PDB数据库中查找蛋白质结构数据

上传人:枫** 文档编号:464306483 上传时间:2022-09-27 格式:DOCX 页数:5 大小:270.92KB
返回 下载 相关 举报
PDB数据库中查找蛋白质结构数据_第1页
第1页 / 共5页
PDB数据库中查找蛋白质结构数据_第2页
第2页 / 共5页
PDB数据库中查找蛋白质结构数据_第3页
第3页 / 共5页
PDB数据库中查找蛋白质结构数据_第4页
第4页 / 共5页
PDB数据库中查找蛋白质结构数据_第5页
第5页 / 共5页
亲,该文档总共5页,全部预览完了,如果喜欢就下载吧!
资源描述

《PDB数据库中查找蛋白质结构数据》由会员分享,可在线阅读,更多相关《PDB数据库中查找蛋白质结构数据(5页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。

1、PDB数据库中查找蛋白质结构数据1.查找蛋白质结构,在检索框输入关键字或名称。在线观看三维数据结构SummnrySeqruenceIijinotatiDnsJSeq_Simdlanty3DSimilartUteratureIBiol.&Chem.*Methc-dsTGeamBtrY11LinksCrystalstructureofhumancytoglobinat1.68angstromsresolution2DC3HDiplrty拜Im*DownlondFik*TDSbw?nIhrePge审Dol:lo.Jlu/pdbJdc3/pdbPrlnidryGldllonHighresolution

2、structureofhuimancvtoalcpbin:identificationofextraN-andCtemninizmdanewdlmeirizaliaiimcKlie-MkinA,H.j.H.;H丄:*N.IL;环itqJ*Mrnol:C2QM)AdiCnftillogr.vctJD62671-77PubMedsldohin.na7/soiW744J.MnnoilScorchRelntedAjrtkiinPubMedPiiftkNrdAbyrrtdlzCtookJbwi(CgbJis真电忒lydiscoveredrnenibeferfkhaertebrehswi-centfini

3、ngglobinMmilpThpsrnjclhjrpnFanrwrrvtslfarmofwildtYpghuin.anCgb(tpacf霄noupC2wasdereiriinnedacairE&alunkmar3_6SAngakroirLThereauits前口曲Meprence.ReddMure些StidrdhPubMed皿UmcJE占J4.选择3Dview,可视化蛋白三维结构视图呈现。且数据量较大,需要较长的时间才能在窗口显示。由于是远程计算机服务器进行图型构建,Jbl5.蛋白结构显示的参数设定:SlTiictijri?D科刮阻OSVniFifltFVT中軒SvmmiStfvStoichi

4、ometrYStlec:Oi-irtlabjhSjjmmilryCustonC2曲召5*P-lCT和1刖MotkOSLrinr自定义设定脚本选项:UyMrip怖nOptionsUomnlnAs$k)inmMirDPOMann1LOCridonchfsiriotkMiMtOlrtJk2DC3Aa2DC3AJ0A:42DC3BC32DC3B00-POPOjaa2DC3AaA:17-L?a初IXZJHd2bC3BLegend:AcliirktcviwinJnwlDciEikdiiih、下载三维数据文件1.在查询结果窗口的右边找到以下图型。2DC3時DisplayFiles1DownloadFiles

5、5tiareihisPage如图:选择DownloadFiles。2确定下载的文件类型,一般根据你要使用蛋白质结构数据而定。closeFASTASaqurKQputHlc;lcO:UhI-le:DZmmClFFilefeci:nle;oejJiDBpri/XMLHlePDBMLAMLHie(az)btrjaure卜actor(lextjtrutnjre卜actor(o?选择PDBFile(Text).BiologicalAsantibly3.用写字板打开PDB文件,可以看到蛋白质数据库文件实质也是文本文件。JEQIHCCITEII尿詁偉miSFOfT21-DBC-2K3TITL1休苗USTWC

6、TTM轉时占CmUOEElJiTLfifl晒:亦房TTn.12EECLCTTlEXHPE?HOLID:1OMF2KLBLE;C7MKUIKI.CUIFKj3.CBiXMLA.Ba0:fPK-4S11i:ll.口97如LOMIhHCILSTILLA7BLLiCTIllTiai-COIF1CS(LS5DC1JT1TFH7TEIIepi?mKVfRklDl1.snnrazareAjiiai-ErinmFir:tonsirzcismm$ij科肆阁iaw;rviyi.财麻QIC和e.Ti駅gMKS5STMU7BfliTTEH占.啊険4G|E!灯.SOUKS予HFfiESTaS_SVSTHi-ESTHEB

7、rCHTAOHIH_2iT2fi3.ftjiiioa:unii2idi_arsrfii_rjLi:D:妙0昭,9QVRHSIfffilSQlLSTSTEIuSTlUillsBL勺山1.suuRca山enissiaijTSTEi邛Erns_ni?flaslo.iiloi.arcTHK.PiJiha1d.pmaiEHTTHSmTELjCEnLnrcUJEII,HEKIraiTCHTEIRZFlfiT.匸OCEI&YiteZfiWQferMKEifTtiJCfflulCtw忙卽陀也軋忙占上献JThli帅!.ffTTO3RIVIiWRnTIMLIFiDM金欝it卜悴zca1OSSi4.下载Pymol,

8、并安装。点DOWNLOAD进入下载,选择windows版本,并安装(需要paymoney)。SuppirtPyMOLAilliAftSjiJr灿二11出二0丫I.lifll*i*Ilr-!*=i-tfri-.v.:和SrhrofTifigwDOWNLOADPyHOtniMdrBXONews4附aiiDUF-l.lOL.HrjLrd.f.lCH-yl7jjl.h底勲如:u*内Rh-rt-或到此网站下载:选择win32,1.7.1.1版本。并安装,需要python编程软件的支持,可从360软件管件直接安装。安装如图:pymoh1.7.1.1使用详情参见教程,注意打开程序需要找到python的安装目录:C:Python27PyMOL,找到文件,双击启动程序。打开或使用RasMol软件进行三维视图分析,步骤同上。

展开阅读全文
相关资源
相关搜索

当前位置:首页 > 办公文档 > 活动策划

电脑版 |金锄头文库版权所有
经营许可证:蜀ICP备13022795号 | 川公网安备 51140202000112号