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1、生物化学临床五年制教案课程代码 MED130004前言根据教学大纲要求,按临床五年制本科生的教学进度安排(总学时106学时),由本系主讲教师共同制订本教案,以供教师备课、讲课、复习指导参考。绪论教学要求:1了解生物化学的发展历史及生物化学研究的基本内容。2认识学习生物化学对未来医药卫生工作者的必要性和重要性。课时安排:05学时重点:本课程的主要内容及未来的研究方向难点:生物化学的发展历史及未来的研究方向教学内容1生物化学与分子生物学的定义、发展历史概况。2生物大分子的结构与功能、物质代谢及其调节、基因信息传递及其调控研究的现状、尚待解决的主要问题以及在生命科学中的意义。3生物化学向基础医学、临
2、床医学各学科的日益广泛的渗透及其对阐明疾病分子机理、提高疾病防治水平的巨大贡献。中、英文专业词汇biochemistry生物化学molecular biology分子生物学polymerase chain reaction(PCR)聚合酶链反应gene knockout基因剔除ribozyme(RNA enzyme)核酶human genome project(HGP)人类基因组计划biomolecules生物大分子思考题:1 生物化学的定义是什么?研究对象和研究手段分别又是什么?2 生物化学与医学有什么关系?为什么作为医学生的必修课?参考书:1 Jeremy M. Berg, John L.
3、 Tymoczko, Lubert Stryer. Biochemistry. 6th ed. New York : W.H. Freeman, 20072 David L.Nelson, Michael M.Cox.Leninger Principles of Biochemistry. 4th ed. New York: Worth Publishers,2004. 第一章 蛋白质的结构与功能教学要求:1了解蛋白质的分子组成、氨基酸的理化性质。2重点掌握蛋白质的基本结构、空间结构及其与功能的关系。3熟悉蛋白质的理化性质。4了解蛋白质的分离纯化、多肽链中氨基酸序列分析及蛋白质空间结构测定的基
4、本原理。课时安排: 总学时 5.5第一节 蛋白质的分子组成 1.0第二节 蛋白质的分子结构 1.5第三节 蛋白质的结构与功能的关系 2.0第四节 蛋白质的理化性质 0.7第五节 蛋白质的分离、纯化与结构分析 0.3重点:1 氨基酸的分类及其结构特征。2 氨基酸和蛋白质的理化性质。3 蛋白质各级结构层次的定义。4 蛋白质结构与功能之间的关系。难点:蛋白质各级结构层次与功能之间的关系。教学内容:一、蛋白质的分子组成1氨基酸 L-氨基酸的结构特征和分类、组成体内蛋白质的20种氨基酸的中、英文名称及缩写符号,氨基酸的两性解离、等电点、紫外吸收等理化性质。2肽 肽链与肽键,重要的生物活性多肽。3蛋白质的
5、分类 单纯蛋白质和结合蛋白质,纤维状蛋白质和球状蛋白质。二、蛋白质的分子结构1蛋白质的一级结构 多肽链中氨基酸的排列顺序。2蛋白质的二级结构 肽链局部的空间排布、肽单元、-螺旋、-折叠、-转角、无规卷曲、模体、锌指结构、分子伴侣。3蛋白质的三级结构 整条肽链的三维空间排布、次级键、结构域。4蛋白质的四级结构 亚基之间的三维空间排布。三、蛋白质的结构与功能的关系1蛋白质的一级结构与功能的关系 一级结构对空间结构和蛋白质功能的决定性、一级结构与物种进化、一级结构变异与分子病。2蛋白质的空间结构与功能的关系 肌红蛋白与血红蛋白的结构特征,血红蛋白与氧结合的正协同效应理论,变构效应。四、蛋白质的理化性
6、质及其分离纯化1蛋白质的理化性质 两性解离、等电点、溶液中蛋白质胶粒稳定的因素,蛋白质的变性与复性,变性与沉淀的关系,紫外吸收,茚三酮反应,双缩脲反应。2蛋白质的分离和纯化 蛋白质的丙酮沉淀、硫酸铵盐析、电泳、透析、层析、凝胶过滤及超速离心等分离纯化方法的基本原理。3多肽链中氨基酸序列分析 由氨基酸残基组成、酶解片段、末端氨基酸测定、组合排列法确定蛋白质中氨基酸序列的原理,由mRNA的核苷酸序列推演蛋白质中氨基酸序列的可行性。4蛋白质空间结构测定 X射线晶体衍射法、基于一级结构的理论预测法的应用。中、英文专业词汇:protein蛋白质primary structure一级结构peptide肽s
7、econdary structure二级结构polypeptide多肽peptide unit肽单元oligopeptide寡肽-helix-螺旋amino acid氨基酸-pleated sheet-折叠isoleucine异亮氨酸-turn-转角tryptophan色氨酸random coil无规卷曲threonine苏氨酸motif模体valine缬氨酸zinc finger锌指结构leucine亮氨酸chaperon分子伴侣lysine赖氨酸tertiary structure三级结构phenylalanine苯丙氨酸domain结构域methionine蛋氨酸fibronectin纤
