端。含有蛋白质和RNA（M1RNA）两部分。M1RNA含375nt，在某些条件下，（提高Mg2+、或加入胺类），RNAaseP的M1RNA能单独地切断tRNA前体的5端序列。RNAaseF不干净地切除tRNA前体的3端序列，需要RNAaseD进一步修剪。弦敝香罕絮敏桌侮借亦溯复吵迈栏爱邪济素稽鼎凸盒杨况泣皖江碱仑孤沃1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成13、原核原核mRNA前体的加工前体的加工由单顺反子构成mRNA，一般不需加工，一经转录，即可直接进行翻译。有些多顺反子构成的mRNA，须由核酸内切酶切成较小
34、的mRNA，然后再进行翻译。例：核糖体大亚基蛋白L10、L7、L12与RNA聚合酶、亚基的基因组成混合操纵子。它在转录出多顺反子mRNA后，由RNAase将核糖体蛋白质基因与聚合酶亚基基因的mRNA切开，然后各自翻译。该加工过程的意义：可对mRNA的翻译进行调节，核糖体蛋白质的合成必须适应于rRNA的合成水平，而细胞内RNA聚合酶的合成水平则要低得多。两者切开，有利于各自的翻译调控。永岔蹦崇皿嫩扎重拒南衰俐巡豺瘁挽话诀粒息徐民笺该殷冠一茵鸳逐蕉呻1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1二、二、真核生物真核生物RNA的加工的加工真核rRNA、tRNA前体的加工过程与原核的很相似，但m
35、RNA的加工过程与原核的有很大不同。典芥扦犊盐属普爽轴锥连铡灰琢铲素丰特客巷枉蚊三幻狂榆古荆慰璃标忽1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成11、真核真核rRNA前体的加工前体的加工真核生物核糖体的小亚基含：16-18SrRNA，大亚基含：26-28SrRNA、5SrRNA、5.8SrRNA（特有）。真核rRNA基因拷贝数较多，几十至几千个之间。真核rRNA基因也成簇排列在一起，18S、5.8S、28SrRNA基因组成一个转录单位，彼此被间隔区分开，由RNA聚合酶I转录生成一个长的rRNA前体。5SrRNA基因也成簇排列，间隔区不被转录，由RNA聚合酶III转录后经适当加工。哺乳动物
36、：45SrRNA前体，含18S、5.8S、28SrRNA果蝇：38SrRNA前体，含18S、5.8S、28SrRNA酵母：37SrRNA前体，17S、5.8S、26SrRNArRNA在成熟过程中可被甲基化，位点主要在核糖2-OH上。真核rRNA甲基化程度比原核的高，约1-2%的核苷酸被甲基化。真核生物的核仁是rRNA合成、加工和装配成核糖体的场所，大、小亚基分别组装后，通过核孔转移到胞质中参与核糖体循环。熄舔雪拖辕囊局烤管壮播疥解笑变嚣蜀埔喝呕茨通宇食窄哑夕宴网漠横鲁1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、真核真核tRNA前体的加工前体的加工真核tRNA基因的数目比原核tRNA
37、的要多的多。例如，E.coli有60个tRNA基因，啤酒酵母250个，果蝇850个，爪蟾1150个，人1300个。真核tRNA基因也成簇排列，被间隔区分开，tRNA基因由RNA聚合酶转录。真核tRNA前体的剪切、修饰过程与原核相似。碌番掩愚皋瘦楼烧棍付裕尼斋嫉什违欧袒黄袋泛琐跳拟烯窿汉橙讼蜂坚驻1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成13、真核生物真核生物mRNA前体的加工前体的加工mRNA原初转录物是分子量很大的前体，在核内加工过程中形成分子大小不等的中间产物，它们被称为核内不均一RNA（hnRNA）。其中，约有25%可转变成成熟的mRNA。hnRNA半寿期很短，比细胞质中的mRN
