染色质结构与基因转录【竹菊书苑】

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1、主讲人:黄曼丽主讲人:黄曼丽组员:吴丽、郑苑琼、李组员:吴丽、郑苑琼、李文锐、李婷婷、方晓丽、文锐、李婷婷、方晓丽、高宁英、马洁娜、华玲燕、高宁英、马洁娜、华玲燕、李威、吴翠玉、庄伟志、李威、吴翠玉、庄伟志、周骏腾周骏腾1向上教学染色质结构与基因活化染色质结构与基因活化活性染色质及其主要特征活性染色质及其主要特征 染色质结构与基因转录染色质结构与基因转录 一一二二2向上教学染染色色质质核酸核酸蛋白质蛋白质少量少量RNADNA组蛋白组蛋白非组蛋白非组蛋白核小体核小体阻断了转录阻断了转录的进行的进行3向上教学一、活性染色质及其主要特征一、活性染色质及其主要特征活性染色质活性染色质(active c

2、hromatin)与与非活性染色质非活性染色质(inactive chromatin) 活性染色质的主要特征活性染色质的主要特征(一)(一)(二)(二)4向上教学 活性染色质:具有转录活性转录活性的染色质 非活性染色质:没有转录活性的染色质 活性染色质的核小体发生构象改变,具 有疏松疏松的染色质结构,从而便于便于转录调 控因子与顺式调控元件结合和RNA 聚合 酶在转录模板上滑动滑动。 (一)活性染色质(一)活性染色质(active chromatin)与与 非活性染色质非活性染色质(inactive chromatin) 5向上教学.活活性性染染色色质质具具有有DNase I超超敏敏感感位位点

3、点( DNase I hypersensitive site,DHS):):活性染色质对DNase具有优先敏感性。超敏感位点是一段长100200bp的DNA序列特异暴露的染色质区域。大部分位于5-端端启启动动子子区区。可能是为RNA聚合酶、转录因子或其他蛋白调控因子提供结合位点提供结合位点。(二)活性染色质的主要特征(二)活性染色质的主要特征6向上教学 . 活性染色质在生化上具有活性染色质在生化上具有特殊性特殊性活性染色质很少有组蛋白H1与其结合;活性染色质的组蛋白乙酰化程度高;活性染色质的核小体组蛋白H2B很少被磷酸化活性染色质中核小体组蛋白H2A在许多物种很少有变异形式; 组蛋白H3的变种

4、H3.3只在活跃转录的染色质中出现HMG14和HMG17只存在于活性染色质中。(二)活性染色质的主要特征(二)活性染色质的主要特征7向上教学 .活性染色质在活性染色质在组蛋白修饰组蛋白修饰上的特异性上的特异性甲基化、乙酰化甲基化、乙酰化(标志)(标志)、磷酸化、磷酸化(二)活性染色质的主要特征(二)活性染色质的主要特征8向上教学Questions:如何形成活性染色质中的如何形成活性染色质中的超敏感结构超敏感结构?如何如何隔离隔离活性区域与非活性区域?活性区域与非活性区域?RNA聚合酶如何通过聚合酶如何通过与组蛋白结合的与组蛋白结合的DNA模板进行转录?模板进行转录?9向上教学二、染色质结构与基

5、因激活二、染色质结构与基因激活(一)(一)(二)(二)(三)(三) 疏松染色质结构的形成疏松染色质结构的形成染色质的区间性染色质的区间性染色质模板的转录染色质模板的转录10向上教学. DNA局局部部结结构构的的改改变变与与核核小小体体相相位位的的影响影响 当调调控控蛋蛋白白与染色质DNA的特定位点结结合合时, 染色质易被引发二二级级结结构构的的改改变变;进而引起其它的一些结合位点与调控蛋白的结合。 核小体变构因子可通过核小体变构因子可通过改变核小体的相位改变核小体的相位协协助基因转录助基因转录 (一)(一)11向上教学核小体核小体易位易位使得转录因子能与使得转录因子能与DNA结合:结合:有些细

6、胞具有某些“工具”(如人类细胞的SWI/SNF复合物复合物)能撬开撬开被核小体阻断的DNA区域,从而允许转录因子与DNA接触。12向上教学. 组蛋白的修饰:影响转录活性组蛋白的修饰:影响转录活性决定了染色质处于活性或非活性状态。决定了染色质处于活性或非活性状态。直接直接影响:改变染色质的结构染色质的结构(如:(如:磷酸化磷酸化)间接间接影响:使核小体变构(易位核小体变构(易位/解体等)解体等),使其他调控蛋白易于和染色质相互接触 例如:组蛋白的赖氨酸残基的乙酰化乙酰化. HMG结构域蛋白结构域蛋白HMG结构域可识别某些异型的DNA结构,与DNA弯折和DNA-蛋白质复合体高级结构的形成有关。(一

7、)(一)13向上教学(二)染色质的区间性(二)染色质的区间性基因座控制区基因座控制区(locus control region,LCR) 染色体DNA上一种顺式作用元件,具有稳定稳定 染色质疏松结构疏松结构的功能; 与多种反式因子的结合序列可保证DNA复制 时与启动子结合的因子仍保持在原位保持在原位。隔离子隔离子(insulator) 概念:处于抑抑制制状态与与活活化化状态的染色质结构域之之间间、能防止不同状态的染色质结构特征向两侧扩展的染色质 DNA序列。 作用:作为异染色质定向形成的起始位点; 提供拓扑隔离区;涉及追踪机制。14向上教学(三)染色质模板的转录(三)染色质模板的转录基因转录的模板不是裸露的不是裸露的DNA,染色质 是否呈疏疏松松结结构构,即是否处于活活化化状状态态是决定转录功能的关键 转录的“核小体犁核小体犁”(nucleosome plow)假说 RNA聚合酶被认为是用“核小体犁核小体犁”(如前面提到的SWI/SNF复合物)来解除组蛋白和DNA间的相互作用。15向上教学转录的激活与转录起始物的形成转录的激活与转录起始物的形成染色质解凝聚,露染色质解凝聚,露出组蛋白尾巴出组蛋白尾巴转录开始被激活转录开始被激活乙酰化乙酰化形成转录起始物形成转录起始物16向上教学17向上教学

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