chemsketch简介课件

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1、制制作:鲍霞作:鲍霞计算机在化学中的应用 Chemsketch Chemsketch 简简介介chemsketch简介Chemsketch简介目目 录录 1 什么是什么是ACD/ChemSketch 2 ACD/ChemSketch主要功能主要功能 3 安装、启动安装、启动ACD/ChemSketch 4 画简单结构画简单结构 5 画复杂结构画复杂结构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 6 超级结构超级结构 7 高级画法高级画法 8 创建特殊的图象对象创建特殊的图象对象 9 其他功能其他功能 10 附加功能附加功能2024年8月2日chemsketch简介Che

2、msketch简介 ACD/ChemSketch是高级化学发展有限公是高级化学发展有限公司司(ACD)设计的用于化学画图用软件包,该软设计的用于化学画图用软件包,该软件包可单独使用或与其他软件共同使用。该软件包可单独使用或与其他软件共同使用。该软件可用于画化学结构、反应和图形。也可用于件可用于画化学结构、反应和图形。也可用于设计与化学相关的报告和出版物。设计与化学相关的报告和出版物。1 什么是什么是ACD/ChemSketch2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介结构模式:用于画化学结构和计算它们的性质。结构模式:用于画化学结构和计算它们的性质。画图模式:用于文本和

3、图象处理。画图模式:用于文本和图象处理。分子性质模式(对以下性质进行估算):分子性质模式(对以下性质进行估算): 分分子子量量、组组成成、摩摩尔尔折折射射率率、摩摩尔尔体体积积、等等张张比容、折射率、表面张力、密度比容、折射率、表面张力、密度 、介电常数、极性、介电常数、极性 2 ACD/ChemSketch主要功能主要功能2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 ACD/ChemSketch 可以作为画图软件包单可以作为画图软件包单独使用,也可作为其他独使用,也可作为其他ACD软件的终端使用,如软件的终端使用,如NMR预测软件。预测软件。 ACD/Tautomers

4、 检查并生成有机结构的最检查并生成有机结构的最常见的异构体。常见的异构体。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 ACD/Dictionary包含包含48,000个化学和生物中个化学和生物中常见的系统和非系统命名的化合物。全部覆盖常见的系统和非系统命名的化合物。全部覆盖200多多个领域。包括超过个领域。包括超过500种不同酶的名称和结构。种不同酶的名称和结构。(只有只有商业版有商业版有)。 ACD/pKa预测软件预测软件 计算酸在计算酸在25度下的电离常度下的电离常数,特殊结构化合物的离子校正系数数,特殊结构化合物的离子校正系数(必须作为必须作为ACD/ChemSk

5、etch 的附件购买的附件购买)2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 ACD/LogP 预测软件预测软件 计算中性分子的醇计算中性分子的醇/水分水分配系数配系数(LogP)预测值预测值(必须作为必须作为ACD/ChemSketch 的附件购买的附件购买) ACD/沸点与蒸汽压预测软件沸点与蒸汽压预测软件 计算从计算从0.001 mmHg到到10个个atm下任意压力下的沸点,一般情况下任意压力下的沸点,一般情况下精确到下精确到10更好更好(必须作为必须作为ACD/ChemSketch 的附件购买的附件购买)2024年8月2日chemsketch简介Chemsketc

6、h简介 ACD/预测溶解度软件预测溶解度软件 计算不同计算不同pH值下的溶解值下的溶解性性(必须作为必须作为ACD/ChemSketch 的附件购买的附件购买)。 包括第二排和第三排元素的化合物性质的预测包括第二排和第三排元素的化合物性质的预测更加准确,如折射率、摩尔体积、密度的估算等。更加准确,如折射率、摩尔体积、密度的估算等。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介3 安装、启动安装、启动ACD/ChemSketch 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介结构结构(Structure)和绘图和绘图(Draw)。结构模式结构模式:画化学

7、结构。:画化学结构。绘图模式绘图模式:提供工具用于创建:提供工具用于创建海报、报告和反应图海报、报告和反应图4 画简单结构画简单结构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 当您在元素周期表中选择新的原子时,在原子当您在元素周期表中选择新的原子时,在原子工具栏中自动增加了相应的按钮。当您要将其从原工具栏中自动增加了相应的按钮。当您要将其从原子工具栏中去除它时,双击它即可。子工具栏中去除它时,双击它即可。 若想改变您创造的结构的性质若想改变您创造的结构的性质(如创建一个粗如创建一个粗键或增加原子的字体键或

