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1、ACD/ChemSketch Version 10.0 for Microsoft Windows 中文使用指南化学结构式和图形图像的绘制高级化学发展有限公司(ACD)本书版权归ACD公司所有。1997-2006ACD/LABS 是ACD公司商标。 Microsoft和Windows是微软公司在美国(或其他国家)注册商标。2006 IBM(International Business Machines)是国际商用机器公司注册商标。1994-2006Adobe,Acrobat, PDF(Portable Document Formats)及关联数据结构等都是Adobe系统组合公司在美国(或其他国
2、家)的注册商标。2006 Camtasia是TechSmith公司的注册商标,Camtasia Studio是TeachSmith公司的商标。 19992006 本指南中提到的所有商标均属于其拥有者。且所有的商标均是被许可的。本说明书中内容可能不在任何通告下进行改变,公司对以下情况不承担责任,包括但不限于商业或任何其他特殊用途。公司对使用该说明书而直接、间接、专门、附带的和因此而引起的任何错误不承担责任。目 录目 录31.ACD/CHEMSKETCH基础71.1目标:71.2启动ACD/ChemSketch71.3设定可兼容的文件类型71.3.1改变可兼容的文件类型81.4改变默认路径81.5
3、安装附件81.6退出ChemSketch92.绘制简单结构102.1目标102.2画原子、化学键和标签102.2.1使用常用画图工具102.2.2双键和三键112.2.3个别原子的删除112.2.4撤销命令112.2.5聚合物112.2.6非原子122.2.7改变原子122.2.8使用连续画图工具132.2.9使用鼠标拖拽绘图142.2.10优化结构142.2.11编辑原子标签142.2.12使用画链工具152.3清除屏幕162.4使用ACD/字典162.5翻转结构172.6输出192.6.1保存ChemSketch(.sk2)文件192.6.2保存结构为 MDL Molfile 格式192.
4、6.3打印202.6.4在文件中插入结构式203.绘制更复杂结构213.1目标213.2使用基团表213.3使用环节构223.4删除原子和基团233.4.1同时删除多个原子243.5替换原子243.6设置双键和三键253.7标定电荷和定义阳离子与阴离子253.8标记键273.8.1原子团标记键283.9使用立体键293.10绘制配位键303.11离域电荷及曲线333.12更多键类型343.13改变原子属性374.超级结构、简化线性分子式和化学反应式394.1目标394.22D优化394.2.1创建环烷烃结构394.2.2画环形的缩氨酸404.3简化线性分子式(SMILES Notations)
5、414.3.1创建简化线性分子式424.3.2从简化线性分子式创建结构式424.4IUPAC国际化学标识分子式434.4.1生成国际化工标识分子式434.4.2从国际化学标识分子式生成结构444.53D优化454.5.1创建双2,2,2环己烷结构454.5.2创建三蝶烯结构464.5.3创建立方烷结构474.5.4创建C20球碳分子494.6绘制、标记和映射化学反应504.6.1绘制化学反应504.6.2标记化学反应524.6.3映射化学反应524.6.4计算化学反应数据仅限商业版!545.高级绘制:模型565.1目标565.2概述565.3原子团表565.3.1创建荧光胺结构565.4快速模
6、型工具585.4.1创建环状体聚物结构585.5模型窗口595.5.1创建DNA分子片断595.5.1.1绘制去氧核糖-5-磷酸盐链的图象605.5.1.2添加碱基615.6绘制复杂的生物化学结构615.6.1创建-麦芽糖酶结构615.7定义用户模型635.7.1模型窗口组织者645.7.2*.cfg模板文件646.计算宏观性质656.1概述656.2计算宏观性质656.2.1菜单命令656.2.2状态栏自动显示666.3计算单一同位素质量667.特殊功能键677.1目标677.2同分异构体677.2.1举例687.2.2化学文献中的错误687.3字典707.4ACD/免费名称附件707.4.
