浙江大学生化甲提纲、全

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1、题型:名词解释3分一题共10题,判断题1 分一题共20题,选择题1 分一题共20题,分 析问答题10 分一题从五道题中选做三道【名词解释】必需氨基酸和非必需氨基酸甲硫氨酸、缬氨酸、赖氨酸、异亮氨酸、苯丙氨酸、亮氨酸、色氨酸、苏氨酸。甲携 来 一本亮 色 书等电点(蛋白质、氨基酸)某一 pH 下,蛋白质解离成阴阳离子的趋势及程度相同,成为兼性离子,某一特定氨基酸分 子上所带的正负电荷相等,在电场中既不向正极也不向负极移动,该PH即为等电点。 结构域,三级结构和结构域的关系 多肽链在超二级结构的基础上进一步折叠成近乎球状的结构,就是三级结构。 结构域:对于较小的蛋白质分子或亚基-其三级结构=结构域

2、; 对于由两个或两个以上相对独立的三维实体缔合而成的三级结构三维实体=结构域。所以,结构域是球状蛋白质的折叠单位。酶的专一性 一种酶只能作用于某一类或某一种特定的物质,促使其发生化学反应,称为酶的专一性。1、结构专一性:(1)绝对专一性:只作用于一个底物。(2)相对专一性:基团专一性: 键专一性2、立体异构专一性:底物的立体构型影响酶和底物的结合与催化。(1)旋光异构专一性:精氨酸酶只能催化L-精氨酸水解,对D-精氨酸则无作用(2)几何异构专一性:当底物具有顺反几何异构体时,酶只作用于其中的一种。 酶的活性中心、酶分子上具有一定空间构象的部位,该部位化学集团集中,直接参与将底物转变为产物的反

3、应过程,成为酶的活性中心。(占酶体积小、为可能在一级结构上相距很远但三维结构上靠 近的的氨基酸残基或辅酶分子)共价催化 亲核或亲电子催化剂能放出或吸收电子并作用底物形成正/负电荷中心,形成不稳定的共价 中间络合物。反应活化能由此大大降低。酶蛋白分子上的主要亲核基团:丝氨酸的羟基、半胱氨酸的巯基、组氨酸的咪唑基。 酸碱催化酶瞬间向反应物提供货接受质子以稳定过渡态、加速反应。 酶蛋白中起广义酸碱催化作用的功能基:氨基、羰基、羧基、硫氢基、酚羟基和咪唑基。 别构调节(变构) 某些代谢物与变构酶分子上的变构部位特异性结合,使分子结构发生改变,从而改变酶的催 化活性以及代谢反应的速度,称为变构调节。具有

4、变构调节作用的酶称为变构酶,可使其发生变构调节的称变构剂。 变构剂一般以反馈方式对代谢途径的起始关键酶进行调节,常见为负反馈调节。 (无共价键变化,代谢物调节酶活性,非耗能、不放大。)协同效应 一个亚基与其配体结合后,能影响此寡聚体中另一亚基与配体的结合能力(正协同效应、负 协同效应)。酶的共价修饰调节酶蛋白分子中的某些基团在其他酶的催化下发生共价修饰从而导致酶活性的改变。如磷酸化 与脱磷酸化等。(有共价键变化,受其他因素影响,一般耗能,有放大效应)维生素的定义 一类人体不能合成、天然食物中含量极微小而对人体生长和健康必需的有机化合物。脂溶性维生素:V、vD、V、vk激素的定义激素是生物体特殊

5、组织或腺体产生的、直接分泌到体液中,通过体液运送到特定的作用部位, 从而引起特殊激动效应的一群微量的有机化合物。抗生素由微生物或高等动植物在生活过程中所产生的具有抗病原体或其它活性的一类次级代谢产 物,是能干扰其他生活细胞发育功能的化学物质。干扰素干扰素是细胞感染病毒后产生的一类蛋白质.可抑制病毒繁殖,保护宿主。氧化磷酸化在呼吸链电子传递过程中偶联的ADP磷酸化形成ATP的过程,又称偶联磷酸化。呼吸链概念:线粒体内膜上存在由多种酶和辅基组成的传递 H 和电子的链式反应体系,它们按一 定顺序排列,能讲能源物质分解代谢脱下来的H氧化生成水。脂肪的动员 长期饥饿或交感神经兴奋时,储存在脂肪组织中的甘

