核酸代谢和蛋白质的生物合成课件

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1、第八章 核酸代谢和蛋白质的生物合成,第一节 核 苷 酸 代 谢,Metabolism of Nucleotides,一、核酸的化学组成,1. 元素组成:C、H、O、N、P(910%),戊 糖,(构成RNA),(构成DNA),嘌呤(purine),腺嘌呤,鸟嘌呤,嘧啶(pyrimidine),尿嘧啶,胸腺嘧啶,胞嘧啶,核苷酸:AMP, GMP, UMP, CMP 脱氧核苷酸:dAMP, dGMP, dTMP, dCMP,C,核苷酸的生物功用,作为核酸合成的原料 体内能量的利用形式 参与代谢和生理调节 组成辅酶 活化中间代谢物,二、核苷酸的消化与吸收,嘌呤核苷酸的分解代谢,Metabolism o

2、f Purine Nucleotides,组织细胞中的嘌呤核苷酸首先在核苷酸酶的作用下水解为核苷。核苷经核苷磷酸化酶催化,磷酸解生成1-磷酸核糖和嘌呤碱。1-磷酸核糖转变成为5-磷酸核糖,进入磷酸戊糖途径。 而嘌呤碱进一步代谢,最终氧化生成尿酸随尿排出,嘌呤核苷酸的分解代谢,核苷酸,核苷,核苷酸酶,Pi,核苷磷酸化酶,碱基,1-磷酸核糖,人体内的嘌呤的分解主要在肝、小肠及肾脏中进行。正常人血中尿酸较低,约为0.12-0.36mmol/L。当血浆中尿酸高于0.48mmol/L,尿酸盐晶体沉积于关节、软组织、软骨及肾等处,导致关节炎、尿路结石、肾疾病,称痛风症,进食高嘌呤或恶性肿瘤等均可使尿酸含量

3、升高,二、嘧啶核苷酸的分解代谢,胞嘧啶,NH3,尿嘧啶,二氢尿嘧啶,H2O,CO2 + NH3,-丙氨酸,胸腺嘧啶,-脲基异丁酸,-氨基异丁酸,H2O,丙二酸单酰CoA,乙酰CoA,TAC,肝,尿素,甲基丙二酸单酰CoA,琥珀酰CoA,TAC,糖异生,二、嘌呤核苷酸的合成代谢,从头合成途径 (de novo synthesis pathway)补救合成途径 (salvage synthesis pathway),嘌呤核苷酸的结构,GMP,AMP,嘌呤核苷酸的从头合成途径是指利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及二氧化碳等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成嘌呤核苷酸的途径。,肝是体内从头合成嘌呤

4、核苷酸的主要器官,其次是小肠和胸腺,而脑、骨髓则无法进行此合成途径。,(一)嘌呤核苷酸的从头合成,定义,合成部位,嘌呤碱合成的元素来源,CO2,天冬氨酸,甲酰基 (一碳单位),甘氨酸,甲酰基 (一碳单位),谷氨酰胺 (酰胺基),过程,1. IMP的合成,2. AMP和GMP的生成,R-5-P (5-磷酸核糖),PRPP (5-磷酸核糖1-焦磷酸),在谷氨酰胺、甘氨酸、一碳单位、二氧化碳及天冬氨酸的逐步参与下,IMP(次黄嘌呤核苷酸),H2N-1-R-5-P (5-磷酸核糖胺),利用体内游离的嘌呤或嘌呤核苷,经过简单的反应,合成嘌呤核苷酸的过程,称为补救合成(或重新利用)途径。,(二)嘌呤核苷酸

5、的补救合成途径,定义,3. 合成过程,APRT为腺嘌呤磷酸核糖转移酶,HGPRT为次黄嘌呤-鸟嘌呤磷酸核糖转移酶,补救合成的生理意义,补救合成节省从头合成时的能量和一些氨基酸的消耗。 体内某些组织器官,如脑、骨髓等只能进行补救合成。,嘧啶核苷酸的代谢,Metabolism of Pyrimidine Nucleotides,嘧啶核苷酸的结构,从头合成途径 补救合成途径,一、嘧啶核苷酸的合成代谢,(二)嘧啶核苷酸的从头合成,主要是肝细胞胞液,嘧啶核苷酸的从头合成是指利用磷酸核糖、氨基酸、一碳单位及二氧化碳等简单物质为原料,经过一系列酶促反应,合成嘧啶核苷酸的途径。,定义,合成部位,嘧啶合成的元素