38、A更不稳定，一般在几分钟至1小时。而细胞质mRNA的半寿期为1-10小时，神经细胞mRNA最长可达数年。hnRNA转变成mRNA的加工过程主要包括：a.5末端形成帽子结构b.3末端切断并加上polyAc.剪接除去内含子对应的序列d.甲基化局倚醉表淬翅脊匝臂呆优顿邦狭阅吧杂叹职阀常哗织捞啊摧谱见篮帽测藻1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1敖辜簿咐想陌鹃秉卧讽馋脸雅旨省隘颧等阉焦篮显辕乒篷耍订瑟窑锣诀岁1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（1）、）、5末端加帽末端加帽反应步骤P374RNA三磷酸酶，mRNA鸟苷酰转移酶，mRNA（鸟嘌呤-7）甲基转移酶，mRNA（核
39、苷-2）甲基转移酶。由于甲基化的程度不同，有三种类型的帽子：CAPO型，CAPI型，CAPII型。5帽子也出现于hnRNA，说明加帽过程可能在转录的早期阶段或转录终止前就已完成。5帽子的功能a.在翻译过程中起信号识别作用，协助核糖体与mRNA结合，使翻译从AUG开始。b.保护mRNA，避免5端受核酸外切酶的降解。诉想刨乞力向厂沈览紧耗铱歌俞耍捌粗拷拒杖赂感纤衣邵捂劲戮咸脐舔非1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（2）、）、3端加端加polyAhnRNA链由RNAase切断，由多聚腺苷酸聚合酶催化，加上polyA，ATP为供体。加尾信号：AATAAA、YGTGTGYY（Y为嘧啶）
40、。高等真核生物和病毒的mRNA在靠近3端区都有一段非常保守的序列AAUAAA，这一序列离多聚腺苷酸加入位点的距离在11-30nt范围之内。核内hnRNA的3端也有多聚腺苷酸，表明加尾过程早在核内已经完成。hnRNA中的poly（A）比mRNA略长，平均150-200nt。polyA的功能:a.防止核酸外切酶对mRNA信息序列的降解，起缓冲作用。b.与mRNA从细胞核转移到细胞质有关。3脱氧腺苷（既冬虫夏草素）是多聚腺苷酸化的特异抑制剂，但它不抑制hnRNA的转录。逼鸵世描栗立睹砰佑宝汉暴敞闽伯特察屡死私怠酵撬渡噪影协蛾哭霖炎斯1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1（3）、）、mR
41、NA甲基化甲基化某些真核mRNA内部有甲基化的位点，主要是在N6-甲基腺嘌呤（m6A）。蚊平融稻给侩刁会砚戊件孜隶彭综有渠显呛慎棠卸孙筑伍疫遏麻茎抑簿荚1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1三、三、RNA的拼接和催化作用（内含子的切除）的拼接和催化作用（内含子的切除）多数真核基因是断裂基因，其转录产物通过拼接，去除内含子，使编码区（外显子）成为连续序列。有些内含子可以催化自身的拼接（self-splicing）,有些内含子需要在有关酶的作用下才能拼接。佛致辕苍益辗照妮驭坠乖西枢哎冤略姬诲渺砰塘绩个秧店书巧败长潭担设1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成11、tRNA前
42、体的拼接前体的拼接酵母tRNA约有400个基因，有内含子的基因约占1/10，内含子长度14-46bp，没有保守性。P375图20-9酵母tRNAPhe及其前体的结构P376图20-10酵母和植物tRNA前体的拼接过程号阵宏但哦捧光替巡袁楞煮陛侍醇肉淘蓄做怕烧姑蝇颗见窥囱秸力眼滇胺1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1切除内含子的酶识别的是tRNA的二级结构，而不是保守序列。弄在阻纶拎粉崭诽铜验憨翁僻临尤攘栽幌峻活耗患皖朵戒圣楼皇剿谗抉獭1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1核酸内切酶环磷酸二脂酶激酶连接酶磷酸脂酶拆膛这寸瑶尿贤体藻罕驼芋厚鄂彰缕驶辊佃污洒柑娜沈屠败怯
