联苯结构及结构解析操作软件

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1、二面角C(6)-C(5)-C(7)-C(8)139.769C(6)-C(5)-C(7)-C(12) -40.231联苯维基百科,自由的百科全书联苯(化学式:c12h10)是两个苯基相连形成的化合物,无色至淡黄色片状晶体, 有特殊香味.常用作有机合成前体,衍生物包括联苯胺、联苯酩,八溟联苯酰、多 氯联苯等勺联苯天然存在于煤焦油、原油和天然气中。不溶于水,但溶于有机溶剂 中。联苯中间的化学键可以目由旋转,但若四个冷R位有体积较大的基团时,旋转受阻, 会产生阻转异构体日此类型的化合物(BINAF)可以作手性配体,以联苯为例, 其平衡态的扭转角为444七0。和90时的能垒分别为6.0kJ/moW6.5

2、kJ/molo 111取代联苯可通过Sue uki反应和Ullman ri反应等偶联反应制取。结构解析:在DOS下:1、用DIR、CD打开原始结构数据所在的文件夹:双击命令提示符后将出现如下命令:(输入数据所在的硬盘)(用CD命令打开目标文件夹)C:Documents and SettingsAdinistrator E:E:CD (目标文件夹)E:.DIR(DIR命令打开该文件夹确认有无,dat文件、.hkl文件 和.inf文件。因这三文件为 解结构的基本文件,包含了 该结构的所有晶体学数据。)2、有了数据后从该步开始将进行结构的解析:E:.XPREP(在目标盘下输入XPREP命令)输入后将

3、出现标题为XPREP的窗口,然后在该窗口中按提示依次进行输入:Input file name.: shelxl.hkl(输入 hkl 文件的文件名),按回车出现:Enter cell:(该步是要求输入晶胞参数,可打开.inf文件,找到第一个词“cell”的一行,将有a,b,c, 六个参数,依次输入数字即可,然后回车,在回车的时候会有一些“select”,这是程序根 据六个参数对晶系、空间群的选择,一般系统会按照对其进行判断选择一些较为合理的参数, 在解结构的初期一般不要去修改,等在解结构的过程中有疑问再做适当的改动);在一系列回车后会出现如下一行:Enter element:(这是要求输入该结

4、构中可能存在的元素,一般把实验中用到的元素输进去,如CHONCu, 该输入不空格也没有先后顺序)输入完后仍然按回车;最后还要求输入输出的文件名:Output file:tref(输入输出文件的文件名)Do you?Y(是否需要保存)按回车后退出xprep,此时将返回DOS下运行。通过该过程产生了两个名为tref的.ins文件和.hkl文件,这两个文件为系统能够进行处理 的文件。3、得到.ins文件和.hkl文件后,此时就可以对数据进行处理。在DOS下运行:E:XS tref(该步骤是程序根据最小二乘法对所得的数据进行模型化处理)计算完毕后,输入:E:XP(运用该命令将查看所得图形并对其修改)4

5、、Xp下运行:Read trefFmolProjPick(确认可能存在的Q值并进行命名)File shx97.ins(保存刚才所做的修改,并另存为shx97.ins)Enter.:tref(系统要求输入原始文件名)Quit然后再回到DOS下:E:COPY tref.hkl shx97.hklE:xl shx97(对.ins文件进行处理)E:Edit shx97.res(计算后的所得结果将以.res的文件输入,即结果文件;注意:若 对.res文件进行了修改并想让该 修改有效的话需将其另存为.ins 文件,因xl精修命令质对.ins文 件进行处理,而.res文件只是处 理的结果文件)计算后再进入X

6、P中进行修改,此时:Reap shx97(读取的是修改文件shx97,此时包含了计算后说产生的Q值;如 果不想读取Q值只需read shx97, 这样只读取命名了的元素)FmolProjPickFile shx97.insEnter (此时只需回车就可以了,因读取的文件为shx97,所以不用输入)Quit然后再回到DOS下又计算,E: XL SHX97E:XP这样不断的重复操作直到将最大Q值尽可能的降到1左右,R1值接近于0.03, S值接近于 1,这样结构已基本解完。对于重原子,应该在其下面加一行ANIS修改文件中间保存的ins加入HTABBond $HWght 0.2Exti 0.0005

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