单击此处编辑母版标题样式,单击此处编辑母版文本样式,第二级,第三级,第四级,第五级,*,第九章 多相分类,放线菌系统学的两个基本任务：,一是利用现代系统学的理论和手段，将分类的对象置于适当的分类界元；,二是研究分类单元（,taxa,）之间的系统发育关系多相分类,(,polyphasic,systematics,),利用现代技术手段获得的放线菌表观和分子信息，进行放线菌的分类鉴定研究多相分类,(,polyphasic,systematics,),多相分类（,polyphasic,taxonomy,）的概念最初由,Colwell,于,1970,年提出，指利用微生物多种不同的信息，包括,表型、基因型和系统发育的信息,，综合起来研究微生物分类和系统进化的过程多相分类几乎包括了现代分类中所有方面，如,传统分类、化学分类、分子分类、数值分类,等，被认为是目前研究各级分类单位的最有效手段，可用于所有水平上的分类单位的描述和定义多相分类信息在不同分类水平的适用性,9.1,种的概念,“种”是最基本的分类单位,(,taxa,),目前大家比较接受的概念是：,16S,rRNA,相似性,小于,98,（,序列碱基差异数小于,2obp,),、,DNA,同源性,小于,70,为“种”的界限。
这不是绝对的，也非唯一标准16S,rRNA,相似性在,98.5,-99,，仍有,50,可能是新种当前不主张定变种或亚种9.2,属的概念,16S,rRNA,相似性小于,95,，,且在进化树上形成稳定的独立分支（,dade,),，又具有特征性碱基，可以大体作为属的界限很多放线菌的细胞壁都同时含有,L-DAP,和,me-so-DAP,，难以按,Lechevalier,夫妇的分型原则划分成不同的氨基酸类型；全细胞糖的含量也同样难于分型在做属的描述时，就直接叙述,16S,rRNA,特征性碱基和细胞壁氨基酸末端序列，细胞壁氨基酸、全细胞糖、磷脂、醒、脂肪酸,等的组成9.3,值得进行分类鉴定的菌株,当前要完成一个菌株的多项分类，将其鉴定到种，一般需要,3-6,个月时间，至少,5000,元人民币,的花费从发现新资源的角度，什么菌株值得鉴定？,值得分类鉴定的菌株,第一，具有特殊形态与化学的菌株,如细胞壁含,L-DAP,和甘氨酸，气丝顶端有大孢囊，孢囊孢子游动或不游动细胞壁含,meso,-DAP,和甘氨酸，气丝有孢囊或长孢子链；气丝断裂第二，具有特殊生理特性的菌株,如能在,15,以上氯化钙，,25,以上其他盐生长的菌种；能在,pH 12,以上或,3,以下,生长的菌种；能在,90,以上、,4,生长良好的菌种；,抗高辐射,的菌种等，从这些菌株发现新物种的可能性很大。
第三，有实际用途或有开发前景的菌株即使是已知种也应该鉴定9.4,放线菌分类鉴定的基本程序,菌株,提取,DNA,16SrDNA,序列测定、提交,Genbank,搜索相似性序列，比对PCR,扩增,16SrDNA,可能新种,已知种,构建进化树,多相分类,9.5,放线菌分类地位,伯杰氏细菌系统学手册,(,第二版,),将放线菌归属于,:,细菌域 古生菌域 真核生物域,放线菌门,放线菌纲,放线菌亚纲,放线菌目,放线菌科,放线菌属,放线菌种,放线菌纲分为,5,个亚纲：,酸微菌,亚纲,(,Acidimicrobidae,),：,红色杆菌,亚纲,(,Rubrobacteridae,),：,科里氏杆菌,亚纲,(,Coriobacteridae,),：,球杆菌,亚纲,(,Sphaerobacteridae,),：,放线菌,亚纲,(,Actinobacteridae,双歧杆菌目,放线菌目,10,亚目、,40,个科、,170,多个属,谢 谢！,。