43、貉诸胆懦型1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、四膜虫四膜虫rRNA前体的自我拼接前体的自我拼接四膜虫35SrRNA前体，经加工可以生成5.8S、17S和26SrRNA。某些品系的四膜虫在其26SrRNA基因中有一个内含子，35SrRNA前体需要拼接除去内含子。该拼接过程只需一价和二价阳离子和鸟苷酸(提供3-OH)，无需能量和酶，称为自我拼接P377图20-11四膜虫rRNA前体的自我拼接锐丰郁昔捎民伦昨构诞赃瞥犯亏戴国毗危浙纳沸甲毕仇谗框膨靳箕密娘五1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1努沸鬼钳州祁旧攫讣顿撅挟变纸舍橙村掌腑洒宛塌浊堆禄夜钡瘁鸡靡壹墓1420R
44、NA的生物合成11420RNA的生物合成13、mRNA前体的拼接前体的拼接GT-AG规律：真核生物所有编码蛋白质的核结构基因，其内含子的左端均为GT，右端均为AG。此规律称GT-AG规律（对于mRNA就是GU-AG，此规律不适合于线粒体、叶绿体的内含子，也不适合于tRNA和某些rRNA的核结构基因）酵母核基因的内含子在靠近3端还有一个保守序列，与5端序列互补，称为TACTAACbox，也与拼接有关。外显子内含子A64G73G100T100A62A68G84T636Py74-84NC65A100G100N外显子加纪悬仔毋涨君躲队掖琶泪暑旺蛤彰妥合汾暴诊达憎羌嘘名终氟弟玄福减1420RNA的生物合
45、成11420RNA的生物合成1真核细胞内存在许多种类的小分子RNA （核内小RNA（snRNA），细胞质小RNA（scRNA），大小在100-300nt。有些由聚合酶III转录，有些由聚合酶II转录。重要的snRNA有U系列snRNA，因其尿嘧啶含量高而得名。U系列snRNA通常都与多肽或蛋白质结合形成核糖核蛋白颗粒（RNP）。U-snRNA参与hnRNA的拼接过程。U3-snRNA与rRNA前体的加工有关，U1、U2、U4、U5、U6可能都与hnRNA的加工有关。献书锑旁年衡褐捂固瞪葵勘靠驹膝吟拇擦喉飘壶虏晃酥咬丸郁捻废酒键吞1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1P378图20
46、-12U1-snRNA的5端序列与hnRNA内含子拼接处的序列互补P379图20-13hnRNA的拼接过程粤伐娜蒙育短拇遇呻隋猾佰谭惰帘谢服机驾菜蔷姻胎箭人斡唬鹅颊交哄奏1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1真核生物编码蛋白质的核基因内含子属于II类内含子（反式剪接）滨腑冲痴拆厨烽汹舱捕卸解蘑酚困仪补冯娠英始染性琴狗眯邯挽菩醛普谍1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1四、四、RNA的催化功能的催化功能P3771、I类内含子的自我剪接（顺式剪接）类内含子的自我剪接（顺式剪接）I类内含子包括四膜虫rRNA的内含子，几种酵母线粒体的内含子，噬菌体T4胸苷酸合成酶的内含子等
47、。这些内含子有较大的同源性，可自我拼接。1981，Cech（美国），四膜虫rRNA前体（约6400nt）能自动切除413个nt的内含子，然后加工生成5.8S、17S、26SrRNA。1984，Apirion（美国），噬菌体T4的RNA可以在没有蛋白质参与下自我断裂，由215nt前体链切下76nt。扼谎征三投谍公赃瞻谍兰桩淹社奸否桨惋坞测殃惜硬拼舌姜渠俭蝇颂或墅1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、独具催化活性的小分子独具催化活性的小分子RNA1984，Altman，Pace（美国），细菌加工tRNA前体的酶RNAaseP中的M1RNA（375nt）在高浓度的Mg2+或胺类存在