8、增加原子的字体),首先单击选择,首先单击选择/移动按钮,移动按钮,再双击结构的任意部分,将弹出性质面板任何改变再双击结构的任意部分,将弹出性质面板任何改变将只影响选定部分。若想改变整个结构,要保证选将只影响选定部分。若想改变整个结构,要保证选定了全部结构。定了全部结构。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介调整屏幕按钮调整屏幕按钮 实际尺寸实际尺寸 全屏幕全屏幕 全部调整全部调整 选择调整选择调整 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介使用常用画图工具使用常用画图工具 设定垂直键按钮设定垂直键按钮延长链延长链氟取代(取代某个基团)氟取代

9、(取代某个基团)打开元素周期表打开元素周期表2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介连续画图工具连续画图工具用于原子用于原子“衍生衍生”:选择:选择F原子,原子, 点击某个点击某个碳原子,双击以碳原子,双击以“衍生衍生”出出F原子,在同一碳原子原子,在同一碳原子上双击,以上双击,以“衍生衍生”第二个第二个F原子原子 。(取代碳上的。(取代碳上的氢)氢)使用鼠标画图使用鼠标画图2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介“清洁清洁”:使键长和角度平均:使键长和角度平均化化2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介远离您的键远

10、离您的键 指向您的键指向您的键 等同键等同键 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介编辑原子标签工具编辑原子标签工具 点击原子标签工具点击原子标签工具 按钮,然后将鼠标移动到结按钮,然后将鼠标移动到结构中最右端的构中最右端的F原子上。再打开的编辑标签原子上。再打开的编辑标签(Edit Label)对话框中,键入对话框中,键入(CH2)3PH,再点击插入键,再点击插入键(Insert ),画出如下结构。,画出如下结构。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 利用已激活的编辑原子标签工具利用已激活的编辑原子标签工具(Edit Atom Lab

11、el),点击已得到的缩写,将编辑标签对话框再,点击已得到的缩写,将编辑标签对话框再次打开,点击次打开,点击“展开展开”(Expand)键,得到如下结构键,得到如下结构 :2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 在编辑标签对话框中键入在编辑标签对话框中键入(OH)2SCl2,点击插入键,点击插入键(insert),注意标签被自动插入),注意标签被自动插入指定位置,并自动生成索引。指定位置,并自动生成索引。 选择改变位置工具,点击选择改变位置工具,点击标签使其变为标签使其变为 :目标化合物目标化合物2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 按按

12、下下SHIFT键键,点点击击标标签签三三次次,以以改改变变标标签签上上连接的原子。连接的原子。 在结构工具栏中,点击设定水平键在结构工具栏中,点击设定水平键 按钮,点击按钮,点击指定的键,将原结构转变为如下形式:指定的键,将原结构转变为如下形式: 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介翻转结构翻转结构 水平键水平键 垂直键垂直键翻转键翻转键上下翻转键上下翻转键左右翻转键左右翻转键 设定水平健、垂直健设定水平健、垂直健或健的翻转,首先选择相或健的翻转,首先选择相应的按钮,再点击相应的应的按钮,再点击相应的健即可。健即可。 进行上下翻转和左进行上下翻转和左右翻转,首先选

13、择目标结右翻转,首先选择目标结构和或图象,点击相应的构和或图象,点击相应的按钮即可。按钮即可。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介5 画复杂结构画复杂结构5.1 使用原子团表使用原子团表5.2 使用环结构使用环结构5.3 删除原子和图象删除原子和图象 5.4 替换原子替换原子5.5 设定双键和叁键设定双键和叁键5.6 标定电荷标定电荷5.7 显示原子性质显示原子性质2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介5.1 使用原子团表使用原子团表2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介点击COOH按钮 点击设定垂直键按钮

14、5.2 使用环结构使用环结构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介删除结构中的所有羟基和羧基:删除结构中的所有羟基和羧基:1. 依次删除每个原子;依次删除每个原子;2. 一次自动删除所有原子。一次自动删除所有原子。 5.3 删除原子和图象删除原子和图象2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介5.4 替换原子替换原子注意:注意:在连续画图模式下,不能替换原子在连续画图模式下,不能替换原子2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介5.5 设定双键和叁键设定双键和叁键2024年8月2日chemsketch简介Chemske

