《DNA的粗提取和鉴定》实验中的两个常见问题陶晓东(江苏省常州市武进高级中学生物组213161)摘要:中学实验中提取DNA的实验材料的选择问题,几种实验材料各 自的优缺点;DNA鉴定过程中易出现的一些常见问题及具体的 解决方案关键词:鸡血细胞DNA提取液 二苯胺试剂人教版高中生物教材第二册(必修)中的实验十一《DNA的粗提取和鉴定》 是一个比较重要的学生实验该实验比较复杂,在实际操作过程中需要注意的 细节问题也非常多,而且往往因为某个环节的操作不当,结果不能观察到明显 的实验现象因此,冇必要对实验过程中应当注意的问题做一些探讨从我个 人和学生的实际实验操作过程中,我认为有以下两个问题值得注意一、 实验材料的选择问题:虽然各种生物细胞中都含冇大量的DNA,但是并不是每一种生物组织都适 合做提取DNA的原材料比较好的实验材料最好应该满足以下几个条件1. 组织中DNA的含量比较丰富,能够适合大量提取2. 该组织中所含化合物种类应比较单纯,避免出于其他物质化学性质与 DNA相近,从而对实验现象产生某些干扰3. 实验材料的价格适宜,从而能相对的降低实验成本4. 实验材料在实验过程中的可操作性较强,在相对简单的条件下能大量 提取ill DNA,便于学生实验操作。
可用于提取DNA的实验材料很多,人教版高中生物第二册教师教学用书 中提供了两类可用于提取DNA的实验材料:鸡血和植物组织(新鲜菜花、蒜 黄、菠菜等);另外在《实验教学与仪器》杂志2002年第一期的《探讨“DNA 的粗提取与鉴定”的实验改进》一文中提供了另一种可行的实验材料:鱼类的 精巢;此外,在高教出版社《生化实验方法和技术》一书中还介绍了一种从动 物胸腺中提取DNA的方法,这是一种大学教材上提供的方法这几种实验材 料由于各口性质的差异,实验的操作过程和步骤有很大的差别,以下是四种实 验材料特点的粗略比较实验成本DNA含特殊药品实验仪器实验效果量配置配置鸡血细胞取材易,价格 较低丰富柠檬酸钠离心机可操作性强,实验 效果明显植物组织易取材,价格 较低较丰富SDSEDTA三轻甲基氨基甲烷常规实验成功率较低, 实验效果•研磨 液关系密切,尙类粘:巢取材易,价格 较低丰富无组织捣碎机可操作性强,效呆 明显,但不易定量 控制动物胸腺収材不易,价格高丰富柠檬酸钠离心机 组织捣碎机可操作性较强,适 宜做定量分析注:SDS:十二烷基磺酸钠 EDTA:乙二胺四乙酸二钠根据以上对比可以看出,如果从取材方面來考虑的话,以动物胸腺组织作为 实验材料是不经济的,而II还要面临中学实验条件的限制等问题。
我没有具体完 成过该实验,如果有兴趣的话,该实验的实验方法可查阅相关资料使用其余三种物质作为实验材料,学生的操作过程大同小异,具体数据可 能会有一定的差别,以下是三种不同方法步骤的比较鸡血细胞植物组织鱼类精巢1.配质量浓度为O」g/ml的柠檬酸钠溶 液,按1:2的比例与新鲜鸡血混合搅拌 均匀2 •将血液倒入离心管中,在1000r/min的转速下离心2〜3分钟,弃上部澄清液3 •取离心管底部的血细胞液约5〜10ml加入到100ml烧杯中,向烧杯中加入 20ml蒸谓水,用玻棒沿一个方向快速 搅拌5分钟,加速血细胞在低渗溶液 中的破裂4 •将10%的氯化钠溶液50ml缓缓倒入烧杯中,用玻棒沿一个方向搅拌,此 吋DNA溶解于氯化钠溶液中,滤除 杂质,获得粘稠状的鸡血细胞DNA 提取液5 •将鸡血细胞DNA提取液置于较大的烧杯中,沿烧杯内壁缓缓倒入蒸憾水,1.取新鲜植物组 织(菜花)放置 于冰箱中冷却 1~2天2 •取30克植物组 织,切碎,置于研 体中,倒入10ml 研磨液,充分研 磨10分钟3. 