乌拉尔甘草栽培技术要点

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1、第一节 概述,第六章 原核生物基因表达调控,负转录调控(阻遏蛋白) 负控诱导 负控阻遏 正转录调控(激活蛋白) 正控诱导 正控阻遏,可诱导调节:乳糖操纵子 可阻遏调节:色氨酸操纵子 弱化子调节:色氨酸操纵子 降解物阻遏:葡萄糖效应(cAMP) 细菌的应急反应:信号鸟苷四磷酸或鸟苷五磷酸诱导物空载tRNA,第二节 操纵子学说,操纵子模型1. 操纵子的发现2. 操纵子的结构,Lac操纵子的调控机理1. 可诱导的负调控2. 可诱导的正调控,Discovery of Operon 1961年, F. Jacob & J.Monod提出, 此后不断完善,获1965年诺贝尔生理医学奖。 1940年, Mo

2、nod发现:细菌在含葡萄糖和乳糖的培养基上生长时,细菌先利用葡萄糖,葡萄糖耗尽后,才利用乳糖;在糖源转变期,细菌的生长会出现停顿,即产生“二次生长曲线”。 细胞中存在两种酶,即组成酶与诱导酶。,诱导酶产生的实验证据: 诱导前后酶的表达情况有何变化?,分解底物的酶只有当底物存在时才出现!,培养基(35S-aa, 无乳糖) E.coli 繁殖细胞有放射性 培养基(无35S -aa, 加入乳糖) -gal(无35S),2.诱导酶是由酶前体转化而来,还是新酶合成的?,乳糖操纵子的结构,调节基因,1. 非代谢诱导物,安慰诱导物 gratuitous inducer 可诱导半乳糖苷酶产生,但不是其底物,异

3、丙基半乳糖苷( IPTG) 巯甲基半乳糖苷( TMG)O-硝基半乳糖苷( ONPG),在研究诱导作用时,很少使用乳糖,2.本底水平的组成型合成 乳糖 异乳糖,原核生物基因表达调控,乳糖操纵子的调控机制: 负调控(负控制):阻遏蛋白的调控作用,无诱导物时,lacI,P,O,有诱导物时,无诱导物阻遏蛋白有活性lac操纵子关闭 有诱导物阻遏蛋白无活性lac操纵子开启,转录,2. 正调控: cAMP-CRP的调控作用,cAMP-CRP促进结构基因转录,使操纵子开启,I -70 -50 II -50 -40,cAMP-CRP复合物与启动子的结合是lac mRNA合成起始所必需的,有利于形成稳定的开放型启

4、动子RNA聚合酶结构。,CAP, catabolite activator protein CRP, catabolite receptor protein 由crp编码,环腺苷酸cAMP,cAMP受葡萄糖代谢的影响: 葡萄糖代谢的中间产物抑制cAMP合成 或促进cAMP分解,葡萄糖对lac操纵子表达的抑制是间接的,有葡萄糖无cAMP CRP不结合操纵子关闭 无葡萄糖有cAMP cAMP-CRP结合操纵子开启,第三节 色氨酸操纵子,Trp操纵子的结构 可阻遏的负调控-粗调 弱化系统-细调,一、Trp操纵子的结构,阻遏蛋白基因R 启动子P, -40+18 操纵位点O, -21+1 前导序列L,

5、+1+162 结构基因 E、D、C、B、A,trp操纵子被关闭,有色氨酸时:,二、可阻遏的负调控,原核生物基因表达调控,trp操纵子被开启,无色氨酸时:,原核生物基因表达调控,trpO -21 +1,反向重复序列 trpP -40 +18 活性阻遏物结合trpO 与 RNA pol 结合启动子发生竞争,三、弱化作用 attenuation,1 弱化子(衰减子,),弱化子, 衰减子,,原核生物基因表达调控,4,3,2,1,2. 前导序列的分区及二级结构,弱化子,抗终止子,前导肽14aa,3 .前导肽,前导肽的翻译(Trp浓度)决定弱化子是否形成,进而决定转录是否继续。,高色氨酸时,为什么需要阻遏

6、体系?当大量外源Trp 存在时,阻遏系统起作用,阻遏物与之结合,阻止前导RNA合成。,当 trp浓度降低时,RNApol启动, 但在L.S.处脱落,转录中断,为什么需要弱化系统?,为什么需要弱化系统?,弥补阻遏作用的不足,因为阻遏只能使转录不起始,而弱化能使已经起始的转录中途停止。 当trp浓度降低时,阻遏物从有活性变为无活性,速度极慢,不能很快引发trp 合成,因此需要一个能快速作出反应的系统(抗终止子),以保持培养基中适当的Trp水平。,细菌演化出弱化系统的生物学意义,通过tRNA负载与否进行调控,更为灵敏 氨基酸的主要用途是合成蛋白质,因而tRNA 负载为标准进行调控更为恰当 两个调控系