15、tch简介 当您使用电荷按钮或对一个非金属的原子进行电当您使用电荷按钮或对一个非金属的原子进行电荷标定时,相应的氢原子也随之加减,以保证化合荷标定时,相应的氢原子也随之加减,以保证化合价的正确。如果您对一个金属原子进行电荷标定,价的正确。如果您对一个金属原子进行电荷标定,电荷的增减决定于它自身的化合价。电荷的增减决定于它自身的化合价。 5.6 标定电荷标定电荷2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 原子的化合价或同位素质量,或者改变原原子的化合价或同位素质量,或者改变原子的大小,点击选择子的大小,点击选择/移动按钮。双击需要改变移动按钮。双击需要改变性质的原子。这时

16、出现性质对话框。性质的原子。这时出现性质对话框。 5.7 显示原子性质显示原子性质2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介6 超级结构6.1 2D优化v创建环烷烃结构创建环烷烃结构v画环形的氨基酸画环形的氨基酸 6.2 3D优化v创建双创建双2,2,2环己烷结构、三将军结构环己烷结构、三将军结构v创建三环己烷结构创建三环己烷结构v3D画法:画法:show3Dv创建一个库班创建一个库班(Cubane)v创建一个十二面体结构创建一个十二面体结构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介6.1 2D优化优化创建环烷烃结构创建环烷烃结构 练习:用以上方

17、法画练习:用以上方法画10个碳和个碳和8个碳的环。个碳的环。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介画环形的氨基酸画环形的氨基酸 TyrAlaTrp注意:注意:在固定原子团前,可通过按在固定原子团前,可通过按TAB键翻转原子团。键翻转原子团。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介练习画如下缩氨酸:练习画如下缩氨酸:PheLeuOrnVal Pr

18、o Pro ValOrnLeuPhe2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介如何创建一个含有非标准角度和键长的结构。如何创建一个含有非标准角度和键长的结构。重要一点:重要一点: 先去掉位于结构表中性质对话框中增加氢原子先去掉位于结构表中性质对话框中增加氢原子标记。标记。options-preferences-structure 6.2 3D优化优化2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介创建双创建双2,2,2环己烷结构、三将军结构环己烷结构、三将军结构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chem

19、sketch简介Chemsketch简介创建三环己烷结构创建三环己烷结构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介注意:注意: 选定了结构表选定了结构表(Structure tab)中性质对话框中性质对话框(Preferences dialog box)中的)中的3D旋转模式检查旋转模式检查对话框,当对话框,当3D优化后,将自动进行优化后,将自动进行3D旋转。旋转。 可通过选择结构表中性质对话框中的交叉键选项,可通过选择结构表中性质对话框中的交叉键选项,使背景键使背景键(background bond)断开或不被标记。断开或不被标记。2024年8月2日chemsketc

20、h简介Chemsketch简介 可通过使键向前可通过使键向前(Bring Bond to front)或使键或使键向后向后(Send Bond to Back)命令,改变您感兴趣的命令,改变您感兴趣的键的位置。键的位置。可在改变位置可在改变位置(Change Position) 工具激活时,工具激活时,按下按下SHIFT键,点击键将其由后面转到前面。键,点击键将其由后面转到前面。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介3D画法:画法:show3D2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsket

21、ch简介注意:注意: 如如果果工工作作区区中中有有多多个个结结构构,先先利利用用选选择择工工具具选选取取将将进进行行3D优优化化的的结结构构(您您可可以以利利用用选选择择/移移动动、选选择择/移动移动/调整、调整、3D旋转工具旋转工具) 。 选定选定3D旋转旋转(3D Rotation) 工具,将鼠标放置在工具,将鼠标放置在任意原子或键上,在工作区拖动鼠标旋转结构,直到任意原子或键上,在工作区拖动鼠标旋转结构,直到它成为您需要的结构。它成为您需要的结构。 在工具菜单中选择显示芳香性命令,显示如下芳在工具菜单中选择显示芳香性命令,显示如下芳香性环:香性环: 2024年8月2日chemsketch

22、简介Chemsketch简介点击点击3D优化按钮优化按钮 创建一个库班创建一个库班(Cubane)2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介练练习习2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介创建一个十二面体结构创建一个十二面体结构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介4,6Fullerene-C24 5,6Fullerene-C24 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介7高级画法高级画法n7.1 插入模型工具插入模型工具n7

23、.2 画结构式的原子团表画结构式的原子团表n7.3 来自模型窗口的模型来自模型窗口的模型n7.4 画复杂的生物化学结构画复杂的生物化学结构n7.5 定义用户模型定义用户模型2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介模型模型 原子基团表原子基团表(Table of Radicals)模型窗口模型窗口(Template Window)插入模型工具插入模型工具(Instant Template tool) 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介将模型连接到结构上有以下几种方法:将模型连接到结构上有以下几种方法: 通过连接结构与模型的键:通过连接结构

