化学信息学

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1、化化 学学 信信 息息 学学乐 英 红 催化楼 314 Tel：22409 Email：第一章第一章 前前 言言1.1 产生的背景 化学学科的重要性 化学信息量的快速增长 计算机与网络技术的发展如何面对出现的大量化学信息如何面对出现的大量化学信息 ? ?束之高阁有效利用现 状截止1999年12月31日，美国化学文摘登记的分子 、化合物和物相数目已超过23,000,000种，但有百年 历史Merck Index，12th Ed.(1996)，收录的分子和化 合物只有10,330种，占0.05%，从最大的试剂商店和 药房能买到的药品和试剂不超过10,000种。所以目前在起作用（为人类服务和为非作歹

2、）的 分子和化合物不到0.05% ，而其中有突出贡献的更 不到0.001% 。99.9%以上的分子深藏在文献库中。如果你挣了一大笔钱？如果你挣了一大笔钱？ 存在银行里 ？（没有利息、贬值） 再投资 ？化学信息就是一个大金库 ！A discipline buried by successNature, 24 May 2001 Vol 411 no 6836, p.399化学形象被与起交叉学科的成功所埋没 药物学 蛋白质组学 纳米技术 材料科学 .1.2 1.2 化学信息学的定义化学信息学的定义化学信息学是信息科学与化学的交叉学科利用数学、统计学与计算机科学的理论、方利用数学、统计学与计算机科学的

3、理论、方法和网络技术作为手段，研究化学信息的获取法和网络技术作为手段，研究化学信息的获取、表示、管理、传播、分析、加工和应用，在、表示、管理、传播、分析、加工和应用，在此基础上进行知识创新，促进化学学科的发展此基础上进行知识创新，促进化学学科的发展。1.3 1.3 化学信息学的内容化学信息学的内容 化学信息的产生和获取 利用检索工具 通过实验方法 . . 化学信息的表达、存储和管理 化学运筹学 数据整理可视化 数据库管理技术 . . 化学信息的加工和处理 化学计量学 化学软件 目的是获取更多的信息 . 化学信息的深化 化学模式识别 计算机模拟设计 . .3.4 3.4 本课程的目标本课程的目标

4、 化学信息的获取 (重点)图书, 工具书, 期刊, CA 检索, 专利检索, 网络检索等手段 网络和多媒体技术及在化学上的应用化学信息的简单总结，表示3.5 3.5 本课程的现实意义本课程的现实意义 今后科学研究的基础科研的第一步 文献调研 （例子） 科学方法的掌握在其他领域的应用第二章第二章 科技文献及检索概论科技文献及检索概论2.1 2.1 科技文献的基本常识科技文献的基本常识 科技文献的分类印刷型、缩微型、声像型、光盘型 一次文献、 二次文献、 三次文献 (原始文献) (检索工具) (总结报告)一次文献种类一次文献种类 二次文献种类二次文献种类 期刊 图书 会议文献 专利文献 科技报告

5、学位论文 技术标准 产品样本 目录 题录 文摘 索引2.2 2.2 科技文献检索基础知识科技文献检索基础知识 科技文献检索的意义科技文献检索的意义假如一个化学家懂 30 国语言，每小时读 4 种杂志，一周阅读 40 小时，从年初开始，要读完全年化学文献，需要 10 年以上的时间 美国前化学文摘总编辑 Bernler 科技文献检索的途径科技文献检索的途径主题途径作者途径引文途径其他途径如号码途径、分类途径、关键词途径等 科技文献检索的方法追溯法工具法交替法手工检索光盘检索网络检索其他途径 科技文献检索的步骤分析检索课题 选定检索工具 确定检索途径 阅读二次文献 获取原始文献第三章第三章 美国美国

6、“ “化学文摘化学文摘” ”3.1 3.1 概概 况况 名称 （CA，Chemical Abstract） 内容 以化学化工为主，涉及生物、医学、轻工 、冶金、物理等领域，最常用的检索工具. 出版情况周刊，两卷/每年，26期/卷 （1967-） 特特 点点 摘录广泛收录 136 个国家 56 种文字出版的 14,000 多种期刊，包括期刊、图书、学位论文、科 技报告、 会议论文、专利等，占总文献 98 % 出版迅速 索引完备 组 成 CA文摘和 CA索引3.2 3.2 CACA文摘文摘 CA文摘的内容以报道性为主，其内容包括研究的目的和范围、新的化学反应、化合物、材料、工艺、操作、设备、性质机

