microRNA 过表达载体具体步骤及说明

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1、microRNA过表达载体具体使用说明及步骤MicroRNA ( miRNA )是一类真核生物内源性 的小分子单链RNA，通常长为1825nt，能够通过与靶mRNA特异性的碱基配对结合，引起靶序列降解或抑制其翻译，从而对基因进行转录后的表达调 控(如右图所示)。 GenePharmaMicroRNA 载体 利用 CMV 启动子可以在众多哺乳动物细胞中快速、 高效、持 续表达pre-miRNA /经过Drosha( RNase 口)乍用形成 small hairpin pre-miRNAs。在使用载体法针对某一 MicroRNA 进行过表达研究过程中，通常会遇到 如下几个问题：实验对照组的确立、

2、细胞转染条件的确定、基因表 达效率的检 测。1、实验对照组的确立 在一个完善的 MicroRNA 表达实验设计中，必须 考虑设立正确合理的实验对照组。通常，这些对照组包括载体阴性对 照组、转染试剂 对照组。 载体阴性对照可以有两种，一种是采用通 用的阴性对照组， 在本试剂盒中包括了该对照所需的载体(microRNA ),可以表达与目的基因序列无同源性的microRNA片 段；另一种是将目的 microRNA 的序列打乱后重新组合所得的阴性 对照( scrambled)。 对照组的设立对于 MicroRNA 表达研究是很有 必要的，您可以利用载体对照来确认 microRNA 实验中转染、 RNA

3、 提取和基因表达检 测方法的可靠性。2、细胞转染条件的确定使用 MicroRNA 载体转染细胞时，为了选择合适的转染方法和确定 转染效率，通常采用报告基因来检测 DNA 的导入情况。最常用的 报 告基因是绿色荧光蛋白。3、 MicroRNA 表达的检测 通常用两大类方法来检测 MicroRNA 表达 效率，一类方法是直接检测 MicroRNA 的变化水平，常用的方法如 northern杂交、芯片（microarrays ）以及核糖核酸酶保护分析，但这 些传统的方法都需要用到标记探针与纯化的 RNA 进行杂交，由于成 熟的 miRNAs 及其前 体共享一段共同的靶序列，而且目前的这些方 法有无法

4、通过大小将其分开，因此很难专一识别成熟的 MicroRNA， 导致较高的背景信号。另一类方法是通过检测目的基因的生物学效应 和细胞效应来间接的反映目的基因的表达变化，这一类方 法很多， 不同的基因有不同的检测方法。通常选用直接检测 MicroRNA 的变 化情况，可以很直观地反映基因的真实情况，不过也有一部分 研究 人员通过检测细胞效应如细胞增殖速率等指标间接反映基因变化。 转染条件的确定转染前一天，接种0.4-13105细胞/孔至24孑L板中，加入500卩1含 血清培养液，37C 5% CO2培养至40-70%融合。 在50卩1 Opti-MEM I培养液或其它无血清培养液中加入0.5-0.

5、8yg DNA，混匀。使用前轻轻混匀RNAi-Mate试剂，切忌离心处理。用30卩1无血清的DMEM或Opti-MEM ,或其他无血清培养基）稀释1-4pg RNAi- Mate 试剂（可以分别设立 DNA/RNAi-Mate 的不同用 量组，通常 DNA 和 RNAi-Mate 的用量在 1：2-1：5 范围内，针对不同的细胞 需要不同的用量）， 轻轻混匀，室温放置 5 分钟。将稀释好的DNA和RNAi-Mate试剂混合，定容到100卩1 ；轻柔混 匀，室温放置 30 分钟， 以便形成 DNA-Mate 复合物。 将100卩1 DNA/RNAi-Mate复合物加到含有细胞和培养基的培养板 的

6、孔中，来回轻柔摇晃 细胞培养板板，使 DNA/RNAi-Mate 混合物 均匀覆盖细胞。 细胞在CO2培养箱中37口温育24h-48h后，进行转染后的其它检 测步骤。如果细胞株比 较敏感，孵育 4-6 小时后，除去复合物，更 换培养基。 通过表达绿色荧光蛋白的 DNA 载体来检测细胞的转染效率，细胞 转染后 24-48 h 后，使 用荧光显微镜观察计数表达绿色荧光蛋白的 细胞，在明场观察计数同一视野中的总细胞数，转染细胞率=荧光蛋 白表达细胞数/总细胞数TOO%。或使用DAPI等染料染核后，吏用流 式细胞 仪进行计数，然后计算转染效率。 如果在转染条件摸索实验中没有找到较高效率的转染方法，请更

7、换 转染方法和试剂。如 无其他方法选择，可以使用流式细胞仪将转染的 细胞分选出来用于后续实验。如果无法分选细 胞，可以在计算 RNA 干扰抑制效率时去除转染效率的影响，也可以使用抗生素对转染后的 细 胞进行初筛后再进一步检测抑制效率。 细胞的转染1) 设定合理的实验组/包括转染试剂对照(mock transfection)、阴性 对照(negative control)和目的基因实验组。2) 按照前面实验确定的细胞接种量接种。37C 5% CO2培养至40- 70%融合。3) 按照前面实验确定的转染条件转染细胞。如果需要转染不同培养量的细胞，试剂的用量可 以根据相关参考进行相应的变化。4) 转

8、染后 24-48h 后，收集细胞进行下一步的检测工作。通常，目的 基因在转染后 24-48h 内 就会表现出现表达，但有一些蛋白比如 稳定性较强、半衰期较长的蛋白在转染后含量降低比较 缓慢，所 以需要延长检测时间。稳定细胞系建立1) 前一天，准备健康细胞，密度在 20%-40%。2) MicroRNA 表达载体和对照，按照转染试剂推荐要求，进行细胞转染，6 小 时后换成新鲜 培养液，培养过夜。3) 第二天，胰酶消化，将细胞转入较大的培养瓶中(如 6 孔板转到 10cm plates ) /加入完全 培养液并含有适当浓度的Blasticidin。4)每3-4天更换含有适当浓度的Blasticidin , 直到 Blasticidin抗性克隆形成 (一般需要 11-14 天药物筛选)。5) 挑取至少 10 个耐药克隆进行扩增。