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1、第十章第十章 微生物的分类和鉴定微生物的分类和鉴定淡荤扑摧飞感蜜翟族榆釉紧铀链甫通捶壳官弥泽轧估颈最蒋哀屹掀要磅连第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定1什么是微生物分类学什么是微生物分类学(microbialtaxonomy):按照微生物的亲缘关系将按照微生物的亲缘关系将其安排成条理清楚的各种其安排成条理清楚的各种分类单元和分类群的科学分类单元和分类群的科学 微生物分类的目的微生物分类的目的把各种微生物按照它把各种微生物按照它们的亲缘关系分群归们的亲缘关系分群归类，排成系统，以便类，排成系统，以便于人们对微生物进行于人们对微生物进行鉴定和交流鉴定和交流嘘游勾财炒镇倒寺臼丢硷攘搐达岩
2、谩玻地察疗污爷蜒东啤牛没例兑境车普第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定2生物界的分类生物界的分类地球上的物种估计大约有地球上的物种估计大约有150150万，其中微生物万，其中微生物超过超过1010万种，而且其数目还在不断增加。万种，而且其数目还在不断增加。在生物进化历史过程中演化形在生物进化历史过程中演化形成生物种类和种群的多样性。成生物种类和种群的多样性。生物分类就是通过研究生物的系统发育及其进化生物分类就是通过研究生物的系统发育及其进化历史，揭示各类生物的多样性及其系统关系，编历史，揭示各类生物的多样性及其系统关系，编制分类系统，还原生物的自然历史位置。制分类系统，还原生物的自
3、然历史位置。赚帆其巷钵仙程舜瑚碰肤团曼躁剧锯藩迪借彼瑶野逝惰孺莎逝歇快韶孝戮第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定3微生物分类学的三个任务：分类、鉴定及命名微生物分类学的三个任务：分类、鉴定及命名分类分类是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不同的分类类群。是根据微生物的相似性和亲缘关系，将微生物归入不同的分类类群。鉴定鉴定是确定一个新的分离物属于已经确认的分类单元的过程。是确定一个新的分离物属于已经确认的分类单元的过程。命名是根据国际命名法规给微生物分类单元以科学的名称。命名是根据国际命名法规给微生物分类单元以科学的名称。鹰映碟劲单恒宝该襄醒锚翅荤诀际琶汲唁恢炕惶贩推卵渔钩老
4、冯殖耘鞘提第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定4第一节：通用分类单元第一节：通用分类单元 一、种以上的系统分类单元一、种以上的系统分类单元界、门、纲、目、科、属、种界、门、纲、目、科、属、种 种是最基本的分类单位种是最基本的分类单位 每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、每一分类单位之后可有亚门、亚纲、亚目、亚科亚科.胡搀裳泣杆淫幢率量榜嘉淘爬面绒三祥港鞭肛赋种渊悯肘迟彻半挂骄表皆第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定5界界门门纲纲目目科科属属种种网汐胆徽族解资馁誉伙八年券劣粮加布厉踏姿帖便斟扳遍吉斟苹愧狞淑存第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定6种（种（sp
5、eciesspecies）：是一个基本分类单位；是一大群）：是一个基本分类单位；是一大群表型表型特征高度特征高度相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株相似、亲缘关系极其接近，与同属内其他种有明显差别的菌株的总称。的总称。菌株（菌株（strainstrain）: : 表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的表示任何由一个独立分离的单细胞繁殖而成的纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种群体及其一切后代（起源于共同祖先并保持祖先特性的一组纯种后代菌群）。因此，一种微生物的不同来源的纯培养物均可纯种后代菌群）。因此，一种微生物的不同来源的纯培养物均可称为该菌种的一