7、器理论，新知识的应用，以及研究结果和作者的判断、结论等。 CA文摘的编排方式 单期号 （一）生物化学 1-20 类 （二）有机化学 21-34 类 双期号 （三）大分子化学 35-46 类 （四）应用化学和化学工程 47-64 类 （五）物理化学、无机化学与分析化学 65-80 类CACA文摘的信息文摘的信息标题（篇名） ？ 出处（来源） ？ 作者 ？ 单位 ？ 地址 ？ 其他 文字 ？ 大小 ？ 价钱 ？不同类型的文献略有不同CACA文摘的著录格式文摘的著录格式A. A. 期刊论文期刊论文107：3735g Gas-phase hydrolysis of proteins and pepti

8、des. Meltzer, Noel M.; Tous, Guillermo I.; Gruber, Stephen; Stein, Stanley (Schering-Plough Corp., Kenil worth, NJ07033 USA) Anal. Biochem. 1987, 160(2), 356-61 (Eng).原文文种期刊名称年份 卷号 页码作者单位地址作者姓名论文题目文摘号B. B. 会议录和资料汇编会议录和资料汇编107：16969m Stationary phase effects in RP- TLC/HPTLC. Gonnet, C.; Marichy, M.

9、(Lab. Chim Anal., Univ. Claude Bernard, Lyon I, F -69622 Villeurbanne, Fr.) Proc. Mp. Instrum. High Perform. Thin Layer Chromatogr. 3rd. 1985, 49-60 (Eng). Edited by Kaiser, R. E Inst. Chromatogr.: Bad Duerkheim, Fed. Rep. Ger.会议或出版物名称会议录编者姓名出版社及所在国家C. C. 技术报告技术报告107：15373a Microemulsions and colloi

10、dal semiconductor dispersions. Graetzel, Michael (Ec. Polytech. Fed., Lausanne, Switz.). Report 1986. Order No. AD A173248/6/GAR, 19pp. (Eng). Avail NTIS. From Gov. Rep. Announce. Index (U.S.) 1987, 87(3), Abstr. No. 703870.报告收藏单位本文摘转摘自技术报告编号报告总页数D. D. 学位论文学位论文107：15759f Laser induced silicon crysta

11、l growth mechanics. Grigoropoulos, Constantine (Columbia Univ., New York, NY USA). 1986. 121pp. (Eng). Avail Univ. Microfilms Int. Order No. DA8703031. From Diss Abstr. Int. B 1987, 47(10), 4275论文收藏形式及序号本文摘转摘自出版年份E. E. 新书新书107：14456t World of Nuclear Energy. (Kaku Enerugi no Sekai) Suzuki, Eiji (Tok

12、yo Denki University Press: Tokyo, Japan). 1986. 144pp. (Japan). Y1200原价（出版国家）出版年份及总页数原书名的音译名F. F. 专利专利107：10494f Fuel cell system. Tajima, Hiroyuki (Fuji Electric Co., Ltd.). U.S. US 4,657,828 (Cl. 429-12; H01M8/06) 14 Apr. 1987, JP Appl. 85/75,579, 10 Apr. 1985; 4pp.专利号国际专利分类号专利公布或批准日期专利申请号 专利申请日期3

13、.3 3.3 CACA的索引的索引 CACA索引体系索引体系（一）分期索引每期文摘后（二）卷索引 每半年（三）累计索引 每十年 CACA索引介绍索引介绍 主题索引（ Subject Index ）（一）1907-1915年初级阶段 （二）1916-1966年发展阶段 （三）1967-1971年成熟阶段 （四）1972-至今分成 化学物质索引 和 普通主题索引出现索引指南物质的名称或表示事 物的概念性名称主题索引的例子主题索引的例子Acetic acid， analysischromatog. of，70：26684w Acetic acid，preparationspurification o

14、f，by cation exchange，70： 91101t Acetic acid，compoundscalcium saltcatalysts， for manuf. of，phenol condensation products，70：58536r副标题文摘号标 题说明语 化学物质索引（Chemical Substance Index）化学成分确定、结构明确、价键清楚的化学物质作为索引的标题，按字序排列，是CA索引中使用最广泛的索引之一。包括：已知的元素、化合物及衍生物、特种 金属的合金、矿物、特殊化合物的混合物和聚合物、各种抗菌素、酶、激素、蛋白质、多糖及基本粒子等化学物质索引以化学

15、物名称为主题词，按字顺排列，基本格式如下：主题词(登记号)副标题说明语文摘号A.A. 化学物质索引的格式化学物质索引的格式Benzoic acid 65-85-0B1246g，R28695bBenzoic acid 65-86-0，analysischromatog. of，75444tBenzoic acid 65-86-0，compoundsaluminum salt 555-32-8，catalysts，116449uBenzoic acid，4-acetyl-586-89-0，56669d登记号CA文摘号普通副标题取代基化学功能副标题B. B. 化学物质索引的编排程序化学物质索引的编排程序化合物名称 普通副标题 化学功能基副标题 取代基（字母顺序） analysis biological studies occurrence preparation properties reactions uses and miscellaneousAcetals；an