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1、医学文献检索概述,张亚莉 广州医科大学 医学文献检索教研室 Tel: 37103339 Email: ,世界医学协会赫尔辛基宣言,涉及人体的医学研究必须遵从普遍接受的科学原则，应对科学文献和相关资料全面了解，并有充分的实验和动物试验（如有必要）的基础上进行。 -世界医学协会赫尔辛基宣言,概述,课程内容模块：,本课程主要内容:,绪论（基础概念、理论） 中文期刊摘要库CBM 外文期刊摘要库PubMed 中、外文全文库（13个） 文献管理工具 参考咨询与开放存取 上机实习,第一部分：基本概念 第二部分：检索技术 第三部分：医学常用数据库 第四部分：检索案例分析,第1讲 绪论主要内容,第一部分： 基本
2、概念,2、信息素养,信息素养（Information Literacy）是人们能够判断确定何时需要信息、并能够对信息进行检索、评价和有效利用的能力。信息素养包括信息意识、信息技能和信息伦理三方面。,概述,3、文 献,文献（Document, Literature）是指记录着知识的一切载体；医学文献就是记录着医学知识、信息的物质载体，如医学图书、期刊、会议录等等。,概述,医学文献的现状和发展趋势,数量大、增长快 出版类型复杂多种 内容分散、交叉、重复 新陈代谢频繁、传播迅速 文献发表时滞严重 ，但随着开放存取期刊（OA）的发展，这种情况已大大改善。,概述,医学文献的增长情况,概述,印刷型,缩微型
3、,电子文献,按载体形式划分,文献的类型（按载体形式划分）,印刷型文献,图书,期刊,报纸,特种文献,图书,图书,图书,图书,期刊,报纸,报纸,报纸,图书,图书,期刊,期刊,期刊,期刊,期刊,期刊,期刊,特种文献,特种文献,特种文献,期刊,ISBN号 内容系统 理论成熟 新颖性较差,图书,期刊,ISSN号 内容不系统 理论不成熟 新颖性较好,报纸,消息、报道 专业性不强 不适宜作学术论文引用源,电子版书、刊/ e-book,e-journal，及其它文献,印刷版书、刊/print,及其它文献,香港大学 馆藏缩微型文献示例,一次文献（原始文献 )article,原创性二次文献 (书目文献、索引），检
4、索工具三次文献（教科书、参考工具书、综述等）零次文献（私人笔记、试验记录、设计草图、口头交流的信息等），未经过出版审核的第一手资料。,按加工层次划分,文献的类型（按加工层次划分）,4、期刊影响因子：反映期刊的整体水平,期刊影响因子（Impact Factor, IF）指期刊近两年的平均被引用率，最早是由美国情报学家SCI创始人尤金加菲尔德(Eugene Garfield)博士在1972年提出来的。 IF=(C2+C3)/(A2+A3) 以1996年Science杂志为例： A21995年出版的文献数1037（篇）， A31994年出版的文献数1054(篇)， C21995年出版的文献在1996
5、年被引用的次数24189(次)， C31994年出版的文献在1996年被引用的次数25170(次)。 IF23.605(次篇)。,概述,一种新的出版模式：公开获取（OA） 示例OA Journal Successes: PLoS Biology,features works of exceptional significance in all areas of biological science, from molecules to ecosystems, including works at the interface with other disciplines, such as che
6、mistry, medicine, and mathematics Public Library of Science impact factor: 14.7,概述,5、核心期刊：反映期刊的整体水平,核心期刊（Core Journal）是指那些发表该学科（或该领域）论文较多、使用率（含被引率、摘转率和流通率）较高、学术影响较大的期刊。它们具有数量少（一般占期刊总数的5-15%），但信息量大（占期刊信息量的50%以上）的特点;浏览核心期刊可在较短的时间 内掌握较多的信息，了解最新的科研动态等。,概述,国际三大索引： SCI科学引文索引: Science Citation Index EI工程索引
7、: The Engineering Index ISTP科技会议录索引: Index to Scientific & Technical Proceedings 国内三大自科核心期刊目录 中文核心期刊(医学:223种) - 北京大学图书馆 中文科技期刊-引证报告-中国科学技术信息研究所 中国科学引文数据库(CSCD) -中国科学院文献情报中心,核心期刊体系,概述,6、文献/信息检索,有效地选择和利用信息的科学方法与手段就是文献/信息检索。 广义：信息存储与信息检索（两个方面） 狭义：仅指信息用户查找信息的过程。,7、文献/信息检索的基本原理,信息存储时，将采集到的大量分散的源信息（一次文献），
8、经过标引著录，加工整理，使之有序化后形成各类信息集合（数据库）；信息检索时，将要查找的信息特征标识与信息集合中已存储的信息特征标识进行比较、匹配，双方特征标识完全一致或部分一致时，检索即为命中。,检索原理示意图,文献信息,检索标识,数据库,标引,存储,检索表达式,检索提问,规范检索语言,检索,匹配运算,输出检索结果,采集,文献/信息检索的分类,按检索对象划分：数据检索(data retrieval)事实检索(fact retrieval)文献检索(literature retrieval)按检索技术手段划分：手工检索计算机检索网络查询与交流,数据检索,又称数值检索，检索对象为特定的数值数据，主
