《帕金森病患者PINK1、LRRK2基因单核苷酸多态性分析》由会员分享,可在线阅读,更多相关《帕金森病患者PINK1、LRRK2基因单核苷酸多态性分析(56页珍藏版)》请在金锄头文库上搜索。
1、研究生简介董丽果,男,党员。2 0 0 5 年考入济宁医学院临床医学专业,担任生活卫生委员。本科期间以5 3 0 分通过大学英语4 级考试,以4 8 9 分通过大学英语6 级考试。曾获学校奖学金、国家励志奖学金、优秀共青团员、优秀三好学生、优秀学生干部、征文比赛一等奖等荣誉称号。2 0 1 0 年7 月本科毕业获得学士学位,应届考入徐州医学院研究生,攻读神经病学专业,担任研究生学院第三党支部委员,研究生期间通过临床执业医师资格考试。研究生期间参与国家自然科学基金项目1项,江苏省卫生厅资助项目1 项,发表论文4 篇,在N e u r o l o g i e a lS c i e n c e s
2、投稿1篇。目录缩略词表l中文摘要。2A b s t r a c t 4前言一6材料和方法一81 材料一82 方法1 l结果1 9讨论2 7结论3 l参考文献3 2综述一3 7攻读硕士学位期间发表学术论文一4 9临床培训小结。5 0致谢5 2论文独创性声明5 3论文使用授权声明5 3论文审阅认定书5 4徐州医学院硕士学位论文缩咯词A G EA R J PC D阶T AE B E O P D兀DG W A SL BL R R 融L O P DP A G EP C RP DP 【N R F L PR N AS N PU P S缩略词表A b b r e v i a t i o n英文全称a g a
3、r o s eg e le l e c t r o p h o r e s i sa u t o s o m a lr e c e s s i v ej u v e n i l ep a r k i n s o n i s mC r o h n Sd i s e a s ed e o x y r i b o n u c l e i ca c i de t h i d i u mb r o m i d ee a r l y - o n s e tP a r k i n s o n sD i s e a s ef r o n t a l - t e m p o r a ld e m e n t i
4、 ag e n o m e w i d ea s s o c i a t i o ns t u d i e sl e w yb o d yl e u c i n e - r i c hr e p e a tk i n a s e2l a t e o n s e tP a r k i n s o n SD i s e a s ep o l y a c r y l a m i d eg e le l e c t r o p h o r e s i sp o l y m e r a s ec h a i nr e a c t i o nP a r k i n s o n Sd i s e a s e
5、p h o s n h a t a s ea n dt e n s i n b o m o l o g u e( P T E N ) 一i n d u c e dp u t a t i v ek i n a s elr e s t r i c t i o nf r a g m e n tl e n g t hp o l y m o r p h i s mr i b o n u c l e i ca c i ds i n g l en u c l e o t i d ep o l y m o r p h i s mu b i q u i t i np r o t e a s o m es y s
6、 t e m中文全称琼脂糖凝胶电泳常染色体隐性幼年期帕金森病克罗恩病脱氧核糖核酸溴乙锭早发性帕金森病额颞叶痴呆全基因组相关性研究路易小体富含亮氨酸重复激酶2晚发性帕金森病聚丙烯酰胺凝胶电泳聚合酶链式反应帕金森病同源性磷酸酶张力蛋白诱导的激酶1限制性长度片段多态性核糖核酸单核苷酸多态性泛素蛋白酶体系统徐州医学院硕士学位论文帕金森病患者P I N K l 、L R R K 2 基因单核苷酸多态性分析中文摘要目的探讨P I N K l 基因r s 4 5 5 3 0 3 4 0 位点及L R R K 2 基因r s l 4 9 1 9 4 2 位点单核苷酸多态性( s i n g l en u c
