英文医学数据库检索上

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1、英文医学数据库检索(上)中南大学 刘雁书 1教 学 内 容 一、重要外文检索系统及其获取 二、Pubmed文献检索系统 三、EMBase 四、Scifinder Scholar 五、Biosis Previews 六、中南大学馆订电子期刊导航 七、如何查到满意文献2一、重要外文数据库及获取途径3重要外文数据库 外文文摘数据库检索(P.84) Medline与Pubmed, EMBASE, SciFinder Scholar, BioSIS Previews, Engineering Village, Dialog 外文全文数据库检索(P.113) OVID Full Text, EBSCOho

2、st, Elsevier SDOS, SpringLink, ProQuest Medical Library, Kluwer Online Journals OCLC FirstSearch馆藏电子刊导航4公共网可获取外文文献数据库 Pubmed文献检索系统2. Google学术论文检索: 3. Scirus科学搜索引擎5中南大学医学图书馆外文数据库资源6校园网可获取外文文献资源 中南大学医学图书馆: 可获取重要外文数据库:SciFinder (CA)Web of Knowledge (SCI)EMbaseBiosis PreviewEI工程索引ISTP科学技术会议录索引博硕士论文文摘数据库

3、PQDDMicromedia临床及循证医药学数据库7 医学图书馆可获取外文全文数据库Elsevier全文数据库OVID全文数据库Proquest全文数据库Springer全文数据库PHMC全文数据库NSTL引进的全文期刊EBscohost全文数据库WorldScinet全文数据库American Chemical Society(ACS)Royal Society of Chemistry(RSC)8中南大学校本部图书馆外文数据库(部分 )9二、Pubmed文献检索系统10二、Pubmed文献检索系统 (一)沿革 (二)可获取资源 (三)基本检索功能 (四)检索结果获取及相关功能 (五)高级检

4、索方式 (六)个性化检索工具 (七)Mesh Database11(一)、Pubmed沿革121、Index Medicus,IM 美国国立医学图书馆(NLM)编辑出版 创刊时间:1879年 收录期刊:4900+多种 范围:全世界,生物医学132 MEDLINE数据库 包括三本印刷本的内容: Index Medicus,IM 美国医学索引 Index to Dental Literation 牙科文献索引 International Nursing Index 国际护理索 引142. Medline数据库 出版单位:美国国立医学图书馆(NLM) 学科:生物医学 文献类型:4900多种期刊论文线

5、索(题录 + 文摘) 年限:1966 - 范围:全世界,英文文献为主(70%)15Medline数据库检索方式 光盘:Medline on CD-ROM 互联网: 1997: Pubmed 2000: NLM Gateway( gateway.nlm.nih.gov ) 其他:Medscape16NLM Gateway检索系统17Medscape检索系统Medscape可获取资源:Medscape:医学新闻CME:继续医学教育资源eMedicine:在线医学专题文献数据库Drugs:可获取20多万种药物信息MEDLINE:免费检索MEDLINE18校园网Medline访问方式 访问网址: 访问

6、路径:1. Pubmed/Medline:检索方式与公共网检 索Pubmed相同,校园网上访问可以直接获 取我校已订购的论文全文2. Embase:可以一次性检索Medline及 Embase数据库,并自动去重3. SciFinder Scholar:可以一次性检索 Chemical Abstract 和Medline数据库,并去 重19校园网访问Pubmed检索结果界面可获取相应 数据库中收 录的全文203 Pubmed文献检索软件 NLM下属的美国国家生物技术信息中心推 出的基于WWW的文献检索软件.可检索 资源包括许多期刊出版商参与共建的 Medline数据库扩充版。21(二)可获取资源

7、 自身资源MedlineOldMedlinePreMedlinePublisher-supplied Citations 相关资源链接Related articles生物信息学资源(P238)Linkout免费期刊全文(PMC)等资源22Pubmed记录来源23Pubmed主页基本检索方式高级检索方式24(三)Pubmed基本检索功能(P86) 逻辑组配检索 字段检索(P85) 自动词语匹配功能 精确短语匹配功能 截词检索 作者检索25作者检索 Medline原来对作者姓名处理是采用姓在前,用 全称,名置后用缩写的方式 2002年起,Medline在同时采用结合缩写与全 称两种方式来处理作者姓

