基因检测读书报告

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1、l l 基因检测 l l 刘颖l 20130319 l l l 2基因(Gene)的定义: 基因是 DNA 分子上含有特定遗传信息的核苷酸序列的总称,是具有遗传效应的 DNA 分子片段,基因位于染色体上,并在染色体上呈线性排列。一、基因检测概述在人类染色体里蕴涵着整个人体生命中所有的遗传信息,它控制着人体生、老、病、死等几乎所有的生命活动,决定着人体毛发、肤色、体质、性格、健康等一切生命表象。可以说,基因是世界上一切生命的本源。3DNA的化学组成DNA是一种长链聚合物,组成单位为四种脱氧核苷酸(dAMP 、dTMP、 dCMP、dGMP )。每个脱氧核苷酸由碱基、脱氧核糖以及磷酸三种物质组成。

2、其中脱氧核糖与磷酸通过酯键相连,组成其长链骨架,排列在外侧,四种碱基与脱氧核糖以糖苷键相连 ,排列在内侧。相邻两个脱氧核苷酸按一定碱基顺序彼此用3,5-磷酸二酯键相连构成的长链4什么是基因检测?l US SACGT Report:基因检测是指,对于染色体、基因、以及(或)基因产物(例如:蛋白质或酵素)加以分析,以决定某一与特定疾病或症状有关的基因变化,是否存在于某个个人。l UK HGC:任何检验DNA、基因或染色体有无异常之测试。基因检测是通过血液、其他体液或细胞对DNA进行检测的技术,是取被检测者脱落的口腔黏膜细胞或其他组织细胞,扩增其基因信息后,通过特定设备对被检测者细胞中的DNA分子信

3、息作检测,分析它所含有的各种基因情况,从而使人们能了解自己的基因信息,预知身体患疾病的风险,从而通过改善自己的生活环境和生活习惯,避免或延缓疾病的发生。5基因检测的意义l 一、疾病的诊断l 二、疾病的预防l 三、指导个体化用药如:结核杆菌感染的诊断,以前主要依靠痰、粪便或血液培养,整检验流程需要在两周以上,现在采用基因诊断的方法,不仅敏感性大大提高,而且在1小时内就能得出结果 检测健康人群的基因型,预测个人患病的风险,并向受检者提出生活上的指导,避免疾病的发生。比如结肠癌,如果一个人 APC 基因发生了问题,不能控制上皮细胞正常的新陈代谢,则失控的上皮细胞可能出现过度增生,这就是结肠癌演变的开

4、始研究发现基因 UGT1A1 启动子区域的态性与药物伊立替康的毒副作用有相关性。如果盲目用药可造成中性粒细胞减少及腹泻的副作用。UGT1A1 基因型检测对于临床正确用药,减少毒副作用,提高疗效具有明确的临床意义 研究发现基因UGT1A1启动子区域的 态性与药物伊立替康的毒副作用有相关性。如果盲目用药可造成中性粒细胞减少及腹泻的副作用。美国FDA已建议病人在使用伊立替康前要进行UGT1A1基因型的检测。中国国家卫生部在新的临床检验项目目录中也增列了“化学药品个体化用药基因检测项目”。UGT1A1基因型检测对于临床正确用药,减少毒副作用,提高疗效具有明确的临床意义。 研究发现基因UGT1A1启动子

5、区域的 态性与药物伊立替康的毒副作用有相关性。如果盲目用药可造成中性粒细胞减少及腹泻的副作用。美国FDA已建议病人在使用伊立替康前要进行UGT1A1基因型的检测。中国国家卫生部在新的临床检验项目目录中也增列了“化学药品个体化用药基因检测项目”。UGT1A1基因型检测对于临床正确用药,减少毒副作用,提高疗效具有明确的临床意义。 研究发现基因UGT1A1启动子区域的 态性与药物伊立替康的毒副作用有相关性。如果盲目用药可造成中性粒细胞减少及腹泻的副作用。美国FDA已建议病人在使用伊立替康前要进行UGT1A1基因型的检测。中国国家卫生部在新的临床检验项目目录中也增列了“化学药品个体化用药基因检测项目”

