DNA复制、RNA转录、蛋白质翻译

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1、第十一章 DNA复制、RNA转录、 蛋白质翻译 l第一节 DNA的复制与修复 l第二节 RNA的生物合成和加工 l第三节蛋白质的生物合成 第一节 DNA的复制与修复 lDNA是由四种脱氧核糖核酸所组成的长链大分子,是遗传信息的携带者。l生物体的遗传信息就贮存在DNA的四 种脱氧核糖核酸的排列顺序中。 lDNA通过复制将遗传信息由亲代传递给子 代;通过转录和翻译,将遗传信息传递给 蛋白质分子,从而决定生物的表现型。 DNA的复制、转录和翻译过程就构成了遗 传学的中心法则。 一 . DNA的复制 (一)、半保留复制lDNA在复制时,以亲代DNA的每一股作模 板,合成完全相同的两个双链子代DNA ,

2、每个子代DNA中都含有一股亲代DNA链 ,这种现象称为DNA的半保留复制。 (二)、 DNA复制的起始点和方式 l复制子是DNA能独立进行复制的单位。 需在特定的位点起始,可能还有终点。 l在原核生物中,复制起始点通常为一个 ,复制方向大多是双向的,也有单向的 , 而在真核生物中则为多个复制起始 点。 (三)、DNA聚合反应有关的酶1.DNA1.DNA聚合反应聚合反应DNA聚合反应的特点: (1) 以4种dNTP为底物; (2) DNA模板; Mg2+ (3)带3-OH末端的引物; (4)延长方向5 3; (5)产物DNA的性质与模板相同。DNA聚合酶Mg2+2.DNA聚合酶l在原核生物(大肠

3、杆菌)中,目前发现 的DNA聚合酶有五种,研究较多的有三 种,分别命名为DNA聚合酶(pol ),DNA聚合酶(pol ),DNA聚合 酶(pol ),这三种酶都属于具有 多种酶活性的多功能酶。参与DNA复制 的主要是pol 和pol 。 lpol 为单一肽链的大分子蛋白质,可 被特异的蛋白酶水解为两个片段,其中 的大片段称为Klenow片段,具有 53聚合酶活性和35外切酶 的活性。 另一小片段有53外切 酶的活性。 lpol 由十种亚基组成,其中亚 基具有53聚合DNA的酶活性 ,因而具有复制DNA的功能;而 亚基具有35外切酶的活性, 因而与DNA复制的校正功能有关。lDNA- pol和

4、DNA- pol 为修复 酶,DNA- pol 真正起复制作用 的酶,为复制酶。原核生物中的三种DNA聚合酶 核酸外切酶活性 35外切酶活性 53外切酶活性3、DNA连接酶催化一条DNA链的3末端与相邻的另一条DNA链的 5末端之间的磷酸二酯键的合成。与同一互补链结 合并相邻。 (双链DNA切口)条件: 需一段DNA片段具有3-OH,而另一段DNA 片段具有5-Pi基; 未封闭的缺口位于双链DNA 中,即其中有一条链是完整的; 需要消耗能量。(四)DNA的半不连续复制半不连续复制:双链DNA分子的两条链是反向平 行的。而DNA聚合酶的方向都是5 3。当DNA复制 时,一条链是连续合成的,称前导

5、链,而另一条在 5 3方向合成小片段DNA(冈崎片段),然后通过 酶将这些片段连接起来,这不连续合成的DNA 链为 滞后链。 冈崎用电子显微镜看到了DNA复制过程中出现一些 不连续片段,这些不连续片段只存在与DNA复制叉 上其中的一股。后来就把这些不连续的片段称为冈 崎片段。前导滞后1、复制的起始由蛋白因子识别复制起始点 解旋解链,形成复制叉: 由拓扑异构酶和解链酶作用,使DNA的超螺旋及双螺旋结构解 开,碱基间氢键断裂,形成两条单链DNA。单链DNA结合蛋 白(SSB)结合在两条单链DNA上,形成复制叉。 DNA复制时,局部双螺旋解开形成两条单链,这种叉状结构称 为复制叉。 引发体组装:蛋白

