生物化学笔记精要

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1、 生物化学:代谢部分每克样品含氮克数6.25100100g样品中蛋白质含量(g%)Gly甘氨酸(G)Gln谷氨酰胺(Q)Glu谷氨酸(E)Ala丙氨酸(A)Arg精氨酸(R)Asn天冬酰胺(N)Asp天冬氨酸(D)Lys赖氨酸(K)Leu亮氨酸(L)Ile异亮氨酸(I)Ser丝氨酸(S)Thr苏氨酸(T)Trp色氨酸(W)Tyr酪氨酸(Y)Cys半胱氨酸(C)Met蛋氨酸(M)Phe苯丙氨酸(F)Pro脯氨酸(P)His组氨酸(H)Val缬氨酸(V)含共轭双键:色氨酸、酪氨酸。紫外吸收:280nm附近为最大峰。蛋白质二级结构:螺旋、折叠、转角、无规卷曲。模体是具有特殊功能的超二级结构,如锌指。

2、蛋白质三级结构:结构域、分子伴侣、次级键(疏水键、盐键、氢键、Van der Waals力等)。蛋白质四级结构中,各亚基间的结合力主要是氢键和离子键。一分子Hb共结合4分子氧。Hb各亚基与O2结合呈正协同效应。大于10个氨基酸的肽称多肽。参与肽键形成的6个原子在同一平面上。B型DNA:右手螺旋,螺旋直径2.37nm,每一螺旋的碱基对数目10.4,螺距3.54nm,相邻碱基对之间的垂直间距0.34nm,反式糖苷键构象,相邻碱基对之间的转角36,使构象稳定的相对环境湿度92%,碱基对平面法线与主轴的夹角1,大沟宽深,小沟窄深。Z型DNA左手螺旋。在所有RNA中,mRNA的寿命最短。hnRNA(不均

3、一核RNA)经剪接成为成熟的mRNA。大部分真核细胞mRNA的起始结构为5末端7甲基鸟嘌呤三磷酸核苷(m7GpppN),即帽结构。真核生物mRNA的3末端有多聚A尾。tRNA含多种稀有碱基。tRNA二级结构似三叶草。tRNA三级结构倒L形。所有tRNA的3末端CCA以结束,氨基酸可通过酯键连接在A上。核酶:催化特定RNA降解。DNA紫外吸收值:最大在260nm附近(嘌呤和嘧啶都含有共轭双键)。Tm(DNA解链温度):50%DNA双链打开。GC含量越高,Tm值越高(GC)。DNA变性:双链解离为单链。snmRNA(非mRNA小RNA)参与基因表达的调控。单纯酶结合酶(全酶酶蛋白辅助因子(金属或辅

4、酶)辅基:与酶蛋白共价结合的辅酶。同工酶催化相同化学反应。Vmax表观Km竞争性抑制不变增大非竞争性抑制降低不变反竞争性抑制降低降低酶分六大类:氧化还原酶类、转移酶类、水解酶类、裂解酶类、异构酶类、合成酶类。名称辅酶或辅基辅酶A(CoA)泛酸磷酸吡哆醛(胺)Vit B6TPP(焦磷酸硫胺素)Vit B1(硫胺素)FMN(黄素单核苷酸)FAD(黄素腺嘌呤二核苷酸)Vit B2(核黄素)NAD(辅酶,尼克酰胺腺嘌呤二核苷酸)NADP(辅酶)尼克酰胺(VitPP之一)钴胺素辅酶类Vit B12四氢叶酸叶酸生物素生物素米氏方程Na依赖型葡萄糖转运体(SGLT)主要存在于小肠黏膜和肾小管上皮细胞。血中葡

5、萄糖进入细胞依赖一类葡萄糖转运体GLUT,已发现5种,GLUT1主要存在于脑、肌、脂肪等组织中,GLUT2主要存在于肝和胰的细胞中,而GLUT4主要存在于脂肪和肌组织中。酶活性中心有的基团作为质子的供体(酸)一般酸碱催化作用。提供电子 亲核催化作用。糖无氧氧化反应过程分为糖酵解途径和乳酸生成两阶段。由葡萄糖分解成丙酮酸,称糖酵解途径。葡萄糖经己糖激酶磷酸化为6磷酸葡萄糖,哺乳类动物体内已发现4种己糖激酶同工酶,肝细胞中存在的是型,称葡萄糖激酶,对葡萄糖亲和力很低。糖酵解途径中有3个非平衡反应:己糖激酶(葡萄糖激酶)、6磷酸果糖激酶1和丙酮酸激酶催化的反应。6-磷酸果糖激酶-1对调节糖酵解途径的

