酸性土壤耐铝及铝敏感大豆间根际微生物群落差异性响应的研究

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1、T h eD i f f e r e n t i a lR e s p o n s e so fR h i z o s p h e r eM i c r o b i a lC o m m u n i t i e st oA I - t o l e r a n ta n dA I - - s e n s i t i v eS o y b e a n si nA c i dS o i l s o i l sB yT o n g y iY a n gAD i s s e r t a t i o nS u b m i t t e dt oN a n ji n gU n i v e r s i t yI

2、 nP a r t i a lF u l f i l l m e n to ft h eR e q u i r e m e n tf o rD o c t o r SD e g r e eo fS c i e n c eS u p e r v i s e db yP r o f Y o n g h u aY a n gS c h o o lo fL i f eS c i e n c e ,N a n j i n gU n i v e r s i t yN a n ji n g ,E R C h i n a2 0 1 1 5独创性声明本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的

3、研究成果。尽我所知,除了文中特别加以标注和致谢的地方外,论文中不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果,也不包含为获得南京大学或其它教育机构的学位或证书而使用过的材料。与我一同工作的同志对本研究所做的任何贡献均己在论文中作了明确的说明并表示了谢意。研究生签名:时间:劲7 年百月日关于论文使用授权的说明本人完全了解南京大学有关保留、使用学位论文的规定,即:学校有权保留送交论文的复印件和磁盘,允许论文被查阅和借阅,可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。同意南京大学可以用不同方式在不同媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容。( 保密的学位论文在解密后应遵守此协议)研究生签名:导师签名

4、:特 移峰时间:珈j 7 年彭月时间:年月日缩写英文名称Q Sq u o r u m s e n s i n gC L P P缩略词表中文名称群体感应c o m m u n i t yl e v e lp h y s i o l o g i c a lp r o f i l e群落水平生理特征P L F Ap h o s p h o l i p i df a t t ya c i dD G G E磷脂脂肪酸d e n a t u r i n gg r a d i e n tg e le l e c t r o p h o r e s i s变性梯度凝胶电泳P C Ap r i n c i p

5、l ec o m p o n e n ta n a l y s i sR D Ar e d u n d a n c ya n a l y s i sC C Ac a n o n i c a lc o r r e s p o n d e n c ea n a l y s i sH P L C主成分分析冗余分析典范对应分析h i g hp e r f o r m a n c el i q u i dc h r o m a t o g r a p h y高效液相色谱目录中文摘要IA b s t r a c t I I I第一部分文献综述。1前言11 酸性土壤中铝的形态及其对植物的影响。11 1 酸性

6、土壤中铝的形态11 2 铝毒对植物的影响22 酸性土壤的改良措施32 1 施用石灰32 2 施用弱酸性或中性改良剂32 3 施用有机酸42 4 施用有机肥和绿肥42 5 种植抗酸铝的作物品种43 植物对土壤铝毒胁迫适应的机理。53 1 植物对铝的吸收及转运53 2 植物耐铝毒的生理机制53 2 1 外部排斥机制53 2 2 内部耐受机制74 土壤微生物的功能及其多样性84 1 土壤微生物的功能84 1 1 改善土壤物理结构84 1 2 土壤微生物降解有机质及加速营养循环94 2 土壤微生物多样性94 2 1 结构多样性94 2 2 遗传多样性一1 04 2 3 功能多样性1 05 土壤微生物群

7、落的影响因子及其与植物的相互作用1 15 1 影响土壤微生物群落的主要因素1 25 1 1 土壤类型1 25 1 2 植物根分泌物1 35 1 3 环境因子1 35 2 植物与土壤微生物的相互影响1 45 2 1 植物诱导特异的根际微生物群落1 45 2 2 有益的土壤微生物与植物互作。1 55 2 - 3 有害的土壤微生物与植物互作一1 75 2 4 细菌群体感应及植物抗病策略186 土壤微生物多样性的度量1 86 1 传统培养法1 96 2 群落水平生理图谱分析2 06 3 生物标记法2 06 4 现代分子生物学方法2 06 5 宏基因组技术2 17 本研究的提出及其科学意义、研究目标及技