24、与模型的键: 将鼠标的指针指将鼠标的指针指向特定的键,使结构的键和模型的影子结合,再向特定的键,使结构的键和模型的影子结合,再点击鼠标。点击鼠标。 通过模型接近结构:将鼠标指向结构中相应通过模型接近结构:将鼠标指向结构中相应的原子,产生连接键后,点击鼠标。的原子,产生连接键后,点击鼠标。 通过模型和结构之间的螺旋线连接:将鼠标通过模型和结构之间的螺旋线连接:将鼠标指向要连接的原子,按下指向要连接的原子,按下SHIFT键,点击鼠标。键,点击鼠标。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介创建一个环形结构创建一个环形结构选选择择插插入入模模型型工工具具,点点击击箭箭头头所所

25、指指原原子子,创创建一个插入模型。点击箭头所指原子,接上模型。建一个插入模型。点击箭头所指原子,接上模型。 7.1 插入模型工具插入模型工具2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介选择正常画图工具,点击指定的选择正常画图工具,点击指定的原子,完成环原子,完成环 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介创建荧光胺的结构创建荧光胺的结构 7.2 画结构式的原子团表画结构式的原子团表2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 在左侧原子工具表中选定氧按钮在左侧

26、原子工具表中选定氧按钮 (注意此时注意此时正常画图工具自动激活正常画图工具自动激活),点击指定的原子,用氧,点击指定的原子,用氧取代。点击鼠标右键,选择连续画图工具,双击取代。点击鼠标右键,选择连续画图工具,双击指定的原子,连接指定的原子,连接OH集团。集团。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介创建一个创建一个DNA分子图象分子图象7.3 来自模型窗口的模型来自模型窗口的模型2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 点击工作区复制选定点击工作区复制选定的模型。的模型。 按

27、下按下SHIFT键,键,移动鼠标到指定原子,点移动鼠标到指定原子,点击以连接下一个去氧核糖击以连接下一个去氧核糖-5-磷酸盐图象。磷酸盐图象。 画脱氧核糖画脱氧核糖-5-磷酸盐链的图象磷酸盐链的图象2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 选定选择选定选择/旋转旋转/调整大小工具。通过拖动矩形调整大小工具。通过拖动矩形选择框选定结构中指定部分,将动作中心拖到指定选择框选定结构中指定部分,将动作中心拖到指定的氧原子上。按下的氧原子上。按下SHIFT键,拖动结构中选定部分键,拖动结构中选定部分顺时针旋转顺时

28、针旋转90度。度。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介1、打开模型窗口,由、打开模型窗口,由DNA/RNA中通过点击将连中通过点击将连接的原子选择您需要的碱基。接的原子选择您需要的碱基。2、将鼠标移动到指定的原子上,按下、将鼠标移动到指定的原子上,按下SHIFT键,键,点击鼠标。点击鼠标。 注意:在固定模型的影子之前,您可以点击注意:在固定模型的影子之前,您可以点击TAB键将其翻转。键将其翻转。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介重复步骤重复步骤2给其他核甘酸添加碱基。给其他核甘酸添加碱基。2024年8月2日chemsketch简介

29、Chemsketch简介创建创建-麦芽糖酶麦芽糖酶(-Maltose)结构结构 7.4 画复杂的生物化学结构画复杂的生物化学结构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介1、点击打开模型窗口按钮。、点击打开模型窗口按钮。2、选择、选择Sugars:alpha-D-Pyr 表,确表,确认您看到的是认您看到的是1(4)Haworth Formulae 页,页, 如果不是,点击右边箭头,直到找到为止。如果不是,点击右边箭头,直到找到为止。3、点点击击-D-Glucopyranose 糖糖,在在工工作作区区点点击击复复制。制。4、重复、重复1-3步骤,选择步骤,选择D-糖表糖表

30、(beta-D-pyranose) ,选择,选择-D-Glucopyranose. 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介5、在在ChemSketch 窗窗口口中中,点点击击将将其其放放置置在在第第一个结构的右边一个结构的右边。 6、 选选 择择 ChemSketch碳碳 原原 子子 按按 钮钮 , 在在 -D-Glucopyranose 中中点点击击指指定定的的原原子子 ,用用CH3集集团团取取代代它它,按按下下SHIFT 键键,将将CH3集集团团拖拖动到右边,以形成动到右边,以形成90键。键。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 7

