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1、如何使用 ChemBioOffice 得到物质光谱图众所周知，ChemBioOffice 是化学生物专业重要的软件之一。其用法简便易学，只要勤于探索，很快就能掌握其基本操作方法。ChemBioOffice 中常用最重要的两个软件是 ChemBioDraw 和 ChemBio3D。前者主要用于画结构式，书写反应方程式等，后者主要用于观测物质的空间构型。除此之外，ChemBioOffice 的强大计算功能让他们还可以画出物质的光谱图，如红外（IR） ，紫外（UV） ，核磁共振（NMR， 1HNMR、 13CNMR） 。以一下物质为例： HO选中物质后单击 Structure，然后选择 predic
2、t 1HNMR，等待一会即可预算处 1HNMR 光谱。光谱图如下，还配有详细解析过程。ChemNMR1HEstimation7.456.596.597.45HO9.68H6.72H5.76H5.250246810 PPMEstimationqualityisindicatedbycolor:good,medium,roughProtocoloftheH-1NMRPrediction(Lib=SUSolvent=DMSO300MHz):NodeShiftBase+Inc.Comment(ppmrel.toTMS)OH9.684.20alcohol4.801-C*R0.68generalcorre
3、ctionsCH6.597.261-benzene-0.531-O-0.05-C=C-0.09generalcorrectionsCH7.457.261-benzene-0.171-O0.04-C=C0.32generalcorrectionsCH6.597.261-benzene-0.531-O-0.05-C=C-0.09generalcorrectionsCH7.457.261-benzene-0.171-O0.04-C=C0.32generalcorrectionsH6.725.251-ethylene1.381-1:C*C*C*C*C*C*1gem0.09generalcorrecti
4、onsH5.765.251-ethylene0.361-1:C*C*C*C*C*C*1cis0.15generalcorrectionsH5.255.251-ethylene-0.071-1:C*C*C*C*C*C*1trans0.07generalcorrections1HNMRCouplingConstantPredictionshiftatomindexcouplingpartner,constantandvector9.6896.59457.5H-C*C-H21.5H-C*C*C-H7.45547.5H-C*C-H11.5H-C*C*C-H6.5927.5H-C*C-H41.5H-C*
5、C*C-H7.45127.5H-C*C-H51.5H-C*C*C-H6.72101116.8HC=CHH1210.0HC=CHCH=CH5.2512112.1H-C(sp2)-H1010.0HCH=CH如果想要得到 UV 和 IR 光谱，则需要进入 ChemBio3D 界面。新打开一个ChemBio3D，将结构图画在空白处进入后点击 CalculationMM2-Minimize Energy，计算最低能量的结构。点击 Run，后计算得到最小能量的结构。 （此步骤可以省略，即可以直接得到光谱图）然后再点击 Calculation-GAMESS Interface-Predict IR/Raman Specturm，预测红外光谱，同理可以预测紫外（UV）光谱，也可以预测核磁共振谱图。红外光谱图拉曼光谱图紫外光谱图（从 ChemBioDraw 中转化得到的 ChemBio3D 图可能不能正常计算出光谱图，所以建议直接把图形画在新建的 ChemBio3D 页面中）
