遗传基础理论关于数量性状

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1、2019/1/27,1,第五章 遗传基础理论 关于数量性状,甘肃农业大学动物科学技术学院,Two periods,2019/1/27,2,一、数量性状遗传基础,1、数量性状微效多基因假说,数量性状是由大量的、效应微小而类似的、并且可加的基因控制,这些基因在世代相传中服从孟德尔原理,即分离规律和自由组合规律,以及连锁交换规律。这些基因间一般没有明显的显隐性区别。此外,数量性状对环境的影响相当敏感。,个体有限基因如何决定众多的数量性状? “多因一效”和“一因多效”机制; 基因间的加性效应、等位基因间的显性效应和非等位基因间的上位效应; 环境效应对数量性状的影响。 正因如此,有限基因所控制的数量性状

2、表现出丰富的变异。,2019/1/27,3,2、数量性状数学模型 P=G+E G=A+D+I E=EP+ET,EP:持久环境效应,指时间上持久或空间上非局部的环境 因素,它影响个体的各次性状表现。 ET:暂时环境效应,一些暂时的、局部的环境因素只对个 体性状的某次度量值产生影响。由于此类效应有正有 负,当度量次数多时,这类效应可以相互抵消。,实际上,只有A可以真正遗传给后代,而D和I与E一样,不能稳定遗传,因此,可以将D、I及E归为一类,即剩余值,用R表示,公式可变为: P=A+R,2019/1/27,4,3、数量性状观察值的分布 数量性状的观察值呈正态分布; 正态分布特性可广泛地应用在动物育

3、种科学中。即当涉及正态分布时,每个标准差都表示了畜群中性状值分布的一个固定比例: 平均数左右1倍标准差范围内代表了畜群中68的个体; 平均数左右2倍标准差范围内代表了畜群中95的个体; 平均数左右3倍标准差范畴内代表了畜群中99以上的个体,几乎包括了全部个体。,平均值,-1,-2,1,-2,2019/1/27,5,例 应用正态分布的性质估计留种数和淘汰数 某品种成年奶山羊平均产奶量600 kg(泌乳期约8个月),产奶量的表型标准差为100 kg 。要从1000只该品种成年母羊中,把奶量低于400 kg 的个体全部淘汰,那么可能要淘汰多少只? 解:产奶量低于400 kg 的个体,就是低于群体均值

4、2倍标准差的个体:6002100400 kg 。2倍标准差以下的个体数:(10.95)/ 20.025=2.5。所以,从1000只该品种奶山羊中可能要淘汰25只产奶量低于400 kg的个体。 若要从该群体中选出产奶量高于900 kg 的最优秀成年母羊,可能选出几只?根据上面分析的同样道理:(10.99)/ 20.005 = 0.5,所以可知,最多能选出5只。,2019/1/27,6,4、祖先遗传定律和选择反应 19世纪生物统计学奠基人英国的高尔登(Galton , F. , 1876)在观察人类身高对群体均值的关系中发现了数量性状遗传中的回归现象:如果双亲身高在群体均值以上时,则后裔身高趋向高

5、于群体均值,趋向低于双亲均值(或称中亲值);如果双亲身高在群体均值以下,则后裔身高也趋向低于群体均值,而趋向高于双亲均值。 大量材料都说明,后裔的平均表型值要比双亲均值更接近于群体均值。也就是说,双亲均值高于或低于群体均值的数值,其中只有一部分能遗传给子女,另一部分是由于环境影响,不能遗传。这说明后裔平均表型值有向群体均值回归的现象。 Galton由此进一步引伸出取决于父母、祖父母、曾祖父母对后裔遗传影响的概念,推导出一个祖先遗传定律的经验公式。此公式也为后来的一些生物统计学家如皮尔逊(Pearson , K.)等所证实。到20世纪30年代,美国的拉什(Lush , J. L.)首先把数量遗传

