《生物化学简明教程》第四版-第二章蛋白质

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1、第 2 章,蛋 白 质 (Protein),蛋白质的分类,蛋白质的组成单位-氨基酸,肽,蛋白质的结构,蛋白质结构与功能的关系,蛋白质的性质与分离、分析技术,内容提要,是由许多不同的-氨基酸按一定的序列通过酰胺键(肽键)缩合而成的,具有较稳定的构象和一定生物功能的生物大分子。,纤维状,球状,蛋白质(Protein),蛋白质的生物学作用,蛋白质是生物体的重要组成成分 蛋白质具有重要的生物学功能 1)作为生物催化剂(酶) 2)物质的转运和储存 3)运动与支持作用 4)免疫保护作用 5)代谢调节作用 6)参与细胞间信息传递 氧化供能,蛋白质是生物 体重要组成成分 分布广:所有器官、组织都含有蛋白质;细

2、胞的各个部分都含有蛋白质。 含量高:蛋白质是细胞内最丰富的有机分子,占人体干重的45,某些组织含量更高,例如脾、肺及横纹肌等高达80。,2.1.1依据蛋白质的形状分类 1)球状蛋白质:(globular protein)外形接近球形或椭圆形,溶解性较好,能形成结晶,大多数蛋白质属于这一类。 2)纤维状蛋白质(fibrous protein)分子构象类似纤维或细棒。它又可分为可溶性纤维状蛋白质和不溶性纤维状蛋白质。 3)膜蛋白质,2.1 蛋白质的分类,2.1.2依据蛋白质的组成分类,1.简单蛋白(simple protein) :又称为单纯蛋白质;这类蛋白质只含由-氨基酸组成的肽链,不含其它成分

3、。 (1)清蛋白和球蛋白:albumin and globulin广泛存在于动物组织中。清蛋白易溶于水,球蛋白微溶于水,易溶于稀酸中。 (2)谷蛋白(glutelin)和醇溶谷蛋白(prolamin):植物蛋白,不溶于水,易溶于稀酸、稀碱中,后者可溶于7080乙醇中。 (3)精蛋白和组蛋白:碱性蛋白质,存在与细胞核中。 (4)硬蛋白:存在于各种软骨、腱、毛、发、丝等组织中,分为角蛋白、胶原蛋白、弹性蛋白和丝蛋白。,(1)核蛋白:由简单蛋白与核酸结合而成。如细胞核中的核糖核蛋白等。 (2)糖蛋白与蛋白聚糖:由简单蛋白与糖类物质组成。如细胞膜中的糖蛋白等。糖与蛋白质的结合方式:O连接和N连接 (3

4、)脂蛋白:由简单蛋白与脂类结合而成。 如血清-,-脂蛋白等。 (4)色蛋白:由简单蛋白与色素结合而成。如血红素、过氧化氢酶、细胞色素c等。 (5)磷蛋白:由简单蛋白质和磷酸组成。如胃蛋白酶、酪蛋白、角蛋白、弹性蛋白、丝心蛋白等。,2.结合蛋白(conjugated protein):由简单蛋白与其它非蛋白成分结 合而成,2.1.3按功能分类,酶 调节蛋白 贮存蛋白 转运蛋白质 运动蛋白 防御蛋白和毒蛋白 受体蛋白 支架蛋白 结构蛋白 异常功能,2.2 蛋白质的组成单位-氨基酸,氨基酸 (amino acid) 是蛋白质的基本组成单位。从细菌到人类,所有蛋白质都由20种标准氨基酸组成。,2.2.

5、1氨基酸的结构通式,氨基酸的结构式书写,20种常见氨基酸的名称和结构式,甘氨酸(a-氨基乙酸) Glycine,丙氨酸(a-氨基丙酸) Alanine,亮氨酸(-甲基-a-氨基戊酸)* Leucine,异亮氨酸(-甲基-a-氨基戊酸)* Isoleucine,缬氨酸(b-甲基-a-氨基丁酸)* Valine,脯氨酸(a-四氢吡咯甲酸) Proline,苯丙氨酸(b-苯基-a-氨基丙酸)* Phenylalanine,蛋(甲硫)氨酸 (a-氨基-甲硫基戊酸) * Methionine,色氨酸 a-氨基-(3-吲哚基)丙酸* Tryptophan,丝氨酸(a-氨基-羟基丙酸) Serine,谷氨酰

