蛋白质的合成与加工

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1、目 录蛋白质的合成与加工 Protein Synthesis and Processing第十八章第十八章目 录 1954年,Paul Zamecnik及其同事实验证明体内蛋白质是 由氨基酸合成的。1956年,他们发现了氨基酰-tRNA合 成酶。 1958年,M. B. Hoagland和Zamecnik又发现蛋白质生物 合成需要可溶性RNA为中介。 1961年,Howard Dintzis证明血红蛋白肽链合成方向是 从N-末端向C-末端进行。 19611966年间,Nirencerg、Matthaei和Khorana先后 确定了64个遗传密码。 19731976年,麦胚无细胞体系、兔网织无细

2、胞体系分 别建立,蛋白质合成的具体过程终于揭晓。目 录l蛋白质的生物合成,即翻译(translation)l翻译的过程就是将核酸中核苷酸序列编码的遗传信息,通过遗传密码破译的方式解读为蛋白质分子中20种氨基酸的排列顺序 。目 录蛋白质合成体系的组成 Components Required for Protein Biosynthesis第一节 目 录参与蛋白质生物合成的三种参与蛋白质生物合成的三种RNARNA:lmRNA(messenger RNA, 信使RNA)lrRNA(ribosomal RNA, 核糖核蛋白体RNA)ltRNA(transfer RNA, 转移RNA)辅助因子包括:起始

3、因子(initiation factor, IF)延长因子(elongation factor, EF)释放因子(终止因子)(release factor, RF) 等 氨基酰-tRNA合成酶(aminoacyl-tRNA synthetase) 目 录一、mRNA是蛋白质/多肽链合成的模板l在遗传信息传递过程中,DNA转录生成mRNA ,mRNA作为蛋白质合成的直接模板,指导蛋 白质多肽链的合成。l mRNA包括 5-非翻译区(5-untranslated region, 5-UTR) 开放阅读框架区(open reading frame, ORF) 3-非翻译区(3-untranslate

4、d region, 3-UTR)原核生物mRNA真核生物mRNA非翻译区核蛋白体结合位点 起始密码子终止密码子编码序列PPP53蛋白质PPPmG -53蛋白质AAA目 录目 录(一)mRNA含有64种密码子mRNA分子上每3个核苷酸构建一个密码子,编码某一特定氨基酸或作为蛋白质合成的起始、终止信号,称为三联体密码(triplet codon),也称遗传密码子(genetic codon)。起始密码(initiation codon): AUG 终止密码(termination codon):UAA、UAG、UGA 遗 传 密 码 表目 录目 录1.遗传密码具有通用性( (universalun

5、iversal) )(二)遗传密码具有几个特性l从原核生物生物(包括病毒、细菌等)、真核生 物以及人类都共同使用同一套遗传密码。 l已发现少数例外,如动物细胞的线粒体、植物细 胞的叶绿体。2. 密码子具有方向性(direction)l起始密码子总是位于mRNA开放阅读框架的5末端,终止密码子位于3末端。 l翻译的方向是从5到3末端。 目 录3. 遗传密码具有连续性(commaless)(commaless)l 密码子按5 3方向每3个一组阅读框架顺序翻 译,无标点、不重叠,即连续性lmRNA开放阅读框架内发生一个或两个碱基插入 或缺失,可引起移码突变(frameshift mutation)。

6、 翻译的蛋白质氨基酸顺序则发生改变。 目 录4. 遗传密码具有简并性(degeneracy)(degeneracy)目 录l简并性,即同一种氨基酸具有多个密码子,或者多个密码子代表一种氨基酸的现象。l遗传密码中,除色氨酸和甲硫氨酸仅对应一个密码子外,其余氨基酸均有一个以上密码子为其编码。简并性(degeneracy)目 录目 录5. 遗传密码具有摆动性(wobble)l编码同一氨基酸的不同密码子互称同义密码子;同义密码子之间的差异通常只在第3位碱基上,密码子第3位碱基与tRNA反密码子不严格遵守碱基配对规律,而是摆动碱基配对。 U摆动配对目 录目 录密码子、反密码子配对的摆动性tRNA反密码子

7、 第1位碱基IUGACmRNA密码子 第3位碱基U、C、AA、 GU、CUG目 录二、一种tRNA只能转运一种氨基酸但 一种氨基酸可由几种tRNA转运反密码环氨基酸臂目 录tRNA的三级结构示意图目 录三、rRNA与蛋白质组成核糖体 目 录蛋白质合成场所目 录核 糖 体 的 组 成目 录原核生物核糖体 70 S Mt 2.7106 真核生物核糖体 80S Mt 4.2106目 录核糖体在蛋白质合成中有主要作用: 核糖体两亚基上具有结合mRNA的位点, 还有与起始因子、延长因子、释放因子及各种 酶的结合位点;并且具有两个tRNA结合的位点 ;A位点是氨基酰tRNA结合位点,P位点是肽 酰tRNA

8、结合位点。通过将mRNA、氨基酰- tRNA和相关的蛋白因子放置在正确的位置来调 节蛋白质的合成。核糖体是合成蛋白质的场所 。目 录l20种氨基酸(AA)l酶及众多蛋白因子,如氨基酰-tRNA合成 酶、起始因子(initiation factor,IF) 、延 长因子(elongation factor,EF)、释放 因子(release factor,RF)。 lATP、GTPl无机离子四、蛋白质合成体系还需要其他辅助因子目 录大肠杆菌蛋白质合成的5个阶段所需化合物1氨基酸的活化20种氨基酸 20种氨基酰-tRNA合成酶 32种(或多于32种)tRNA ATP、Mg2+ 2起始mRNA N-

