RT-PCR基本步骤

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1、实时荧光定量PCR原理所谓实时荧光定量PCR技术,是指在PCR反应体系中加入荧光基团,利用荧光信号积累实时监测整个PCR进程,最后通过标准曲线对未知模板进行定量分析的方法。1内标在传统定量中的作用由于传统定量方法都是终点检测,即PCR到达平台期后进行检测,而PCR经过对数期扩增到达平台期时,检测重现性极差。同一个模板在96孔PCR仪上做96次重复实验,所得结果有很大差异,因此无法直接从终点产物量推算出起始模板量。加入内标后,可部分消除终产物定量所造成的不准确性。但即使如此,传统的定量方法也都只能算作半定量、粗略定量的方法。2实时荧光定量PCR无需内标实时荧光定量PCR技术有效地解决了传统定量只

2、能终点检测的局限,实现了每一轮循环均检测一次荧光信号的强度,并记录在电脑软件之中,通过对每个样品Ct值的计算,根据标准曲线获得定量结果。因此,实时荧光定量PCR无需内标是建立在两个基础之上的:1)Ct值的重现性PCR循环在到达Ct值所在的循环数时,刚刚进入真正的指数扩增期(对数期),此时微小误差尚未放大,因此Ct值的重现性极好,即同一模板不同时间扩增或同一时间不同管内扩增,得到的Ct值是恒定的。2)Ct值与起始模板的线性关系由于Ct值与起始模板的对数存在线性关系,可利用标准曲线对未知样品进行定量测定,因此,实时荧光定量PCR是一种采用外标准曲线定量的方法。 RT-PCR步骤总RNA提取1. 取

3、200mg组织,放到1.5ml EP管中,加入1ml Trizol剪碎。2. 震荡30s。3. 加0.2ml氯仿,剧烈摇动30s,室温3min。 4. 12000g,4 离心,15min。5. 吸上层无色水相,移入另一EP管中(约0.5ml)。6. 加等体积异丙醇,-20,30min。7. 12000g,4 离心,10min。在管底部可见微量RNA沉淀8. 弃上清,加75乙醇1ml,振荡。9. 7500g,4 离心,10min。10. 弃上清,用滤纸小心吸取残留液体,室温干燥510min。11. 沉淀溶于20l DEPC水,取1l加入79l DEPC水测OD260/OD28012. 计算浓度与

4、纯度,70保存。 OD26040稀释倍数RNA浓度(g/l) 1000逆转录合成 cDNA 反应体系如下 MgCl2 2l 10RT Buffer 1l RNase Free dH2O 3.75l dNTP Mixture(各10mM) 1l RNase Inhibitor 0.25l AMV Reverse Transcriptase 0.5l Random 9 mers 0.5l Positive Control RNA (1g) 1l混匀快速离心一次反应条件如下 30 10min 42 30min 99 5min 5 5min -20 冰箱冻存 PCR反应 摸板cDNA 2.5l 5PCR Buffer 2.5l 灭菌蒸馏水 7.2l 聚合酶 Ex Taq HS 0.1l 上游引物 0.1l 下游引物 0.1lTotal 12.5l混匀快速离心一次反应条件 94 2min 1Cycle 94 40sec 50-65 40sec 25-35Cycles 72 1min 72 5min 1Cycle PCR产物-20冰箱保存取PCR产物8l加5Loading Buffer 2l 2%琼脂糖凝胶电泳120V 100mA 30min 溴化乙锭染色,凝胶成象仪成象并保存结果

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