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1、import导入mimics10.01教程-入门级（二）2011-05-110:241.如上图所示，点击FILE后，菜单里显示两种导入方法：一为openproject二为importimages（其中乂分为自动导入，半自动导入，手动导入三种）。下文分述之： openproject:即导入工程文件，mimics的工程文件后缀名为.mcs,安装完程序后，程序自带工程文件demon.mcmimi.mcs,femur.mcs等，当然也可以导入其他用户及自己创建的mcs工程文件。 importimagesauto-import:自动导入，即我们选定路径及文件后，系统自动导入，此限于mimics支持的di
2、com文件。点击importimages后弹出importimages菜单，左上角显示1，即第1步，左侧为路径选择栏，右侧为内容，找到你所存放的dicom格式文件的文件夹后，右侧即显示其中的内容，并默认全部选中状态，可点击下方next（或可选择需要导入的图像，然后点击next）,进入第2步，如方才选中的图像参数一致（即高、宽、像素大小、倾斜角度、定位、标注、病人信息、对象信息及图像重建中心）则显示为一个部分，如否，则分成几个部分分别显示，然后点击convert。如果定位参数缺失或不能识别则进入changeorientation对话框，此时需手动设置图像的方向，移动鼠标至图像中标为X”的部位，右
3、键单击，选择top或bottom等。设置完成，点击OKSemi-automaticimport:半自动导入，当导入的文件格式为BM俄TIFF时，会弹出BMP/TIFFimport对话框，以设置部分参数，见下图：Filenames6nl974.bmp6nl978bmpBnl982.bmpBnl986.bmpImigeInformationSze:341Importtablepositionsfrom:FirstTablePosition:0.0000SliceDistance:LOOOOQ.5000O.OOOCFileSi况!SortNum.OAlpha.* 201986bMoveUpDownP
4、reviewExamInformationPatientName:n/dInstitute:n/dOrientation;XXXOKCancelGantryTilt:一般手动更改红色箭头所标示的SliceDistance,PixelSize数值，然后点击OK即可，如导入错误，则说明其余数值有变动，应向CT扫描人员索取变动信息并填入，余同前。可预先preview0manualimport:手动导入，当在importimages菜单的第一步时，将对话框下方的manualimport选中并点击next,当导入的文件为多个时，则弹出下图对话框，将其中内容填写后点击ok即可。可预先preview。Man
5、ual和DptionuFiwiintr：1&9Ji【饵那in;法m44引1&做rT2WM11136S32tU9m.wcin响m幅113WJ21vONCJAWtahiMFieSine:&2&122b-i螭1ffeool(vakjesatgioahm-1Tjps:&lewbj蛀fit利饵QLwMnamInwgVho;|酩.MAwumIrviajeVsAje1S3SS5Irvwl-GrVJuM说明：FileheaderSize头文件大小，mimics可自动计算。如需手动填写，可有公式计算，此处从略。ExamInformation中：1) Slices:医用扫描一般为横断面成像，默认选择Axial(轴
6、视图)。ImageInformation中：2) Size:是图像的大小。3) SliceDistance:层距。4) PixelSize:像素的大小，可从像素间距得出。如像素间距为0.8398x0.8398，则此处填0.8398.PixelProperties中：5) Type:选择Signedshort或者Unsignedshort。当导入的文件为一个文件时，比如一些裸数据文件，如(http:/www.volvis.org/网站、然后点击DownloadNewDataset后可下载)stent16.raw文件，弹出如下图示：hUnualDptiprtjL一奥ICnaJIfI5wrtPiew
7、trnogrInhxnkdtignFtafMmeU1&8O1HKE22：i*4994129Fit珀&4勃h4&iSu：I*25fifrcrfIrtwi回FistIdlePmjocifi.fiMMMOiwnSfeaMM!:lunaooom5标QWWOWEGirtilk.：.ODMOOOOd制PiapefL|3土nmvalr-3、Tfpe;E火LBwtej*lu:l|BOS|vMnwalrwtVAc国1!35&irwwtgW4u说明：FileStructure中：1) FileHeaderSize:指图像文件头部的大小。裸数据文件没有头部信息只包含像素，所以填0。NumberofImagesper
8、File:是指裸数据文件中一共包含的图像数。mimics10.01教程-help之中文翻译-中文帮助-mimicstutorial-Mimi-Windowing2011-05-1112:09Windowing视窗调整Firstofall,wehavetoadjustthecontrastoftheimagesdisplayedinthedifferentviews.Contrastenhancementisaverygoodtoolforselectingpartswithdifferentintensities,e.g.bonevs.braintumor.Thisactioncanbeper
