生物医学文献检索与利用信息检索基础知识

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1、生物医学文献检索与利用,信息检索基础知识,基本概念,文献:记录有知识的一切载体。 现在一般认为,凡属于人类的知识,用文字、图形、符号、声频、视频等手段记录保存下来,并用以交流传播的一切物质形态的载体,都统称为文献。,甲骨文,碑文,竹 简,纸,缩微文献,光盘,因特网,文献的类型,按加工层次划分 按载体形式划分 按出版类型划分,一次文献 二次文献 三次文献,按加工层次划分,一次文献: 即原始文献,是作者根据自己的工作和研究成果而写成的,也可称原始论文。 例如:期刊论文、学位论文 研究报告、专利说明书等,二次文献,是对一次文献进行收集、分析、整理并将其外部特征或内部特征(如篇名、作者、刊名、分类号、

2、内容摘要等)按照一定的规则加以编排。 是查找一次文献的线索。 例如:目录、索引、文摘,二次文献 题录,二次文献 文摘,三次文献,针对某一专题检索二次文献,获得与之相关的大量一次文献,对一次文献进行阅读、筛选所需内容,最后归纳、整理、加工、提炼而写成的文献。 综述,即 review最常见的三次文献,是综合、分析、评论某一专题,能全面反映该课题在国内外发展动态的文章。 如:肝癌发生的分子机制,按载体形式划分,印刷型:教科书、纸本期刊 缩微型:缩微平片、缩微胶卷 视听型:磁带 电子型:光盘、网络,按出版类型划分,图书 期刊 资料,图书(Book),是对已发表的科研成果、生产技术和经验的总结性的概括论

3、述。 如教科书、参考书、专著等 如字典、百科全书、年鉴等,正式出版的图书,均冠有ISBN号,即国际标准书号(International Standard Book Number, ISBN),电子书,电子书(Electronic Book,e-book) 是以数字形式制作、出版、存取和使用的图书,一般以磁性或电子载体为存贮载体,并借助一定的阅读软件和设备读取。 电子图书的来源 印刷型图书的电子版(electronic version) 纯电子版图书:属于原生(born-digital)数字资源,Riding the Bullet 骑弹飞行,国内外常用电子书,超星中文电子图书 读秀 方正Apab

4、i电子书 圣典E-BOOK(高等教育版) MD Consult电子书: Cecil Textbook of Medicine Thieme电子书: Color Atlas of Pathophysiology NetLibrary Ebrary Springer电子图书 Safari电子图书 ,是一种定期或不定期的连续性出版物,每期版式基本相同,有固定的刊名,有连续的年、卷、期号。 如:杂志、学报、通报、综述与述评、索引、文摘等,期刊(Periodical),正式出版的期刊具有国际标准连续性出版物编号ISSN(International Standard Series Number),ISSN

5、 0028-0836,电子期刊,电子期刊,指以数字(或称电子)形式出版发行的期刊,英文为Electronic Journal,简称e-journal。电子期刊最早产生于20世纪80年代中期。 印刷型期刊的电子版:如SCIENCE杂志的电子版Science Online 纯电子版期刊:如英国皇家物理学会出版的New Journal of Physics(新物理学杂志),国内外常用电子期刊数据库,ScienceDirect Onsite SpringerLink Wiley InterScience LWW ProQuest电子期刊全文数据库 EBSCO电子期刊全文数据库 中国期刊全文数据库 万方

6、电子期刊 ,核心期刊Core Journals,指刊载某学科文献密度大、载文率、被引用率及利用率较高,深受本学科专家和读者关注的期刊。 中文核心期刊要目总览(2008年版) 期刊引文报告(简称JCR),资料(Material),非书非刊的出版物,又称特种文献。 包括: 专利文献 会议文献 科技报告 学位论文 政府报告 标准文献 产品资料 技术档案,文献检索的概念,文献检索:从用户的角度来理解,仅指从一个文献集合中按照用户的需要查找出其中相关文献的过程。,文献检索的意义,促进素质教育,培养信息意识 促进专业学习 节省查找文献的时间,提高科研效率 避免重复劳动,电凝法治疗下肢静脉曲张,课题组199

7、9年发表论文,2003年申报成果 国外早就有此方面的文献报道: Lamper,-S-R, et al. Electrocoagulation in the treatment of varicose subcutaneous veins of the lower extremities(电凝法治疗下肢皮下曲张静脉). Khirurgiia-(Mosk). 1969 Jun; 45(6): 93-6 Brala,-Z, et al. Endovenous electrocoagulation in surgical treatment of varicose changes in the vei

8、ns of the lower extremities(静脉内电凝治疗下肢静脉曲张). Lijec-Vjesn. 1968 Jul; 90(7): 665-9,检索语言,一、概念: 是文献检索中用来描述文献特征和表达用户检索提问的一种专门的标识系统。 二、检索语言的分类: 按语言的受控情况分为: 1非规范化检索语言(或称自然语言) 如表达“肿瘤”的英文词:cancer、tumor、neoplasms 2规范化检索语言(或称受控语言) AIDS、艾滋病、爱滋病、获得性免疫缺陷综合征 获得性免疫缺陷综合征,检索语言的种类,(一)分类法语言 用分类号作为语言来表达各种概念,将各种概念按学科性质进行分