6、因子以及引物酶一起组装形成引发体。 引发:在引物酶的催化下,以DNA为模板,合成一段短的RNA片 段,从而获得3端自由羟基(3-OH)。(五)DNA复制的过程(原核生物)起始、延长、终止拓扑异构酶(又称DNA旋转酶) 拓扑异构酶可使DNA双链中的一条链切断,松开双 螺旋后再将DNA链连接起来,从而避免出现链的缠绕 。 拓扑异构酶可切断DNA双链,使DNA的超螺旋松解 后,再将其连接起来。解螺旋酶 又称解链酶或rep蛋白,是用于解开DNA双链的酶蛋白 ,每解开一对碱基,需消耗两分子ATP。单链DNA结合蛋白(SSB) 这是一些能够与单链DNA结合的蛋白质因子。其作 用为: 使解开双螺旋后的DNA

7、单链能够稳定存 在,即稳定单链DNA,便于以其为模板复制子代 DNA; 保护单链DNA,避免核酸酶的降解。引物酶(合成RNA) 引物酶本质上是一种依赖DNA的RNA聚合酶,该酶 以DNA为模板,聚合一段RNA短链引物,以提供自 由的3-OH,使子代DNA链能够开始聚合。 2.2.复制的延长复制的延长 由DNA聚合酶催化,以35方向的亲代DNA链为模 板,从53方向聚合子代DNA链。在原核生物中, 参与DNA复制延长的是DNA聚合酶。 引发体向前移动,解开新的局部双螺旋,形成新的复 制叉,滞后链重新合成RNA引物,继续进行链的延长。解3.3.复制的终止复制的终止 去除引物,填补缺口;连接冈崎片段

8、; 在原核生物中,由DNA聚合酶来水解去除RNA 引物,并由该酶催化延长引物缺口处的DNA, 直到剩下最后一个磷酸酯键的缺口。在DNA连 接酶的催化下,形成最后一个磷酸酯键,将冈 崎片段连接起来,形成完整的DNA长链。前导滞后拓扑异构酶解链酶单链结合蛋白DNA聚合酶引物酶DNA连接酶引物前导链滞后链冈崎片段5533DNA复制过程模式图DNA旋转酶 ATP ADP+Pi DNA结合蛋白 引物RNA 引物酶DNA聚合酶DNA聚合酶DNA连 接 酶RNA引物解旋酶DNA聚合酶复制叉移动方向5, 3,3, 5,3, 5,真核生物端粒的形成:端粒是指真核生物染色体线性DNA分子末端的结构部分,通常膨 大

9、成粒状。线性DNA在复制完成后,其末端由于引物RNA的水解而可能出现 缩短。故需要在端粒酶的催化下,进行延长反应。 端粒酶是一种RNA-蛋白质复合体,它可以其RNA为模板,通过逆 转录过程对末端DNA链进行延长。(既有模板,又有逆转录酶)以自 身的RNA为模板延长DNA单链,然后反折为双链。端粒酶与生物体的衰老、肿瘤的发生有关。 端粒酶的作用机制端粒酶的作用机制DNA复制的保真性: 为了保证遗传的稳定,DNA的复制必须具有 高保真性。DNA复制时的保真性主要与下 列因素有关:1遵守严格的碱基配对规律;2DNA聚合酶在复制时对碱基的正确选 择;3对复制过程中出现的错误及时进行校 正。 二、DNA

10、的损伤与修复 (一)、DNA的损伤(突变)l由自发的或环境的因素引起DNA一级结 构的任何异常的改变称为DNA的损伤, 也称为突变。 l常见的DNA的损伤包括碱基脱落、碱基 修饰、交联,链的断裂,重组等。 引起突变的因素:1自发因素:2物理因素: l由紫外线、电离辐射、X射线等引起的DNA损 伤。 3化学因素:如亚硝酸与亚硝酸盐。DNA突变的效应:1同义突变:基因突变导致mRNA密码子第 三位碱基的改变但不引起密码子意义的改变, 其翻译产物中的氨基酸残基顺序不变,但有时 可引起翻译效率降低。2误义突变:基因突变导致mRNA密码子碱 基被置换,其意义发生改变,翻译产物中的氨 基酸残基顺序发生改变