6、应用于动物育种中,指出不同的数量性状,其子女的表型均值对双亲均值的回归系数不同,由此提出了“遗传力”的概念。,2019/1/27,7,二、数量性状遗传参数估计,1、重复力(repeatability) 一个数量性状在同一个体多次度量值之间相关程度。如同一奶牛不同泌乳期产奶量间的相关(时间不同)、同一绵羊身体不同部位剪毛量间的相关(空间不同)等。 对于同一性状不同时间、空间度量值间的相关,与其遗传因素与持久性环境因素有关,因此,重复力可表示为:,重复力表示性状受遗传效应与持久环境效应影响的大小; 重复力高说明性状受暂时性环境效应影响小,每次度量值的代表性强,因而所需度量的次数少; 重复力低说明性

7、状受暂时性环境效应影响大,每次度量值的代表性差,所需度量次数多。,2019/1/27,8,2、遗传力(heritability) 广义:数量性状基因型方差占表型方差的比例。表示性状受遗传效应与环境效应影响的大小。 狭义:数量性状育种值方差占表型方差的比例。 一般情况下,遗传力是指狭义遗传力,用公式表示为:,从实际估计看,由于育种值无法直接度量,而表型值可以度量,因此从祖先遗传定律可以得到:子女平均表型值对双亲均值的回归系数就等于遗传力,即: h2 = bop (式中:h2为遗传力;bop为子女均值对双亲均值的回归系数。),可以把子女均值(依变量)对双亲均值(自变量)的回归关系表达为:,P任一双

8、亲均值的数值; 全群双亲均值,实际为亲代全群平均数; 子女均值的全群平均数,也就是子代的全群平均数,对不作选择的群体 ;O与任一个双亲均值P相对应的子女均值理论值。,2019/1/27,9,3、遗传相关(genetic correlation) 相关性状 (correlated traits):动物的很多生产性能有着内在的联系。当一个性状改变时,结果引起其它性状的变化,这种性状就称为相关性状。 性状间的相关也可区分为表型相关与遗传相关。 由于基因的一因多效和基因间的连锁不平衡造成的相关,即为遗传相关。其中基因间连锁造成的相关,由于基因间的互换和丧失,由此造成的相关也逐渐减少,这种相关也是不能稳

9、定遗传的。由一因多效性造成的相关是能稳定遗传的。 两个体由于所处相同环境造成的相关,称为环境相关,另外,由于等位基因间的显性效应和上位效应造成的相关也不能真实遗传,因此,一般都并入环境相关中,统称为剩余相关。 表型相关是由遗传和环境所引起的总相关。,2019/1/27,10,三、影响数量性状选择效果的因素,1、数量性状的选择反应,表示选作种用的个体某性状表型值与供选择的初始群体该性状均值之差,简单地讲,就是选留个体的均值与群体均值之差,这称为选择差(selection differential),用S表示之; 是选留个体的子女某性状表型平均值与供选择的初始群体的该性状均值之差即子女均值高于全群

10、均值的部分,或理解为由于选择而在下一代产生的反应,这称为选择反应(selection response),也叫选择效应、选择响应,或遗传进展(genetic advance),或遗传获得量(genetic gain),用R表示之。,只要我们知道某一性状的遗传力,并决定选择差的大小,即可求出子代的遗传获得量,也即,遗传获得量大小决定于h2和S。 遗传进展的快慢除决定于选择差和遗传力外,还受到世代间隔、选择性状的数目、交配体系、遗传相关、培育等因素的影响。,2019/1/27,11,2、遗传力 (1)遗传力直接影响选择反应 选择反应R与遗传力成正比,遗传力越高的性状,在同一选择差的条件下,选择反应

11、越大。 原因:遗传力高的性状,能够遗传给后代的比例大,因此,动物育种实践中,可以把遗传力理解为选择差中可传递给下一代的百分率,或已选双亲的优势在它们后代中出现的比率。 (2)遗传力可影响选择的准确性。 表型选择的准确性是以表型值与育种值的相关(rAP)来衡量的。,相关系数的平方叫做相关指数(correlation index),它是度量准确度的一个统计量,所以,可以认为遗传力就是根据表型值来估计育种值的准确度。 遗传力高的性状,表型值和育种值的相关较大。因此,遗传力越高的性状,表型选择的准确性越大,选择效果也就越好。,2019/1/27,12,应用:性状遗传力不同而采用不同的选择方法,以提高选