6、胺(a-氨基戊酰胺酸) Glutamine,天冬酰胺(a-氨基丁酰胺酸) Asparagine,苏氨酸(a-氨基-b-羟基丁酸)* Threonine,半胱氨酸(a-氨基-b-巯基丙酸) Cysteine,酪氨酸(a-氨基-对羟苯基丙酸) Tyrosine,天冬氨酸(a-氨基丁二酸) Aspartic acid,谷氨酸(a-氨基戊二酸) Glutamic acid,赖氨酸(a,w-二氨基己酸)* Lysine,精氨酸(a-氨基-d-胍基戊酸) Arginine,组氨酸a-氨基-b-(4-咪唑基)丙酸 Histidine,20种标准氨基酸,蛋白质的元素组成:,C(5055%)、H(68%)、O(

7、2023%)、N(1518%)、 S(04%)、,Others: P、Cu、Fe、Zn、Mn、Se、I等,蛋白质氮占生物组织中所有含氮物质的绝大部分。因此,可以将生物组织的含氮量近似地看作蛋白质的含氮量。 由于大多数蛋白质的含氮量接近于16%,所以,可以根据生物样品中的含氮量来计算蛋白质的大概含量,蛋白质含量蛋白氮6 .25,6 .25 16的倒数,每测定g 氮相当于6 .25g的蛋白质。也就是1 g 氮所代表的蛋白质量(克数),蛋白质含量的测定(自学),凯氏定氮法 (测定氮的经典方法) 优点:对原料无选择性,仪器简单, 方法也简单; 缺点:易将无机氮(如核酸中的氮) 都归入蛋白质中,不精确。

8、 除了上法外,还有 双缩脲法 ,Folin酚,考马斯亮兰G250比色法等,总结,从蛋白质水解物中分离出来的氨基酸有二十种,除脯氨酸和羟脯氨酸外,这些天然氨基酸在结构上的共同特点为: (1)与羧基相邻的-碳原子上都有一个氨基,因而称为-氨基酸 (2)除甘氨酸外,其它所有氨基酸分子中的-碳原子都为不对称碳原子,所以: A.氨基酸都具有旋光性,左旋(-)或右旋(+) B.每一种氨基酸都具有D-型和L-型两种立体异构体。目前已知的天然蛋白质中氨基酸都为L-型。,2.2.2氨基酸的分类,1.根据R的化学结构 (1)脂肪族氨基酸: 1)疏水性:Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Met、Cys; 2)

9、极性:Arg、Lys、Asp、Glu、Asn、Gln、Ser、Thr (2)芳香族氨基酸:Phe、Tyr (3)杂环氨基酸:Trp、His (4)杂环亚氨基酸:Pro,2.根据R的极性 (1)极性氨基酸: 1)不带电:Ser、Thr、Asn、Gln、Tyr、Cys; 2)带正电:His、Lys、Arg; 3)带负电:Asp、Glu (2)非极性氨基酸: Gly、Ala、Val、Leu、Ile、Phe、Met、Pro、Trp,总结,属于芳香族氨基酸的是: 色氨酸Trp、酪氨酸Tyr、苯丙氨酸Phe 属于亚氨基酸的是: 脯氨酸Pro 含硫氨基酸包括: 半胱氨酸Cys、甲硫氨酸Met 分子量最小的氨

10、基酸是:甘氨酸Gly 能形成二硫键的氨基酸是:半胱氨酸Cys 含二羧基一氨基的氨基酸有: 谷氨酸Glu、天冬氨酸Asp,几种特殊氨基酸,脯氨酸 (亚氨基酸), 半胱氨酸,胱氨酸,几种特殊氨基酸,这些氨基酸都是由相应的基本氨基酸衍生而来的,几种特殊氨基酸,2.2.3氨基酸的重要理化性质,一般物理性质: 氨基酸一般有味(无味、甜、苦、鲜等) 一般均溶于水,溶于酸、碱中;不溶于有机溶剂。 高熔点(200以上),氨基酸的旋光性及立体异构 除甘氨酸外,氨基酸含有一个手性-碳原子,因此都具有旋光性左旋(-)或右旋(+),比旋光度是氨基酸的重要物理常数之一,是鉴别各种氨基酸的重要依据。,氨基酸的光吸收,构成

11、蛋白质的20种氨基酸在可见光区都没有光吸收,但在远紫外区(220nm)均有光吸收。 在近紫外区(220-300nm)只有酪氨酸、苯丙氨酸和色氨酸有吸收光的能力。 酪氨酸的max275nm,苯丙氨酸的max257nm,色氨酸的max280nm。,氨基酸在水溶液中或在晶体状态时都以离子形式存在,在同一个氨基酸分子上带有能放出质子的NH3+正离子和能接受质子的COO-负离子,为两性电解质。,(1)两性解离和等电点,调节氨基酸溶液的pH,使氨基酸分子上的+NH3基和COO-基的解离程度完全相等时,即所带净电荷为零,此时氨基酸所处溶液的pH值称为该氨基酸的等电点(pI)。,(当氨基酸相互连接成蛋白质时,