11、。3无义突变:基因突变导致mRNA密码子碱 基被置换而改变成终止密码子,引起多肽链合 成的终止。4移码突变:基因突变导致mRNA密码子碱 基被置换,引起突变点之后的氨基酸残基顺序 全部发生改变。 (二)、DNA损伤的修复 lDNA损伤的修复方式可分为直接修复和 取代修复两大类。 错配修复(一)直接修复:1光复活: l这是一种广泛存在的修 复作用。光复活能够修 复任何嘧啶二聚体的损 伤。其修复过程为:光 复活酶识别嘧啶二聚体 并与之结合形成复合物 在300600nm可见光 照射下,酶获得能量, 将嘧啶二聚体的丁酰环 打开,使之完全修复 光复活酶从DNA上解离 。 2转甲基作用: l在转甲基酶的催

12、化下,将DNA上的被修 饰的甲基去除。此时,转甲基酶自身被 甲基化而失活。3直接连接: lDNA断裂形成的缺口,可以在DNA连接酶 的催化下,直接进行连接而封闭缺口。 (二)取代修复:1切除修复: l这也是一种广泛存在的修复机制,可适 用于多种DNA损伤的修复。该修复机制 可以分别由两种不同的酶来发动,一种 是核酸内切酶,另一种是DNA糖苷酶。 内2重组修复: l这是DNA的复制 过程中所采用 的一种有差错 的修复方式。 3.错配修复DNA 在复制过程中发生错配,如果新合成的 链被矫正,基因编码信息可得到恢复;但如果模 板链被矫正,基因突变就被固定。第二节 RNA的生物合成和加工 一、DNA指

13、导下的RNA 合成l转录: DNA指导下的RNA 合成在RNA聚合酶的催化下,以一段DNA链为模板合成RNA,从而将DNA所携带的遗传信息传递给RNA的过程称为转录。lRNA转录合成时,只能以DNA分子中 的某一段作为模板,故存在特定的起始 位点和特定的终止位点.特定起始点和 特定终止点之间的DNA链构成一个转录 单位。 l启动子 l终止子DNA指导的RNA聚合酶l单链DNA为模板,Mg2+ l四种核糖核苷三磷酸(NTP)为底物l不需要引物 l从53聚合RNAl无校正功能转录的不对称性l转录的不对称性就是指以双链DNA 中的一条链作为模板进行转录,从 而将遗传信息由DNA传递给RNA 。l 对

14、于不同的基因来说,其转录信息可以存在 于两条不同的DNA链上。能够转录RNA的那 条DNA链称为负链(模板链),而与之互补 的另一条DNA链称为正链(编码链)。模板链编码链553 355lRNA转录合成时,只能向一个方向 进行聚合,所依赖的模板DNA链的 方向为35,而RNA链的合成方 向为53。l合成的RNA中,如只含一个基 因的遗传信息,称为单顺反子 ;如含有几个基因的遗传信息 ,则称为多顺反子。l 原核生物中的RNA聚合酶全酶由五个亚基构 成,即2。l 亚基与转录起始点的识别有关,而在转录 合成开始后被释放,余下的部分(2) 被称为核心酶,与RNA链的聚合有关。 l真核生物中的RNA聚合

15、酶可按其对-鹅膏 蕈碱敏感性而分为三种,它们均由1012个 大小不同的亚基所组成,结构非常复杂,其 功能也不同。 RNA转录合成的基本过程 1、识别l原核生物RNA聚合酶中的因子识别转录 起始点,并促使核心酶结合形成全酶复合 物。 位于基因上游,与RNA聚合酶识别、结合 并起始转录有关的一些DNA顺序称为启动 子 原核生物的两个启动子:-10序列和-35序列 。 RNA聚合酶与启动子结合后,可开始转 录。原核生物启动子TGTTGACATATAAT-10区-35区启动子转录起始部位+1基因转录区5 RNA 产物5 533编码链模板链l真核生物的转录起始区上游也存在一段 富含TA的顺序,被称为Hogness盒或 TATA盒。除此之外,在真核生物中还 可见到其他带共性的序列,如CAAT盒 及GC盒等。 l 真核生物的转录起始较为复杂。l 真核生物的转录起 始较为复杂。目前 已知RNA聚合酶 至少有六种不同 的蛋白因子参与转 录复合体的形成。 这些蛋白因子被称 为转录因子( trans-criptional factor, TF)。包括 TFA,TFB, TFD,TFE, TFF,TF-I。 转录因子 功 能TFA 稳定TFD结合 TFB 促进pol 结合 TFD

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