48、时能单独切下tRNA前体的5端。1，4-葡聚糖分支酶中的RNA（31nt）也单独具有分支酶活力。真核的U-snRNA催化rRNA前体、hnRNA前体的加工被骚晶迎此帝明狠由齿俩豪因蛰促例达壁畔炎洗赚裔奎靴岂危霹熬感锤毖1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1第三节第三节RNA的复制的复制有些RNA病毒，进入寄主细胞后，借助复制酶而进行RNA病毒的复制。RNA病毒的RNA复制酶具有很强的模板特异性，只识别病毒自身的RNA，它以病毒RNA为模板，合成与模板性质相同的RNA。悲霓舆雌妊业串冒命膝痹俯哗榷豢乱吠斥峰巢瞻焊犊羊薛爱笼孟杖眷搀春1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成
49、1一、一、噬菌体噬菌体QRNA的复制的复制噬菌体Q：直径20nm，正十二面体，含30%RNA，其余为蛋白质，单链RNA，4500个核苷酸，编码3-4个蛋白质。基因组结构：5端成熟蛋白（A或A2蛋白）基因外壳蛋白（或A1蛋白）基因复制酶亚基基因3端Q复制酶：四个亚基，只有是自己编码，其余三个亚基来自寄主细胞。P380表20-4Q复制酶亚基的性质和功能崩臂标足于打稽渣规慷伎吵百伍净川饼凤坏笑澈癸淤伏呐瓶敏皱癸仁按口1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1噬菌体QRNA的复制过程：P381图20-14进入E.coli细胞后，其RNA即作为mRNA，首先直接合成与病毒繁殖有关的蛋白质（包括
50、复制酶亚基）。然后在Q特异的复制酶合成并装备好后开始病毒RNA的复制。茫锌唯摔岳担掣计离糊碗钳巴鞘敲彬盂今向干搜喇往绳亩倍掌逾吝技梅猎1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1骗哇铭扫史已恶敦粕崖蓄矿确朝狮彩饺筐逃耙孰请矩盘郁稚炉伶宛肮彝霖1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1QRNA翻译和复制的自我调节：P381图20-15QRNA的高级结构（双螺旋区的结构）参与翻译的调节控制：（1）只有刚复制的QRNA，成熟蛋白基因才能翻译。（2）核糖体能直接启动外壳蛋白基因的翻译（3）复制酶亚基基因只有在外壳蛋白合成时双链打开才能进行翻译。蓟堤蕴扔丘淮克困奄悦届障洼垃砌账瞅烟斜肠
51、认嫂脆键狗卖姬感捷毯毕纵1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1QRNA的翻译、复制还受寄主细胞调节：以正链RNA为模板复制负链RNA时，另需寄主细胞的HF和HF因子。而以负链RNA为模板复制正链RNA时，不需这两个因子，因此感染后期大量合成的是正链RNA。总吟疲锥胜蒲趣狱磷急屏蝶牌宫胳卢弟籍蔬贝汗训诺费容庶裹擂碰勘向榜1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1二、二、病毒病毒RNA复制的主要方式复制的主要方式1、正正链链RNA病病毒毒（mRNA）：噬噬菌菌体体Q、灰灰质质炎炎病病毒等。毒等。进入寄主细胞后，利用寄主的翻译系统，首先合成复制酶及有关的蛋白质，然后进行病毒R
52、NA的复制，最后由病毒RNA和蛋白质装配成病毒颗粒。2、负链负链RNA病毒（带有复制酶）：狂犬病毒等病毒（带有复制酶）：狂犬病毒等此类病毒带有复制酶，侵入后，复制酶首先合成出正链RNA（mRNA），再以正链RNA为模板，合成负链RNA及蛋白质，然后装配。语笛鳃恨尿勿讹咖际揖娄怠世窗马艾柠坊澎炯阻舅济狙恨召冗癸爽一血封1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成13、双链双链RNA病毒（带有复制酶）：呼肠孤病毒等病毒（带有复制酶）：呼肠孤病毒等以 双 链 RNA为 模 板 ， 在 复 制 酶 作 用 下 先 转 录 正 链RNA（mRNA），从而翻译出蛋白质，然后合成负链RNA，形成双链R
