生物信息学网站汇总

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1、EMBL biocomputing tutorialshttp:/www.bio.cam.ac.uk/Embnetut/Gcg/index.htmlPlant genome dababase tutorialhttp:/www.nal.usda.gov/pgdic生物信息学机构NCBIhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/International Nucleotide Sequence Database Collaboration.http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/collab/EBI http:/www.ebi.ac.uk/USDAhttp:/www.n

2、al.usda.gov/Sanger Centrehttp:/genomic.sanger.ac.uk/北京大学生物信息学中心http:/数据库信息发布及其它GenBank Release Notesftp:/ncbi.nlm.nih.gov/genbank/gbrel.txtdbEST summary reporthttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/dbESTsummarv.htmlEMBL release noteshttp:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?emblDDBJ release noteshttp:/www

3、.ddbj.nig.ac.jp/ddbjnew/ddbj relnote.htmlEukaryotic promoter database release noteshttp:/www.genome.ad.jp/dbget/dbget2.htmlSwissProt release noteshttp:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?swissprotPIR release noteshttp:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pirPRF release notes http:/www.genome.ad.jp/

4、dbget-bin/show man?prfPDBSTR release noteshttp:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pdbstrProsite release noteshttp:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?prositePDB release notes http:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pdbKEGG release noteshttp:/www.genome.ad.jp/dbget-bin/show man?pathway核苷酸数据库GenB

5、ankhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/dbEST/index.htmldbSTS http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/dbSTS/index.htmldbGSS http:/www2.ncbi.nlm.nih.gov/dbGSS/index.htmlGenome (NCBI)http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/Genome/org.htmldbSNP http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/SNP/HTGShttp:/www.ncbi.nlm.

6、nih.gov/HTGS/UniGenehttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/UniGene/EMBL核苷酸数据库http:/www.ebi.ac.uk/emblGenome (EBI)http:/www.ebi.ac.uk/genomes/向EMBL数据库提交序列http:/www.ebi.ac.uk/embl/Submission/webin.htmlDDBJ http:/www.ddbj.nig.ac.jp/Plant R gene database http:/www.ncgr.org/rgenes启动子数据库Eukaryotic promoter database h

7、ttp:/www.epd.isb-sib.chhttp:/www.genome.ad.jp/dbget/dbget2.html转录因子数据库FRANSFAChttp:/transfac.gbf.deooTFDhttp:/www.ifti.org蛋白质数据库SWISS-PROT或TrEMBL http:/www.ebi.ac.uk/swissprot/http:/www.expasy.ch/sprot/PIRhttp:/www-nbrf.georgetown.edu/pir/PRF http:/www.prf.or.jp/PDBSTRhttp:/www.genome.ad.jp/dbget-bi

8、n/www bfind?pdbstr-todayPrositehttp:/www.expasy.ch/sprot/prosite.html结构数据库PDB http:/www.rcsb.org/pdbhttp:/www.pdb.orgNDBhttp:/ndbserver.rutgers.edu/NDB/ndb.htmlhttp:/ndbserver.rutgers.edu/DNA-Binding Protein Database http:/ndbserver.rutgers.edu/NDB . /dnabind/index.htmlNMR Nucleic Acids Databasehttp

9、:/ndbserver.rutgers.edu/NDB/structure-finder/nmr/index.htmlProtein Plus Databasehttp:/ndbserver.rutgers.edu/NDB . /protein/index.htmlSwiss 3Dimage http:/www.expasy.ch/sw3d/SCOPhttp:/scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/CATHhttp:/www.biochem.ucl.ac.uk/bsm/cath/酶、代谢和调控路径数据库KEGG http:/www.genome.ad.jp/kegg/kegg

10、2.htmlEnzyme Nomenclature Database http:/expasy.hcuge.ch/sprot/enzyme.htmlProtein Kinase Resource (PKR)http:/www.sdsc.edu/kinases/LIGANDhttp:/www.genome.ad.jp/dbget/ligand.htmlWIT http:/www.cme.msu.edu/WIT/EcoCychttp:/ecocyc.PangeaS Database http:/www.nal.usda.gov/Demeters Genomeshttp:/genome.cornel

11、l.eduRiceGenes http:/genome.cornell.edu/cgi-bin/WebAce/webace?db=ricegenesRiceBlastDBhttp:/genome.cornell.edu/cgi-bin/WebAce/webace?db=riceblastdbFlyBasehttp:/flybase.bio.indiana.edu/.bin/fbidq.html?FBgn0003075Mouse Genome Informatics http:/www.informatics.jax.org/bin/query_accession?id=MGI:97555Sac

12、charomyces Genome Databasehttp:/genome-url=http:/www.stanford.edu/cgi-bin/dbrun/SacchDB?find+Locus+%22PGK1%22www.stanford.edu/cgi-bin/dbrun/SacchDB?find+Locus+%22PGK1%22/url多种基因组数据库http:/www.hgmp.mrc.ac.uk/GenomeWeb文献数据库PubMed http:/www.ncbi.nlm.nih.gov/PubMed/OMIMhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Omim/Agr

13、icola http:/www.nal.usda.gov/ag98/关键词为基础的数据库检索Entrezhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/Entrez Nucleotide Sequence Searchhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/nucleotide.htmlEntrez Protein Sequence Searchhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/protein.htmlBatch Entrezhttp:/www.ncbi.nlm.nih.gov/Entrez/batch.htmlSequence Retrieval System, India http:/bioinfo.ernet.in:80/srs5/Sequence Retrieval System, Singapore http:/www.bic.nus.edu.sg:80/srs5/Sequence Retrieval System, US http:/iubio.bio.indiana.edu:80/srs/srscSequence Retrie

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