在药物合成研发上

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1、嚴佳琳 2002年11月12日在藥物合成研發上 如何應用STN資料庫新藥開發程序上市藥品製備有機合成萃取分離純化醱酵生物技術活性篩選藥理試驗前臨床試驗藥物安全藥物代謝藥物傳遞臨床試驗Phase IPhase IIPhase III查驗登記2上市藥品製備活性篩選前臨床試驗 臨床試驗新藥開發程序化合物資料:REGISTRY、BEILSTEIN化學反應:BEILSTEIN、CASREACT、CHEMINFORMRX、DJSMONLINE文獻資料:CAPLUS、MARPAT、SCISEARCH、ANABSTR3查化合物或藥物資料之資料庫化合物 REGISTRY BEILSTEIN 藥物 ADISINS

2、IGHT PHAR DDFU DRUGPAT MRCK RTECS USANDatabase Summary Sheet4REGISTRY 資料庫特色提供特定化學物質辨識資訊的資料庫: 包括化學名稱、分子式、化學結構式及 CAS Registry Numbers (CAS RNs)。 STN許多資料庫都可以CAS RNs為檢索點 ,找出該物質之參考文獻、專利、特性資 料、物質註冊資料或是商情資料.等等。 同分異構物、光學異構物、鹽類、同位素 化合物,都有其特定的CAS RNs。 43,712,450 records (10/02) 5光學異構物之CAS No.6REGISTRY 資料格式Che

3、mical NameCAS No.CAS No. Molecular Formula7查確定結構化學物質之方式在REGISTRY中可運用的檢索策略(1)化學名稱 Chemical Name=S MISOPROSTOL/CN(2)分子式 Molecular Formula=S C22H38O5/MF(3) CAS No. =S 59122-46-2(4)化學結構 Structrue EXA,FAM8查不確定結構化學物質之方式在REGISTRY中可運用的檢索策略 (1)特定元素符號 =S C H N/ELF =S 66/C (P) 4/N (2)分子量的區間 =S 900-1000/FW (3)環

4、系統 Ring system =S 4/RID.CNT(T)1819.35/RID (4)化學結構 Structrue SSS1819.35/RID9化學名稱檢索的原則/CN表示檢索完整的化學名稱 /BI、/CNS則使用部分化學名稱檢索 依需要保留片段化學命名中的倍數詞 及結構性字首。(例:DI(W)CHLORODICHLORO; CYLORO(W)HEXANECYLOROHEXANE ) 依需要保留片段化學命名中的 “locant strings” 來精簡檢索的結果。(例:TRINITRO2,4,6-TRINITRO)10分子式的排列原則分子式需依照 Hill System Order排列1

5、1分子式計算示範6116C=+=14 3114H=+=9 11Cl=+=2 11N=+=2 11O=+=2 分子式=C14H9CL2FN2O212結構檢索 EXA FAM SSS利用STN EXPRESS 繪製檢索結構,並 將結構送入STN系統。 EXACT EXA可找出與所繪結構完 全符合的化合物,包括同位素、立體 異構物(Stereoisomers)、單體聚合物 (Homopolymers)、Free radicals、 Charged Compounds。13結構檢索 FAM SSSFAMILY FAM:含EXA,及其鹽 類(Salts)、混合物(Mixtures)、共聚 合物(Copo

6、lymers)、Addition compound。 Substructure search SSS:含 FAM,及根據使用者定義處,作不 同官能基之取代及延伸的部份。EXAFAMSSS14結構檢索範例 EXA送入系統的結構EXA找到的化合物15結構檢索範例 FAM送入系統的結構FAM找到的化合物16結構檢索範例 SSS送入系統的結構SSS找到的化合物17REGISTRYCAPLUS 或接受CAS No. 檢索的資料庫檢索策略REGISTRYL-numberReferenceCAplus及REGISTRY之關聯18CAPLUS 資料庫特色Chemical Abstracts Service 提

7、供資料收錄領域:包括應用化學、化工、 生物化學、有機化學、物理化學、分析 化學、無機化學 資料涵概範圍:自1967年起,收錄超過 1,600種重要化學期刊資料及36國專利 資料。19CAPLUS資料格式20CAPLUS資料格式21在CAPLUS找出相關資料 利用CAS ROLE快速找出下列資料 合成 PREP/RL,SPN/RL,BPN/RL 分析 ANST/RL 純化 PUR/RL 製劑 FORMULATION,USES/RL 應用 USES/RL 專利 P/DTMISOPROSTOLTAXOLCALCITONIN22MISOPROSTOL簡介作用:一種前列腺素E1類似物 它能抑制胃酸分泌,