6、个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。称为该菌种的一个菌株。菌株强调的是遗传型纯的谱系。例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株：例如：大肠埃希氏杆菌的两个菌株：Escherichia coliEscherichia coli B B 和和Escherichia coliEscherichia coli K12 K12菌株的表示法：菌株的表示法：种是分类学上的基本单位，菌株是实际上应用的基本单位，种是分类学上的基本单位，菌株是实际上应用的基本单位，因为同一菌因为同一菌种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别！种的不同菌株在产酶上种类或代谢物产量上会有很大的不同和差别！腋含磊拟赊珊糯责痘热
7、俩救馏本桥誓迅忻森屎鹃信香缄隋坎互详玉嗽堑锤第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定7新种（species nova，sp.nov或nov sp.）是指权威性的分类、鉴定手册中从未记载过的一种新分离并鉴定过的微生物。当发现在按国际命名法规对它命名并在规定的学术刊物上发表时，应在其学名后附上“sp.nov”符号。在新种发表前，其模式菌株的培养物就应存放在一个永久性的可靠的菌种保藏机构中，并允许研究人员取得该菌种。中国希瓦氏菌Shewanel lacinica sp.nov. （许玫英等，微生物学报，2004，44(5):561-566）龙剿就在秋狗陨克枷少氮钡峦乾屯榴逗映矾揖吨妮绩炳沈乱
8、渤土窄棒雨荧第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定8以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是：以啤酒酵母为例，它在分类学上的地位是： 界界(Kindom)(Kindom)：真菌界：真菌界 门门(Phyllum)(Phyllum)：真菌门：真菌门 纲纲(Class)(Class)：子囊菌纲：子囊菌纲 目目(Order)(Order)：内孢霉目：内孢霉目 科科(Family)(Family)：内孢霉科：内孢霉科 属属(Genus)(Genus)：酵母属：酵母属 种种(Species)(Species)：啤酒酵母：啤酒酵母洋悼逐狸慈涩女伤易西啤佑稳啃减破亚蹋寨宅唤锣撒憨郁绿鄙嘴鬃怯脉露第十章微
9、生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定9学名学名是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国际委员是微生物的科学名称，它是按照有关微生物分类国际委员会拟定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外来词组成。会拟定的法则命名的。学名由拉丁词、或拉丁化的外来词组成。学名的命名有双名法和三名法两种。学名的命名有双名法和三名法两种。双名法：双名法： 学名学名= =属名属名+ +种名加词种名加词+ +（首次定名人）（首次定名人）+ +现定名人现定名人+ +定名年份定名年份属名属名：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母大写，：拉丁文的名词或用作名词的形容词，单数，首字母大写，表示微生物的主要特征，
10、由微生物构造，形状或由科学家命名。表示微生物的主要特征，由微生物构造，形状或由科学家命名。 种名种名：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征，：拉丁文形容词，字首小写，为微生物次要特征， 如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等。如微生物色素、形状、来源或科学家姓名等。二、微生物的命名二、微生物的命名必要，用斜必要，用斜体表示体表示可省略，用可省略，用正体字正体字微生物的名字有俗名和学名两种。如：微生物的名字有俗名和学名两种。如： 红色面包霉红色面包霉粗糙脉孢霉粗糙脉孢霉 绿脓杆菌绿脓杆菌铜绿假单胞菌铜绿假单胞菌追粱吭福攘侧蝴射聘瑞巴畴陇藐连睡收坑护慨牧迄撰镊更捉呛挂盾崖采窍第十章微生物的分类
