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分子生物学 复习资料

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分子生物学 复习资料_第1页
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一、 名词解释1、 c值和c值反常现象:生物单倍体基因组DNA的总量称为C值;C值往往与种系进化复杂程度不一致,某些低等生物却具有较大的C值,这就是著名的“C值反常现象”2、 DNA的转座和转座子:DNA的转座:由可移位因子介导的遗传物质重排现象,转座子(transposon):存在与染色体DNA上可自主复制和位移的基本单位3、 复制原点:是在基因组上复制(replication)起始的一段序列 其中复制可以是在生命体中(如真核生物或者原核生物)的DNA复制,或者是在RNA病毒里面的RNA复制4、 顺式作用元件:存在于基因旁侧序列中能影响基因表达的序列,包括启动子、增强子、调控序列和可诱导元件等,本身不编码任何蛋白质,仅仅提供一个作用位点,与反式作用因子相互作用参与基因表达调控5、 启动子:是一段位于基因5’端上游区的DNA序列6、 增强子:能强化转录起始的序列为增强子7、 沉默子:某些基因含有负性调节元件——沉默子,当其结合特异蛋白因子时,对基因转录起阻遏作用8、 反式作用因子:是指能直接或间接地识别或结合在各类顺式作用元件核心序列上参与调控靶基因转录效率的蛋白质9、 锌指结构: 是一种常出现在DNA结合蛋白中的结构基元(motif)。

是由一个含有大约30个氨基酸的环和一个与环上的4个Cys或2个Cys和2个His配位的Zn构成,形成的结构像手指状 10、 外显子:真核细胞基因DNA中的编码序列,这些序列被转录成RNA并进而翻译为蛋白质11、 内含子:真核细胞基因DNA中的间插序列,这些序列被转录成RNA,但随即被剪除而不翻译 12、 选择性剪切:同一基因的转录产物由于不同的剪接方式形成不同mRNA 13、 基因重排:通过基因的转座或DNA的断裂错接等形式使正常基因序列发生改变,使一个基因从远离启动子的地方移到距它较近的位点从而启动转录14、 SNP:单核苷酸多肽性,指基因组DNA序列中由于单个核苷酸(A,T,G和C)的突变而引起的物种多态性15、 EST: 通过从cDNA文库中随机挑选的克隆进行测序所获得的部分cDNA的5'或3'端序列称为表达序列标签(EST),一般长300-500bp左右 16、 比较基因组学:在基因组图谱和序列分析的基础上,对已知基因和基因组结构进行.比较,了解基因的功能,表达调控机制和物种进化过程的学科17、 功能基因组学:利用结构基因组学提供的信息,以高通量,大规模实验方法及统计与计算机分析为特征,全面系统地分析全部基因的功能。

18、 遗传标记:指可识别的、按孟德尔方式遗传、能反映个体遗传多态性的等位基因或标志物可追踪染色体、染色体某一节段、某个基因座在家系中传递的任何一种遗传特性19、 cDNA:在体外以mRNA为模板,利用反转录酶和DNA聚合酶合成的一段双链DNA.20、 信号肽:在起始密码子后,有一段编码疏水性氨基酸序列的RNA区域,被称为信号肽序列,它负责把蛋白质引导到细胞内不同膜结构的亚细胞器内21、 开放阅读框:从mRNA 5¢端起始密码子AUG到3¢端终止密码子之间的核苷酸序列,各个三联体密码连续排列编码一个蛋白质多肽链,称为开放阅读框架22、 操纵子:指原核生物中由一个或多个相关基因以及转录翻译调控元件组成的基因表达单元23、 可诱导调节:是指一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用下,由原来关闭的状态转变为工作状态,即在某些物质的诱导下使基因活化24、 可阻遏调节:这类基因平时都是开启的,处在产生蛋白质或酶的工作过程中,由于一些特殊代谢物或化合物的积累而将其关闭,阻遏了基因的表达25、 弱化子:是指原核生物操纵子中能显著减弱甚至终止转录作用的一段核苷酸序列,该区域能形成不同的二级结构,利用原核生物转录与翻译的偶联机制对转录进行调节。

