琼脂糖凝胶电泳SOP

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1、DNA琼脂糖凝胶电泳SOP1. 2.5%琼脂糖凝胶的配置(40ml)(1) 称取1g 琼脂糖置于干净的三角瓶中,加入1TAE 电泳缓冲液 40 ml,轻轻晃匀后放到微波炉中加热(边加热变拿出摇晃以便于加快琼脂糖溶化),至琼脂糖颗粒全部溶解后取出冷却。(2) 待琼脂糖溶液冷却到60左右,加入溴化乙锭(EB)溶液,使终浓度为0.5g/ml, 并充分混匀。(3) 在制胶膜的适当位置插上梳子(根据实验需要选择不同规格的梳子),将琼脂糖溶液倒入制胶模中,胶厚度一般在3-5mm之间。(注意:不要产生气泡,溶液温度太高,会使得水分过分蒸发,也会使胶板变型,影响电泳效果)。 (4) 在室温下使胶凝固(大约30

2、分钟),小心垂直向上拔出梳子,然后把胶放置于电泳槽中,样品孔靠近阴极端。加入1TAE 电泳缓冲液至液面恰好覆盖凝胶。2. 上样电泳 (1) 用移液器吸取9ul样品和1ul的上样缓冲液(10),混匀后,小心加入点样孔(加样量根据孔的大小而定)中,每加一个样均需更换枪头。 (2) 加完样后,合上电泳槽盖,打开电源开关,调节电压至110V,可见溴酚蓝条带由负极向正极移动,当溴酚蓝条带移动到距离凝胶前沿约2cm,停止电泳。3. 紫外观察将凝胶置于凝胶成像系统中,在紫外灯上观察电泳结果,DNA存在处显出橘红色荧光条带。(注意:波长302nm的紫外适合核酸的观察和分析,波长为365nm的紫外适合制备观察及切割条带,以减少对DNA的破坏)附:不同浓度琼脂糖凝胶的分离范围凝胶中的琼脂糖含量(w/v)线性DNA分子的有效分离范围(bp)0.51000 300000.7800 120001.0500 100001.2400 70001.5200 30002.050 20002.5小于50

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