质粒DNA的提取及电泳

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1、分子生物学实验当你翻开书本的时候,你必须尽可能地展开想象的“翅膀”,否则,你就不能走在别人的前面;而当你进入实验室时,要象脱下你的外衣那样脱下你的想象力,因为实验操作中不能有一丁点儿的想象,否则,你对事物的观察就会受到影响。实验相关知识1、实验准备:2、实验室安全与卫生3、分组与实验操作4、实验报告与成绩评定离心机的使用移液器的使用实验一、质粒DNA的提取纯化1实验目的:学习与掌握最常用的质粒DNA的提取与纯化方法2实验原理:碱变性抽提质粒DNA是基于染色体DNA与质粒DNA的变性与复性的差异而达到分离的目的。nDNA是具有一定结构的物质,一些特殊的环境会导致DNA变性,如加热、极端PH值、有

2、机溶剂、尿素、酰胺试剂等,而适宜的环境又可以使DNA复性nSDS是一种阴离子表面活性剂,即可使细菌裂解,又可使蛋白变性,因此用SDS处理细菌会导致细菌细胞壁的破裂,从而使质粒DNA和基因组DNA同时从细胞中释放出来。n释放出的DNA在强碱的作用下发生变性,再用酸性醋酸钾(KAc)缓冲液中和,质粒DNA迅速复性,而基因组DNA分子量太大不能复性。n离心后,质粒DNA在上清中,而基因组DNA与细胞碎片一起沉淀至离心管底部。n通过这种方法即可将质粒DNA从细菌中提取出来3试剂准备 1.溶液: 50mM葡萄糖,25mM Tris-HCl(pH 8.0),10mM EDTA(pH 8.0)。1M Tri

3、s-HCl(pH 8.0)12.5ml,0.5M EDTA(pH 8.0)10ml,葡萄糖4.730g,加ddH2O至500ml。高压灭菌15min ,贮存于4。2.溶液:0.2N NaOH,1% SDS。0.4N NaOH,2%SDS使用前等体积混合,临时配置。3.溶液:醋酸钾(KAc)缓冲液,pH 4.8。5M KAc 60ml,冰醋酸 11.5ml,加ddH2O至100ml。4保存备用。4.酚/氯仿/异戊醇(25:24:1)4操作步骤 1.在50毫升的LB培养基中加入50微升氨苄青霉素(终浓度50微克/毫升),接入含PUC19的大肠杆菌,37度过夜培养。2.取1ml培养物入微量离心管中,

4、室温离心12000转30s,弃上清,将离心管倒置,使液体尽可能流尽,将10毫升菌体收集在1个小指管中。3.将细菌沉淀重悬于100l预冷的溶液中,剧烈振荡,使菌体分散混匀。4.加200l新鲜配制的溶液,颠倒数次混匀(不要剧烈振荡),并将离心管放置于冰上2-3min2-3min,使细胞膜裂解(溶液为裂解液,故离心管中菌液逐渐变清)。5.加入150l预冷的溶液,将管温和颠倒数次混匀,见白色絮状沉淀,可在冰上放置15min。12000转,10分钟,将上清移到另一个小指管中。 (溶液为中和溶液,此时质粒DNA复性,染色体和蛋白质不可逆变性,形成不可溶复合物,同时K+使SDS-蛋白复合物沉淀。)5.加入等

5、体积的酚/氯仿/异戊醇,振荡混匀,离心12000转 10min,将上清移到另一个小指管中。6.加入等体积的氯仿/异戊醇,振荡混匀,离心12000转 10min,将上清移到另一个小指管中。7.加入2倍体积预冷的无水乙醇,旋涡混匀,-20 放置30min,离心12000转10min,去上清。8.1ml预冷的70%乙醇洗涤沉淀2次(每次离心12000转5min),弃上清,将沉淀在室温下晾干。9.沉淀溶于20l TE缓冲液(超纯水), -20保存备用。 实验二、质粒实验二、质粒DNADNA的琼脂糖凝胶电泳的琼脂糖凝胶电泳 1 1实验目的:实验目的:学习水平式琼脂糖凝胶电泳,检测DNA的构型 2 2实验

6、原理:实验原理:闭合环状质粒、线性质粒和开环质粒DNA由于构形不同,在加溴化乙锭的琼脂糖凝胶电泳上呈现不同的迁移率,因而在紫外灯下观察,能区别闭合环状质粒DNA、线性质粒DNA和开环质粒DNA。 3实验方法实验方法 1.选择合适的水平式电泳槽,调节电泳槽平面至水平。2.选择孔径大小合适的点样梳子,垂直架在电泳胶模的一端,使点样梳子底部离电泳胶模底部的距离为1.0mm。 3.制备1%琼脂糖凝胶。 (0.2克琼脂糖,加20毫升0.5倍的TBE)4.将电泳胶模四周密封好,防止浇灌琼脂糖凝胶板时发生渗透。待琼脂糖凝胶冷却至60左右时,加入一滴溴化乙锭,摇匀,轻轻倒入电泳胶模中,琼脂糖凝胶的厚度在35m

7、m。倒胶时要避免产生气泡,若有气泡可用吸管小心吸去。 5.琼脂糖凝胶凝固后,在室温放置20分钟,小心拔掉点样梳子和电泳胶模两端的挡板,保持点样孔的完好。 6.将电泳胶模放入电泳槽中,加入电泳缓冲液,使电泳缓冲液面高出琼脂糖凝胶表面12mm。如点样孔内有气泡,用吸管小心吸出,以免影响加样。 7.将DNA样品与1/5体积的溴酚蓝指示剂点样缓冲液混合。8.用微量移液器将样品小心加入加样孔内,记录样品点样秩序。 9.盖上电泳槽,开启电源开关,最高电压不超过5V/cm(100150V恒压电泳),使DNA从负极向正极移动。 10.电泳一般需12小时。电泳完毕后关闭电源,戴一次性塑料手套取出凝胶,尽可能将所有的电泳缓冲液淋干,在紫外灯下观察。

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