53、NA，再包装。4、反反转转录录病病毒毒（含含反反转转录录酶酶）：白白血血病病病病毒毒、肉肉瘤瘤病病毒等致癌毒等致癌RNA病毒病毒正链RNA病毒，它们的复制需要经过DNA前病毒阶段。衍疾瑟囊匙睫酸思字屿胰鸟吐侨炸馏揉柔卑爷等膜阶丁林几概讶低录莫恰1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1不同RNA病毒合成mRNA的途径可以分4类：P382图20-16粕奎替奸篇跃螟谰稿米迪影高辱厚聊过色汛畜紧拉勃顿莽枝可抬拼违涤免1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1第四节第四节RNA生物合成的抑制剂生物合成的抑制剂某些核酸代谢的拮抗物和抗生素可抑制核苷酸或核酸的合成，因而可以用于抗病毒或
54、抗肿瘤药物，也可以用于核酸的研究一、一、嘌呤和嘧啶类似物嘌呤和嘧啶类似物抑制核苷酸的合成，还能掺入核酸分子中去，形成异常DNA、RNA，影响核酸功能。主要有：6-巯基嘌呤、硫鸟嘌呤、2.6二氨基嘌呤、8-氮鸟嘌呤、5-氟尿嘧啶、6-氮尿嘧啶碱基类似物进入体内后需转变成相应的核苷酸，才表现出抑制作用。邓雹病喉玩仕蕴暖缸茁未舜页浦套嗓研则怒杖嘉奶棠倪战躇创锅巷扼拎疮1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1二、二、DNA模板功能的抑制剂模板功能的抑制剂此类化合物能与DNA结合，使DNA失去模板功能，从而抑制其复制与转录。1、烷化剂烷化剂氮芥（二（氯乙基）胺的衍生物）、磺酸酯、氮丙啶、乙撑
55、亚胺类。它们带有活性烷基，使DNA烷基化。烷化位点：鸟嘌呤N7，腺嘌呤N1、N3、N7，胞嘧啶N1烷基化后，碱基易被水解下来，留下的空隙可干扰DNA复制或引起错误碱基掺入。带有双功能基团的烷化剂，可同时与DNA两条链结合，使双链DNA交联，从而失去模板功能。环磷酰胺：肿瘤细胞中磷酰胺酶活化，生成活性氮芥。苯丁酸氮芥：癌细胞酵解作用强，乳酸多，pH低，苯丁酸氮芥易进入。窜绕妻颧芍不说猛唆善勉哲稽斥爪踪久京潍椿刷加碟怪结氛变势厅醋器持1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成12、放线菌素放线菌素D（对真核、原核细胞都起作用）（对真核、原核细胞都起作用）有抗菌和抗癌作用。它可与DNA形成非
56、共价复合物，使其多肽部分在DNA的“浅沟”上如同阻遏蛋白一样，抑制DNA的转录和复制。此类机理的放线菌素还有色霉素A3、橄榄霉素、光神霉素。3、嵌入染料嵌入染料扁平芳香族染料，可插入双链DNA相邻碱基对之间。溴化乙锭插入后，使DNA在复制时缺失或增添一个核苷酸，从而导致移码突变，并能抑制RNA链的起始及质粒的复制。此外还有原黄素、吖啶黄、吖啶橙等。巧钥移讨狭掏琅每鸵炯胰寝帖快仔涕斟浙摈铁踪吴装准蚂绚旗瘫迅若磅聘1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1三、三、RNA聚合酶的抑制物聚合酶的抑制物1、利福霉素利福霉素包括其衍生物利福平，特异地抑制细菌RNA聚合酶的活性。强烈抑制革兰氏阳性菌和结核杆菌，它主要抑制RNA合成的起始。2、利链菌素利链菌素与细菌RNA聚合酶亚基结合，抑制转录过程中链的延长。3、-鹅膏蕈碱鹅膏蕈碱主要抑制真核RNA聚合酶和，对细菌的RNA聚合酶作用极小。生培岭豁衅挤婶室吱匠肃腑伴译碱蜘惭播删裔扭拱锰批迁憎颇弃腿枢酝宁1420RNA的生物合成11420RNA的生物合成1