8、名,作者姓名缩写放 入AU字段,全称放入FAU字段 西文检索工具对中国人名的处理较混乱。如Xia Jia-hui文献可能被分散在“Xia JH”及“ Xia J”下 面,检索时需综合考虑,尽可能查全。26作者检索示意Queries Results xia j 894 Xia jau 891 Xia jh 118 Xia jhau 118 Xia,jiahui 23 Xia,jiahuifau 2327(四)检索结果获取及相关功能 检索结果获取、显示、排序及输出 全文获取28不必要的心血管支架手术?29 Q:如何查找“不必要的心血管支架手术” 英文原文出处?查找思路: 利用数据库:Pubmed

9、原文线索(检索途径): 作者:William Boden 来源期刊:新英格兰医学杂志(New Engl J Med)英文原文出处:Boden WE, ORourke RA, Teo KK, etal. Optimal medical therapy with or without PCI for stable coronary disease. New Engl J Med, 2007, 356(15):1503-16301. 输入提问式,点击”Search”312. 获取检索结果检索结果中综述篇数自动获取相关记录在NCBI其它数据库中查 找关联数据系统转换后的检索策略323. 获取英文原文出

10、处33记录转换显示格式及输出转换记录显示格式选择记录输出方式34Related Articles:自动获取相关记录35全文获取 公共网获取方式:免费:Pubmed Central或期刊网站收费:登录期刊网站图书馆:限于国外 校园网获取方式在Pubmed检索结果界面会自动显示我校订 购的全文数据库中可获取全文篇数,点击数 据库超链可获取全文。36Pubmed Central37“不必要的心血管支架手术”英文全文38(五)高级检索方式 Pubmed2009年新推出的检索方式,集成 了以往Pubmed的Limits、History、 Preview/Index、Details、Clipboard等多

11、 项辅助检索功能39Pubmed高级检索方式界面I查看并利用已有的检索策略 进行检索40高级检索方式界面II: 指定字段并进行组配检索41高级检索方式界面III:限制条件进行检索获取检索结果提供全文篇数获取检索结果提供文摘篇数42高级检索方式界面III: 查看并利用数据库索引进行检索43高级检索方式界面IV:获取更多相关资源44(六)个性化检索工具(P89) Single Citation Matcher:查找某篇文献 准确信息 Batch Citation Matcher:批量核对文献信 息 Clinical Queries:专供查找临床信息 Topic-Specific Queries:供

12、查找专题文献 信息 Journal Database:查找期刊信息及论文45Single Citation Matcher检索服务46Batch Citation Matcher检索服务47Clinical Queries检索服务48Topic-Specific Queries检索服务49Journal Databases 检索服务50(七) 利用主题词检索Pubmed Mesh Database检索功能51主题词:词汇类型(P30) 主题词(Mesh Heading),又称叙词 Descriptor, 从信息内容中抽取出来的、能表达信息实质内 容的规范化专业名词或术语 款目词,又称入口词,e

13、ntry word,主题词的同 义词或近义词 副主题词(Subheading), 又称为限定词( Qualifiers), 对主题词进一步限定的规范化用 词52主题词:形式 选词范围:包括生物医学文献中能表达与 医学或生命科学有关的概念,并具有检索 意义的常用词或词组 单个词:liver, brain 词组: 直接:lung abscess 倒装:genes, tumor suppressor53主题词特性:单一性例如:肿瘤抑制基因 tumor suppressor genesTumor suppressor genesgenes, tumor suppressorantioncogenesc

14、ancer suppressor genesgrowth suppressor genesGenes, tumor suppressorEntry termMesh Heading54主题词特性:动态性 动态性:词表每年修订如”Influenza A Virus, H1N1 Subtype”(流感 病毒A型,H1N1亚型)是2006年才正式作为 主题词的,1978-2005年间相关文献是放在“ Influenza A Virus”(流感病毒A型)主题词下 的。 55医学词汇关系 款目词与主题词 用代参照,符号“see”、”x” 主题词与主题词 交叉关系:相关参照 “see also” “gen

15、es, tumor suppressor” see also“tumor suppressor proteins” 包含关系:“Tree Structure” 56Tree Structure (P33) 主题词概念等级分类体系 将所有主题词归为15大类,并逐级展开 每一个主题词有一个Tree numbergenes, tumor suppressor G14,330,415,400 57“Genes, Tumor Suppressor”树状结构表58 副主题词进一步修饰、限定主题词的规范化用词。 也是由主题词表规定的必须与主题词配套使用,单独使用没有意 义其与其主题词组配范畴及使用规则都由词 表严格规定动态的,现在共有副主题词83个(P36)副主题词也有树状结构59Mesh Qualifier Data: therapy

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