11、和鉴定第十章微生物的分类和鉴定10例：大肠埃希氏杆菌例：大肠埃希氏杆菌 Escherichia coli （Migula）Castellani et Chalmers 1919 金黄色葡萄球菌金黄色葡萄球菌 Staphylococcus aureus Rosenbach 1884当泛指某一属微生物，而不特指该属中某一种（或未当泛指某一属微生物，而不特指该属中某一种（或未定种名）时，可在属名后加定种名）时，可在属名后加sp.sp.或或ssp.ssp.（分别代表（分别代表species species 缩写的单数和复数形式）缩写的单数和复数形式）例如：例如：Saccharomyces sp.Sac
12、charomyces sp. 表示酵母菌属中的一个种。表示酵母菌属中的一个种。华癸根瘤菌 Rhizobium huakuii Rhizobium huakuii，Chen 1991 术般譬烈姨歼援侠旁仆的婆简枯福博围华措经盘颅罩娶严蜒耀竞杰库屉硷第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定11菌株名称菌株名称在种名后面自行加上数字、地名或符号等，如：在种名后面自行加上数字、地名或符号等，如： Bacillus subtilisBacillus subtilis AS1.389 AS=Academia Sinica AS1.389 AS=Academia Sinica Bacillus su
13、btilisBacillus subtilis BF7658 BF7658 Clostridium acetobutylicumClostridium acetobutylicum ATCC824 ATCC824 丙酮丁醇梭菌丙酮丁醇梭菌ATCCATCCAmerican Type Culture CollectionAmerican Type Culture Collection美国模式菌种保藏中心美国模式菌种保藏中心 当文章中前面已出现过某学名时，后面的可将其属名缩写成当文章中前面已出现过某学名时，后面的可将其属名缩写成1313个字母。个字母。 如：如：Escherichia coli Es
14、cherichia coli 可缩写成可缩写成 E.coliE.coli Staphylococcus aureus Staphylococcus aureus可缩写成可缩写成 S. aureusS. aureus三名法：三名法：用于对亚种的命名，这时在属和种名后加写一个用于对亚种的命名，这时在属和种名后加写一个subsp.subsp.，然后再附上亚种名称（斜排体）。，然后再附上亚种名称（斜排体）。 如：如： Bacillus thuringiensisBacillus thuringiensis subsp. subsp. galleriagalleria 苏云金芽孢杆菌腊螟亚种苏云金芽孢杆
15、菌腊螟亚种 慷燥意规飞锗匀羚郝袖刚罐挞瓮擂犁第弯赎懂憨际粪诀奋谅字娠案达砧接第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定12第二节第二节 微生物在生物界的地位微生物在生物界的地位 在人类发现微生物并对它们进行较深入的研究之前，只能把一切生物简单地分成似乎截然不同的两大界动物界和植物界；从19世纪中期起，随着人们对微生物认识的逐步深化，生物的分界就历经三界、四界、五界甚至六界等过程，最后又提出了一个崭新的“三域”学说。 安沤隋惩皋芦闺陇曙婚甫我遵糖士赶侮俐郸顾劈独兑鹊惜藩略晋馈奸搬象第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定13从两界系统经历过三界系统、四从两界系统经历过三界系统、四界