6、来源,合成过程,1. 尿嘧啶核苷酸的合成,2. 胞嘧啶核苷酸的合成,UDP,UTP,脱氧核糖核苷酸的生成,(三)DNA的生物合成复制,基因 概念:是指DNA分子上携带着遗传信息的碱基序列片段,是遗传的功能单位。 特征:1、携带遗传信息2、基因能被复制3、基因能突变,中心法则,反映了从DNARNA蛋白质的遗传信息主流,揭示了生物体内遗传信息的贮存、传递和表达的规律。,转录,RNA,翻译,蛋白质,DNA,RNA (病毒),复制,复制,翻译,蛋白质 (病毒),反转录,复制:以亲代DNA或RNA为模板, 根据碱基配对的原则,在一系列酶的作用下,生成与亲代相同的子代DNA或RNA的过程。,一、 DNA的

7、复制,复制的方式,DNA的半保留复制,(一)DNA的半保留复制,1.定义:,以亲代DNA双链为模板以碱基互补方式合成子代DNA,这样新形成的子代DNA中,一条链来自亲代DNA,而另一条链则是新合成的,这种复制方式叫半保留复制。,原料:DNA复制的原料是四种dNTP(包括dATP、dGTP、dCTP、dTTP)复制所需的酶 类:,1. 解链酶(又称解螺旋酶或螺旋酶,helicase),作用:断裂互补碱基间的氢键,使DNA双链分离形成单链(复制叉)。并有单链蛋白附着于单链,防止单链重新结合成双链,2.引物酶(Primase),它是一种依赖DNA的RNA聚合酶,此酶以DNA为模板,催化四种核糖核苷酸

8、合成短片RNA作为DNA合成的引物,3. DNA聚合酶(DNA polymerase, DNA pol)即依赖于DNA的DNA聚合酶(DDDP): 以DNA为模板链,合成子代DNA,模板可以是双链,也可以是单链DNA,催化四种脱氧核苷三磷酸在RNA引物的3 OH聚合形成DNA片段合成方向:5 3 ,4. DNA连接酶(DNA Ligase),作用:在有模板指导的条件下,催化2个DNA片段通过3 ,5 -磷酸二酯键连接在一起形成更大的DNA片段,DNA的复制过程复制的起始 链的延长 复制的终止,复制的起始,1.在拓扑异构酶、解链酶及单链DNA 结合蛋白的共同作用下,DNA解旋、解链,形成复制叉。

9、 2.RNA引物的生成 在引物酶的作用下,以单链的DNA为模板,按碱基互补的规律(A-U, T-A, C-G)合成一个短链,并以此合成DNA的引物,3. DNA片段的生成 在DNA聚合酶的作用下,以四种脱氧核苷酸为原料,以DNA每一条链为模板,按碱基互补规律,在引物酶的3-OH末端合成沿5 3延伸的DNA片段,链的延长,引物合成后,在引物3-OH末端逐一添加与模板链对应互补的脱氧核苷磷酸,使新合成的链不断延长。 领头链:链的延长方向(5 3)与解链方向(复制叉移动方向)相同, 为连续合成。 随从链: 链的延长方向(53)与解链方向(复制叉移动方向)相反,为不连续合成。 分段合成的DNA片段,

10、最初被命名为冈崎片段,三、DNA复制的半不连续性,前导链,滞后链,冈崎片段,前导链:以3 5 方向的亲代链为模板连续合成的子代链。,滞后链:以5 3方向的亲代链为模板的子代链先逆复制叉移动方向合成冈崎片段,再连接成滞后链。,或领头链,III,复制的终止,1.水解引物及填补空隙冈崎片段合成后,由DNA聚合酶水解去除RNA引物。 2.完整双链DNA分子的形成 在DNA连接酶的作用下,各冈崎片段连接起来形成完整的双链DNA分子。,DNA的半保留复制的生物学意义:,DNA的半保留复制表明DNA在代谢上的稳定性,是保证亲代的遗传信息稳定地传递给后代必要措施。,二、逆转录 (reverse transcr

11、iption),概念以RNA为模板,按碱基配对规律合成DNA的过程。 反转录酶, 又称为依赖RNA的DNA聚合酶 (RNA-dependent DNA polymerase, RDDP),DNA,RNA,RNA(病毒),病毒RNA,RNA-DNA 杂化分子,cDNA,前病毒 (双链DNA),酶催化反应示意图,RNA的生物合成,转录以 DNA为模板合成RNA,将DNA的遗传信息传递到RAN分子中的过程实质:按碱基配对规律(T-A,A-U,G-C)合成一条与模板链互补的RNA链的过程。,转录的模板转录的模板是DNA的分子双链中的一条单链。作为转录模板的DNA称为模板链或有意义链,与其互补的另一条称