6、流量最重要,ATP和柠檬酸是此酶的变构抑制剂,变构激活剂有:AMP、ADP、1,6二磷酸果糖和2,6二磷酸果糖(F2,6BP)(最强)。己糖激酶受其反应产物6磷酸葡萄糖的反馈抑制,葡萄糖激酶分子内不存在6磷酸葡萄糖的变构部位,故不受6磷酸葡萄糖的影响。糖有氧氧化的反应过程包括糖酵解途径、丙酮酸氧化脱羧、三羧酸循环及氧化磷酸化。丙酮酸进入线粒体氧化脱羧生成乙酰CoA,此反应由丙酮酸脱氢酶复合体催化,参与的辅酶有硫胺素焦磷酸酯(TPP)、硫辛酸、FAD、NAD及CoA。在真核细胞中,丙酮酸脱氢酶复合体存在于线粒体中,是由丙酮酸脱氢酶(E1),二氢硫辛酰胺转乙酰酶(E2)和二氢硫辛酰胺脱氢酶(E3)

7、三种酶按一定比例组合成多酶复合体,其组合比例随生物体不同而异。8种营养必须氨基酸:亮、异亮、苏、缬、赖、甲硫、苯丙、色氨酸。三羧酸循环(TCA循环,柠檬酸循环,Krebs循环):首先由乙酰CoA(主要来自于三大营养物质的分解代谢)与草酰乙酸缩合生成含3个羧基的柠檬酸,再经4次脱氢、2次脱羧,生成4分子还原当量和2分子CO2,重新生成草酰乙酸的循环反应。TCA循环本身每循环一次只能以底物水平磷酸化生成1个GTP。TCA循环中有3步不可逆反应(3个关键酶):柠檬酸合酶、异柠檬酸脱氢酶和酮戊二酸脱氢酶催化的反应。TCA循环是3大营养素的最终代谢通路,是糖、脂肪、氨基酸代谢联系的枢纽。1分子乙酰CoA

8、经三羧酸循环彻底氧化分解共生成10个ATP。TCA循环:(乙酰CoA草酰乙酸)柠檬酸顺乌头酸异柠檬酸酮戊二酸琥珀酰辅酶A琥珀酸延胡索酸苹果酸草酰乙酸磷酸戊糖途径生成NADPH和磷酸戊糖(胞质中进行)。糖酵解:葡萄糖6-磷酸葡萄糖6-磷酸果糖1,6-双磷酸果糖3-磷酸甘油醛1,3-二磷酸甘油酸3-磷酸甘油酸2-磷酸甘油酸磷酸烯醇式丙酮酸丙酮酸乳酸糖酵解两次底物水平磷酸化:1,3-二磷酸甘油酸变成3-磷酸甘油酸,磷酸烯醇式丙酮酸变成丙酮酸。糖原合酶作用下,形成1,4糖苷键,糖链只能延长。分支酶将糖链以1,6糖苷键相接,形成分支。糖原合酶是糖原合成的关键酶,糖原合酶a有活性,磷酸化成糖原合酶b后即失

9、去活性。糖原磷酸化酶只能分解1,4糖苷键,1,6葡萄糖苷酶水解与糖链形成分支的葡萄糖基。糖原磷酸化酶是糖原分解的关键酶,磷酸化酶b磷酸化为磷酸化酶a时活性增强。糖原合成糖原分解1,4糖苷键糖原合酶糖原磷酸化酶活性a有活性b磷酸化活性增强ba磷酸化失去活性活性很低1,6糖苷键分支酶-1,6-葡萄糖苷酶糖原合成中,UDPG(尿苷二磷酸葡萄糖)充作葡萄糖供体。肝糖原分解最终产物中约85%为1磷酸葡萄糖,15%为游离葡萄糖。1磷酸葡萄糖转变为6磷酸葡萄糖后,由葡萄糖-6-磷酸酶水解成葡萄糖入血。葡萄糖-6-磷酸酶只存在于肝、肾中。肌糖原不能补充血糖。乳酸循环(Cori循环):肌中产生的乳酸运输至肝进行

10、糖异生。三碳途径(间接途径):摄入的相当一部分葡萄糖先分解成丙酮酸、乳酸等三碳化合物,然后再异生成糖原。糖异生途径:从丙酮酸生成葡萄糖的具体反应过程。软脂酸16:0,硬脂酸18:0.小肠上段是脂类消化的主要场所,脂类消化产物主要在十二指肠下段及空肠上段吸收。胰腺分泌如十二指肠中消化脂类的酶有胰脂酶、辅脂酶、磷脂酶A2、胆固醇酯酶。甘油三酯是脂酸的主要储存形式,是机体的主要能量储存形式。脂肪动员:储存在脂肪细胞中的甘油三酯,被酯酶逐渐水解为游离脂肪酸(FFA)和甘油并释放入血,通过血液运输至其他组织氧化利用的过程。肝细胞的甘油激酶活性最高,脂肪动员产生的甘油主要被肝细胞摄取利用。脂酸的活化形式为

