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1、第二章 原核生物第一节 细菌的分类与鉴定第二节 真细菌第三节 古细菌微生物细菌Bacteria古生菌Archaea真菌（酵母、霉菌、蕈菌等） 单细胞藻类、原生动物等非细胞型：病毒细胞型原核微生物真核微生物古生菌在进化谱系上与真细菌及真核生物相互并列， 且与后者关系更近，而其细胞构造却与真细菌较为接 近，同属于原核生物。第一节 细菌的分类与鉴定1、细菌含义的界定三原界中的真细菌原核生物：真细菌和古细菌2、细菌分类学的工作内容分类：依据相似性和进化关系划分鉴定：通过系统测定，确定菌株在类群中的所属关系命名：根据国际通用法则给所鉴定的菌株以学名。真细菌古细菌真核生物原核生物第一节 细菌的分类与鉴定一
2、、细菌分类的原则细菌分类系统界 门 纲 目 科 属 种基本单位亚 级亚种第一节 细菌的分类与鉴定一、细菌分类的原则国际命名法则：林奈的双名法亚种：subsp.（subspecies） 变种：var.(variety)学 名 = 属 名 + 种名 + 命名人姓氏枯草芽孢杆菌： Bacillus subtilis Cohn荧光假单胞菌纤维素亚种：Pseudomonas fluorescens subsp. cellulosae亚种形态学生理生化免疫学遗传学第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法分类鉴定依据第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法分类鉴定方法经典方法数值分类
3、法分子分类法（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（1）形状：细菌的基本形状第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（1）形状球菌单球菌双球菌链球菌（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）球菌分裂后的子细胞的连接方式八叠球菌四联球菌葡萄球菌第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（1）形状球菌（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）球菌分裂后的子细胞的连接方式梭状芽孢杆
4、菌短杆菌长杆菌第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（1）形状杆菌（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）杆菌的基本形状第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（1）形状螺旋菌（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）螺旋不满一圈称为弧菌螺旋不满一圈称为弧菌(vibrio)(vibrio)，满，满2626环称为螺旋菌环称为螺旋菌(spirllum)(spirllum)，旋转周，旋转周 数在数在6 6环以上的称为螺旋体环以上的称为螺旋体(spirochaeta)(spiro
5、chaeta)。螺旋菌弧菌螺旋体弧菌：菌体只有一个弯曲，其程度不足一圈， 形似“C”字或逗号，鞭毛偏端生。蛭 弧 菌霍乱弧菌螺旋菌：菌体回转如螺旋，螺 旋数目和螺距大小因 种而异。鞭毛二端生 细胞壁坚韧，菌体较 硬。螺旋体菌：菌体柔软，用于运动的类似鞭毛的轴丝位于细胞外鞘内。梅毒密螺旋体第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（1）形状细菌的特殊形态（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）柄细菌 肾形菌 臂微菌 网格硫细菌 贝日阿托氏菌(丝状) 具子实体的粘细菌第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小
6、、结构和染色反应（1）形状细菌的异常形态（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）结核杆菌的异常形态结核杆菌的正常形态第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（2）大小（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）(1)测量：测微尺(2)长度单位： 微米(m) (3)表示： 球菌:直径0.5-1.0 m 杆菌:宽(0.5-1.0 m )长 螺菌:宽、长、螺距与细菌鉴定有关的细胞结构：细胞壁 芽孢 荚膜 鞭毛 内含物细胞结构的光学鉴定方法：染色革兰氏染色法芽孢染色法荚膜染色法鞭毛染色法第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依
7、据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（3）细菌结构与染色反应（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）(6)细胞壁缺陷细菌：缺壁突变L型细菌实验室或宿主体内形成 基本去尽原生质（G+） 缺 壁 人工去壁 细 菌 部分去除球状体（G-）在自然界长期进化中形成枝原体a.L型细菌（L-form of bacteria）细菌在某些环境条件下（实验室或宿主体内）通过 自发突变而形成的遗传性稳定的细胞壁缺陷变异型。因英国李斯德（Lister）预防研究所首先发现而得名 （1935年，念珠状链杆菌 Streptobacillus moniliformis）特点：没有完整而坚韧的细胞壁，细胞
8、呈多形态； 有些能通过细菌滤器，故又称“滤过型细菌”对渗透敏感，在固体培养基上形成“油煎蛋”似 的小菌落（直径在0.1mm左右）；由于细菌细胞微小又透明，一般先要经过染色才能在显微镜下 观察清晰。革兰氏染色法细菌染 色方法鉴别染色法简单染色法负染色：正染色：死菌活菌抗酸性染色法芽孢染色法姬姆萨染色法荚膜染色法用美蓝或TTC等作活菌染色第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（3）细菌结构与染色反应（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）简 单 染 色 法第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和