将研磨液置于 离心管中,在 1000r/min 的转 速下离心2~3 分钟,取上清夜 置于冰箱中冷 却几分钟4. 取1倍体积的1・取成年雄性 鲫鱼1条,取出 精巢10克,用组 织捣碎机捣碎成 糜2・组织糜溶于 500ml 10%NaCL 溶液中,用玻璃 棒搅拌至凝胶状 3・取部分凝胶 状的DNA捉取 液进行DNA的 提纯,提纯DNA 的实验过程同以 鸡血为实验材料 的实验操作步骤 6〜7,具体数拯有上清液,加入2 倍体积的95% 的冷酒精当中, 用玻棒轻轻搅 拌,沉淀3〜5 分钟后可见白 色絮状DNA缠 绕于玻棒末端。
5 . DNA的提纯同 鸡血细胞为实 验材料的实验 操作步骤6、7, 具体数据有一 定的差异6.鉴定(略)一定的并异4 .鉴定(略)并不断搅拌,直到粘稠状DNA不再 析出为止用玻棒搅拌,使析出的 DNA缠绕于玻棒末端为减少DNA 的损失,可省略教材上耍求的用纱布 过滤这一步骤6 •将析出的DNA再溶解于20ml 10%的氯化钠溶液中7 .在DNA的氯化钠溶液中倒入95%的酒精50 ml(冷却过的酒精效果较好), 使DNA再次析出,用玻棒搅拌,使 DNA再次缠绕于玻棒末端8.DNA的鉴定:取两支试管,各加入 2mll0%氯化钠溶液,将DNA溶解于 其中一支试管中,另一支做为对照组 然后,在两支试管内加入相同的量的 二苯胺试剂,水浴加热lOmin左右, 冷却,观察实验现象从实验的效果來看,使用鱼类的精巢与使用鸡血细胞没有太人的区别,如 果考虑实验成木的话,两者存在一定的差别如果使用鸡血细胞作为实验材料, 鸡血细胞DNA提取液的储备一定耍充足,一•般来说,每组学生(2人)需要使用至少5ml鸡血细胞DNA提取液,一个60人的班级则至少需要150毫升鸡血 细胞DNA提取液,而鸡血细胞DNA提取液与鸡血体积比约为5: 1,宰杀一 只中等犬小的活鸡可以获取100毫升左右的鸡血,可制备约500毫升鸡血细胞 DNA提取液。
口J以供3个班级使用,实验成本尚可(根据具体的实验结果,在 此我提供的实验数据与教学参考书上有区别)相对于鸡血,如果使用鱼类精 巢做实验材料的话,一条普通的鲤鱼的精巢约重30〜40克,大约可以制备粘稠状的DNA提取液2000毫升左右,每个学生-•般只需要使用5ml左右的凝胶状 的DNA提取液,这样一条鲤血的精巢可以作为至少12个班级的实验材料,可 人人降低实验成木但是从实验准备的角度来看,使用鸡血细胞作为实验材料 的操作就比较简便了,用鱼类精巢虽然可以省略离心等实验准备工作,但如果 没有组织捣碎机的话,制备DNA粗提取液是一件相当费事的事植物组织作为实验材料,实验的效果并不理想,为了避免植物细胞中一些 物质的干扰,需要在研磨液中须加入SDS作为蛋白质的变性剂,加入EDTA作 为DNA酶的抑制剂,并依靠三轻甲基氨基甲烷/HCL缓冲体系维持DNA的稳定在研濟过程中,往往会产生大量的气泡,而实际能获得的含冇DNA的研 磨液极少,而离心后得到的上清液会更少另外,由于植物组织中DNA的含 量相对较少,实验效果也会差许多从以上实验步骤的对比可以看出,从实验准备的角度来看,使用鱼类精巢 作为实验材料成本最低,由于鱼类精巢中DNA的含量极为丰富,且精巢细胞内 其他生物活性物质较少,在做DNA的鉴定时能够避免其他物质的干扰,因此, 我认为,如果只要求一个定性的实验结果的话,无疑,鱼类精巢是一种比较好的 实验材料。