·26、 前导序列:在trp mRNA5'端trpE基因的起始密码前一个长162bp的mRNA片段二、 填空1、 基因表达调控的表现:基因表达调控主要表现在信号传导研究、转录因子研究及RNA剪辑3个方面2、 组蛋白的种类:组蛋白是染色体的结构蛋白,分为H1、H2A、H2B、H3及H4五种,与DNA共同组成核小体3、 染色质的基本结构单位,由什么组成?: 染色质是一种纤维状结构,叫做染色质丝,它是由最基本的单位——核小体(nucleosome)成串排列而成的4、 原核生物转座子的类型: 1、插入序列2、复合转座子3、TnA家族5、 终止密码子:UAA ,UAG ,UGA6、 反式作用因子的结构: DNA结合结构域,连接区, 转录活化结构域7、 真核生物基因表达调控的分类: 根据其性质可分为两大类:一是瞬时调控或称为可逆性调控,它相当于原核细胞对环境条件变化所做出的反应瞬时调控包括某种底物或激素水平升降时,及细胞周期不同阶段中酶活性和浓度的调节二是发育调控或称不可逆调控,是真核基因调控的精髓部分,它决定了真核细胞生长、分化、发育的全部进程根据基因调控在同一事件中发生的先后次序又可分为:DNA水平调控--转录水平调控--转录后水平调控(RNA加工成熟过程的调控、翻译水平的调控、蛋白质加工水平的调控)8、 转录后水平的调控包括哪些?: (一)RNA的加工成熟1、rRNA和tRNA的加工成熟, rRNA的加工:分子内的切割和化学修饰, rRNA的切割, rRNA的化学修饰 原核生物:碱基甲基化 真核生物:核糖甲基化,tRNA的加工,2、mRNA的加工成熟,3、真核生物基因转录后加工的多样性9、 真核生物DNA水平上的基因表达调控包括哪些: 基因丢失, 基因扩增, 基因重排(抗体分子的形成,Ti质粒,转座子 ), DNA的甲基化与基因表达调控染色质的结构与基因表达调控,10、 DNA甲基化导致了什么变化,影响了哪些功能?: DNA甲基化导致某些区域DNA构象变化,从而影响了蛋白质与DNA的相互作用,即抑制了转录因子与启动区DNA的结合效率。

11、 真核细胞中基因转录的模板是什么: 模板链 (反义链)12、 rRNA的化学修饰主要是哪种?原核生物与真核生物的区别13、 HGP主要完成哪四张图:物理图、 转录图,遗传图 、序列图 14、 重组DNA的核心是什么?重组DNA的核心是用限制性核酸内切酶和DNA连接酶对DNA分子进行体外切割和连接这些酶的发现和应用是现代生物工程技术史上最重要的事件15、 遗传标记的基本特征: 可遗传性(跨代追踪),可识别性(多态性)16、 PCR技术: 将RNA的反转录(RT)和cDNA的聚合酶链式扩增(PCR)相结合的技术首先经反转录酶的作用从RNA合成 cDNA,再以cDNA为模板,扩增合成目的片段 17、 RACE技术:经典的RACE技术是由Frohman等(1988)发明的一项技术,主要通过RT-PCR技术由已知部分cDNA序列来得到完整的Cdna5’和3’端,包括单边PCR和锚定PCR 18、 什么是蛋白质组学?试验方法?:指应用各种技术手段来研究蛋白质组的一门新兴科学,其目的是从整体的角度分析细胞内动态变化的蛋白质组成成份、表达水平与修饰状态,了解蛋白质之间的相互作用与联系,揭示蛋白质功能与细胞生命活动规律。

