微生物发酵产酶

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1、Chapter 2 The production of Enzyme by Fermentation of Microorganism微生物发酵产酶制作:郑穗平酶的生产方法提取分离法 (Extraction)生物合成 (Biosynthesis)化学合成 (chemicalsynthesis)SOD - blood Papain-Papaya Chymotrypsin-Pancrea organ/tissue/cellAmylase from Bacillus Protease from Bacillus Phosphatase from Bacillus Glucoamylase from

2、Aspergillus Plant cell culture Animal cell cultureFew exampleContents of chapter 21、酶生物合成过程2、常见产酶微生物3、酶的发酵工艺条件及控制4、酶生产过程的动力学GoGoGoGo5、动植物细胞培养产酶,自学2.1 酶生物合成过程 The biosynthesis process of Enzyme1、中心法则- Central Dogma 2、RNA的生物合成- Transcription3、蛋白质的生物合成- Translation4、酶生物合成的调节- RegulationGoGoGoGo下一节本章 目录

3、Reverse transcription1、中心法则-Central Dogma nReplication 复制:亲代DNA或RNA在一系列酶的作用下,生成与亲代相同的子代DNA或RNA的过程。nTranscription 转录:以DNA为模板,按照碱基配对原则将其所含的遗传信息传给RNA,形成一条与DNA链互补的RNA的过程。nTranslation 翻译:亦叫转译,以mRNA为模板,将mRNA的密码解读成蛋白质的AA顺序的过程。nReverse translation 逆转录:以RNA为模板,在逆转录酶的作用下,生成DNA的过程。本节 目录2、RNA的生物合成(转录)- Transcri

4、ption细胞内RNA的生物功能(1) 在某些RNA病毒中,其所含的双链RNA作为遗传信息的载体。 (2) 在蛋白质的生物合成过程中,各种RNA起着重要的作用。其中, tRNA作为氨基酸载体,并由其上的反密码子识别mRNA分子上的 密码子;mRNA作为蛋白质合成的模板,由其分子上的三联体密 码控制蛋白质分子中氨基酸的排列顺序;rRNA与蛋白质一起组成 核糖核蛋白体(核糖体),作为蛋白质生物合成的场所。(3) 某些RNA具有生物催化活性,属于核酸类酶,在一定条件下,可 以催化有关的生化反应。(4) 各种小分子RNA在分子修饰和代谢调节等方面有重要作用。转录过程的特点1、转录的不对称性:在RNA的

5、合成中,DNA的二条链中仅有 一条链可作为转录的模板,称为转录的不对称性。反义链 antisense strand(无意义链,负链):在RNA的转录中 ,用作模板的DNA链称为反义链。 有义链 coding strand(编码链,正链):在RNA的转录中,不 作为模板的DNA链称为有义链。2、转录所需酶:依赖DNA的RNA聚合酶又称为转录酶,是以 DNA为模板的一类RNA聚合酶。在原核生物和真核生物中 ,转录酶有所不同。原核生物的转录酶比较简单,由1 种RNA聚合酶催化所有RNA的生物合成。而在真核生物中 RNA聚合酶有3种,分别为RNA聚合酶、RNA聚合酶和 RNA聚合酶,它们都属于寡聚酶,

6、酶的亚基数目为4 10个,亚基种类有46种。 转录过程n起始位点的识别 recognitionn转录起始 initiationn链的延伸 elongationn转录终止 terminationn转录后加工 modificationThe E. coli RNA polymerase holoenzyme consists of six subunits: a a2 2 s. s.Possible catalytic subunitsPromoter specificityEnzyme assembly,Enzyme assembly, promoter recognition,promoter

7、 recognition, activator bindingactivator bindingRole unknownRole unknown (not needed (not needed in vitroin vitro) )36.5 36.5 kDakDa151151 15515511 11 kDakDa(32-90 (32-90 kDakDa) )本节 目录3、蛋白质的合成(翻译)-Translation翻译: 以RNA中mRNA为模板,按照其核苷酸顺序所组成的密码指导蛋白质的合成的过程.mRNA蛋白质翻译各种信息 各种蛋白质(核苷酸排列顺序) (氨基酸排列顺序)蛋白质合成的几个要素

8、-mRNA(模板, template)nmRNA是带有DNA遗传信息指导蛋白质合成的直接模板。n以mRNA为模板,合成一定结构的多肽链的过程(翻译),就 是将mRNA分子中的核苷酸排列顺序转变成蛋白质分子中的 氨基酸排列顺序。蛋白质合成的几个要素-遗传密码,nucleotide triplet codonnmRNA分子中,每三个相邻的核苷酸组成的三联体代表某种 氨基酸或其它信息,称为密码子或三联密码。n四种核苷酸编成三联体可形成43个即64个密码子。其中:n一个起始密码: AUGn三个终止密码: UAA UGA UAGn多数氨基酸拥有 2-4个密码蛋白质合成的几个要素- 转运RNA (tran

9、sporter)ntRNA是氨基酸的转运工具,携带活化的氨基酸到核蛋白体。ntRNA有特异性,至少有20种以上。每种tRNA的反密码环顶端均 有由三个核苷酸组成的反密码,能与mRNA上相应的密码互补结 合。酪553AUG GUU UAC ACA酪氨酰- tRNA反密码mRNA密码(codon)与反密码(anticodon) 的碱基配对蛋白质合成的几个要素-核糖体,ribosomen核糖体(或称核糖核蛋白体)由蛋白质和rRNA组成。是 存在于细胞质内的微小颗粒。The ribosome composition of prokaryotic and eukaryotic cell蛋白质合成的几个要