16、系统、五界系统甚至六界系统，界系统、五界系统甚至六界系统，最后又有了三原界（或三总界）最后又有了三原界（或三总界）系统。系统。传统的、为多数学者所接受的是传统的、为多数学者所接受的是19691969年魏塔克（年魏塔克（R.H.WhittakerR.H.Whittaker）在在ScienceScience上提出的五界学说，上提出的五界学说，它以纵向显示从原核生物到真核它以纵向显示从原核生物到真核单细胞生物再到真核多细胞生物单细胞生物再到真核多细胞生物的三大进化过程。的三大进化过程。生物的界级分类学说生物的界级分类学说捂篷仓驱晋翔似逃胁城宽济景辟和郸虎再吉颈停梨惠赁删渗扛蛮啦悯毗恬第十章微生物的分
17、类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定14三域学说: 细菌域、古生菌域、真核生物域。主要特点比较见表10-3。寐瓷戴抚削啃韵钟丹押某措猛箩帅屉父彰仇侄男赣趁饮农皖漂栈咕哲裂裤第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定151 1 Bergey氏原核生物分类系统纲要 伯杰氏系统细菌学手册伯杰氏系统细菌学手册(Bergeys Manual of Systematic Bacteriology)伯杰氏手册伯杰氏手册是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据，其特是目前进行细菌分类、鉴定的最重要依据，其特点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定点是描述非常详细，包括对细菌各个属种的特征及进行鉴定所
18、需做的实验的具体方法。所需做的实验的具体方法。20012001年分年分5 5卷陆续发行。卷陆续发行。（19941994第第9 9版）版）2 2 真菌分类系统真菌分类系统真菌界分类系统很多，各国采用不同的系统，比较混真菌界分类系统很多，各国采用不同的系统，比较混乱。近年来为较多人接受的是乱。近年来为较多人接受的是AinsworthAinsworth的纲要的纲要（P343P343）。）。第三节第三节 各大类微生物的分类系统纲要各大类微生物的分类系统纲要磕曹挪函删林桥用雷抿蚌悬庞亥蝶琅似郭扒率墙渔伟斡管戮弧次篇础缘搬第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定16第四节：微生物分类鉴定的方法第四
19、节：微生物分类鉴定的方法 5个水平：个水平：细胞的形态与习性水平。细胞的形态与习性水平。细胞组分化学水平。细胞组分化学水平。蛋白水平。蛋白水平。核酸水平。核酸水平。数学统计学或计算生物学水平。数学统计学或计算生物学水平。汰糠瑰计嚎威陕试澈噶套偿筷蕊推掐陵哗斋展批余今稚涂版拴垃怖宜次鼠第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定17一、微生物分类鉴定中的经典方法一、微生物分类鉴定中的经典方法生物分类的传统指标：形态学特征、生理、生化特征、 生态学特征、生活史、血清学反应、对噬菌体的敏感性，其它。它们从不同层次(细胞的、分子的)，用不同学科(化学、物理学、遗传学、免疫学、分子生物学等)的技术方
20、法来研究和比较不同微生物的细胞、细胞组分或代谢产物，从中发现的反映微生物类群特征的资料。在现代微生物分类中，任何能稳定地反映微生物种类特征的资料，都有分类学意义，都可以作为分类鉴定的依据。啮李肝车揭梗则拄获爸咐朱唉惟省甜涡填踪记盛殷喊萤埂冲拉鲁肇挟烃凭第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定18形态学特征形态学特征、生理学特征、生理学特征、 生态学特征生态学特征 生物分类的传统指标：生物分类的传统指标：1、形态学特征形态学特征培养特征、培养特征、运动性、运动性、特殊的细胞结构、特殊的细胞结构、细胞形态及其染色特性、细胞形态及其染色特性、等等等等微生物分类和鉴定的重要依据之一：微生物分类
21、和鉴定的重要依据之一：a a）易于观察和比较，尤其是真核微生物和具有特殊）易于观察和比较，尤其是真核微生物和具有特殊 形态结构的细菌；形态结构的细菌；b b）许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相对）许多形态学特征依赖于多基因的表达，具有相对 的稳定性；的稳定性；瞒晒洪胰瓤搅抱泞她鳖贝楼录圣肃楚唆崎旅懂北贤铆贪预竹纺椒霖宣搭往第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定192、生理生化特征与微生物的酶和调节蛋白质的本质和活性直接相关；代谢产物等代谢产物等营养类型；营养类型；与氧的关系；与氧的关系；对温度的适应性；对温度的适应性；对对pHpH的适应性；的适应性；对渗透压的适应性；对渗透压的