双向电泳技术,新型非凝胶技术 19、 蛋白质的跨膜影响的因素?蛋白伴侣的作用?20、 启动子中的元件的种类: 核心启动子和上游启动子元件21、 分子生物学的研究内容:● DNA重组技术(基因工程)● 基因的表达调控● 生物大分子的结构和功能研究(结构分子生物学)● 基因组、功能基因组与生物信息学研究22、 DNA重组技术:DNA重组技术(又称基因工程)是20世纪70年代初兴起的技术科学,目的是将不同DNA片段(如某个基因或基因的一部分)按照人们的设计定向连接起来,在特定的受体细胞中与载体同时复制并得到表达,产生影响受体细胞的新的遗传性状 23、 如何判断启动子的强弱24、 原核生物RNA聚合酶各亚基的功能:25、 大肠杆菌RNA聚合酶与启动子的相互作用包括哪些方面?:启动子区的识别;酶与启动子的结合;σ因子的结合与解离 26、 真核生物启动子区的功能、位置:TATA区--使转录精确地起始:如果除去TATA区或进行碱基突变,转录产物下降的相对值不如CAAT区或GC区突变后明显,但发现所获得的RNA产物起始点不固定CAAT区和GC区主要控制转录起始频率:基本不参与起始位点的确定27、 原核生物启动子区的位置,功能。

保守的序列:-10序列 (Pribnow框盒) 其保守序列为TATAAT,功能: RNA pol紧密结合; 形成开放启动复合体; 使RNA pol定向转录 -35序列 (Sextama盒) 其保守序列为TTGACA,功能:(1) 为RNA pol的识别位点2) RNA Pol的核心酶只能起到和模板结合和催化的功能,并不能识别-35序列,只有σ亚基才能识别-35序列,为转录选择模板链28、 tRNA的二级结构,三级结构:1、二级结构:三叶草形2、三级结构: “L”形29、 tRNA的结构中关键的结构3’端CCA以及反密码子部位的功能:3’端CCA:接受氨基酸,形成氨酰-tRNA与mRNA结合部位—反密码子部位30、 真核生物,原核生物的起始密码子,起始AA-tRNA:真核生物:起始密码子AUG 所编码的氨基酸是Met,起始AA-tRNA为Met-tRNAMet原核生物:起始密码子AUG 所编码的氨基酸并不是 甲硫氨酸本身, 而是甲酰甲硫氨酸,起始AA-tRNA为fMet-tRNAfMet31、 基因表达的规律: 时间性和空间性32、 Lac阻遏蛋白:结合乳糖操纵子(元)的O序列 ,由I基因编码33、 Trp操纵子的精细调节:包括弱化机制及阻遏机制两种机制。

34、 根据操纵子对某些能调节它们的小分子的应答,可分为可诱导调节和可阻遏调节两大类35、 正转录,负转录调控系统的调节基因的产物及其分类:可诱导调节:指一些基因在特殊的代谢物或化合物的作用下,由原来关闭的状态转变为工作状态,即在某些物质的诱导下使基因活化可阻遏调节:基因平时是开启的,处在产生蛋白质或酶的工作过程中,由于一些特殊代谢物或化合物的积累而将其关闭,阻遏了基因的表达在负转录调控系统中,调节基因的产物是阻遏蛋白(repressor),起着阻止结构基因转录的作用根据其作用特征又可分为负控诱导和负控阻遏:在负控诱导系统中,阻遏蛋白与效应物(诱导物)结合时,结构基因转录;在负控阻遏系统中,阻遏蛋白与效应物(辅阻遏物)结合时,结构基因不转录在正转录调控系统中,调节基因的产物是激活蛋白(activator) 根据激活蛋白的作用性质分为正控诱导和正控阻遏在正控诱导系统中,效应物分子(诱导物)的存在使激活蛋白处于活性状态;在正控阻遏系统中,效应物分子(辅阻遏物)的存在使激活蛋白处于非活性状态36、 在负控诱导系统和负控阻遏系统中,阻遏蛋白的效应物(诱导物)结合时是否转录:在负控诱导系统中,阻遏蛋白与效应物(诱导物)结合时,结构基因转录;在负控阻遏系统中,阻遏蛋白与效应物(辅阻遏物)结合时,结构基因不转录。

三、 选择题1、 真核生物复制起始点的位置: ori(或o)、富含A、T的区段2、 DNA结合结构域的种类螺旋-转折-螺旋(Helix-turn-helix,H-T-H)锌指结构(zinc finger)碱性-亮氨酸拉链(basic - leucine zipper)碱性-螺旋-环-螺旋(basic – helix /loop /helix,bHLH)3、 真核生物RNA聚合酶之间的差别4、 Shine-Dalgarno顺序(SD-顺序):在mRNA分子的起始码上游8-13个核苷酸处。

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