12、只有其侧链基团和末端的-氨基,-羧基是可以离子化的。),氨基酸等电点的确定:,1)酸碱滴定(滴定曲线),2)根据pK值(该基团在此pH一半解离)计算: 等电点等于两性离子两侧pK值的算术平均数。,推导过程,pI =1/2(pKl+ pK2),推导过程,对多氨基和多羧基氨基酸的解离,解离原则:,注意,推导过程,结论,中性氨基酸:pK1,为羧基的解离常数,pK2,为氨基的 解离常数。 pI=(pK1,+pK2,)/2 酸性氨基酸:pK1,为羧基的解离常数,pK2,为侧链羧基的解离常数。 pI=(pK1,+pK2,)/2 碱性氨基酸: pK2,为氨基的解离常数,pK3,为侧链氨基的解离常数。 pI=

13、(pK2,+pK3,)/2,应用,pH pI aa “ - ” aa向正极移动 pH pI aa “ + ” aa向负极移动 pH = pI aa “ 0 ” aa不移动 溶液的pH偏离pI越远,氨基酸带净电荷越多,在电场中越容易分离。 利用不同的氨基酸在同一pH下所带电荷不同而分离,如用阴离子交换树脂柱层析分离氨基酸。 等电点时,氨基酸溶解度最小,容易聚集沉淀。,自 测,丙氨酸Ala的 pI6.02,在pH7时,在电场中向( ? )极移动。,(2)氨基酸的化学性质,氨基酸在溶液状态时,存在的平衡,1)与茚三酮的反应,氨基酸与水合茚三酮共热,发生氧化脱氨反应,生成NH3与酮酸。水合茚三酮变为还

14、原型茚三酮。 加热过程中酮酸裂解,放出CO2,自身变为少一个碳的醛。水合茚三酮变为还原型茚三酮。 NH3与水合茚三酮及还原型茚三酮脱水缩合,生成蓝紫色化合物。,脯氨酸与茚三酮反应的产物:,N+,黄色化合物,反应要点与应用,A.该反应由-NH2与-COOH共同参与 B.茚三酮是强氧化剂 C.用于氨基酸的定性、定量分析 该反应非常灵敏,可在570nm测定吸光值 测定范围:0.550g/ml D.脯氨酸和羟脯氨酸与茚三酮直接生成黄色物质(不释放NH3),2)与甲醛的反应:氨基酸的甲醛滴定法,OH-,中和滴定,A.为- NH2的反应 B.在常温,中性条件,甲醛与- NH2很快反应,生成羟甲基衍生物,释

15、放氢离子。,应用,氨基酸定量分析-氨基酸的甲醛滴定法(间接滴定) A.直接滴定,终点pH过高(12),没有适当指示剂。 B.与甲醛反应,滴定终点在9左右,可用酚酞作指示剂。 C.释放一个氢离子,相当于一个氨基(摩尔比1:1) 简单快速,一般用于测定蛋白质的水解或合成的速度,3)与2,4-二硝基氟苯(DNFB)的反应,弱碱性,DNP-氨基酸(黄色),A.为- NH2的反应 B.氨基酸- NH2的一个H原子,在弱碱性条件下,与DNFB发生芳环取代,生成黄色的2,4二硝基苯基氨基酸(DNP氨基酸,稳定),应 用,鉴定多肽或蛋白质的N-末端氨基酸 此反应首先由Sanger应用测定蛋白质中氨基酸的排序,

16、确定了胰岛素的一级结构 5二甲氨基萘磺酰氯(DNSCl,又称丹磺酰氯)可以代替DNFB试剂测定蛋白质的N端氨基酸,肽链氨基末端残基的检测( Sanger法),黄色:根据它在薄层层析或纸电泳中的 迁移特性进行鉴定,二甲氨基萘磺酰氯的简称丹磺酰氯 可以取代DNFB测定蛋白质N端氨基酸,灵敏度高,与5-二甲氨基萘磺酰氯的反应,(4)与异硫氰酸苯酯(PITC)的反应,pH8.3,无水HF,重复测定多肽链N端氨基酸排列顺序,设计出“多肽顺序自动分析仪”,反应特点及应用,为- NH2的反应 由Edman于1950年首先提出 用于N末端分析,又称Edman降解法, 此法的特点是能够不断重复循环,将肽链N-端氨基酸残基逐一进行标记和解离。,5)与亚硝酸的反应,NH

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