31、、对对-d-glucopyranose结结构构重重复复步步骤骤3,得到如下结构:得到如下结构:8、选择、选择O原子,点击原子,点击-D-Glucopyranose结构结构中指定的原子。中指定的原子。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介9、选选定定选选择择/移移动动 按按钮钮,点点击击工工作作区区附附近近,选选定定结结构构。将将鼠鼠标标放放在在结结构构的的任任意意原原子子或或键键上上,向向左拖动直到左拖动直到OH和和CH3集团连接成键。集团连接成键。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介注意:注意: 通通 过过 选选 择择 工工 具具

32、菜菜 单单 中中 的的 移移 去去 氢氢 原原 子子 功功 能能(Remove Hydrogens),将将选选定定结结构构中中的的氢氢原原子子隐藏起来。隐藏起来。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 尽尽管管与与中中心心氧氧原原子子连连接接的的碳碳原原子子被被隐隐藏藏起起来来,但但它它是是存存在在的的。如如果果在在您您的的任任务务中中,它它的的化化学学意意义义很很重重要要,您您可可以以将将它它们们去去掉掉。激激活活选选择择/移移动动工工具具(Select/Move),双双击击需需要要隐隐藏藏的的原原子子。当当选选项项菜菜单单出出现现后后,选选择择原原子子表表 ,选

33、选择择元元素素符符号号按按钮钮(Atom Symbol) , 右右 下下 拉拉 菜菜 单单 中中 选选 择择 空空(Empty) ,点击应用,点击应用(Apply)。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介练练 习习b-Cellobiose 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介7.5 定义用户模型定义用户模型 将一个将一个ChemSketch文件保存为模型文件文件保存为模型文件 将您的当前文件保存为将您的当前文件保存为SK2形式,或在形式,或在ChemSketch中打开中打开SK2文件。文件。 由模型菜单中选择保存用户模型命令。由模型菜单

34、中选择保存用户模型命令。 在保存用户模型对话框中键入模型的名字,并注在保存用户模型对话框中键入模型的名字,并注意文件保存的路径,如意文件保存的路径,如“CACD40Templates alkaloids.sk2”,再点击,再点击OK。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介注意:注意: 您可以为您的文件键入任意名字您可以为您的文件键入任意名字(例如:对于例如:对于b_d_fur.sk2文件,文件,Sugare:beta-D-Furanose这这样的名字可能更好一些。样的名字可能更好一些。) 您可以从任何文件创建模型文件,即使它是关闭您可以从任何文件创建模型文件,即使

35、它是关闭的也可以。打开模型管理器对话框的也可以。打开模型管理器对话框(模型菜单中模型菜单中),点击新按钮,找到您需要的文件,为其指定名字即点击新按钮,找到您需要的文件,为其指定名字即可。可。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 一旦您的文件被保存为用户模型,它的名字被自一旦您的文件被保存为用户模型,它的名字被自动加到模型管理器中和模型窗口的模型清单中。动加到模型管理器中和模型窗口的模型清单中。 您可以对用户模型进行如下操作:您可以对用户模型进行如下操作: 快速找到文件并将其打开进行编辑。从模型清单快速找到文件并将其打开进行编辑。从模型清单中中(模型管理器中模型管

36、理器中)选定您需要的文件,点击打开按钮。选定您需要的文件,点击打开按钮。 将您的文件的任意部分复制到工作区将您的文件的任意部分复制到工作区(结构或图结构或图象象)而不必打开文件:在模型清单中找到您需要的文而不必打开文件:在模型清单中找到您需要的文件,点击它并将其放在工作区即可。件,点击它并将其放在工作区即可。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介8创建特殊的图象对象创建特殊的图象对象n8.1 反应能量图反应能量图n8.2 画轨道图画轨道图n8.3 画脂肪和胶体画脂肪和胶体n8.4 创建广告画创建广告画n8.5 画画DNA双螺旋双螺旋n8.6 画实验装置画实验装置 精

37、熘精熘2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介8.1 反应能量图反应能量图选择绘图模式并选择多线工具,画一条曲线选择绘图模式并选择多线工具,画一条曲线 。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介1、从曲线起点向右画出控制线。、从曲线起点向右画出控制线。2、释放鼠标按钮。、释放鼠标按钮。3、向上移动鼠标画出曲线的第、向上移动鼠标画出曲线的第一部分。一部分。8.1.1 画一条曲线画一条曲线 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介4、向右水平延长控制线。通过改变控制线的长度、向右水平延长控制线。通过改变控制线的长度您可