8、术路线2 27 1 本研究的提出、科学意义及研究目标2 27 2 技术路线2 3第二部分研究论文2 4第一章酸性土壤中耐铝及铝敏感大豆根际微生物群落功能多样性研究2 41 前言:! 紫土花岗岩 红壤 石灰岩 河沙泥( 朱波e ta 1 2 0 0 9 ) 。杨超等研究在烟叶生长期内4 种不同种烟1 2南京大学博士学位论文文献综述土壤类型微生物的变化,发现根际及非根际土壤中各类微生物数量与土壤养分含量呈正相关关系f 杨超e ta 1 2 0 0 7 ) 。林飞龙等研究发现不同土壤类型间有机质、全氮、速效钾、总腐殖酸和富里酸含量差异极显著,但细菌和放线菌个数差异不显著:不同土壤类型的土壤酸碱度对微

9、生物数量影响,真菌在酸性土壤中多,细菌和放线菌在中性或碱性土壤中数量较多f 林飞龙e ta 1 2 0 0 9 ) 。从微生物群落多样性的全球格局来看,植物群落类型初步决定了微生物群落的组成,植被通过影响土壤环境进而影响土壤微生物群落结构和多样性。从不同土壤及覆盖其上的植被与土壤微生物群落结构和多样性的关系来看,植被使土壤中的微生物种类更丰富,群落多样性更高,表层土壤微生物没有明显的优势种群,种间竞争作用较弱( 夏北成e ta 1 1 9 9 8 ) 。5 1 2 植物根分泌物在生长的过程中,植物向土壤中分泌大量有机物质,而增加了土壤中有机物质的含量和种类( M a t a m a l ae

10、ta 1 2 0 0 3 ) 。植物根分泌物包括渗出物、分泌物、分解物等,其化合物种类非常多,包括蛋白质、氨基酸、多种有机酸和木质纤维素等( W a l k e re ta 1 2 0 0 3 ) 。它们不仅为微生物提供代谢能源,对微生物生长产生影响,如碳水化合物和有机酸可为根际土壤微生物提供有效的碳源,且在数量和种类上影响着土壤微生物种群的分布,从而改变土壤微生物群落( W a l k e re ta 1 2 0 0 3 ) ,这势必影响土壤微生物群落的生态功能。研究发现根际微生物的分布与可溶性碳的分布距离有关,微生物生物量的积累依赖于根分泌物的释放;分泌物越多,微生物生长越旺盛;而根分泌物

11、的种类则影响根际微生物的种类( T a r a f d a ra n dJ u n g k1 9 8 7 ) 。5 1 3 环境因子我们生活的地球上有多种多样气候类型,由此形成的复杂自然条件影响土壤微生物的生态分布。特别是在高寒极地、高山冻原、热带雨林等各类土壤中,土壤微生物扮演了主要生物因子。而在高温、高盐、高碱、高压和低温、低p H 的极端环境中,土壤微生物更是发挥了不可替代的作用。如酸热芽孢杆菌( B a c i l l u sa c i d o c a l d a r i u s ) 的大多数菌株在6 5 7 5 还能生长,在4 0 。C 下停止生长;温暖、干燥气候条件下土壤曲霉属占多数,寒冷地方毛霉和青霉属为主,多湿地方木霉属最多。研究表明,微生物有一套特殊的代谢及遗传机制,这些机制可以保证微生物在短期内适应各种环境的改变,从而造成丰富的微生物多样南京大学博士学位论文文献综述性( S c h m i d te ta 1 2 0 0 7 ) 。5 2 植物与土壤微生物的相互影响植物与微生物之间存在相互交流现象,而植物和微生物分泌的化学信号介导了这些复杂的交流,并且决定了这些相互交流是有利的还是有害的。植物与微生物有益的互作包括微生物固氮、内生菌提高植物抗逆能力及植物生长促进菌的直接和间接影n 向( M o u l i ne ta 1 2 0 0 1 ;S c h

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