9、甲酰甲硫氨酰-tRNAfmer mRNA上的起始密码子(AUG) 30S核糖体亚基 50S核糖体亚基 起始因子(IF-1, IF-2, IF-3) GTP、Mg2+ 3延长具有功能的70S核糖体(起始复合物) 密码子特异的氨基酰-tRNA 延长因子(EF-Tu, EF-Ts, EF-G) GTP、Mg2+ 4终止与释放mRNA上的终止密码 释放因子(RF-1, RF-2, RF-3) 5折叠和翻译后的加工特异酶、辅助因子、除去起始残基和信号肽所需的化合物, 水解过程,末端残基的修饰,磷酸、甲基、羧基、碳水化合物或辅 基结合到蛋白质上阶段必需化合物1氨基酸的活化20种氨基酸 20种氨基酰-tRN

10、A合成酶 32种(或多于32种)tRNA ATP、Mg2+ 2起始mRNA N-甲酰甲硫氨酰-tRNA mRNA上的起始密码子(AUG) 30S核糖体亚基 50S核糖体亚基 起始因子(IF-1, IF-2, IF-3) GTP、Mg2+ 3延长具有功能的70S核糖体(起始复合物) 密码子特异的氨基酰-tRNA 延长因子(EF-Tu, EF-Ts, EF-G) GTP、Mg2+ 4终止与释放mRNA上的终止密码 释放因子(RF-1, RF-2, RF-3) 5折叠和翻译后的加工特异酶、辅助因子、除去起始残基和信号肽所需的化合物, 水解过程,末端残基的修饰,磷酸、甲基、羧基、碳水化合物或辅 基结合

11、到蛋白质上阶段必需化合物目 录蛋白质的合成过程Protein Synthesis Process 第二节目 录l氨基酸的活化l肽链合成的起始(initiation)l肽链的延长(elongation)l肽链合成的终止(termination )及释放整个翻译过程可分为4个阶段 :翻译过程从开放阅读框架的5-AUG开始向3阅读,按mRNA上三联体密码的顺序指导蛋白质从N端向C端合成,直至终止密码。 目 录氨基酸 + tRNA氨基酰- tRNAATP AMPPPi氨基酰-tRNA合成酶(一)氨基酰-tRNA合成酶催化氨基酸 与tRNA的连接一、氨基酸活化成氨基酰-tRNA氨基酰-tRNA合成酶(a

12、minoacyl-tRNA synthetase)目 录第一步反应:氨基酸 ATP-E 氨基酰-AMP-E PPi 目 录目 录第二步反应:氨基酰-AMP-E tRNA 氨基酰-tRNA AMPE目 录(型)目 录l氨基酰-tRNA合成酶对底物氨基酸和tRNA都有高度特异性。l氨基酰-tRNA合成酶具有校正活性(editing activity),即酯酶的活性 。l氨基酰-tRNA的表示方法:Ser-tRNASerMet-tRNAMet (二)氨基酰-tRNA合成酶具有校读作用目 录二、起始阶段形成翻译起始复合物指在起始因子的作用下,mRNA和起始氨基酰-tRNA分别与核糖体结合而形成翻译起始

13、复合物 (translational initiation complex)。目 录l原核生物中有3种起始因子(initiation factor,IF) :IF-1、 IF-2、 IF-3l真核生物起始因子被称作eIF (eukaryotic initiation factor) eIF-1、-2、-3、-4、-5和-6 目 录翻译的起始因子真核起始因子功能 eIF-1 多功能因子,参与多个翻译步骤 eIF-2 促进起始Met-tRNAMet与核糖体40S小亚基结合 eIF-2B 又称鸟苷酸交换因子,将eIF-2上的GDP交换成GTP eIF-3 首先与40S小亚基结合的因子,并能加速后续步

14、骤 eIF-4A 具有RNA解旋酶的活性,能解除mRNA 5端的发夹结构, 使其与40S小亚基结合。是eIF-4F 的组成成分 eIF-4B 与mRNA结合,对mRNA进行扫描并定位第一个AUG eIF-4E 结合mRNA的帽子结构,是eIF4F的组成成分 eIF-4G 一种接头蛋白,能与eIF-4E 、eIF-3和poly A结合蛋白结合将 40 S的小亚基富集至mRNA,而刺激翻译。是eIF4F的组成 成分 eIF-5 促进上述起始因子从40S小亚基脱落,以便40S小亚基与60S 大亚基结合形成80S起始复合物 eIF-6 促进无活性的80S核糖体解聚生成40S小亚基和60S大亚基原核起始

15、因子功能 IF-1 防止tRNA过早地结合到A位 IF-2 促进fMet-tRNAfMet结合到30S小亚基 IF-3 结合30S小亚基,防止它过早地与50S大亚基结合,并提高P 位对fMet-tRNAfMet的特异性真核起始因子功能 eIF-1 多功能因子,参与多个翻译步骤 eIF-2 促进起始Met-tRNAMet与核糖体40S小亚基结合 eIF-2B 又称鸟苷酸交换因子,将eIF-2上的GDPGTP eIF-3 首先与40S小亚基结合的因子,并能加速后续步骤 eIF-4A 具有RNA解旋酶的活性,能解除mRNA 5端的发夹结构, 使其与40S小亚基结合。是的组成成分 eIF-4B 与mRNA结合,对mRNA进行扫描并定位第一个AUG eIF-4E 结合mRNA的帽子结构,是的组成成分 eIF-4G 一种接头蛋白,能与、eIF-3和poly A结合蛋白结合将 40 S的小亚基富集至mRNA,而刺激翻译。是eIF4F的组成 成分 eIF-5 促进上述起始因子从40S小亚基脱落,以便40S小亚基与60S 大亚基结合形成80S起始复合物 eIF-6 促进无活性的80S

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