12、择准确性 。 遗传力高的性状,如羊的成年体重(0.39)、剪毛量(0.36)、羊毛品质(0.49)等性状,采用表型选择,因为育种值与表型值之间存在着较高的相关,实践证明根据表型值的高低进行选择就可以收到比较满意的效果。 遗传力低的性状,采用表型选择,则效果较差,主要因为这些性状的表型值受环境影响太大,育种值与表型值之间的相关值较低。,2019/1/27,13,3、选择差 选择反应(R)与选择差(S)成正比。,影响选择差的因素: (1)留种率 留种头数和全群(同性别)头数的比例,留种率:,留种率小,则选择差大。在同样大小的群体中,留种数越少,则留种率越小,选择差就越大。,2019/1/27,14

13、,选择强度,选择强度(i):以性状的表型标准差为单位的选择差,即标准化的选择差: i= S / P (P表型标准差)此时, 由于不同性状的度量单位和标准差不同,选择差之间不能相互比较,为统一标准,选择差可用各自的标准差做单位,即 i= S / P 为选择强度。,留种率与选择强度的关系,2019/1/27,15,选择强度,2019/1/27,16,P,Z,在正态分布条件下,分布截点处的纵座标高度(Z)、截点右侧正态曲线下的面积(P),也就是留种率和选择强度(I)有以下关系:,选择强度,2019/1/27,17,选择强度,2019/1/27,18,(2)性状的变异程度 性状或生产性能的变异是很重要

14、的。如果变异小,选留个体的生产性能比群体均值高不了多少;如果群体中生产性能的变异程度很大,则在相同留种率比例下,选留个体的性状值要比群体均值高出很多。 度量性状变异程度的最好方式是标准差(通常指表型标准差,P),因为标准差考虑了平均数周围数值的散布情况。 由公式 可知,性状的变异程度(表型标准差)与选择反应成正比。,越是内部五花八门、性状不整齐的群体(品种、品系等),不仅越应当进行选种,而且也越容易通过选种来改变群体面貌。,2019/1/27,19,例:通过表型标准差确定选择差 假定以羔羊的生长作为选择目标。羔羊平均日增重为100 g , 群体中40的优秀个体留作种用。 当P30 g时(图3.

15、4 a): 选留羔羊的平均日增重应该比群体均值100 g高出:0.973029 g,其中0.97是当留种率为40时的选择强度。 即当选留40的优秀羔羊作为种用时,入选羔羊的平均日增重应该是:10029129 g。 与之相似,若选留20的优秀羔羊,则入选羔羊的平均日增重为142 g(留种率为20时,i1.40)。 当P15 g时: 选留40的优秀羔羊,则选留羔羊的平均日增重比原群体均值100 g要高出:0.971514.5 g,那么选留羔羊的平均日增重应该是114.5 g 。 当选留20的优秀羔羊时,它们的平均增长率为121 g / d 。,2019/1/27,20,4、世代间隔 繁殖一个世代所

16、需要的时间称为世代间隔(generation interval)。实践中通常以留种个体出生时其父母的平均年龄来表示世代间隔。从更严格意义上说,世代间隔是指当后代代替双亲时的父母平均年龄。 世代间隔的计算公式为:,ai父母平均年龄; Ni父母平均年龄相同的子女数; n组数(父母平均年龄相同的为一组)。,2019/1/27,21,例:设3窝山羊的父母产生下一代的月龄如表,计算该山羊的世代间隔。,三窝羊的父母产生下一代时的月龄,2019/1/27,22,不同性别的动物,其世代间隔不同,因为基因在世代传递过程中有下列几种方法:父亲儿子,母亲儿子,父亲女儿,母亲女儿。 一般来讲,由母亲儿子的世代间隔最长,而父亲女儿的世代间隔最短。 计算群体的世代间隔时,应分别计算各种传递方式的平均世代间隔,然后再求全群的平均值。,动物第一次繁殖后代的年龄影响世代间隔。 相继两次分娩之间的

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