如果无须精打细算且希槊能尽量简化实验准备工作,鸡血细胞是一 个很好的选择具体采用哪种实验材料可酌情选择二、 DNA的鉴定过程中的若干问题1、 二苯胺的性质:二苯胺是一种非极性芳香族有机分子,熔点比水低, 微溶解于水,易溶解于酒精、冰乙酸等有机溶剂化学性质活泼, 遇光易变色因此要放置于暗处保存二苯胺有毒2、 二苯胺试剂的配制:A液:1.5克二苯胺溶解于100ml冰乙酸中,在 加入1.5ml浓硫酸(此处浓硫酸的作用可能是作为强氧化剂来维持试 剂的稳定),配制好的A液保存在棕色瓶中B液:休积分数为0.2% 的乙醛由于乙醛是一种还原性试剂,所以实验前不能将A液和B 液混合在一起同时因为二苯胺试剂性质不稳定,极易变色,因此 建议现配现用3、 二苯胺试剂鉴定DNA的原理:DNA分子中的脱氧核糖在酸性环境 下生成3 ■疑基・丫 ■酮基戊醛,再与二苯胺试剂结合显蓝色,颜色的 深浅与溶液中的DNA含量成正比4、 鉴定实验的一些问题:在学生实际的实验过程中,在水浴后15分钟 内岀现明显实验现彖的比例往往非常低,经常会出现整个班级没冇 明显鉴定结果的现象根据实际操作的结果,我认为很可能取决于 以下儿个因素:⑴在试管中加入一定量10%氯化钠溶液,然后再将捉取出来的DNA 溶解于其中,在实验过程中,经常会出现缠绕于玻璃棒末端的DNA 的量过少的情况,如果溶解于氯化钠溶液中的DNA的量过少的话,与过量的二苯胺试剂共热时,出现的蓝色会比较浅。
⑵加入二苯胺试剂时,首先观察二苯胺试剂A的颜色新配的二苯 胺试剂A呈无色,而如果放置一段时间之后,逐渐呈现浅绿色, 放置几天Z后,变为蓝色,如果使用该变色后的试剂,对实验结果 有很大影响因此,实验应使用新配制试剂,同时使配制好的试剂 尽量避免受到强光照射实验时,可先将试剂A滴加入溶有DNA 的氯化钠溶液的试管后,再滴加几滴试剂B,震荡均匀(试剂A 与试剂B不要事先混合)⑶滴加入一定量的二苯胺试剂并震荡后,溶液会呈现口色浑浊(二 苯胺遇水后大量析岀),水浴加热后,白色浑浊可能会消失,由于 二苯胺的熔点较低,最初我认为很有可能是析出的二苯胺转化为液 态油滴的缘故经多次实验,我发现白色浑浊的消失与否实际上和 加入的二苯胺试剂的量的多少冇关当二苯胺试剂加入较多时,整 个混合溶液体系中的醋酸浓度会相应的增大,由于二苯胺能很好的 溶解与醋酸中,因此口色浑浊消失也就不足为怪了具体的实验结 果可参见下而的表格⑷水浴加热5〜10分钟后,撤去酒精灯,使试管冷却,静置一段时 间后,试管中溶液变为蓝色在实际操作过程中,我发现如果没有 将试管及时冷却的话,多数情况下试管内的物质不会变色而水浴 一段时间后静置冷却,试管内会或深或浅的呈现岀蓝色。
因此加热 后建议冷却一段时间冷却后不同试管内溶液变色的时间可能会有 差异,冇的可能会立刻变色,冇的则几天Z后才慢慢变色下面的表格表示了不同情况下DNA鉴定结果出现的差异(为定量表示 DNA含量与实验现彖的关系,本实验以鸡血细胞作为实验的材料,以鸡血 细胞DNA捉取液的量来表示DNA的量,所冇的对照组中粗捉取出的DNA均溶解于2mll0%氯化钠溶液中)①加入二苯胺试剂A2M :加入二苯胺试剂A后试管中岀现口色浑浊,水浴吋间约10〜15分钟<1小时>1天、/、/V②加入二苯胺试剂A4M :加入二苯胺试剂A后试管中出现白色浑浊,水浴加热白色浑浊部分消失血细胞DNA提、^液(ML)出现蓝色 时间 、\246约10〜15分钟<1小时VVV>1天③ 加入二苯胺试剂A6ml :加入二苯胺试剂A后试管中出现口色浑浊,震荡后白色浑浊即可消失血细胞DNA提、^液(ML) 出现蓝色矗\ 吋间246约10〜15分钟<1小时>1天综合以上实验的分析结果,二苯胺试剂A与鸡血细胞DNA提取液的定量 比并不是影响实验效果的关键因素,当二苯胺试剂A量比较大时,整个溶液体 系中遇水析岀的二苯胺的量比较小,此时,实验的效果比较明显,有时甚至还 在水浴加热时(无须冷却)就可。