38、以改变曲线的形式。您可以改变曲线的形式。5、释放鼠标按钮。、释放鼠标按钮。6、向下移动鼠标画出下一部分。、向下移动鼠标画出下一部分。7、重复以上步骤画出下面两部分。、重复以上步骤画出下面两部分。8、点击鼠标右键结束画曲线。、点击鼠标右键结束画曲线。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介8.1.2 画画X轴和轴和Y轴轴 首先画出线,再画箭头。首先画出线,再画箭头。 1、选择画线按钮、选择画线按钮 。2、按下、按下SHIFT键,向下拖动鼠标画出键,向下拖动鼠标画出Y轴。轴。3、将鼠标移动到起点,鼠标左键。、将鼠标移动到起点,鼠标左键。4、按下、按下SHIFT键,向右移动

39、鼠标画出键,向右移动鼠标画出X轴。轴。方法方法12024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介5、当、当X轴符合长度后,释放鼠标和轴符合长度后,释放鼠标和SHIFT键。键。此时两条线成此时两条线成90度。度。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介1. 选定选定Y轴,并点击箭头按钮。轴,并点击箭头按钮。2. 通过点击右侧的小箭头打开下级菜单。通过点击右侧的小箭头打开下级菜单。方法方法22024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介3、在左边框中选择合适的箭头,点击应用。、在左边框中选择合适的箭头,点击应用。4、同样对、同样对X轴

40、选取箭头,注意箭头的方向。轴选取箭头,注意箭头的方向。5、选定箭头对话框,点击左上角。、选定箭头对话框,点击左上角。6、使用文本命令、使用文本命令 加入注释,再选择加入注释,再选择90度。度。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介8.2 画轨道图画轨道图选定画图模式选定画图模式 进行以下操作,画出这样的轨道进行以下操作,画出这样的轨道 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介选定多角选定多角(Polygon)模式模式1.由起点向右移动水平鼠标,以画出轨道的控制线。由起点向右移动水平鼠标,以画出轨道的控制线。2.释放鼠标。释放鼠标。3.向下

41、移动鼠标,画出轨道的全部。向下移动鼠标,画出轨道的全部。4.点击轨道。点击轨道。5.点击鼠标右键两次,结束画轨道。切换到选择点击鼠标右键两次,结束画轨道。切换到选择/移移动动/调整大小调整大小(Select/Move/Re-size) 工具。工具。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介5、将光标放在选定的轨道上,按下、将光标放在选定的轨道上,按下CTRL键,向键,向下拖动鼠标画出轨道的下半部分。下拖动鼠标画出轨道的下半部分。6、选择上下翻转、选择上下翻转(Flip Top to Bottom)按钮,点按钮,点击鼠标左键改变填充颜色的轨道。击鼠标左键改变填充颜色的轨

42、道。7、在调色盘中点击灰色按钮,点击鼠标左键将轨、在调色盘中点击灰色按钮,点击鼠标左键将轨道颜色改变。道颜色改变。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介1、选定椭圆工具,按下、选定椭圆工具,按下SHIFT键在工作区画出圆,键在工作区画出圆,将圆涂成黑色。将圆涂成黑色。2、选定多线工具、选定多线工具 ,在圆附近点击鼠标画出碳链,点,在圆附近点击鼠标画出碳链,点击鼠标右键结束。击鼠标右键结束。8.3 画脂肪和胶体画脂肪和胶体2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介3、选定编辑交点工具、选定编辑交点工具 a)通过选择矩形选定所有的点,通过选择矩形

43、选定所有的点,注意选定的点变为黑色。注意选定的点变为黑色。 b)点击转换成曲线按钮点击转换成曲线按钮 ,再,再点击平滑按钮。点击平滑按钮。 c)点击鼠标右键转换到选择点击鼠标右键转换到选择/移动移动/调整调整/大小工具。大小工具。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介4、按下、按下CTRL键,将鼠标放在曲线上,键,将鼠标放在曲线上,对曲线进行复制。对曲线进行复制。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介5、拖动曲线如图安排。、拖动曲线如图安排。 如如果果您您利利用用群群按按钮钮(Group) 将将所所有有的的元元素素选选定定,您您可可以以

44、将将它它们们象象一一个个对对象象一一样样处处理理,如如使使用用选选择择/移移动动/旋转旋转 工具使其旋转。工具使其旋转。 使用复制命令使用复制命令(CTRL+拖动拖动),群群(Group)、旋转、旋转90度度(Rotate 90),选择,选择/移动移动/旋转等命令,包括旋转等命令,包括合并合并(aligning)和翻转工具和翻转工具(flipping),您可以画出如下的图形:,您可以画出如下的图形:2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 使用复制命令使用复制命令(CTRL+拖动拖动),群,群(Group)、旋、旋转转90度度(Rotate 90),选择,选择/移动移