9、染色反应（3）细菌结构与染色反应（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）背景着色，菌体不着 色，多用于荚膜的观察。背 景 染 色 法第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法1、细胞的形状、大小、结构和染色反应（3）细菌结构与染色反应（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）C.Gram 丹麦医生 步骤：涂片固定； 结晶紫初染1min； 碘液媒染1min； 95%乙醇脱色0.5min； 番红复染2min。 结果:阳性菌紫色； 阴性菌红色。革 兰 氏 染 色 法菌落特征：大小、形状、隆起形状、边 缘和表面状况、颜色、黏度、硬度、透 明度等。第一节 细菌的分类与
10、鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法2、细胞的群体形态（菌落形态、斜面菌苔、液体培养形态）（1）菌落：在固体培养基上（内）形成的以母细胞为中心的一堆肉眼可见的在固体培养基上（内）形成的以母细胞为中心的一堆肉眼可见的，有一定形态、构造特征的子细胞集团。，有一定形态、构造特征的子细胞集团。 如果该母细胞是一个单细胞，由它繁殖成的菌落就是如果该母细胞是一个单细胞，由它繁殖成的菌落就是单菌落单菌落 或克隆（或克隆（clone)clone)，则它的一切后代都是纯种培养物。，则它的一切后代都是纯种培养物。（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）2、细胞的群体形态（菌落形态、斜面菌苔、液体培养形态
11、） （2）菌苔：在斜面培养基上划线接种，培养3-5天形成的培养物。如果多个如果多个菌落连成一片，或者用大量纯种细胞接种在固体培养基菌落连成一片，或者用大量纯种细胞接种在固体培养基上，则长成的培养物就是上，则长成的培养物就是菌苔菌苔。第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）菌苔特征：隆起形状、表面形状、表面光泽、质地、颜色等。2、细胞的群体形态（菌落形态、斜面菌苔、液体培养形态） （2）液体培养：培养1-3天后，观察液体培养基表面生长状态第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生
12、理生化特性）培养特征：混浊程度，沉淀形态，有无气泡、颜色等。反映微生物与氧气的关系常用的细菌鉴定的生化试验氧化酶接触酶葡萄糖氧化糖发酵3、生理生化反应第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）微生物的许多科、属的划分必须依据生理生化性质的分析4、细菌的生态条件第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法（一）经典方法（依据细菌形态、细胞结构、生理生化特性）温度 pH O2等不同微生物对生态条件的需求有差 异，这种差异也是分类鉴定的重要 依据。第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法 （二）细菌的数值分类法（始于
13、20世纪50年代末 ）数值分类法与传统方法的区别：采用更多的分类特征，并且各特征不分主次，同等对待。用数理统计的方法处理细菌的各种特征，求出相似值，根据相似值大小决定细菌在分类学中的关系，并进行类群的划分。第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法（三）分子分类法分类的依据：遗传特征1、G+C百分比的测定原 理：G+CG+C+A+T100%G+C百分比值=A-腺嘌呤T-胸腺嘧啶G-鸟嘌呤C-胞嘧啶（2）不同细菌G+C百分比值的变化幅度较大（27-75%）（1）同种细菌DNA中的碱基对的顺序、数量和比例稳定。2、核酸杂交第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法（三）分子分类
14、法基本原理：双链DNA加热解链成为单链； 恢复温度后DNA单链互补形成稳定的双链3、16S rRNA碱基测序（80%的rRNA）原 理：根据不同原核生物16S rRNA碱基序列的相似性比较不同生物间的进化关系。第一节 细菌的分类与鉴定二、细菌分类鉴定的依据和方法（三）分子分类法微生物 分类方 法经典方法数值分类方法分子分类方法个体形态观察群体形态观察各项理化指标采用“等重原则”G+C含量的测定核酸杂交16S rDNA序列的测定形状 （球，杆，螺旋）大小 （微米）染色等菌落：颜色，边缘，隆 起度，粘度等 菌苔形态学形态学生理生化测定 （碳源、氮源利用等）第一节 细菌的分类与鉴定三、生物的分类系统
15、（一）两个生物分类系统1、生物的五界系统：惠特克，1969年；动物界 植物界 原生生物界 真菌界 原核生物界2、三原界（三域）系统：沃斯，1978根据生物的16SrRNA碱基序列，对生 物进行划分。真细菌古细菌真核生物第一节 细菌的分类与鉴定三、生物的分类系统（一）两个生物分类系统影响较大的两部著作：第一节 细菌的分类与鉴定三、生物的分类系统（二）细菌的分类系统1、伯杰氏细菌鉴定手册，1994年，第九版特点：吸纳了与核糖体RNA测序有关概念，并结合常规分类 信息。特点：以细菌形态、生理类型为依据，参考了系统发育关系2、伯杰氏系统细菌学手册，第2版已出版第二节 真细菌1、革兰氏阴性菌2、革兰氏阳性菌3、放线菌真细菌是人类研究得最多的一类原核生物。螺旋体球菌杆菌螺菌需氧兼性厌氧球菌乳酸菌杆菌（有芽孢、无芽孢）假丝状杆菌按形态及与 氧的关系分第二节 真细菌一、革兰氏阴性菌（一）需氧性杆菌和球菌（二）需氧性螺菌和弯曲杆菌如：克雷伯氏杆菌、布氏杆菌、假单 胞菌属的成员。哈维氏壶菌（三）兼性厌氧细菌按形态、鞭毛及氧化酶反应分肠杆菌科弧菌科巴斯德氏菌科沙门氏菌属 志贺氏菌属 大肠杆
