细菌基因组DNA提取方法

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1、细菌基因组 DNA 提取方法1、取1.5mL菌液于2mL离心管,12000rpm离心5min,弃上清;2、加入600ul 1xTE重悬菌体沉淀,4C 12000rpm离心5min,弃上清;3、加入450ul 1xTE和50ul 10mg/mL溶菌酶和10ul 100mg/mL蜗牛酶,吹吸混匀,37C 孵育1h (或4C过夜),每隔15min颠倒混匀一次;4、加入600ul TENS裂解液,和与沉淀等体积的玻璃珠,吹吸混匀,涡旋震荡10min 后,再加入30ul 20mg/mL蛋白酶K,吹吸混匀,55C孵育1h,每隔15min颠倒混匀一次;5、4C 12000rpm离心10min,转移上清至另一

2、个干净的1.5mL离心管;6、加入等体积的酚:氯仿:异戊醇(25:24:1),充分混匀,-20C静置2min,4C 12000rpm 离心5min;7、转移上清至另一个干净的1.5mL离心管,加入等体积的氯仿:异戊醇(24:1),充 分混匀,-20C静置 2min,4C 12000rpm 离心 5min;8、转移上清至另一个干净的1.5mL离心管,加入1/10体积的3M醋酸钠,2倍体积(加 入醋酸钠后的终体积)预冷的无水乙醇,充分混匀,-20C沉淀2h。(或加入0.6-0.8倍体 积的异丙醇,-20C沉淀2h), 4C 12000rpm离心10min,弃上清;注:如需得到纯度更高的样品,可先用

3、异丙醇沉淀,无菌水充分溶解后,离心取上清, 再用醋酸钠+无水乙醇沉淀一次。9、加入600ul预冷的70%乙醇洗涤DNA沉淀,颠倒混匀,4C 12000rpm离心5min,弃 上清;重复洗涤一次。10、吸干离心管中的残留液体,待离心管风干后,加入30ul无菌水和0.5ul10mg/mL的 RNase A,吹吸混匀,取3ul电泳检测,剩余置于-20C保存。附:一、所需仪器恒温水浴锅、高压灭菌锅、高速冷冻离心机、超净工作台、通风橱、电子天平、称量纸、药 匙、各种规格移液器及吸头、剪刀、1.5mL离心管、2mL离心管、15mL离心管、50mL离心管、 涡旋震荡仪、掌上离心机、4C及-20C冰箱、微波炉

4、、电泳仪、凝胶成像仪、Nanodrop微 量分光光度计、烧杯、三角瓶、量筒、玻璃棒、封口膜、橡皮筋。二、所需试剂75%酒精、Tris、浓盐酸、EDTA、溶菌酶、蜗牛酶、蛋白酶K、NaCl、SDS (十二烷基磺酸钠)、 Tri ton XT00、NaAc (醋酸钠)、冰乙酸、无水乙醇、无菌水(或超纯水)、Tris饱和酚、 氯仿(三氯甲烷)、异戊醇、异丙醇、玻璃珠(直径1-2mm)、琼脂糖凝胶、RNaseA10XTE (pH 8.0)100 mM Tris-Cl,pH 8.010 mM EDTA,pH 8.0高压灭菌,室温保存,使用时超纯水稀释至1X浓度。1M Tris-HCl(pH 8.0)16

5、0 mL H),24.22g Tris碱,加入浓HCl 8.4 mL后冷却至室温,调pH 8.0,定容至200 mL。 高压灭菌,室温保存。0.5M EDTA(pH 8.0)160 mL HO, EDTA-Na-2H O (37.22g),磁力搅拌,用 NaOH (约 4g )调 pH 8. 0,定容至 200mL。 高压灭菌,室温保存。TENS裂解液终浓度Tris-Cl100 mM (pH&0)EDTA50 mMNaCl200 mMSDS2.0 %(w/v)Triton X-100 0.5%(v/v)母液浓度1M0.5M5M10%体积20mL20mL 8mL 40mL-J四种溶液混合后,再加

6、入ImLA Triton X-100,超纯水定容至200mLo高压灭菌,室温保存。蛋白酶K (20 mg/mL)工作浓度:l-2mg/mL用50 mM Tris-Cl (pH &0), 1.5 Mm Ca(Ac)2溶解蛋白酶K粉末,配制成20 mg/mL的贮存 液,过滤除菌,分装,-20C保存。2溶菌酶(10 mg/mL)工作浓度:lmg/mL用10 mM Tris-Cl (pH & 0)溶解溶菌酶粉末,配制成10 mg/mL的贮存液,过滤除菌,分 装,-20C保存。蜗牛酶(100 mg/mL)工作浓度:lmg/mL用10 mM Tris-Cl (pH & 0)溶解蜗牛酶,配制成100mg/mL的贮存液,过滤除菌,分装, -20C保存。RNase A(10 mg/mL)工作浓度:0.1mg/mL将 RNase A 溶解在 10 mM NaAc (pH 5.2)中,使终浓度为 10 mg/mL,100C加热 15 min, 室温下缓慢冷却,用0.1倍体积的1M Tris-Cl调整pH至7.4后,过滤除菌,分装,-20C 保存。TAE电泳母液(50X)Tris冰乙酸EDTA ddH?。定容至242g57.1 ml37.2g1L

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