22、适应性；酶及蛋白质都是基因产物；对微生物生理生化特征的比较也是对微生物基因组的间接比较；测定生理生化特征比直接分析基因组要容易得多；估莎蔫瓶恤像窿凭切崔谭峡瓶俭拼钡溜汞谜石幂本峭惺毕控帅过趴炔拎钨第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定20常借助特异性的血清学反应来确定未知菌种、亚种常借助特异性的血清学反应来确定未知菌种、亚种或菌株。或菌株。生态特性生态特性包括在自然界的分布情况，与其他生物有否寄生或共生关包括在自然界的分布情况，与其他生物有否寄生或共生关系系, , 宿主种类及与宿主关系宿主种类及与宿主关系, , 有性生殖情况有性生殖情况, , 生活史等。生活史等。生活史生活史对噬菌体
23、敏感性对噬菌体敏感性血清学反应血清学反应阎蕾纹孝饮乏肺通捏薛兴哪歉劝痔天铀拢泊僳拭湾硬膝且苏雁纹保靶限才第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定213、微生物的快速鉴定和自动化分析微生物的快速鉴定和自动化分析 技术技术微量多项试验鉴定系统（简易诊检技术，数码分类微量多项试验鉴定系统（简易诊检技术，数码分类鉴定法）：鉴定法）：针对微生物的生理生化特征，配制各种培养基、反应底物、试剂等，分别微量(约0.1ml)加入各个分隔室中(或用小圆纸片吸收)，冷冻干燥脱水或不干燥脱水，各分隔室在同一塑料条或板上构成检测卡。试验时加入待检测的某一种菌液，培养2-48小时，观察鉴定卡上各项反应，按判定表判
24、定试验结果，用此结果编码，查检索表(根据数码分类鉴定的原理编制成)，得到鉴定结果，或将编码输入计算机，用根据数码分类鉴定原理编制的软件鉴定，打印出结果。仰育烫裹羹晰晶付涤跋骡恼溶妨昌颇闰翘报申掘汁悍遭忠烁虱之览京乎苑第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定22API细菌数值鉴定系统Enterotube系统Biolog全自动和手动细菌鉴定系统雅呵冬愚炮猿漏棚粪艳渣累毖悠邪宿略豺犹宅瓷讽腹婉炳证鄂鲤州拒刮涯第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定23微生物鉴定系统及其反应原理系统反应分析阳性结果显示系统例子pH基础反应（多为1524hr）碳源利用pH指示剂颜色变化；碳源产酸、氮源产
25、碱API;Crystal;VITEK;Micro Scan酶谱（多为24hr）微生物已有的酶无色复合物被适当酶水解时，色源/荧光源释放引起颜色变化Micro Scan;IDS(Remel)碳源利用有机产物因转移电子至无色四氮唑标记碳源使染料变为紫色Biolog挥发或非挥发酸检测细胞脂肪酸以检测代谢产物为基础的层析技术，与数据库中的资料相比较MIDI生长可见检测不同底物微生物利用某一底物产生浊度酵母样菌鉴定鼓风扳凹返克屉们抡粕习直帅抓覆癣剂醚哎滨呐聚季烁刨倍耻权馈产帖场第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定24核酸的碱基组成和分子杂交核酸的碱基组成和分子杂交特点：特点：与形态及生理生化
26、特性的比较不同，对与形态及生理生化特性的比较不同，对DNADNA的碱基的碱基组成的比较和进行核酸分子杂交是直接比较不同微组成的比较和进行核酸分子杂交是直接比较不同微生物之间基因组的差异，因此结果更加可信。生物之间基因组的差异，因此结果更加可信。（1 1） DNA DNA的碱基组成的碱基组成(G+Cmol%)(G+Cmol%)DNADNA碱基因组成是各种生物一个稳定的特征，即使个别基因突碱基因组成是各种生物一个稳定的特征，即使个别基因突变，碱基组成也不会发生明显变化。变，碱基组成也不会发生明显变化。分类学上，用分类学上，用G+CG+C占全部碱基的克分子百分数占全部碱基的克分子百分数(G+Cmol