7、统,避免浪费提高效率阻遏系统 大量trp时,不转录无trp时,转录全部结构基因弱化系统 高水平trp时,转录至前导RNA低水平trp时,转录全部结构基因,原核生物细致的精细调控机制,增强原核生物对环境的适应性,第四节 其他操纵子,半乳糖操纵子,阿拉伯糖操纵子,3个结构基因: galE,异构酶(UDP-galactose-4epimerase,), galT,半乳糖-磷酸尿嘧啶核苷转移酶(galactose transferase,), galK,半乳糖激酶(galactose kinase,)。 半乳糖葡萄糖-1-磷酸。GalR与galE、T、K及操纵区O等离得很远,而galR产物对galO的

8、作用与lacI-lacO的作用相同。,半乳糖操纵子,gal操纵子的特点: 它有两个启动子,其mRNA可从两个不同的起始点开始转录;每个启动子拥有各自的RNA聚合酶结合位点S1和S2。 它有两个O区,一个在P区上游-67-53,另一个在结构基因galE内部。,因为半乳糖的利用效率比葡萄糖低,人们猜想当葡萄糖存在时半乳糖操纵子不被诱导,但实际上有葡萄糖存在时,gal操纵子仍可被诱导。,从S1起始的转录只有在培养基中无葡萄糖时,才能顺利进行,RNA聚合酶与S1的结合需要半乳糖、CRP和较高浓度的cAMP。从S2起始的转录则完全依赖于葡萄糖,高水平的cAMP-CRP能抑制由这个启动子起始的转录。当有c

9、AMP-CRP时,转录从S1开始;当无cAMP-CAP时,转录从S2开始。,为什么gal操纵子需要两个转录起始位点?,1、半乳糖可作为唯一碳源供细胞生长。 2、尿苷二磷酸半乳糖(UDP-gal)是大肠杆菌细胞壁合成的前体。在没有外源半乳糖的情况下,UDP-gal是通过半乳糖差向异构酶的作用由UDP-葡萄糖合成的,该酶是galE基因的产物。,现在设想只有S1一个启动子,那么由于这个启动子的活性依赖于cAMP-CRP,当培养基中有葡萄糖存在时就不能合成异构酶。假如唯一的启动子是S2,那么,即使在葡萄糖存在的情况下,半乳糖也将使操纵子处于充分诱导状态,这无疑是一种浪费。,原核生物基因表达调控,原核生

10、物基因表达调控,第五节 转录后水平的调控,翻译起始的调控-SD序列与AUG的距离 稀有密码子的影响-数量较少的蛋白 重叠基因的控制-两种蛋白的等量翻译 Poly(A)尾的影响蛋白合成旺盛,尾长 翻译阻遏蛋白质阻遏翻译的进行 蛋白合成自体调控 魔斑核苷酸水平 反义RNA与mRNA互补的RNA,翻译起始调控,SD序列与核糖体16S rRNA的3端互补配对,促使核糖体结合到mRNA上 SD与AUG之间相距一般以410个核苷酸为佳,9个最佳 mRNA二级结构影响翻译起始调控,稀有密码子对翻译影响,高频率使用稀有密码子的翻译过程容易受阻,影响蛋白质合成总量,重叠基因对翻译的影响,重叠的密码保证了同一核糖

11、体对两个连续基因进行翻译的机制 偶联翻译可能是保证两个基因产物在数量上相等的重要手段,Poly(A)尾长短对翻译的影响,细胞中蛋白合成旺盛时,mRNA链上核糖体数量多, mRNA链上的poly(A)也较长 当某些mRNA链不再翻译时,核糖体释放, mRNA链上的poly(A)也相应缩短,翻译的阻遏,复制酶作为翻译阻遏物 纯化的复制酶可以和外壳蛋白的翻译起始区结合,抑制蛋白合成,严谨反应: AA饥饿蛋白合成下降RNA合成下降,原理: AA饥饿产生ppGpp、pppGpp 影响RNApol与启动子结合RNA合成下降,rRNA合成下降核糖体蛋白与自体mRNA结合核糖体蛋白翻译停止,报警信号:空载tRNA,原核生物基因表达调控,干扰mRNA的互补RNA :(mRNAinterfering complementary RNA,micRNA) 反义RNA (antisense RNA) :1.可与mRNA结合,结合位点是S-D、AUG、 部分N端密码子。2.与RNA形成双螺旋结构,作为内切酶底物3.与转录产物结合,使转录提前终止,RNA也可作为调节物质 ?!,OmpF蛋白,本章作业,弱化子 cAMP-CRP 简述细菌乳糖操纵子的调控机制。 简述细菌色氨酸操纵子的调控机制(粗调和细调),为什么要同时存在阻遏和弱化系统?,

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