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1、一、核酸的一般物理性质nDNA为白色纤维状固体,RNA为白色粉末状固体,都微溶于水,其 钠盐在水中的溶解度较大。但不溶于乙醇、乙醚和氯仿等一般有 机溶剂。(用乙醇从溶液中沉淀核酸)nDNA和RNA在细胞中常以核蛋白形式存在,两种核蛋白在盐溶液中 的溶解度不同。DNA核蛋白 RNA核蛋白0.14mol/LNaCl - +1-2mol/LNaCl + - DNA溶液的粘度很大,而RNA溶液的粘度小得多。核酸发生变性或 降解后其粘度降低。 核酸受到强大离心力的作用时,可从溶液中沉降下来,其沉降速 度与核酸的大小和密度有关。第四节 核酸的重要理化性质二、核酸的两性性质及等电点n与蛋白质相似,核酸分子中
2、既含有酸性基团(磷酸基) 也含有弱碱性基团碱基,因而核酸也具有两性性质。n由于核酸分子中的磷酸是一个中等强度的酸,而碱基呈 现弱碱性,所以核酸的等电点比较低。(当核酸分子内 的酸性解离和碱性解离相等,本身所带的正电荷与负电 荷相等时,此时核酸溶液的pH值即为核酸的等电点pI) 如DNA的等电点为44.5,RNA的等电点为22.5。核酸 在其等电点时溶解度最小。nRNA的等电点比DNA低的原因,是RNA分子中核糖基2- OH通过氢键促进了磷酸基上质子的解离。DNA没有这种 作用。三、核酸的水解1.核酸的酸解和碱解 n核酸分子中的磷酸二酯键可在酸或碱性条件下水解切断 (降解)。n酸对核酸的作用因酸
3、的浓度、温度和作用时间不同而不 同。嘌呤碱基比嘧啶碱基易被水解下来。nDNA和RNA对碱的耐受程度有很大差别。例如,在0.3-1 mol/L NaOH溶液中,在室温至370C条件下RNA几乎可以 完全水解,生成2-或3-磷酸核苷;DNA在同样条件 下则不受影响,若加温至1000C,4个小时也可得到小分 子的寡聚脱氧核苷酸。这种水解性能上的差别,与RNA 核糖基上2-OH的羟基参与作用有很大的关系。在RNA 水解时,2-OH首先进攻磷酸基,在断开磷酯键的同时 形成环状磷酸二酯,再在碱的作用形成水解产物。2、核酸的酶解n生物体内存在多种核酸水解酶。这些酶可以催化水解多聚核苷酸 链中的磷酸二酯键。n
4、以DNA为底物的DNA水解酶(DNases)和以RNA为底物的RNA水解酶 (RNases)。n根据作用方式又分作两类:核酸外切酶和核酸内切酶。n核酸外切酶的作用方式是从多聚核苷酸链的一端(3-端或5- 端)开始,逐个水解切除核苷酸;核酸内切酶的作用方式刚好和 外切酶相反,它从多聚核苷酸链中间开始,在某个位点切断磷酸 二酯键。(小球菌核酸酶即可外切又可内切)n在分子生物学研究中最有应用价值的是限制性核酸内切酶。这种 酶可以特异性的水解核酸中某些特定碱基顺序部位。四、核酸的紫外吸收n在核酸分子中,由于嘌 呤碱和嘧啶碱具有共轭 双键体系,因而具有独 特的紫外线吸收光谱, 一般在260nm左右有最
5、大吸收峰,可以作为核 酸及其组分定性和定量 测定的依据。五核酸的变性、复性与杂交1. 核酸的变性(denaturation)与变性因素n核酸的变性是指核酸双螺旋区的氢键断裂,变成 单链结构的过程。变性核酸将失去其部分或全部 的生物活性。核酸的变性并不涉及磷酸二酯键的 断裂,所以它的一级结构(碱基顺序)保持不变。n能够引起核酸变性的因素很多。温度升高、酸碱 度改变、甲醛和尿素等的存在均可引起核酸的变 性。nRNA本身只有局部的双螺旋区,所以变性行为 所引起的性质变化没有DNA那样明显。n利用紫外吸收的变化,可以检测核酸变性的 情况。因为天然状态的DNA在完全变性后,紫外吸收 (260 nm)值增
6、加2540%.而RNA变性后,约增 加1.1%。n增色效应:变性后DNA对260nm紫外光的吸收 率(A260)比变性前明显增加,这种现象称为 增色效应.nA260值增加n粘度下降n浮力密度增大n分子量不变2.DNA变性后的表现3.DNA的热变性和解链温度(Tm)n用加热的方法使DNA变性叫做热变性nDNA的变性过程是突变性的,它在很窄的温度区 间内完成。因此,通常将DNA的变性达到50%时 ,即增色效应达到一半时的温度称为DNA的解链 温度(melting temperature,Tm),Tm也称熔解 温度或DNA的熔点。一般DNA的Tm值在70-85C之间RNA的T m值 tRNA的T m
7、值G和C的含量高,Tm值高。因而测定Tm值,可反映DNA分子中G、 C 含量,可通过经验公式计算:(G+C)%=(Tm-69.3)X2.44Tm大小可反映出DNA的均一性:均质DNA的熔解过程发生在一个较 小的温度范围内;异质DNA的熔解过程发生在一个较宽的温度范 围内。Tm与介质中离子强度有关:DNA的保存应在含盐的缓冲液中温度/0CA2600.020.11.0mol/LKClDNA变性(加热或极端pH)n当DNA的稀盐溶 液加热到80- 100时,双螺 旋结构即发生解 体,两条链彼此 分开,形成无规 线团。nDNA变性后,它 的一系列性质也 随之发生变化, 如紫外吸收(260 nm)值升高
8、, 粘 度降低等。4、核酸的复性n变性DNA在适当的条件下,两条彼此分开的单链 可以重新缔合成为双螺旋结构,这一过程称为复 性。DNA复性后,一系列物理、化学性质将得到 恢复。DNA复性的程度、速率与复性过程的条件 有关。n将热变性的DNA骤然冷却至低温时,DNA不可能复 性。但是将变性的DNA缓慢冷却时,可以复性, 这一过程也叫退火(annealing)。分子量越大复 性越难。浓度越大,复性越容易。此外,DNA的 复性也与它本身的组成和结构有关。n复性反应的速度用Cot1/2表示。Co为变性DNA复性 时的浓度,t为时间,以秒表示。(P352)DNA复性5、核酸的杂交(hybridization)n热变性的DNA单链,在复性时并不一定与同源DNA 互补链形成双螺旋结构,它也可以与在某些区域 有互补序列的异源DNA单链形成双螺旋结构。n这样形成的新分子称为杂交DNA分子。DNA单链与 互补的RNA链之间也可以发生杂交。n核酸的杂交在分子生物学和遗传学的研究中具有 重要意义。核 酸 的 杂 交核酸杂交的应用nSouthern blotting(Southern 印迹)nNorthern blotting(Northern 印迹)nWestern blotting(Western 印迹)