6、油三酯在三酰甘油脂肪酶(激素敏感脂 肪酶)作用下水解为甘油和游离脂肪酸,并释放入血供全身组织利用的过程。B-氧化在原核生物细胞质和真核生物线粒体中,脂肪酸的B-C断开,C被氧化形成羰基,分解出一 个乙酰CoA的过程。氮平衡 氮总平衡:摄入氮等于排出氮叫做总氮平衡。 正氮平衡:摄入氮大于排出氮叫做正氮平衡。 负氮平衡:摄入氮小于排出氮叫做负氮平衡。联合脱氨作用转氨酶和L-谷氨酸脱氢酶(或腺苷酸脱氢酶)联合催化,转氨与脱氨相偶联,使a-氨基酸 脱去氨基生成a-酮酸的过程。嘌呤和嘧啶的从头合成及补救合成从头合成途径:利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及CO2等简单物质为原料,经一系列酶促 反应,合成嘌呤

7、核苷酸的途径。补救合成途径:利用体内游离的嘌呤或嘌呤核苷,经过简单的反应过程,合成嘌呤核苷酸。 前馈、反馈(正、负) 正(负)前馈作用:代谢底物对其某一催化反应的调节酶起激活(抑制)作用。 正(负)反馈作用:代谢产物对其某一催化反应的调节酶起激活(抑制)作用。代谢池同一代谢物,无论是体外摄入的成分还是由体内各组织细胞生成的,在进行中间代谢时,不 分彼此,参加到共同的代谢池中参与代谢。以血糖为例,无论消化吸收的糖、肝糖原分解的葡萄糖,还是氨基酸或甘油经糖异生转化生 成的糖,均可共同组成血糖代谢池,参与各种组织的代谢。半保留复制在DNA复制时,以亲代DNA解开的每一单链分别作为模板,dNTP作为原

8、料,碱基互补配 对原则下合成完全相同的两个双链子代DNA,每个子代DNA都含有一条亲代的DNA链,称 为半保留复制,是DNA复制的最显著特征冈崎片段在 DNA 的半保留复制过程中,分段合成的后跟随片段称为冈崎片段。DNA 损伤的修复损伤指复制过程中发生的DNA突变。可直接修复、切除修复、重组修复、SOS修复。【切除修复:内切酶-外切酶-DNA聚合酶I-连接酶】转录与翻译转录:生物体以DNA单链为模板,按碱基互补配原则传递遗传信息合成RNA的过程,翻译:以成熟mRNA为模板,把mRNA分子中的开放读码框翻译成多肽链的过程。RNA 加工、拼接、编辑、剪切、修饰RNA聚合酶转录形成的RNA需要经过进

9、一步加工才能得到有生物活性的RNA分子剪切部分片段:切除5端前导序列、 3端尾端和中部内含子拼接部分片段:5-帽子结构,3端ployA尾编辑:加入部分碱基修饰:对某些碱基进行甲基化信号肽指导蛋白质寻靶的任何一段连续的氨基酸序列。N-端的一段疏水氨基酸C 端 小分子氨基酸(信号肽酶裂解部位)乳糖操纵子基因表达的协调单位,包括调控区(启动子、操纵基因、调节基因)、结构基因(lacA、lacZ、lacY基因)【分析问答题】等电点与两性性质在同一个氨基酸分子上带有能释放出质子的NH3正缬氨酸离子和能接受质子的C00-负离 子,因此氨基酸是两性电解质。某一特定氨基酸分子上所带的正负电荷相等,在电场中既不

10、向正极也不向负极移动,该PH 即为等电点。蛋白质的一(二)级结构与功能的关系(举例)蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序,作为基本结构,决定了蛋白质空间构象。、 二级结构为蛋白质分子中局部肽段主要原子的相对空间位置蛋白质的空间构象决定了其理化性质以及生活活性进而决定了蛋白质的功能。 如血红蛋白的一级结构的氨基酸残基改变导致的空间构象变化表现在功能上即镰刀状贫血 而许多酶源需要剪切部分片段改变其一级结构才能发挥生物活性。(胰岛素激活)酶催化反应的特点 高效性:酶能降低反应的活化能,显著增大反应速度。 专一性:一种酶只能作用于某一类或某一种特定的物质,促使其发生化学反应。 易失活:凡易使蛋白

11、质变性的因素都能使酶失去催化活性。 酶的活性可调控:抑制调控、共价修饰调控、反馈调控、酶原调控、激素调控等。 催化活力与辅酶、辅基及金属离子有关。 反应条件温和。只能催化热力学生允许进行的反应,自身不参与反应,不改变平衡常数。酶催化反应机制1、趋近效应和定向效应 趋近效应:指两个反应的分子,它们反应的基团需要互相靠近,才能反应。 定向效应: 指酶的催化基团与底物的反应基团之间的正确定向。2. 共价催化:亲核或亲电子催化剂能放出或吸收电子并作用底物形成正/负电荷中心,形成 不稳定的共价中间络合物。反应活化能由此大大降低。3. 酸碱催化:酶瞬间向反应物提供货接受质子以稳定过渡态、加速反应。4. 金

