分子生物学科大重点知识点

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1、分子生物学 科大重点知识点基因gene：能够表达和产生蛋白质和 RNA的DNA序列，是决定遗传 性状的功能单位基因组genome：细胞或生物体的一套完整单倍体的遗传物质的总和基因组文库( genomic library ) : 由基因组DNA 所制成的基因文库基因文库( Gene library )是来自某生物的不同DNA 序列的总集这些序列都已被克隆进了载体以便于纯化贮存与分析。cDNA 文库 ( cDNA library ) ： 用来自表达目的基因的细胞或组织的 mRNA 作为来源构建的文库。 cDNA 文库不同于基因组文库，被克隆 DNA 是 从 cRNA 反转录来源的 DNA 。 cD

2、NA 组成特点是其中不含有内含子和其他 调控序列。Sd序列(Shine-Dalgarno sequence：原核生物mRNA起始密码子上游8-13 个核苷酸处的保守序列， 可与核糖体小亚基中的 16srRNA 的 3-端邻近 的互补序列配对，称为核糖体结合位点，又叫 sd 序列。tRNA 负载( tRNA charging) : The amino acid is joind to the tRNA by aminoacyl-tRNA synthetases to bacome charged tRNA. This process is called tRNA charging.操纵子(Ope

3、ron) ：是原核生物基因表达的单位，它包括被协同调剂的基因和被调剂基因的产物所识不的调控原件, 在细菌中， 为一个代谢途经所需要的几种酶的结构基因， 可沿 DNA 直线排列在一起， 并受一个共同的启 动基因和操纵基因的操纵，把如此的启动基因、操纵基因和结构基因能够 看做一个单位，称为操纵子。启动子(Promoter) ： DNA 上的一个特定位点， RNA 聚合酶在此和 DNA 结合，并由此开始转录过程。基因表达 ( Gene expression) : 是指生物基因组中结构基因所携带的遗传信息通过转录、翻译等一系列过程，合成特定的蛋白质，进而发挥其特定的生物学功能和生物学效应的全过程。基因

4、表达( Gene expressing) :is the process from DNA to protein co ntaining transcription and translation.冈崎片段( okazaki fragment) : DNA 半不连续性复制复制过程中至少有一条链第一合成较短的片段，然后再用连接酶连接成大分子DNA 。这些片段称冈崎片段。 在 DNA 不连续复制过程中， 沿着后随链的模板链合成的新 DNA 片段， 其长度在真核与原核生物当中存在差不， 真核生物冈崎片段长度约为100200核甘酸残基，而原核生物的为10002000核甘酸残基。增强子(Enhancer

5、 :能从启动子的上游或下游数千个 bp处来激活转录的序列原件, 是通过启动子来增强基因转录的一种远端基因表达调控元件，长约为50bp,多为重复序列，具有组织细胞特异性，往往优先或只能在某种类型的细胞中表现功能。弱化子(Attenuator) ：是一种位于trpE 基因之前的前导区的转录终止子。该序列由专门的 RNA 发卡环组成，发卡环之后还有8个连续的尿嘧啶碱基，mRNA的合成通常就在此处停止。一个不依靠p因子的终止子区域，能够导致色氨酸RNA 合成提早终止的一段序列。回文序列(Palindrome) ：双链中每一条链均按5-到 3-方向阅读，其序列相同。RNA 加工( RNA process

6、ing) ：对初生转录物进行加工的总称。终止结构： stem-loop 和 hairpin.全酶(Holoenzyme):核心酶加上(T因子所组成的完整的酶。顺式作用元件(cis-element) ：对某一个基因起调控决定作用，然而不转录 ,是指那些与结构基因表达调控有关、能够被基因调控蛋白特异性识不和结合的特异DNA 序列。包括启动子、上游启动子元件、增强子、加尾信号和一些反应元件等。 。反式作用元件：是指真核细胞内含有的大量能够通过直截了当或间接结合顺式作用元件而调剂基因转录活性的蛋白质因子。 反式作用元件与DNA 相互作用且在转录过称中起作用。上游调控元件(URE):位于启动子上游100

7、-200bp范畴内，能够极大地提升低水平转录活性的序列。限制性内切酶( restriction endonuclease) :一种在专门核甘酸序列处水解双链 DNA 的内切酶。减色性/效应hypochromicity ； hypochromic effect 核酸碱基的消光系数与它所处的环境有关。单一的核苷酸的吸取值比 RNA 和单链 DNA 的吸取 值都大单链DNA 又比双链 DNA 大。 这种双链 DNA 有关于单链DNA 吸取值减小的现象就称为减色效应。CpG 甲基化：哺乳动物中一种可能传递信号使得表达基因位点处的染色体保持适当的包装水平的重要化学修饰是序列5 -CG-3 中对胞嘧啶C-

8、5 的甲基化即通常所称的 CpG 甲基化。亚克隆 ( Subcloning) ： 将已克隆的细胞或在载体中的 DNA 进行再次克 隆。增色性/效应hyperchromicity ； hyperchromic effect 由于 DNA 变性引起的光吸取增加称增色效应,也确实是变性后DNA 溶液的紫外吸取作用增强的效应。DNA 变性 (denaturation) 指核酸双螺旋区的氢键断裂，变成单链，不涉及共价键的断裂。DNA 复性 (renaturation) 变性 DNA 在适当条件下又能够使两条彼此分离开的链重新缔合为双螺旋结构。解链温度 (melting temperature)： 升高温