9、formedatanytime.首先，我们需要在不同的视窗中调整图像的对比度，对丁选择不同密度的选区来说，对比度增强是一个很好的工具。举例来说，如骨与脑肿瘤。这个功能在任何时候均可使用。YoucanchangethecontrastinthecorrespondingtaboftheProjectmanagement.Thecontrasttabshowsthehistogramoftheprojectwithalinerepresentingthe“window/.ThegrayvaluesorHounsfieldunitsbelowthestartpointofthelinewillbed
10、isplayedinblack.Allgrayvaluesabovetheendpointofthelinewillbedisplayedinwhite.Thegrayvaluesinbetweenthewindowwillbemappedonashadeofgray.你可以在相关工具栏里更改工程管理的对比度。对比度工具栏将工程以直方图方式显示，并以一条线代表了视窗的调整。比这条线起始点低的灰度值或亨氏单位被以黑色显示，反之，比此线结束点高的以白色显示。居中的灰度值以灰色的明暗显示。Youcanchangethewindowsizebyclickingyourleftmouseononeoft
11、hepointsanddraggingittoitsnewlocation.Tomovethewindowselectthelineanddragittoitsnewposition.你可以左键点击起始点或结束点中的一个并将其拖动到新的位置来做视窗的调整。也可点击代表视窗的那条线并拖动至新位置来调整。Youcanalsochooseoneofthepredefined“windows”byselectingtheappropriatescalefromthemenuonthebottomofthetab.你也可以通过挑选此栏底部的适当的刻度值，来选择视窗调整的预设值。Thefollowings
12、tepswilldescribethenecessaryactionstoachieveanicesegmentationmask.Asegmentationmaskisacollectionofpixelsofinterestthatconstituteanobjectyouwishtoworkon.Onecancreateseveral-dependentorindependent-masks,eachdisplayedwiththeirownidentifyingcolor.Usuallyseveralmaskswillbeneededtoobtainafinalsegmentation
13、objectthatcontainstheinformationthatisneeded.下面的步骤将描述必要的命令，以便于更好地进行蒙罩分割。分割后的蒙罩即为你感兴趣的像素集，它包含着你希望处理的对象。你可以建立几个独立的或非独立的蒙罩，每个都可以以可辨识的颜色来显示。通常蒙罩应为包含所需信息的分割图像。mimics10.01教程-入门级（三）Windowing视窗调整2011-05-1112:58mimics中所提到的windowing,指的是调整视窗图像的对比度，使感兴趣的组织突出显示，以便丁观察。调节栏在右下角的contrast,以直方图的方式，其中乂两个关键点，分别为起始点和结束点，
14、调整两点的位置，可以观察到视窗图中的变化。可以看到：低丁左边点密度的组织呈黑色，左边点的位置调向极右，则连骨组织也成黑色；高丁右边点密度的组织呈白色，右边点的位置调向极左，则体内空气亦成白色；向上调节两点，图像整体变白，反之则变黑；两点上下距离越大，对比越大，反之对比越小，图像内容无法区分。简单来说：点向右，则黑多白少，点向左，则黑少白多；点向上，则白，点向下,则黑；点距越大，对比越大。mimics10.01教程-入门级（四）Thresholding阈值分割2011-05-1113:23如本例以mimi.mcsX程文件为例，提取颅骨为目的。1. 点击如上图所示按钮，即Thresholding阈
15、值分割按钮，并在轴视图中选取要提取的组织（分别在感兴趣的组织两侧左键单击即可，软件会自动生成一条线段横跨目标组织，如图示1）。2. 弹出profilelines对话框，点击startthresholding（如图示2）,mimics会自动分析并在左上方图小中表现出来。3. 并弹出对话框thresholding（如图示3）4点击apply按钮，并关闭对话框，可以看到，在3个视图里（轴视图、侧视图、前视图）颅骨组织被提取出来了，并以默认的颜色以示区分，同时在右上角Marks栏里将此次结果定义为蒙罩，起名为Green,并visible状态显示为可见，及最低阈值1250,最高阈值3810.Measjjre：玳|DrstarrcebMeeridottedlin洵slueTr-|Mea&jreinentonProfile01ProfilePrijfieOL特500|-沔!4!Thrwholds:1250CMax:1BL0ZScaleToFitOptoris回GridX-AxisAGridY；-AxisColoirbJCCTrafthn&slrolddiFfgreince
