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1、蛋白质的结构与功能第 一 章Structure and Function of Protein一、什么是蛋白质?蛋白质(protein)是由许多氨基酸(amino acids)通过肽键(peptide bond)相连形成的高分子含氮化合物。二、蛋白质的生物学重要性1. 蛋白质是生物 体重要组成成分分布广：所有器官、组织都含有蛋白质；细胞的各个部分都含有蛋白质。含量高：蛋白质是细胞内最丰富的有机分子，占人体干重的45，某些组织含量更高，例如脾、肺及横纹肌等高达80。1）作为生物催化剂（酶）2）代谢调节作用3）免疫保护作用4）物质的转运和存储5）运动与支持作用 6）参与细胞间信息传递2. 蛋白质具
2、有重要的生物学功能3. 氧化供能蛋 白 质 的 分 子 组 成 The Molecular Component of Protein第 一 节 组成蛋白质的元素主要有C、H、O、N和S。有些蛋白质含有少量磷或金属元素铁、铜、锌、锰、钴、钼，个别蛋白质还含有碘 。各种蛋白质的含氮量很接均为16。 由于体内的含氮物质以蛋白质为主，因此，只要测定生物样品中的含氮量，就可以根据以下公式推算出蛋白质的大致含量：100克样品中蛋白质的含量 ( g % )= 每克样品含氮克数 6.251001/16% 蛋白质元素组成的特点一、氨基酸 组成蛋白质的基本单位存在自然界中的氨基酸有300余种，但组成人体蛋白质的氨
3、基酸仅有20种，且均属 L-氨基酸（甘氨酸除外）。H甘氨酸CH3丙氨酸L-氨基酸的通式R1. 非极性疏水性氨基酸2. 极性中性氨基酸3. 酸性氨基酸4. 碱性氨基酸（一）氨基酸的分类* 20种氨基酸的英文名称、缩写符号及分类如下:甘氨酸 glycine Gly G 5.97丙氨酸 alanine Ala A 6.00缬氨酸 valine Val V 5.96亮氨酸 leucine Leu L 5.98异亮氨酸 isoleucine Ile I 6.02苯丙氨酸 phenylalanine Phe F 5.48脯氨酸 proline Pro P 6.301. 非极性疏水性氨基酸色氨酸 trypt
4、ophan Try W 5.89丝氨酸 serine Ser S 5.68酪氨酸 tyrosine Try Y 5.66半胱氨酸 cysteine Cys C 5.07蛋氨酸 methionine Met M 5.74天冬酰胺 asparagine Asn N 5.41谷氨酰胺 glutamine Gln Q 5.65苏氨酸 threonine Thr T 5.602. 极性中性氨基酸天冬氨酸 aspartic acid Asp D 2.97谷氨酸 glutamic acid Glu E 3.22赖氨酸 lysine Lys K 9.74精氨酸 arginine Arg R 10.76组氨酸
5、histidine His H 7.593. 酸性氨基酸4. 碱性氨基酸几种特殊氨基酸 脯氨酸 （亚氨基酸） 半胱氨酸 +胱氨酸二硫键-HH（二）氨基酸的理化性质1. 两性解离及等电点氨基酸是两性电解质，其解离程度取决 于所处溶液的酸碱度。等电点(isoelectric point, pI) 在某一pH的溶液中，氨基酸解离成 阳离子和阴离子的趋势及程度相等，成为 兼性离子，呈电中性。此时溶液的pH值 称为该氨基酸的等电点。pH=pI+OH-pHpI+H+OH-+H+pHpI氨基酸的兼性离子 阳离子阴离子2. 紫外吸收 色氨酸、酪氨酸的 最大吸收峰在 280 nm 附近。大多数蛋白质含有 这两种
6、氨基酸残基，所 以测定蛋白质溶液 280nm的光吸收值是分 析溶液中蛋白质含量的 快速简便的方法。 芳香族氨基酸的紫外吸收3. 茚三酮反应 氨基酸与茚三酮水合物共热，可生成蓝紫色化合物，其最大吸收峰在570nm处。由于此吸收峰值与氨基酸的含量存在正比关系，因此可作为氨基酸定量分析方法。二、肽* 肽键(peptide bond)是由一个氨基酸的-羧基与另一个氨基酸的-氨基脱水缩合而形成的化学键。（一）肽(peptide)+-HOH甘氨酰甘氨酸肽键* 肽是由氨基酸通过肽键缩合而形成的化合物 。* 两分子氨基酸缩合形成二肽，三分子氨 基酸缩合则形成三肽* 肽链中的氨基酸分子因为脱水缩合而基团 不全，
7、被称为氨基酸残基(residue)。* 由十个以内氨基酸相连而成的肽称为寡 肽(oligopeptide)，由更多的氨基酸相连 形成的肽称多肽(polypeptide)。N 末端：多肽链中有自由氨基的一端C 末端：多肽链中有自由羧基的一端多肽链有两端* 多肽链(polypeptide chain)是指许多氨基 酸之间以肽键连接而成的一种结构。N末端C末端牛核糖核酸酶（二） 几种生物活性肽1. 谷胱甘肽(glutathione, GSH)GSH过氧 化物酶H2O2 2GSH 2H2O GSSG GSH还原酶NADPH+H+ NADP+ 体内许多激素属寡肽或多肽 神经肽(neuropeptide)