11、脂酰CoA,(长链) 脂酰CoA经肉碱转运进入线粒体。肉碱脂酰转移酶是脂酸-氧化的限速酶。经脱氢、加水、再脱氢及硫解等四步连续反应,一次氧化可产生1分子乙酰CoA、1分子FADH2、1分子NADHH和比氧化前少2个碳原子的脂酰CoA。除脑组织外,大多数组织均能氧化脂酸,但以肝及肌最活跃。长期饥饿、糖供应不足时酮体可代替葡萄糖成为脑等组织的主要能源。酮体包括乙酰乙酸、丙酮、羟基丁酸。酮体:肝内合成,尤其HMGCoA合成酶(羟甲基戊二酸单酰CoA合成酶);肝外利用。1分子FADH2通过呼吸链氧化产生1.5分子ATP,1分子NADHH氧化产生2.5分子ATP,1分子乙酰CoA通过三羧酸循环氧化产生1

12、0分子ATP。脂酸活化时消耗2个高能磷酸键(相当于2个ATP)。1分子软脂酸彻底氧化共生成108个ATP,净生成106分子ATP。乙酰CoA是合成脂酸的主要原料,主要来自葡萄糖。线粒体内的乙酰CoA主要通过柠檬酸丙酮酸循环进入胞液。乙酰CoA羧化酶存在于胞液中,将乙酰CoA羧化为丙二酰CoA,是脂酸合成的限速酶,辅基为生物素,Mn为激活剂。柠檬酸、异柠檬酸可使其由无活性的单体聚合成有活性的多聚体,而软脂酰及其他长链脂酰CoA则能使其解聚失活。乙酰CoA羧化酶可被一种依赖于AMP(不是cAMP)的蛋白激酶磷酸化而失活。脂酸合成,每次延长2个碳原子。大约一半以上的甘油三酯水解至甘油一酯后即被吸收。

13、肠黏膜细胞中由甘油一酯合成脂肪的途径称甘油一酯途径。甘油二酯途径是肝细胞及脂肪细胞合成甘油三酯的主要途径。甘油三酯脂酶是脂肪动员的限速酶,又称激素敏感性甘油三酯脂酶(HSL)。除红细胞外,全身各组织均有合成PG的酶系。花生四烯酸可合成PG、TX、LT(白三烯)。由鞘氨醇或二氢鞘氨醇构成的磷脂称鞘磷脂。神经酰胺与磷酸胆碱结合生成神经鞘磷脂。心磷脂(二磷脂酰甘油),是线粒体膜的主要脂质,是仅有含双甘油的磷脂。磷脂酰肌醇是第二信使的前体,被磷酸化生成磷脂酰肌醇-4,5-2磷酸(PIP2),PIP2可分解为二脂酰甘油(DAG)及三磷酸肌醇(IP3),二者均为重要第二信使。甘油磷脂合成的基本原料为甘油、

14、脂酸、磷酸盐、胆碱、丝氨酸、肌醇等。CTP在磷脂合成中为合成CDP乙醇胺、CDP胆碱及CDP甘油二酯等活化中间物所必需。甘油磷脂的合成有甘油二酯合成途径和CDP甘油二酯合成途径两条途径。类固醇的母体结构为环戊烷多氢菲。胆固醇仅存在于动物体内。除成年动物脑组织及成熟红细胞外,几乎全身各组织均可合成胆固醇。胆固醇合成酶系存在于胞液及光面内质网膜上。HMGCoA还原酶催化HMGCoA还原生成甲羟戊酸(MVA),是合成胆固醇的限速酶。胆固醇合成:甲羟戊酸鲨烯胆固醇。磷脂酰乙醇胺(脑磷脂)磷脂酰胆碱(卵磷脂)血脂:血浆所含脂类的统称。apoB100是迄今世界上阐明一级结构的分子量最大的蛋白质。CM由小肠

15、黏膜细胞合成,运输外源性甘油三酯至骨骼肌、心肌、脂肪等组织,运输外源性胆固醇至肝。LDL主要由VLDL在人血浆中转变而来,是转运肝合成的内源性胆固醇的主要形式。HDL主要功能是参与胆固醇的逆向转运(RCT),即将胆固醇从肝外组织转运至肝。HDL及VLDL主要由肝细胞合成,小肠亦可合成部分。HDL主要含apoA及apoA,LDL几乎只含apoB100;VLDL除含apoB100外,还有apoC、apoC、apoC及apoE;CM含apoB48,而不含apoB100.CM含脂最多,密度最低,电泳最慢。脂蛋白电泳:CM前密度:CMVLDLLDLHDLCM及VLDL主要以甘油三酯为内核,LDL及HDL主要以胆固

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