9、要回答“是多少”一类的问题，属于确定性检索的范围。如：物质的各种参数、电话号码、银行帐号、各类统计数字、化学药物的理化常数，常用计量等。数据检索需借助相关的参考工具书或通过数值型数据库。,事实检索,又称事项检索，检索对象为特定的事实，主要回答“是谁”或“是什么”一类的问题，也属于确定性检索。如：名词、概念、标准、法律法规等。事实检索主要借助参考工具书或事实型数据库。如美国MedlinePlus平台的drug information，dictionary等数据库。,文献（型）检索,以某些特定的文献为检索对象，检索结果是关于某一课题的切题文献或相关文献。如：查国内外近五年关于“早老素与老年痴呆的关
10、系”方面的研究文献。文献检索属于相关性检索，系统仅提供相关的文献线索、文献摘要或全文以供检索者参考阅读和分析研究。文献检索借助手工检索工具或大型期刊文献数据库（书目型或全文型数据库）。,检索方式,手工检索（1879-）（印刷型检索工具）美国医学索引中文科技资料目录 计算机检索 （1960-）（包括计算机，操作系统，数据库，检索软件）如： CBMMEDLINE 网络查询与交流（1990-）（利用各种搜索引擎，访问各类信息资源站点、查询网络数据库、通过电子邮件、讨论组等）,数值数据库(Numeric Database) 存储各种统计、实验、测量等方面的数据。 事实数据库(Fact Database
11、) 存储描述事物等信息的情况过程和现象的事实。（如各类电子版字辞典） 文献数据库（Literature Database),数据库类型,文献型数据库,书目数据库(Bibliographic Database) 存储文献的外部特征，主要包括文献的题名、著者、著者单位、所载期刊刊名，出版年、卷、期和起止页码，可以包括摘要，但不包括文献的全文。 全文数据库(Full Text Database) 与书目数据库相对而言。主要存储原始文献的全文，如期刊论文、报纸新闻、法律法规、政府出版物等。,文献型数据库的一般结构,数据库 （data bank） 文档 （file，通常按年限划分） 记录（record，
12、单元论文） 字段（field） 字段用来记录和描述每篇文献的外表特征和内容特征。（如：题名、作者、摘要）,数据库常见字段,题名（Title, TI） 著者（ Author, AU） 著者单位地址（Address, AD） 出处（Source, SO） 摘要（ Abstracts, AB） 文献类型（Publication type, PT） 文献题录三要素（线索）：题名 著者 出处（刊名、卷、期、页码）,题 录,第二部分： 检索技术,不论是最早的单机或联机检索，或是目前流行的网络查询，一般使用的检索技术主要包括： 布尔逻辑检索 截词检索 邻近检索（位置检索） 字段限定检索 网络信息检索规则,1
13、.布尔逻辑检索技术,布尔逻辑检索是建立最早、应用最为广泛的检索理论和检索技术，也是最简单、最基本的计算机检索的匹配模式。 逻辑检索以布尔逻辑表达式来表达用户的检索要求，并通过逻辑运算符连接两个以上的检索词，从而实现两个以上概念的逻辑组配检索。,布尔逻辑示意图,运算符：AND，* 起缩小检索范围，提高查准率的作用。,运算符：OR，+ 起扩大检索范围，提高查全率的作用。,运算符：NOT，- 起缩小检索范围，用于去除检出文献中不需要的部分。,逻辑与,逻辑或,逻辑非,布尔逻辑表达式,child and asthma 小儿哮喘 lung cancer and smoking 吸烟与肺癌 trace el
14、ements not zinc 除锌以外的微量元素 肝癌或肝细胞瘤的诊断(肝癌 or 肝细胞瘤) and 诊断 优先级：（ ）NOT AND OR（但PubMed除括号外，另外3个无优先级的区分，如果不加括号，则从左至右计算）,布尔运算符在不同的检索系统中有不同的表达方式（在线浏览） 清华同方的“中国学术期刊全文库” CBM PubMed Google et al.,2.截词检索技术,截词检索(Truncation)是将检索词截断，取其中的一部分片段，再加上截词符号一起输入计算机，系统自动将词片段与数据库中的索引词匹配，凡含有该词片段的文献均被检出。 截词方式主要有： 右截词符 “*” （*=
15、0-n个字符） 中间截词符 “ ？” (？=0-1个字符),输入Pain*，即可检出：Pain, painful, painless, painness， painkiller,3.邻近检索技术（Proximity),邻近检索是用邻近算符（或叫位置算符）连接两个检索词，要求检出文献中的两个检索词必须同时出现在同一个句子或同一个字段当中。常用于自由词检索，起提高查准率的作用。 near 要求两词出现在同一个句子中。 with 要求两词出现在同一个字段中，如篇名、摘要、主题词等。,4.字段限定检索技术,多数文献数据库检索系统中都设置了字段限定检索功能Limit，以满足检索用户指定检索某一个特定字段
16、或几个字段信息的要求。 AU限查作者 AD限查作者机构 MH限查医学主题词 PT限查文献类型 TA限查特定刊名 John SmithAU, CellTA,5.加权检索（含义）,基本含义：加权检索是某些检索系统中设置的一种定量检索技术。 基本方法：在每个提问词后面给定一个数值表示其重要程度，这个数值称为权。在检索时，先查找这些检索词在数据库记录中是否存在，然后再计算存在的检索词的权值总和。权值之和达到或超过预先给定的阈值，该记录即为命中记录。,加权检索（作用）,加权检索可以命中核心概念文献，因此是一种缩小检索范围提高检准率的有效方法. 如:中国生物医学文献数据库（CBM）就采用了这种技术,可以将主要论述某一主题概念的医学论文检出来，减少命中文献数量，提高文献主题专指度。 在线浏览(CBM, PubMed),