45、动/旋转旋转(Select/ Move/Rotate)等命令,包括合并等命令,包括合并(aligning)和翻和翻转工具转工具(flipping),画出如下的图形:,画出如下的图形: 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 在文件菜单在文件菜单(File)中选择设置页命令中选择设置页命令(Page Setup)。在出现的对话框中选择广告表。在出现的对话框中选择广告表(Poster tab),点击旋转按钮,点击旋转按钮(spin),设定您的广告中标,设定您的广告中标准页数,请注意您可以看到软件会在虚拟页中自准页数,请注意您可以看到软件会在虚拟页中自动计算广告的尺寸。动

46、计算广告的尺寸。 8.4 创建广告画创建广告画 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介在尺寸来源和页边表在尺寸来源和页边表(Size & Orient. and Margins)中设定页的边距和来源。中设定页的边距和来源。点击点击OK!在结构和画图模式中,使用工具画出您的广告画。在结构和画图模式中,使用工具画出您的广告画。注意:您可以在编辑菜单中使用粘贴注意:您可以在编辑菜单中使用粘贴(Paste)和特殊和特殊粘贴工具粘贴工具(Paste Special)插入其他窗口中创建的文插入其他窗口中创建的文件

47、件(如:文本,图片等如:文本,图片等)。您也可以使用。您也可以使用OLE 对这些对这些对象进行编辑。对象进行编辑。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介(推荐推荐)如果您想看到您的广告画在打印时如何如果您想看到您的广告画在打印时如何被分成独立的页,选定优化菜单被分成独立的页,选定优化菜单(Options menu)总表中总表中(General tab)参数对话框参数对话框(Preferences)中观察可打印区域中观察可打印区域(View Printable area)。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介由文件菜单由文件菜单(File

48、)中选择打印设置中选择打印设置(Printer setup)。 选定设置打印机。选定设置按钮。在安装打印机选定设置打印机。选定设置按钮。在安装打印机对话框中选定按图形打印对话框中选定按图形打印(Print TrueType as Graphics),请注意不同的打印机的这个设置可能不同。,请注意不同的打印机的这个设置可能不同。点击点击OK! 从文件菜单从文件菜单(File)中选择打印命令中选择打印命令(Print) ,或在,或在总工具表总工具表(General toolbar)中点击打印按钮,打印出中点击打印按钮,打印出广告。广告。 整理。整理。2024年8月2日chemsketch简介Che

49、msketch简介8.5 画画DNA双螺旋双螺旋8.6 画实验装置画实验装置 精熘精熘2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介9 其他功能其他功能 n 9.1 计算宏观性质计算宏观性质 在结构模式下,画出一个结构,可以通过选择在结构模式下,画出一个结构,可以通过选择工具工具(Tools) 、计算、计算(Calculate) 等菜单命令对其等菜单命令对其性质进行计算,包括:摩尔体积,性质进行计算,包括:摩尔体积,MV ;摩尔折射;摩尔折射率率 MR;等张比容等张比容 Pr;密度密度 d;折射率;折射率 n;表面张力;表面张力 ;介电常数;介电常数 f();极性;极性20

50、24年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介自动显示在状态栏自动显示在状态栏 只有点击最右边的状态对话框,并选择相应的性只有点击最右边的状态对话框,并选择相应的性质即可。默认值是分子量。图中显示的是介电常数。质即可。默认值是分子量。图中显示的是介电常数。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介 使用前面讲的技术画出如下结构:使用前面讲的技术画出如下结构: 使用选择使用选择/移动工具移动工具(Select/Move) 选定结构,选定结构,在顶部的工具栏中点击检查同分异构在顶部的工具栏中

51、点击检查同分异构(Check Tautomeric Forms) 按钮,程序开始工作,简单所按钮,程序开始工作,简单所画结构的同分异构,当过程完成后,出现以下结果:画结构的同分异构,当过程完成后,出现以下结果: 9.2 同分异构同分异构2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介1、浏览全部结构,点击前进、浏览全部结构,点击前进(Next) 或后退键或后退键(Prew) 。2、用当前显示的结构取代所画的结构,点击取代按钮、用当前显示的结构取代所画的结构,点击取代按钮(Replace) 。2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介插入新页插入新页 :