8、2. 多肽类激素及神经肽三、蛋白质的分类 * 根据蛋白质组成成分 单纯蛋白质结合蛋白质 = 蛋白质部分 + 非蛋白质部分* 根据蛋白质形状 纤维状蛋白质球状蛋白质蛋 白 质 的 分 子 结 构 The Molecular Structure of Protein第 二 节蛋白质的分子结构包括一级结构(primary structure)二级结构(secondary structure)三级结构(tertiary structure)四级结构(quaternary structure)高级 结构定义蛋白质的一级结构指多肽链中氨基酸的排列顺序。一、蛋白质的一级结构主要的化学键肽键，有些蛋白质还包括
9、二硫键。 一级结构是蛋白质空间构象和特异生物学 功能的基础。二、蛋白质的二级结构蛋白质分子中某一段肽链的局部空间结构，即该段肽链主链骨架原子的相对空间位置，并不涉及氨基酸残基侧链的构象 。定义 主要的化学键： 氢键 （一）肽单元参与肽键的6个原子C1、C、O、N、H、C2位于同一平面，C1和C2在平面上所处的位置为反式(trans)构型，此同一平面上的6个原子构成了所谓的肽单元 (peptide unit) 。蛋白质二级结构的主要形式 -螺旋 ( -helix ) -折叠 ( -pleated sheet ) -转角 ( -turn ) 无规卷曲 ( random coil ) （二） -螺旋
10、（三）-折叠（四）-转角和无规卷曲-转角无规卷曲是用来阐述没有确定规律性的那部 分肽链结构。 （五）模体在许多蛋白质分子中，可发现二个或三个具有二级结构的肽段，在空间上相互接近，形成一个特殊的空间构象，被称为模体(motif)。钙结合蛋白中结 合钙离子的模体 锌指结构 （六）氨基酸残基的侧链对侧链对 二级结级结 构形 成的影响蛋白质二级结构是以一级结构为基础的。一段肽链其氨基酸残基的侧链适合形成-螺旋或-折叠，它就会出现相应的二级结构。 三、蛋白质的三级结构疏水键、离子键、氢键和 Van der Waals力等。 主要的化学键整条肽链中全部氨基酸残基的相对空间位置。即肽链中所有原子在三维空间的
11、排布位置。（一） 定义 肌红蛋白 (Mb) N 端C 端纤连蛋白分子的结构域 （二）结构域大分子蛋白质的三级结构常可分割成一个或 数个球状或纤维状的区域，折叠得较为紧密，各 行使其功能，称为结构域(domain) 。（三）分子伴侣分子伴侣(chaperon)通过提供一个保护环境从 而加速蛋白质折叠成天然构象或形成四级结构。* 分子伴侣可逆地与未折叠肽段的疏水部分结合随 后松开，如此重复进行可防止错误的聚集发生， 使肽链正确折叠。 * 分子伴侣也可与错误聚集的肽段结合，使之解聚 后，再诱导其正确折叠。 * 分子伴侣在蛋白质分子折叠过程中二硫键的正确 形成起了重要的作用。 亚基之间的结合力主要是疏
12、水作用，其次 是氢键和离子键。四、蛋白质的四级结构蛋白质分子中各亚基的空间排布及亚基接触部位的布局和相互作用，称为蛋白质的四级结构。有些蛋白质分子含有二条或多条多肽链， 每一条多肽链都有完整的三级结构，称为蛋白 质的亚基 (subunit)。血红蛋白的四级结构 蛋白质结构与功能的关系 The Relation of Structure and Function of Protein第 三 节（一）一级结构是空间构象的基础 一、蛋白质一级结构与功能的关系 牛核糖核酸酶的 一级结构二 硫 键天然状态， 有催化活性尿素、 -巯基乙醇去除尿素、 -巯基乙醇非折叠状态，无活性（二）一级结构与功能的关系例
13、：镰刀形红细胞贫血N-val his leu thr pro glu glu C(146) HbS 肽链HbA 肽 链N-val his leu thr pro val glu C(146) 这种由蛋白质分子发生变异所导致的疾病 ，称为“分子病”。（一）肌红蛋白与血红蛋白的结构 二、蛋白质空间结构与功能的关系 Hb与Mb一样能可逆地与O2结合， Hb与O2结合后称为氧合Hb。氧合Hb占总Hb的百分数（称百分饱和度）随O2浓度变化而改变。（二）血红蛋白的构象变化与结合氧 肌红蛋白(Mb)和血红蛋白(Hb)的氧解离曲线* 协同效应(cooperativity) 一个寡聚体蛋白质的一个亚基与其配体结
14、合后，能影响此寡聚体中另一个亚基与配体结合能力的现象，称为协同效应。 如果是促进作用则称为正协同效应 (positive cooperativity)如果是抑制作用则称为负协同效应 (negative cooperativity)O2血红素与氧结合后，铁原子半径变小，就能进入卟啉环的小孔中，继而引起肽链位置的变动。变构效应(allosteric effect)蛋白质空间结构的改变伴随其功能的变化，称为变构效应。（三）蛋白质构象改变与疾病 蛋白质构象疾病：若蛋白质的折叠发生错误，尽管其一级结构不变，但蛋白质的构象发生改变，仍可影响其功能，严重时可导致疾病发生。蛋白质构象改变导致疾病的机理：有些蛋白质错误折叠后相互聚集，常形成抗蛋白水解酶的淀粉样纤维沉淀，产生毒性而致病，表现为蛋白质淀粉样纤维沉淀的病理改变。这类疾病包括：人纹状体脊髓变性病、老年痴呆症、亨停顿舞蹈病、疯牛病等。疯牛病中的蛋白质构象改变疯牛病是由朊病毒蛋白(prion p