9、类和系统排列。 如中国图书分类法(简称中图法) R 医药卫生 R1 预防医学卫生学 R2 中国医学 R3 基础医学 R4 临床医学 R5 内科学 R6 外科学 R71 妇产科学 R72 儿科学 R73 肿瘤学 R74 神经病学与精神病学 R75 皮肤病学与性病学 R76 耳鼻咽喉科学 R77眼科学 R78 口腔科学 R8 特种医学 R9 药学,检索语言,(二)主题语言:用词语表达各种概念 1.叙词语言 2.关键词语言 (三)代码语言,医学文献检索工具,报道、存储和检索各种文献,并提供检索途径的工具。 常见的检索工具 目录型检索工具 题录型检索工具 文摘型检索工具 全文检索工具,几种常用的文献检

10、索工具,目录型检索工具 是著录图书、期刊、资料的外部特征,很少揭示其实际内容,通常所著录的是一个完整的出版单位,例如一种图书、一种期刊等,记录它们的名称、作者、出版项(年、单位)与馆藏情况,按照一定规则编排在一起的检索工具。主要用于查找出版物的出版或馆藏单位。 目录分为国家目录、馆藏目录、联合目录和出版社与书商目录等。,联机公共目录 (Online Public Access Catalog, OPAC),OPAC是读者查找馆藏的检索工具 。 现在图书馆的图书、期刊从采购编目到读者借阅都采用计算机管理,我们想知道图书馆有什么书?哪些书可以借?在哪里借?已经借了哪些书?应该何时归还?等问题都可以

11、通过联机公共目录查到。 OPAC的功能 1.检索中西文图书、报刊的馆藏情况及收藏地点 2.查询个人借阅情况 3.续借,几种常用的文献检索工具,题录型检索工具 描述文献的外部特征 与目录不同之处: 题录著录的是一个完整出版物的某一部分 目录著录的是一个完整的出版单位,题录,全文数据库,文献检索的基本方法,常用法 顺查法 倒查法 抽查法 追溯法 分段法 浏览法,常用法,顺查法: 按照时间顺序由远及近逐年查找文献的方法。一般用于检索某一课题进展,已知课题开始年代。如查找“有关艾滋病的文献”。 倒查法: 按照时间顺序由近及远逐年查找文献的方法。适用于一些新课题或有新内容的老课题,查找近期文献。如查找“

12、阿司匹林的新用途”。 抽查法: 针对某学科或某课题研究的特点,根据文献资料发表集中的年代或时期,抽出其中一段时间进行文献检索的方法。,文献检索的基本方法,追溯法: 利用参考文献查找文献的方法。 分段法: 应用“常用法”与“追溯法”进行交替查找的一种综合性文献检索方法。 浏览法: 为及时获得最新文献,利用最新期刊目录进行浏览,查找所需文献的方法。,文献检索途径,书(刊)名途径 著者途径 分类途径 主题途径 关键词途径 其他途径,著者途径,根据已知著者姓名(个人和团体著者)检索文献的途径。 著者索引是按著者姓名字顺排列的。,检索外文著者索引时应注意的问题,姓名次序:检索工具中的著者索引和参考文献著

13、录中人名表达方式为姓在前,用全称,名在后,用首字母。 例:William Henry Harrison(威廉亨利哈里森) William H. Harrison W. H. Harrison Harrison WH,Leo M. Pinchera A. Fiore E. Giustarini E. Giani C. A swollen, red scar. Case Reports. Journal Article Lancet. 370(9585):456, 2007 Aug 4. Authors Full Name Leo, Marenza. Pinchera, Aldo. Fiore,

14、Emilio. Giustarini, Elisa. Giani, Claudio.,Marenza Leo, Aldo Pinchera, Emilio Fiore, Elisa Giustarini, Claudio Giani,著者途径,团体著者:按原名著录,并加国名以示区别, 如FDA (Food & Drug Administration) 姓名前有前缀de,des,du,la, della, von, van, den, dan, der等时,将前缀和姓作为一个整体,按字顺排列。 有的著者有家族称呼即族姓,族姓与姓之间无空格,族姓与姓第一个字母均大写。如McAda, P.C 复姓人

15、名:将复姓作为一个整体对待。 如Martin-Smith, M 中国人姓名按汉语拼音著录: 如:童坦君 Tong T J 注意同名同姓不同人的情况,分类途径,以某种分类方法,将文献的主题内容进行分类,编排所形成的检索途径,常通过分类号进行检索。,主题途径,根据文献主题内容编制主题索引,通过主题索引来检索文献的途径。,文献检索步骤与方法,分析课题确定主题概念 选择检索方式和数据库 确定检索途径 编制检索策略(检索式) 检索策略的反馈调整 检索结果的输出,确定检索途径,常用的检索途径: 分类途径 主题途径 著者途径 符号途径 常用的检索词 主题词 自由词,检索系统中常用的运算符或检索规则,布尔逻辑运算符 布尔逻辑运算符是为了表达检索词之间的逻辑关系的算符。 由英国学者乔治布尔发明的布尔逻辑运算符包括逻辑“与”、逻辑“或”和逻辑“非”三种类型,分别用and、or和not表示。,逻辑“与”运算,检索式写成A and B,表示检索结果中同时包含检索词A和检索词B的文献才是命中文献。 基本作用是对检索词加以限定,逐步缩小检索范围,减少命中文献量,提高查准率。,肝癌 and 诊断,逻辑“或”运算,检索式写成A or B,表示检索结果中包含检索词A的文献或者包含检索词B的文献或者同时包含检索词A和B的文献为命中文献。 基本作用是扩大检索范围,增加命中文献

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