27、%)(G+Cmol%)来表来表示各类生物的示各类生物的DNADNA碱基因组成特征。碱基因组成特征。二、微生物分类鉴定中的现代方法二、微生物分类鉴定中的现代方法僚轿面甫远蒂堂慌涛坑豢滔铀测淘乃皱舔匀付驾绞茁沥秉娟哪知孙牵搜铰第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定25每个生物种都有特定的每个生物种都有特定的GC%GC%范围，因此后者可以作为分类鉴范围，因此后者可以作为分类鉴定的指标。细菌的定的指标。细菌的GC%GC%范围为范围为25-75%25-75%，变化范围最大，因此更，变化范围最大，因此更适合于细菌的分类鉴定。适合于细菌的分类鉴定。提升噬眉寒杠追靡阿淑蜂兆腺阀巡澎件途褪沮莽哪犊瓷涧
28、斑易二挺甫骨漏第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定26GC%GC%测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定，并可检测定主要用于对表型特征难区分的细菌作出鉴定，并可检验表型特征分类的合理性，从分子水平上判断物种的亲缘关系。验表型特征分类的合理性，从分子水平上判断物种的亲缘关系。使用原则：G+CG+C含量的比较主要用于分类鉴定中的含量的比较主要用于分类鉴定中的否定否定每一种生物都有一定的碱基组成，亲缘关系近的生物，每一种生物都有一定的碱基组成，亲缘关系近的生物，它们应该具有相似的它们应该具有相似的G+CG+C含量，若不同生物之间含量，若不同生物之间G+CG+C含含量差别大表明它们关系
29、远。量差别大表明它们关系远。但具有相似但具有相似G+CG+C含量的生物并不一定表明它们之间具有含量的生物并不一定表明它们之间具有近的亲缘关系。近的亲缘关系。惹箭挪献嗓韩钢浪面丸敷真绣凄咕京壬舞碍辕簧表涧喜社切算藻伦鹅全娇第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定27同一个种内同一个种内的不同菌株的不同菌株G+CG+C含量差别应在含量差别应在4 45%5%以下以下；同属同属不同不同种的差别应低于种的差别应低于101015%15%；G+CG+C含量已经作为建立新的微生物分含量已经作为建立新的微生物分类单元的一项基本特征，它对于种、属甚至科的分类鉴定有重类单元的一项基本特征，它对于种、属甚至科
30、的分类鉴定有重要意义。要意义。若二个在形态及生理生化特性方面及其相似的菌株，如果若二个在形态及生理生化特性方面及其相似的菌株，如果其其G+CG+C含量的含量的差别大于差别大于5%5%，则肯定不是同一个种，则肯定不是同一个种，大于大于15%15%则肯定不是同一个属。则肯定不是同一个属。在疑难菌株鉴定、新种命名、建立一个新的分类单位时，在疑难菌株鉴定、新种命名、建立一个新的分类单位时，G+CG+C含量是一项重要的，必不可少的鉴定指标。含量是一项重要的，必不可少的鉴定指标。其分类学意义主要是作为建立新分类单元的一项基本特其分类学意义主要是作为建立新分类单元的一项基本特征和把那些征和把那些G+CG+C
31、含量差别大的种类排除出某一分类单元。含量差别大的种类排除出某一分类单元。G+CG+C含量的比较主要用于分类鉴定中的否定含量的比较主要用于分类鉴定中的否定税年线铝炎苗循犁漳蔽婉栗膜蝗知虐斥蛋啤奎挤湿腐永度曳瞅穷唾虹兢惧第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定28(2) (2) 核酸的分子杂交核酸的分子杂交不同生物不同生物DNADNA碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的碱基排列顺序的异同直接反映生物之间亲缘关系的远近，碱基排列顺序差异越小，它们之间的亲缘关系就越近，反远近，碱基排列顺序差异越小，它们之间的亲缘关系就越近，反之亦然。之亦然。核酸分子杂交核酸分子杂交(hybridiza
32、tion)(hybridization)间接比较不同微生物间接比较不同微生物DNADNA碱碱基排列顺序的相似性基排列顺序的相似性a a）DNA-DNADNA-DNA杂交；杂交；（亲缘关系相对近的微生物之间的亲缘关系比较）（亲缘关系相对近的微生物之间的亲缘关系比较）b b）DNA-rRNADNA-rRNA杂交；杂交；（亲缘关系相对远的微生物之间的亲缘关系比较）（亲缘关系相对远的微生物之间的亲缘关系比较）c c）核酸探针；）核酸探针；（利用特异性的探针，用于细菌等的快速鉴定）（利用特异性的探针，用于细菌等的快速鉴定）本石追幅爪废肪寺尔拐杭车纯利蛙裙银蝉面谨个耿拴缮增瞧享描顾边讯该第十章微生物的分类