7、1ACD/免费名称的局限718.结构搜索仅限商业版!728.1目标728.2搜索结构728.2.1通过哪些文件搜索728.2.2鉴于搜索结果749.创建绘画对象769.1目标769.2绘制反应能量图769.2.1画一条曲线769.2.2修改曲线779.2.3绘制X、Y轴789.3绘制各种不同轨道799.3.1绘制p轨道799.3.2绘制d轨道809.3.3绘制pi轨道819.4绘制真空蒸馏装置829.4.1在图形上加注释839.4.1.1文字注释849.4.1.2插入注释框859.4.1.3修改注释框的形状859.4.1.4将元素编组/拆开869.5绘制一个双链DNA螺旋结构869.6绘制脂肪
8、和胶体899.6.1绘制脂肪909.7创建表格919.7.1绘制表格内容929.7.2插入表格939.7.3置入数据939.7.4修改表格内容959.7.5编辑表格外观9610.管理文件9810.1插入页眉和页脚9810.2转换成PDF仅限商业版!9910.3创建海报9911.结构模式中的样式10111.1目标10111.2改变结构样式10111.2.1应用期刊样式10111.2.2准备发表10211.3创建用户样式10211.3.1用户定义样式:糖10311.3.2用户定义样式:磷酸盐10311.3.3用户定义样式:碱10411.3.4用户定义样式:强调10411.4应用现有样式10511.
9、5设定默认样式10612.画图模式中的样式10712.1目标10712.2改变对象样式10712.3保存样式10712.4应用现有样式10812.5设置默认样式10812.6管理样式10813.创建汇报模型11013.1目标11013.2关于汇报模型11013.3输入汇报模型11013.4插入模型对象11113.5设定显示参数11213.6编排模型对象11713.7保存和应用汇报模型1171. ACD/ChemSketch基础1.1 目标:本章讲解如下内容: 如何启动ACD/ChemSketch 如何设定和改变文件可兼容的文件类型(File Assosciation) 如何设定默认文件路径 如
10、何退出ACD/ChemSketch1.2 启动ACD/ChemSketch 安装完毕后,按以下步骤操作可启动程序。1. 打开Windows。2. 双击图标,启动;或任务栏中,由开始菜单击图标;或在ACD 栏目中双击CHEM.exe程序文件;或从正在运行的其他ACD程序中的ACD/Labs 目录中选择ChemSketch。3. 如果是免费版本,您将看到15秒ACD产品滚动图象,请等待并点击取消键(Cancel)。1.3 设定可兼容的文件类型1. 在您第一次使用此软件时, 设定可兼容的文件类型(File Associations)对话框将出现. 2. 这些可兼容的形式包括CS ChemDraw(*
11、.CHM), REACCS Rxnfiles (*.RXN), ISIS/Sketch (*.SKC) , 可能还有其他格式的文件, 这些文件都可以在ChemSketch 中打开. 具体做法是在您想要添加的选项前的方框内点上对号, 然后点击YES键即可。3. 如果您不知道或者不确切地知道 ChemSketch将打开的文件的扩展名, 不要选任何选项, 然后点击NO键。4. 然后今日诀窍(Tip of the Day)窗口将跳出, 您可以在阅读结束后关闭。1.3.1 改变可兼容的文件类型 在您没有选择可兼容文件类型以前, ChemSketch将自动使用默认的文件类型,您可以随时改变默认文件类型,
12、只要在文件 (File)菜单下选择相关ACD产品命令(File Associations)即可。重要启事:如果在Window NT的系统中您没有被授权改变可兼容文件的同时选择File Associations的命令,会出现警告信息,请联系您的系统管理员解决问题。如果您已经选择了所有的可兼容文件类型, 一条信息会提示您已经选择了所有的文件类型-“all supported file types are already associated with the current application, 您可以通过Windows Explorer选择选项:1. 打开 Windows Explorer,
13、 选择您想选的选项:2. 按住 SHIFT键, 在要打开的文件上右击鼠标,在菜单中选择 Open With.3. 选择您要打开的文件相对应的文件类型, 然后选择 Always use this program(只要在前面的方框内打对号即可)。4. 点击 OK,然后关闭 Windows Explorer.1.4 改变默认路径如果您使用的是单一用户(可以单独使用的版本), 默认路径可能是没有任何问题的.如果您使用的是网络版本, 我们建议您改变您的默认路径,将您的文件保存在您自己的硬盘,而不是网络服务器。当做好了单机路径后, 再在每一个单机上进行以下操作:1. 打开 ChemSketch 的窗口后,从Options菜单中选择 Preferences 命令键。2. 点击 General, 然后在默认栏内键入每次您要输入, 打开, 保存和输出文件的路径。注意: 在 Private 栏内, 您可以设定记录每次ChemSketch操作的设置。3. 点击 OK。1.5 安装附件从8.00的版本开始就可以安装附件了编写的用于扩展主要应用的一些程序(有.ADDON的扩展名)。每个附件都包含了用于当前记录或整个数据库的一整套命令。当附件被安装, 它的命令可能被安置或在工具栏作为按钮或在主菜单作为添加子菜单的命令, 或二者都有。