10、素-其他因子和酶n其他辅助因子n工具酶蛋白质的合成过程n肽链合成的起始 initiationn肽链合成的延伸 elongationn肽链合成的终止与释放 termination and releasen合成多肽的输送和加工 transport and modificationn蛋白质分子的折叠 folding氨基酸活化生成 氨酰-tRNA 原核生物肽链合成的起始阶段是在GTP和起始因子( Initiation Factor)的参与下,核糖体30 S亚基, fMet- tRNAF ,mRNA和50 S 亚基结合,组成起 始复合物的过程。主要包括5个步骤: (1)30 S亚基与起始因子IF3 结合

11、; (2)30 S亚基与mRNA结合,形成30 S-IF3-mRNA 复合物; (3)fMet- tRNAF 与起始因子IF2以及GTP结合,生 成fMet- tRNAF -IF2-GTP; (4)在起始因子IF1的参与下,fMet- tRNAF-IF2- GTP与30 S-IF3-mRNA结合生成30 S起始复合物 。在此30 S起始复合物中,fMet- tRNAF上的反密 码子正好与mRNA上的起始密码子AUG结合; (5)50 S亚基与上述30 S起始复合物结合,形成完 整的70 S核糖体。同时放出IF1,IF2,IF3 ,并使 GTP水解生成GDP和Pi。在此70 S核糖体形成时 ,f

12、Met- tRNAF 位于70 S核糖体的“P”位(肽酰基 位),而它的“A”位(氨酰基位)是空位。 蛋白质合成起始进 位转 位成肽合成终止高效率的蛋白 质合成体系n蛋白质的空间结构如何形成?n功能与结构如何统一?n体外、体内的结构如何变化?n蛋白质分子设计及蛋白质工程的需要n越来越多的基因工程产物需要复性复活, 要求蛋白质折叠 的理论及技术的指导。基因工程重组蛋白类产物必须要形 成正确的折叠才能表现出功能和活性。蛋白质的折叠本节 目录4、酶生物合成的调节 (regulation)n基因水平的表达控制q酶含量的调节n操纵子(operon):是一组功能上相关,受同一调控区 控制的基因组成的一个遗

13、传单位。A BEX底物水平 的调节酶水平 的调节酶活性的调节 酶含量的调节 酶的定位调节辅助因 子调节生长发育的不同时期 外界环境变化 酶合成与分解速度的变化(基因表达调控)产物调节细胞内酶的调控模式n酶在细胞内的含量取决于酶的合成速度和分解速度。细胞 根据自身活动需要,严格控制细胞内各种酶的合理含量, 从而对各种生物化学过程进行调控。n酶浓度调节的化学本质是基因表达的调节。在细胞内,所 合成的酶的种类及数量是由特殊的基因信息决定的。DNA所 携带的酶蛋白遗传信息,需要通过转录和翻译而合成酶蛋 白。在细胞内进行的转录或翻译过程都有特定的调节控制 机制,其中转录的调控占主导地位。因此,基因表达的

14、调 控主要在转录水平上进行。酶合成诱导的现象Jacob and Monod的工作:已知分解利用乳糖的酶有:-半乳糖苷酶; -半乳糖苷透过酶 ;硫代半乳糖苷转乙酰酶。 实验:1.大肠杆菌生长在葡萄糖培养基上时,细胞内无上述三种酶合成 ;2.大肠杆菌生长在唯一碳源乳糖培养基上时,细胞内有上述三种 酶合成;当换成葡萄糖培养基时,三种酶基本消失;3.表明菌体生物合成的经济原则:需要时才合成。本世纪三十年代,H.Karstrom在对糖代谢过程中的某些酶 的合成进行研究时提出:诱导酶与组成酶某些代谢物可以诱导某些酶的合成,是通过促进为该酶编码 的基因的表达而进行的,这种现象叫做酶合成的诱导。能诱 导酶合成

15、的物质叫诱导物。被诱导合成的酶叫诱导酶。酶合成阻遏的现象Jacob and Monod的工作: 实验:1.大肠杆菌生长在无机盐和葡萄糖的培养基上时,检测到细胞内 有色氨酸合成酶的存在;2.在上述培养基中加入色氨酸,检测发现细胞内色氨酸合成酶的 活性降低,直至消失。3.表明色氨酸的存在阻止了色氨酸合成酶的合成,体现了菌生长 的经济原则:不需要就不合成。某些代谢物可以阻止某些酶的合成,是通过阻止为该酶编 码的基因的表达而进行的,这种现象叫做酶合成的阻遏。 能阻遏酶合成的物质叫辅阻遏物。被辅阻遏物作用而停止 合成的酶叫阻遏酶。乳糖操纵子的结构诱导机制调节基因操纵基因结构基因mRNA酶蛋白阻遏蛋白不能

16、与操纵基因结合, 结构基因表达调节基因操纵基因结构基因辅阻遏物trp代谢产物与阻遏蛋白结 合,使之构象发生变化 与操纵基因结合,结构 基因不能表达色氨酸操纵子(酶的阻遏)-阻遏物和操纵基因的调节细菌乳糖操纵子的作用机制(降解物阻遏)调节基因启动子操纵 基因lacZ lacYlacACAP cAMPCAP-cAMP 复合物mRNA当葡萄糖作唯一碳源时,葡萄糖的降解物对腺苷酸环化酶有抑制作用 ,则cAMP的浓度降低, CAP-cAMP复合物减少,不能与启动子结合, 故转录不得进行。+-半乳糖苷酶-半乳糖苷透过酶-半乳糖苷乙酰 基转移酶酶过去称葡萄糖效应本节 目录2.2 常见产酶微生物 Common microorganism in Enzyme Production基本要求:n不是致病菌n发酵周期短,产酶量高n不易变异退化n最好是产生胞外酶的菌种,利于分离。n对医药和食品用酶,还应考虑安全性:n凡

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