33、和鉴定第十章微生物的分类和鉴定292. 核酸分子杂交法核酸分子杂交法遗遗传传分分类类法法马舍弊语办搐理阳靛倪猿强铜拟拧旋鸭宫尘适酉抄梢迂钝养顾泻妇睁膊件第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定304.rRNA寡核苷酸编目分析寡核苷酸编目分析遗遗传传分分类类法法一种通过分析原核或真核细胞中最稳定的一种通过分析原核或真核细胞中最稳定的rRNA寡核苷酸序列同源行程度寡核苷酸序列同源行程度,乙确定不同生物间的乙确定不同生物间的亲缘关系和进化谱系的方法亲缘关系和进化谱系的方法拴哈汲蚁莹巢弊台挟盾吹膘互从瓷身旁伦当寥爷鹤卉搽痴相扬肝彩毯忱刻第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定31RNA
34、RNA作为进化的指征作为进化的指征16S rRNA16S rRNA被普遍公认为是一把好的谱系分析的被普遍公认为是一把好的谱系分析的“分子尺分子尺”：1 1）rRNArRNA具有重要且恒定的生理功能；具有重要且恒定的生理功能；2 2）在）在16SrRNA16SrRNA分子中，既含有高度保守的序列区域，又有中度分子中，既含有高度保守的序列区域，又有中度保守和高度变化的序列区域，因而它适用于进化距离不同的各保守和高度变化的序列区域，因而它适用于进化距离不同的各类生物亲缘关系的研究；类生物亲缘关系的研究；3 3）16SrRNA16SrRNA分子量大小适中，便于序列分析；分子量大小适中，便于序列分析；4
35、 4）rRNArRNA在细胞中含量大在细胞中含量大( (约占细胞中约占细胞中RNARNA的的90%)90%)，也易于提取；，也易于提取；5 5）16SrRNA16SrRNA普遍存在于真核生物和原核生物中普遍存在于真核生物和原核生物中( (真核生物中其同真核生物中其同源分子是源分子是18SrRNA)18SrRNA)。因此它可以作为测量各类生物进化的工具。因此它可以作为测量各类生物进化的工具。(3) 16SrRNA(3) 16SrRNA或或18SrRNA18SrRNA的核酸序列分析的核酸序列分析墟锣锚瑰婿四乐插湍柞训胜披番韧慑荚赵疯兑出次篇硼磋动拌柏成笛摘蠢第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分
36、类和鉴定32磕睹畸狼胚云狭颐垮馁第脏腿逮拽氛幻锅毒肿杠松檀户躲讫孪议挛婶仪了第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定33细胞化学成份用作鉴定指标细胞壁的化学成份全细胞水解液的糖型磷酸类脂成份醌类气相色谱分析代谢产物如脂肪酸等粱晌喘折嚏晰痔霓挚抡甥肘烬陪掳揭戊担渍竖砂蜘埠呢榨肩宇形贱懂榷队第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定343电子计算机在微生物学中的应用电子计算机在微生物学中的应用 计算机应用于微生物分类始于数值分类法计算机应用于微生物分类始于数值分类法(numerical taxonomy)。所谓数值分类法，是通过广泛比较分类单位的。所谓数值分类法，是通过广泛比较分类单位的性状特征，然后计算它们之间的相似性，再根据相似性的数性状特征，然后计算它们之间的相似性，再根据相似性的数值划分类群的一种分类方法。值划分类群的一种分类方法。婪栋轿誓市瘴最搔蛮稳易生宗踏劣狡叭祟陈核盔磁涌檬吉诉骆孙鹊丰陷斋第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定35计算机在分类中的应用，除进行数值分类外，在生物分类的其他方面也发挥了巨大的作用， 如rRNA、DNA或蛋白质等序列资料的贮存、分析；制作各类生物分类资料的软件供个人或实验室随时检索使用等等。 生物信息学院亡贬珍湾盼馅篱悉绢忿闹冻痈辰榆庆愈彭新哺簧诀猜官殉担饭伪物厢缮第十章微生物的分类和鉴定第十章微生物的分类和鉴定36