52、在您的在您的ChemSketch 文件中的任何地方文件中的任何地方插入空白页,请注意这是一个有用的方法,因为页插入空白页,请注意这是一个有用的方法,因为页/新菜单新菜单(pages/New menu)将在文件的最后增加页。将在文件的最后增加页。 克隆页克隆页 :将当前页将当前页(包括内容包括内容)复制一定次数,在填写复制一定次数,在填写含有页模型、表、标题的页时非常有用。新页将添加含有页模型、表、标题的页时非常有用。新页将添加在文件的最后。在文件的最后。 10 附加功能附加功能2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介移动移动/复制页复制页 :移动和复制页,如改变您文件

53、中页移动和复制页,如改变您文件中页码的顺序码的顺序 删除页删除页 :同时删除一些页同时删除一些页注释文件注释文件 :根据文件内容在页的左上角注释您的文根据文件内容在页的左上角注释您的文件,对于管理大型文件将是十分方便。件,对于管理大型文件将是十分方便。将将Sketch转换为转换为 VRML文件文件 :将所有文件转换为将所有文件转换为VRML 2.0 形式输出,这样您可以用浏览器形式输出,这样您可以用浏览器(Cosmo,GlView或其他或其他VRML浏览器浏览器 )观察文件。观察文件。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介SDF形式形式-Sketch转换器转换器

54、:将将(分子、文本等分子、文本等)MDL、SDF文件输入到文件输入到ChemSketch 文件中。文件中。SDF文件中每文件中每个记录将变成一页。个记录将变成一页。限制:限制:最多可以输入最多可以输入100个记录,因为个记录,因为ChemSketch 文件最多可以包括文件最多可以包括100页。页。文件浏览器文件浏览器 :通过目录找到需要的文件,或通过文本通过目录找到需要的文件,或通过文本字符串不必打开文件就可以找到需要的字符串不必打开文件就可以找到需要的ChemSketch 文件。文件。 快速表格快速表格 :创建一个表格或将一个对象按一定的行和创建一个表格或将一个对象按一定的行和列排队。列排队

55、。 2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介替换元素替换元素 :将给定结构中的所有原子用另一种原子替将给定结构中的所有原子用另一种原子替换。在画图中,这是非常有用的工具,如将结构氟化。换。在画图中,这是非常有用的工具,如将结构氟化。溶解计算溶解计算 :用于计算指体积和摩尔浓度后溶液中需要用于计算指体积和摩尔浓度后溶液中需要的物质的重量。的物质的重量。标签打印标签打印 :快速为化合物创建标签并且以标准形式或快速为化合物创建标签并且以标准形式或在您的页中打印。在您的页中打印。 氨基酸构造器氨基酸构造器 :创建创建3D的氨基酸结构的氨基酸结构 2024年8月2日chemsk

56、etch简介Chemsketch简介碳水化合物构造器碳水化合物构造器 :由缩写名称创建碳水化合物结构由缩写名称创建碳水化合物结构 重新编页:重新编页:在同一文件中允许您对一串页进行剪切在同一文件中允许您对一串页进行剪切-粘粘贴或复制贴或复制-粘贴。粘贴。 对页进行重新命名对页进行重新命名 :改变页的名称:改变页的名称 插插入入页页码码/注注释释:在在您您的的文文件件中中插插入入页页码码或或注注释释。注注意:注释将插在页的左下角。意:注释将插在页的左下角。 创建创建HTML :将当前文件的所有页输出为将当前文件的所有页输出为HTML 文件,文件,这样您就可以用浏览器观看这样您就可以用浏览器观看。

57、2024年8月2日chemsketch简介Chemsketch简介Sketch-SDF转换器转换器 :将当前页或全部文件输出为将当前页或全部文件输出为SDF文件文件 。显示氢原子显示氢原子 :在画出的结构中显示氢原子在画出的结构中显示氢原子 去掉离子去掉离子 :SDF文件中包含一个或多个盐结构文件中包含一个或多个盐结构 可以改可以改变成不含盐的结构。这个按钮可以在分子量和原子计数变成不含盐的结构。这个按钮可以在分子量和原子计数中去掉小离子。如醋酸钠含有钠离子,去掉钠离子后,中去掉小离子。如醋酸钠含有钠离子,去掉钠离子后,留下乙酸留下乙酸(注意:留下的分子以中性形式存在注意:留下的分子以中性形式存在)。 建造建造3D核酸核酸(DNA,RNA)结构结构 :建造建造3D核酸核酸(DNA,RNA)结构结构(单链或双链单链或双链) 2024年8月2日chemsketch简介chemsketch简介

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