12、属离子催化:结合底物为反应定向、可逆改变金属离子氧化态、稳定或屏蔽负电荷5. 张力作用与表面效应。酶的活性调节方式一、别构调节:某些代谢物与变构酶分子上的变构部位特异性结合,使分子结构发生改变, 从而改变酶的催化活性以及代谢反应的速度。二、酶的共价修饰:酶蛋白肽链上的某些残基侧链在另一组酶的催化下发生可逆共价修饰: 如磷酸化与去磷酸化。三、酶原的激活:分子内肽键一处或多处断裂,使分子构象发生一定程度改变,从而形成酶 的活性中心。四、某些酶结合了专一性的激促蛋白质或抑制蛋白质,从而使其活性受到调控。糖酵解中不可逆步骤1 葡萄糖经已糖激酶催化生成6磷酸葡萄糖2 6磷酸果糖经磷酸果糖激酶催化生成1,

13、6二磷酸果糖3 磷酸烯醇式丙酮酸经丙酮酸激酶生成丙酮酸丙酮酸到乙酰辅酶A的过程中有哪些酶参与、如何参与?由三种酶(丙酮酸脱氢酶、二氢硫辛酰转乙酰基酶、二氢硫辛酸脱氢酶)和六种辅助因子(焦 磷酸硫胺素、硫辛酸、FAD、NAD、CoA和Mg离子)组成,在它们的协同作用下,使丙 酮酸转变为乙酰CoA和CO2。TCA 循环1. 每一圈消耗一个乙酰 COA, 4 次脱氢, 2 次脱羧,一次底物水平磷酸化。2. 生成一份子FADH2、三分子NADH+H+、2分子C02、一分子GTP3. 关键酶:柠檬酸复合酶,a-酮戊二酸脱氢酶复合体、异柠檬酸脱氢酶4. 整个反应为不可逆反应。5. 以FAD为受氢体的是琥珀

14、酸脱氢酶。涉及草酰乙酸的反应:1三羧酸循环中,草酰乙酸与乙酰CoA缩合,得柠檬酸;2. 三羧酸循环中,苹果酸在苹果酸脱氢酶作用下被NAD+氧化脱氢生成草酰乙酸3糖的乙醛酸途径:乙酰CoA转变为草酰乙酸4.糖异生中,草酰乙酸在磷酸烯醇式丙酮酸羧化激酶作用下转变为磷酸烯醇式丙酮酸;5苹果酸-天冬氨酸穿梭中,草酰乙酸发生C-a转氨基作用,得到天冬氨酸6. 脂肪代谢中,柠檬酸生成草酰乙酸7. 嘌吟核苷酸循环中,草酰乙酸得到-NH2变为Asp。氧化磷酸化作用机理1. 前提:氧化磷酸化中,NADH链中有三个偶联部位(即ATP生成部位),P/0比为2.5,琥 珀酸链中,有两个偶联部位, P/O 为 1.5.

15、2. 作用:当电子经过呼吸链传递时,可将质子从线粒体内膜的基质侧泵到内膜包浆侧,产生 膜内外化学梯度储存能量。当质子顺浓度梯度回流时,驱动ADP形成ATPDNA 双螺旋结构要点1. DNA两条链反向平行,形成右手螺旋结构。2. 磷酸核糖链在螺旋外部,碱基在螺旋内部。3. 螺旋形成大小沟,相接排列。4. 碱基平面与螺旋中心轴垂直,A=T、C与G配对,每10个碱基对螺旋上升一圈,螺距为3.4nm。5. 氢键维持双螺旋的横向稳定性,碱基堆积力维持纵向稳定性。【人工合成的补充: 1.实际每一螺周围10.4个碱基对 2.并非同一平面而是螺旋浆状扭曲3. 相较氢键,碱基堆积力才是维持二级结构的主要作用力。】DNA 的变性和复性在理化因素作用下, DNA 双螺旋的两条互补链松散分开成为单链,从而导致其理化性质及 生物学性质的改变,这种现象成为DNA的变性。变性DNA经适当处理,使其重新形成双螺旋结构的过程,成为DNA的复性。变性条件: 1.高温2.强酸强碱3.有机溶剂等。性质改变:1.增色效应(A260增加)2.旋光性下降3.粘度降低4.生物功能降低或丧失。【附: 1mol 硬脂酸彻底氧化可生成多少摩尔 ATP?答:硬脂酸含有18个C原子,可以进行8次B氧化。得到9分子乙

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