12、编码链或反意义链。,编码链,模板链,转录的原料为四种核苷酸,即ATP、GTP 、 CTP 、 UTP。转录酶 RNA聚合酶,转录的过程,转录时,在DNA双链转录的部位先解开一段螺旋,暴露出DNA模板链,然后在RNA 聚合酶作用下,按碱基互补规律合成RNA。RNA链的合成的方向是5 3。转录完毕,RNA从DNA上水解下来,DNA模板链与编码链又重新形成双链,RNA的复制,以RNA为模板合成RNA 的过程称为RNA 的复制。 主要见于某些病毒和吞噬体,他们的遗传信息不是由DNA携带而是由RNA携带。,第三节 蛋白质的生物合成,RNA,蛋白质,蛋白质,RNA,DNA,复制,复制,反转录,转录,翻译,

13、翻译,遗传信息传递的中心法则,蛋白质是体现生命现象的最重要物质。生物体内蛋白质的合成需要准确无误的按照遗传信息来进行。DNA的遗传信息经过转录传给mRNA,再按mRNA上的遗传信息转化成具有氨基酸序列的蛋白质。 这种以mRNA为模板,按照其核苷酸的顺序组成的密码指导蛋白质合成的过程称为翻译,一、 mRNA(messenger RNA) 蛋白质生物合成的直接模板,DNA,mRNA,蛋白质,一、 mRNA,mRNA分子中每三个相邻碱基组成一个 密码子或遗传密码,mRNA上的四种碱基可组成64(43)个密码子, 其中61个代表不同的氨基酸,其余三个 代表终止信号。,通用 遗传 密码 子,起始密码子与

14、终止密码子:,起始密码子:AUG 蛋氨酸,终止密码子:UAA, UGA , UAG。,氨基酸臂,反密码子环,二、 tRNA(transfer RNA) 蛋白质生物合成的“高级搬运工”,tRNA的功能:,2. 活化氨基酸,跨越能障,使肽键的 形成变得容易。,1.tRNA搬运特定的氨基酸, 保证了遗传信息传递的准确性。,3.将密码子信息转换为对应氨基酸的符号,4.即tRNA能与专一的氨基酸结合并识别 mRNA分子上的密码子.,氨基酸的活化与转运,氨基酸+tRNA,氨基酰tRNA合成酶,氨基酰-tRNA+ppi,ATP AMP,一种tRNA仅转运一种氨基酸, 而一种氨基酸可由几种tRNA转运。,Et

15、,Ep,P,A,mRNA,mRNA 结合位点,细胞 内膜 系统,三、核糖体 蛋白质生物合成的场所,T,A:受位,氨基酰位;,P:给位,肽位;,Et:tRNA出口,Ep:多肽链出口;,T:转肽酶。,蛋白质生物合成过程,一、 氨基酸的活化与转运,二、多肽链的形成核糖体循环,三、翻译后加工,一、 氨基酸的活化与转运,氨基酸+tRNA,氨基酰tRNA合成酶,氨基酰-tRNA+ppi,ATP AMP,二、核糖体循环(ribosome cycle),活化氨基酸既氨基酰t-RNA在核糖体上缩合形成多肽链的过程,1. 起始,2. 肽链延长,3. 终止,肽酰位(P): 结合肽酰-tRNA,氨酰位(A): 结合氨

16、酰-tRNA,催化肽键生成,兼有酯酶活性,空载tRNA排除位(真核无E位),(一) 起始阶段 起始氨基酰-tRNA 与 mRNA 结合到核糖体上,形成起始复合物的过程,二、肽链的延长,1、进位:氨基酰-tRNA在延长因子1、GTP及Mg2+参与下,以其反密码识别起始复合物氨酰位上mRNA的密码,并与之结合,于是进入氨酰位。,2. 转肽,Mg2+, K+,转肽酶,通过进位-转肽-移位不断重复, 肽链自NC端不断延长,OH,EFG,GTP,每生成1个肽键,要消耗2分子GTP(进位和移位), 而氨基酸活化需消耗2个高能磷酸键,每增加1个氨基酸残基实际消耗4个高能磷酸键,3. 移位,EFG,GTP,53,

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