9、度时使DNA 和 RNA 变化， RNA 随温度的升高逐步变性，双链DNA 在某一确定的温度“溶解”为单链DNA ，这一温度为Tm。染色质(chromatin)是细胞核内能够被碱性染料着色的一类非定形物质。染色体(chromosome)M细胞在有丝(减数分裂)时遗传物质存在的特定 形式，是间期细胞染色质结构紧密组装的结果。着丝粒(centromere跺色体中将两条姐妹染色单体结合起来的区域。由无编码意义的高度重复DNA 序列组成，是动粒的形成部位。常染色质(euchromatin)中期染色体比较松散的区域，包括无活性的 30n m 纤丝区和转录活跃区。异染色质(heterochromatin)

10、中期染色质的一部分，结构比较紧密，无转录活性。DNasel超敏性(DNasel hypersensitivity)染色质活性区，或因结合特异蛋白或因进行转录而被松散的 30nm 纤丝的区域， 其特点是对DNAseI 的高度敏锐性。复制子 (replicon) 是 DNA 复制是从一个DNA 复制起点开始， 最终由那个起点起始的复制叉完成的片段。 DNA 中发生复制的独立单位称为复制子。每个复制子使用一次，同时在每个细胞周期中只有一次。复制子中含有复制需要的操纵元件。在复制的起始位点具有原点，在复制的终止位点具有终点。复制子起点(origin)是DNA链上具有专门的具有起始DNA复制功能的碱基顺

11、序。RNA 聚合酶 (RNA polymerase) 以一条 DNA 链或 RNA 为模板催化由核昔-5-三磷酸合成RNA的酶。是催化以DNA为模板(template)、三磷酸核糖核苷为底物、通过磷酸二酯键而聚合的合成RNA 的酶。因为在细胞内与基因 DNA 的遗传信息转录为 RNA 有关，因此也称转录酶。核酸(nucleic acid)由核甘酸或脱氧核甘酸通过 3 , 5-磷酸二酯键连接而成的一类生物大分子。具有专门重要的生物功能，要紧是贮存遗传信息和传递遗传信息。包括核糖核酸(RNA)和脱氧核糖核酸(DNA)两类。核酶(Ribozyme)是具有催化功能的RNA分子，是生物催化剂。核酶又称核

12、酸类酶、 酶 RNA 、 核酶类酶 RNA 。 整个生化反应可由 RNA 酶或核酶催化，这种具有催化功能的 RNA 能够剪切自身或其他的 RNA 分子，或者完成连接或自身剪切反应。核酶能够独自进行催化，但在体内通常与蛋白结合在一起工作，这将提升它们的催化活力。能够作为基因表达和病毒复制的抑制剂。RNA 编辑 (RNA editing)RNA 加工的一种形式， 是通过改变、 插入或删除初生转录物特定部位的残基而改变其中的核苷酸序列。 RNA 编辑会涉及向导 RNA ( RNA 编辑的模板) 。遗传密码 (genetic code) 包含在脱氧核糖核酸或核糖核酸核苷酸序列中的遗传信息。它决定蛋白质

13、中的氨基酸排列顺序，由 3 个连续的核苷酸组成的密码子所构成，因而决定蛋白质的化学构成和生物学功能。核糖体结合位点(ribosome binding site)是原核生物 mRNA起始密码子上游的一段序列它能够与16SrRNA 的 3 端邻近的互补序列配对，对核糖体进行定位以便起始蛋白质的合成。核小体(nucleosome深色体结构的差不多单位，由DNA和组蛋白构成。蛋白质定位(protein targeting潼白质中某些短肽序列可决定蛋白质的细胞定位，如细胞核、线粒体或叶绿体。分泌蛋白的信号序列导致执行翻译的核糖体某些使得核糖体停泊在膜上的因子的结合，并将合成蛋白转至膜外通常信号序列随后被

14、信号肽酶切掉。蛋白质修饰(protein modification) 新生多肽的最常见的加工是被切割及化学修饰。信号肽的切除、多蛋白成熟片段的开释、中间肽的切除以及N端和 C 端的修剪均需要进行切割。除6 种氨基酸侧链外，所有氨基酸侧链都能够进行多种化学修饰。通常磷酸化调控着蛋白质活性。多蛋白(polyproteins)单一翻译产物被切割形成两个或多个独立蛋白，则 被称为多蛋白，许多病毒产生多蛋白。小核RNA (snRNA):是一类称为小核核蛋白体复合体(snRNP)的组成成分，功能是在hnRNA 成熟转变为 mRNA 的过程中，参与RNA 的剪接，运输。southern blot ：基因是D

15、NA 分子，如果基因拷贝数发生变化(增多或减少) ，但基因序列没有改变，就能够按照基因序列合成探针，利用同源互补序列能够退火形成异源双链的原理，探测染色体上能与探针结合的 DNA 序列。northern blot ： 是最早用于定性分析 RNA 的方法， 但当对不同样本总 R NA 或 mRNA 定量后再进行杂交反应时，也能够相对定量分析特定RNA 。蛋白激酶protein kinase：是指能够将磷酸集团从磷酸供体分子转移到 底物蛋白的氨基酸受体上的一大类酶。蛋白磷酸酶protein phosphatase是具有催化差不多磷酸化的蛋白质分子发生去磷酸化反应的一类酶分子，与蛋白激酶相对应存在，共同构成了磷酸化和去磷酸化这一重要的蛋白质活性的开关系统退火annealing:指将温度B至引物的TM值左右或以下，引物与DNA 摸板互补区域结合形成杂交链。咨询答填空describe the principle of PCR.PCR is to be used to amolify a sequen ce of DNA using a pair of primers each complementary to one end of th e DNA ta