6、。UGT1A1基因型检测对于临床正确用药,减少毒副作用,提高疗效具有明确的临床意义。 研究发现基因UGT1A1启动子区域的 态性与药物伊立替康的毒副作用有相关性。如果盲目用药可造成中性粒细胞减少及腹泻的副作用。美国FDA已建议病人在使用伊立替康前要进行UGT1A1基因型的检测。中国国家卫生部在新的临床检验项目目录中也增列了“化学药品个体化用药基因检测项目”。UGT1A1基因型检测对于临床正确用药,减少毒副作用,提高疗效具有明确的临床意义。 研究发现基因UGT1A1启动子区域的 态性与药物伊立替康的毒副作用有相关性。如果盲目用药可造成中性粒细胞减少及腹泻的副作用。美国FDA已建议病人在使用伊立替

7、康前要进行UGT1A1基因型的检测。中国国家卫生部在新的临床检验项目目录中也增列了“化学药品个体化用药基因检测项目”。UGT1A1基因型检测对于临床正确用药,减少毒副作用,提高疗效具有明确的临床意义。 基因检测与常规体检的区别基因检测是人在没发病时,预防将来会发生什么疾病,属于检测的第一阶段;而常规检测是发生疾病后,疾病到达什么程度,这属于检测的第二个阶段。传统体检主要针对人体已经出现的临床病变进行诊断和检查,它的主要任务是配合疾病的治疗,无法在病变之前预知,下更多、更深的结论。也就是说,在疾病的预防上,传统体检十分的被动和滞后。一般医疗检测手段是要看你身体是否已经有癌细胞存在,而对于没有产生

8、癌变的细胞但已经具有的风险却无从得知。基因检测则不然,通过基因检测完全可以准确地告诉你,未来某个生命时段是否存在发生某种疾病的可能性或机率,给你一个预警通知,以便及早采取有效的防病措施。1994年美国率先在一些人群中开展肠癌基因筛检,经历了10多年的发展,截至2005 年底,美国已有500多万人接受了基因检测,并且其家族性大肠癌的发病率下降了 90%,乳腺癌的发病率下降了70%。2002年英国开始实施一套全面的基因筛检制度。截至到2002年底,全世界已有559个实验室从事基因检测。欧美国家中能够实行基 因诊断的各类疾病已达1451种,并还在以每三到五天增加一个病种的速度递增。2003年,欧盟已

9、有70多万人进行了基因检测实验。根据2004年美国疾病预防和控制中心曾发布的一份调查显示,2002年9月到2003年2 月,亚特兰大和丹佛两个城市参加乳腺癌基因检测的消费者达到一万人,检测收入 达300万美元。美国犹太先锋报2007年月份报道,在美国,已经有超过10万名妇女接受了 BAC-1 和 BAC-2(两种乳癌易感基因检测)。2007年英国全民医疗服务体系开始采用基因测试的手段来检测和监测前列腺癌,这 不仅可以使诊断结果更为准确,同时还可减少患者做活体组织检测时的痛苦。截至2007年底中国有约10万人次接受了检测,而2004年还不足5000人。全球基因检测普及情况肿瘤的基因检测肿瘤处理肿

10、瘤易感性检测肿瘤处理相关分子检测正处于市场发育 的早期,从长远来看,肿瘤处理的分子 检测可以让临床医生决定特异肿瘤的亚 型,选用最有效的方法,提供更精确的 预后信息。随着当前针对肿瘤靶向治疗 而应用于临床的多个单克隆抗体的出现 ,由于不同遗传背景,应用这些方法必 将驱动分子检测的发展,这将可望是一 个巨大的检测市场。市场存在检测费用昂贵,可应用的检测 项目少,涉及到个人隐私等原因阻碍了 市场的发展。同时也由于现在出现的大 多数肿瘤易感性检测项目被专利化,其 造成的技术壁垒也阻碍了其他公司的进 入,导致市场不能迅猛发展。基因检测的前景(肿瘤基因检测市场)争议价格高昂准确性市场混乱性状是由基因与环

