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1、Biology for a better worldhttp:/ 基因组数据和临床结果直接关联。常用的临床样本包括福尔马林固定石蜡包埋（FFPE）的样本、血液组织和小的活检样本， 所有这些样本的处理在技术上都颇具挑战性，数量有限，且往往质量不佳。Affymetrix 的 GeneChip 转录组分析能从广泛的临床样本中产生最准确、最可靠的结果，且起始 量要求极低，为研究人员开展珍贵样本的实验带来信心。减少全血的数据可变性对于研究而言，血液是一种非常理想的样本类型，因为采集是相对非侵入性的，价格便 宜，再加上标本广泛易得。从分离的白细胞中提取总 RNA 时，血液样本产生了最具重 复性的表达结果。
2、不幸的是，这种方法可能影响转录组图谱，在临床环境下非常麻烦， 且不切实际。因此，研究人员需要适用于全血的轻松而可靠的基因表达分析方案。然而， 全血中 70% 的 mRNA 是红细胞释放的球蛋白 mRNA，它引入噪音并降低转录本检测的 灵敏度。大部分可使用全血的表达技术都需要从样本中去除球蛋白 mRNA，这是个费时 又费钱的步骤，还会引入误差。Affymetrix 提供了简单的分析，能从少量全血中产生可 靠的转录组表达数据，而不需要去除球蛋白 mRNA，在省时省钱的同时也保留了数据的 完整性。Biology for a better worldhttp:/ FFPE 样本的数据据估计，全球约有超
3、过 10 亿个长期保存的 FFPE 样本。详细注释 的 FFPE 样本为临床研究人员提供了一种很好的资源，因为他们 能够开展大规模、高性能的回顾性研究，特别是癌症研究。然而， 从 FFPE 样本中产生可靠的基因表达数据有一定的挑战，因为所 产生的 RNA 往往质量不佳，且数量有限。众所周知，福尔马林对细胞和遗传材料影响很剧烈，而石蜡保存 导致核酸逐渐降解；因此，从长期保存的 FFPE 样本中提取出的 RNA 很难分析，因为过度的片段化、碱基修饰，以及与样本基质 中的蛋白质交联。而且，这些样本通常产生的总 RNA 很有限， 这在需要测定多个基因或重复时带来了挑战。因此，研究人员将 最大程度地受益
4、于那些能利用少量异质且降解的核酸很好地开展 表达分析的技术。Affymetrix 让研究人员能可靠地分析高度降解 的 FFPE 样本的全转录组，而只需 100 pg 总 RNA。应对有限和微量的样本表达谱分析是目前最广泛接受且最可靠的描述细胞或组织类型的 生理状态的方法。为了实现准确的分析，许多技术都需要使用从 数千至数百万个细胞中产生的 RNA。然而，许多研究领域 如干 细胞研究、肿瘤学、神经科学和免疫学 处理专门的细胞类型， 也只有少量的细胞。不光是研究人员有时受到材料数量的限制，人们也更加希望能够 揭开小的特定细胞群体中的内在基因表达差异。这能够通过选择特定表型的细胞、准确分离细胞和分析转录组来实现。然而，对 于从小的细胞亚群中提取出可靠的表达数据，现有的技术仍存在 挑战。Affymetrix 是唯一的解决方案供应商，能够解决与有限 RNA 的转录组图谱分析相关的问题，它提供的分析适用于各种具 有挑战性的临床样本类型，可从 10 个细胞或 100 pg 总 RNA 中 产生详细、可靠且准确的数据。GeneChip WT Pico Kit揭示微量细胞和临床样本的转录组 秘密