8、又能刺激胃和十二 指腸的黏液分泌增強胃碳酸氫根微分泌 同時改善胃部循環血流促進潰瘍傷口癒 合,保護胃腸黏膜細胞。 適應症: (1)NSAID (非類固醇消炎藥)包括Aspirin 引起胃潰瘍和十二指腸潰瘍的癒合及治 療。 (2)對傳統的消化性潰瘍療效亦佳。 (3)對潰瘍患者可以同時合併NSAID給藥 23MISOPROSTOL檢索範例TAXOL簡介作用:紫杉醇是一種具抗腫瘤作用的 天然產物,它會促進微管雙體聚合成 微小管的全新抗微小管劑,可使微小 管穩定,進而抑制維持細胞功能所必 須的微管體網路的正常動態重組。 用途: 1992 年底經美國FDA核准使用於在卵巢 癌的治療。 用於乳癌的治療也有

9、許多國家獲准使用 。 肺癌及其他癌症的核准也都正在進行中 。25TAXOL 檢索範例CALCITONIN簡介Calcitonin(抑鈣激素)是一個多胜物荷 爾蒙,含32個胺基酸,一個雙硫鍵, 分子量約3600。 Calcitonin抑制骨骼異常快速形成及 溶解,而可改善帕哲氏特病(Pagets disease)。 本劑並可降低多發性骨髓癌或原發性 副甲狀腺抗進病患之高血鈣。27CALCITONIN檢索範例範例一類似結構的化合物有療效否?29愛憶欣Aricept-衛采製藥 國內第一個核准上市,有效改善阿玆海默氏型失 智症患者認知功能及行為異常的藥物。獲得2001 年國家生技醫療品質獎單一處方藥品

10、類品質獎。 1996 年在美國 FDA的審查分類為 1P優先審查醫 藥品(新規化合物) 成份Donepezil Hydrochloried Donepezil為一具專一性之可逆性 acetylcholinesterase inhibitor,能抑制乙醯膽鹼的 分解,進而增加患者突觸間隙乙醯膽鹼的濃度, 加強膽鹼性神經的功能,而改善患者的認知功能 。301.藥物基本資料取得ADISINSIGHT311.藥物基本資料取得REGISTRY322.結構轉入Structure Drawing將游標移到化學結構上,按下滑鼠右 鍵,依指示及可將結構轉入Structure Drawing。 將希望有變異的部份

11、結構進行處理。 如下圖所示:333.進行結構檢索將變更過的結構利用REGISTRY進行 SSS 及 SAM結構檢索,找到5筆。344.進入CAPLUS找文獻與療效有關的CAS ROLE可用 THU/RL運用 (L) 運算元,將REGISTRY取得 的CAS No.進行處理= FILE CAPLUS= S L5(L)THU/RL L5係由REGISTRY而來找到 5筆資料355.利用D SCAN檢視檢索結果在REGISTRY及CAPLUS都可使用D SCAN進行檢索結果的檢視。 這個動作很重要,D SCAN不收資料 印出費用,但會提供我們可判斷檢索 結果是否符合檢索策略的必要條件。 REGIST

12、RY:命名、分子式、結構式 CAPLUS:Title、Indexing term D SCAN的資料序是隨機的,如資料 範圍要縮小,就必須再使用檢索策略 限縮。366.印出所需資料376.印出所需資料 (續)38CASREACT資料庫特色資料收錄領域:期刊或專利中所提到 的化學反應 資料涵概範圍: CA所收錄的期刊自1985年起,專利則 自1991年起 InfoChem (journals 1974-1991, patents 1982-1991) INPI (Institut National de la Propriete Industrielle) (1907-1985) 399,075

13、篇文獻(9/02) 有620萬筆反應式(9/02) 39化學反應的結構檢索找下列反應的資料401.繪製反應式的化學結構使用STN Express 的 Structure Drawing 繪製反應式的結構41= S L1 SSS SAM2.進行反應式結構檢索選擇可進行反應式結構檢索的資料庫 -CASREACT,進行SSS 及 SAM 結構檢索,找到2筆。 = FILE CASREACT上載結構 = D L1檢索歷程423.利用D SCAN檢視檢索結果434.以FHIT印出檢索結果444.以FHIT印出檢索結果 (續)建議除非必要,否則不要在此資料以ALL的格式印出資料45化學反應的官能基檢索找出

14、由一個nitroso group反應成 primary amine的方法= FILE CASREACT=S NITROSO/FG.RXN (S) PRIMARY AMINE/FG.FORM 利用D SCAN找出可限縮範圍的資料 。 印出資料 檢索歷程46藥物發展之資料庫介紹http:/www.cas.org/PHARM/pharm.html Discovering New Chemical Entities Finding Drug Names Researching Pharmacology and Toxicology Locating Government Regulations Searching for Pharmaceutics Patent Watch Monitoring Worldwide Drug Developments臺灣永光化學工業股份有限公司研究發展處嚴佳琳 電話:03-4838088分機308 傳真:03-4832795E-mail :.tw 47

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