8、连蛋白histine组氨酸quaternary structure四级结构arginine精氨酸subunit亚基tyrosine酪氨酸myoglobin肌红蛋白cysteine半胱氨酸hemoglobin(Hb)血红蛋白alanine丙氨酸allosteric effect变构效应glycine甘氨酸denaturation变性serine丝氨酸renaturation复性aspartic acid天冬氨酸protein coagulation蛋白质凝固asparagine天冬酰胺ninhydrin reaction茚三酮反应glutamic acid谷氨酸biuret reaction双缩
9、脲反应glutamine谷氨酰胺salt precipitation盐析isoelectric point等电点electrophoresis电泳peptide bond肽键dialysis透析glutathione(GSH)谷胱甘肽chromatography层析neuropeptide神经肽gel filtration凝胶过滤conformation空间构象ultracentrifugation超速离心amino acid sequence氨基酸序列sedimentation coefficient(S)沉降系数思考题:1 试讨论20种L-氨基酸的结构与分类。2 试举例说明蛋白质结构与功能
10、之间的关系。3 测定氨基酸和蛋白质的方法有哪些?试讨论其测定原理。参考书:1Jeremy M. Berg, John L. Tymoczko, Lubert Stryer. Biochemistry. 6th ed. New York : W.H. Freeman, 20072Robert H. Glew and Miriam D. Rosenthal. Clinical studies in medical biochemistry. 3rd ed. New York: Oxford University Press, 2007.3David L.Nelson, Michael M.Cox.
11、Leninger Principles of Biochemistry. 4th ed. New York: Worth Publishers,2004. 4Donald Volt, Judith G. Volt. Biochemistry. 3rd ed. John Wiley &Sons Inc.,2004.第二章 核酸的结构与功能教学要求:1掌握核苷酸的分子结构,了解连接键及分子表达式2重点掌握DNA、RNA的结构特征及主要功能3了解DNA的理化性质与结构的关系4了解DNA的高级结构课时安排:总学时 4.0第一节 核酸的化学组成及一级结构 1.0第二节 DNA的空间结构与功能 1.0第三
12、节 RNA的结构和功能 1.0第四节 核酸的理化性质 0.8 第五节 核酸酶 0.2重点:1 核酸的化学组成2 DNA的双螺旋结构3 RNA的结构和功能4 核酸的理化性质难点:1 DNA的双螺旋结构2 核酸的理化性质教学内容:一、核酸的化学组成及一级结构1核苷酸 嘌呤与嘧啶,DNA和RNA分子中核苷酸组成上的特点,核苷酸各组分之间的连接方式2脱氧核苷酸的连接3核苷酸的连接4核酸的一级结构二、DNA的空间结构与功能1DNA的双螺旋结构 Chargaff规则、B-双螺旋结构模型和Z-DNA。2DNA的超螺旋结构 染色质、核小体、组蛋白、基因3DNA是遗传信息的物质基础三、RNA的结构和功能1mRN
13、A 模板、hnRNA2tRNA 稀有碱基、茎环结构、反密码环3rRNA 核糖体、多核糖体四、核酸的理化性质紫外吸收、变性、复性、增色效应、减色效应、解链温度、杂交、探针。五、核酸酶中、英文专业词汇:nucleic acid核酸purine嘌呤deoxyribonucleic acid(DNA)脱氧核糖核酸pyrimidine嘧啶ribonucleic acid(RNA)核糖核酸adenine(A)腺嘌呤base碱基guanine(G)鸟嘌呤nudeotide核苷酸cytosine(C)胞嘧啶nucleoside核苷uracil(U)尿嘧啶thymine(T)胸腺嘧啶base pair碱基对phosphodiester linkage磷酸二酯键nucleosome核小体ribosome核糖体hybridization杂交genetic code遗传密码double helix双螺旋supercoil超螺旋probe探针ribosomal RNA(rRNA)核糖体RNAtransfer RNA(tRNA)转运RNAmess