11、境共同决定, 不是说检查出阳性,就肯定会患 病,也许阴性结果,过两年却这 种病;同时基因检测的准确性牵 扯到仪器设备的精准和人类的个 体差异性,做起来有很多复杂性 ,也有很多不确定性。在中国的基因体检市 场上存在很多不正规 的体检机构,让人们 做一些根本不需要基 因体检的项目,来获 得利润,并且价格昂 贵。基因检测的争议有专家提出,“事实上,目前基因体检检测的大部分疾病被查出阳性以后,我们得到的只是医师给我们的生活建议,但是,我们自己本来就知道合理膳食、适当运动、戒烟限酒对身体有益,不需要基因检测来告诉我们。”二、基因检测的主要类型l目前基因检测的方法主要有:l荧光定量PCRl基因芯片l液态生

12、物芯片等PCR扩增时在加入一对引物的同时加入一个特异性的荧光探针,该探针为一寡核苷酸,两端分别标记一个报告荧光基团和一个淬灭荧光基团。探针完整时,报告基团发射的荧光信号被淬灭基团吸收;刚开始时, 探针结合在DNA任意一条单链上;PCR扩增时,Taq酶的5端3端外切酶活性将探针酶切降解,使报告荧光基团和淬灭荧光基团分离,从而荧光监测系统可接收到荧光信号,结合相应的软件可以对产物进行分析,计算待测样品模板的初始浓度。1998年法国Bieche等用FQ-PCR测定了108例乳腺癌标本。他们选择扩增频率较高的myc、ccnd1和 erbB2基因进行扩增,在108例标本中,发现10%的myc基因、23%

13、的ccnd1基因和15%的erbB2基因都有不同程度拷贝数增加,拷贝数增加的最大值分别为4.6、18.6、15.1。基因芯片的测序原理是杂交测序方法,即通过与一组已知序列的核酸探针杂交进行核酸序列测定的方法。在一块基片表面固定了序列已知的八核苷酸的探针。当溶液中带有荧光标记的核酸序列TATGCAATCTAG,与基因芯片上对应位置的核酸探针产生互补匹配时,通过确定荧光强度最强的探针位置,获得一组序列完全互补的探针序列。据此可重组出靶核酸的序列。q 把微小的乳胶颗粒(Beads,微球)分别染 成不同的(多达100种)荧光色。q 把针对不同检测物的核酸(互补链)或蛋 白(如抗原抗体)以共价方式结合到

14、特定 颜色的微球上。q 应用时,先把针对不同检测物的、用不同 颜色编码的微球混合,再加入被检测物( 被测物可以是血清中的抗原、抗体、或酶 等,也可以是PCR产物)。 在悬液中的微 球与被检测物特异性地结合,并加上荧光 标记。检测核酸检测抗原检测抗体液态芯片原理癌基因细胞株或原发肿瘤相关肿瘤N-myc细胞株神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、肺癌(小细胞)原发肿瘤神经母细胞瘤、视网膜母细胞瘤、横纹肌肉瘤C-erb-2原发肿瘤胃腺癌、肾腺癌、乳腺癌N-ras细胞株胃腺癌C-myc细胞株乳腺癌、胃腺癌、肺癌(巨细胞)原发肿瘤急性粒细胞白血病、结肠腺癌H-ras细胞株黑色瘤原发肿瘤膀胱癌、皮肤鳞癌 K-ra

15、s细胞株结肠癌、骨肉瘤原发肿瘤膀胱癌、胰腺癌、卵巢癌常见癌基因1980年 Langbcheim 等通过基因转染实验发现了与 Harvery 及 Kristein 小鼠肉瘤病毒相似的细胞癌基因,即 c-Ha-ras(1)基因,定位于第11号染色体的 11p15 区;c-Ha-ras(2)基因为伪基因,定位于X染色体上;c-Ki-ras(1)基因为伪基因,定位于第 6 号染色体 6p11-p12 区,另一种相似的基因是在人神经母细胞瘤 DNA 感染NIH3T3 细胞时发现的与 ras 类似的基因,称为c-N-ras。ras基因家族肿瘤类型临床意义乳腺癌c-Ha-ras基因mRNA水平升高与恶性肿瘤进展期中p21ras水平相关结直肠癌50的肿瘤出现 c-Ki-ras 基因点突变肺癌20-30肿瘤出现ras基因家族成员点突变,其中c-Ki-rad基因点突变与预后不良相关胰腺癌90左右的肿瘤出现c-Ki-ras基因点突变胃癌在恶性肿瘤中p21表达水平明显升高

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