7、l e o t i d ep o l y r a o r p h i s m ,S N P ) 与徐州地区汉族人群晚发散发性帕金森病( P a r k i n s o n sd i s e a s e ,P D ) 的相关性。方法收集1 5 2 例晚发散发性P D 患者和1 6 0 名年龄和性别相匹配的健康对照者,入组者均来自中国汉族人群。抽取其外周血并提取全基因组D N A ,应用聚合酶链式反应( p o l y m e r a s ec h a i nr e a c t i o n ,P C R ) 扩增包含多态位点的目的基因片段,通过琼脂糖凝胶电泳( A G E ) 检测P C R 产物
8、。对P C R 产物分别用D N A 限制性内切酶N h l V 和S m l I 进行酶切,用聚丙烯酰胺凝胶电泳( P A C 迅) 、硝酸银染色检测酶切产物,采用聚合酶链式反应限制性片段长度多态性( r e s t r i c t i o nf r a g m e n tl e n g t hp o l y m o r p h i s m ,R F L P ) 技术分析基因型。计算所有研究对象两个S N P 位点的基因型频率和等位基因频率。定量资料以( x s ) 表示,两组间定量资料的比较采用t 检验,计数资料采用z 检验进行统计分析。P o 0 5 )_ ( 表6 ) 。表6 晚发散发
9、性P D 病例组与对照组的一般资料比较注:P I 为两组间年龄的比较( 1 = 1 0 5 7 ,P 0 0 5 ;P b 为两组问性别的比较,Z = o 6 4 3 ,P 0 0 5 。2H a r d y - W e i n b e r g 平衡吻和度检验r s 4 5 5 3 0 3 4 0 位点基因型实际频数与预计频数检测符合H a r d y - W e i n b e r g 平衡,吻合好( 帕金森病组z = 0 2 7 5 ,P - - - - 0 6 0 0 ;对照组z 。= 0 0 3 9 ,P = 0 8 4 3 ) 。r s l 4 9 1 9 4 2位点基因型实际频数与
10、预计频数检测符合H a r d y - W e m b e r g 平衡,吻合好( 晚发散发性P D 组z = 1 2 1 8 ,P = O 2 7 0 ;对照组z = o 9 8 9 ,P = 0 3 2 0 ) 。表明这两个多态位点在所研究的样本中基因型分布符合H a r d y - W e i n b e r g 遗传平衡定律,本次研究所选取的样本具有群体代表性,可以做后续的统计分析。3P C R 产物琼膳糖凝胶电泳结果r s 4 5 5 3 0 3 4 0 位点的P C R 产物经琼脂糖凝胶电泳结果显示片段大小一致,扩增产物大小为3 9 6 b p ( 图1 ) 。徐州医学院硕士学位论
11、文6 0 5 0 4 0 3 02 01 0M12345673 9 6 b p图1r s 4 5 5 3 0 3 4 0 多态位点P C R 产物电泳图M 为M a r k e r ( 1 0 0 6 0 0 b p ) 。1 7 泳道为P C R 产物。目的片段大小为3 9 6 b pr s l 4 9 1 9 4 2 位点的P C R 产物经琼脂糖凝胶电泳结果显示片段大小一致,扩增产物大小为( 图2 ) 。 M12345676 0 0 5 0 0 4 0 0 3 0 0 2 0 01 0 00 0 b p图2r s l 4 9 1 9 4 2 多态位点P C R 产物电泳图M 为M a r
12、 k e r ( 1 0 0 - 6 0 0 b p ) ,1 - 7 泳道为P C R 产物,目的片段大小为4 0 0 b p 4 醐产物聚丙脓胺凝胶电泳结果r s 4 5 5 3 0 3 4 0 多态的酶切产物有3 种基因型:C C 、C G 、G G ,C C 基因型显示9 4 b p 和1 1 0 b p 两条条带,1 4 b p 、2 3 b p 、3 6 b p 、6 0 b p 和6 2 b p 的酶切产物分子量较小,电泳时跑出胶外;杂合子c T 电泳后显示1 1 7 b p 、1 1 0 b p 、9 4b p3 条条带,6 2 b p 、徐州医学院硕士学位论文1 4b p 、
13、6 0b p 、2 3b p 、3 6b p 片段电泳时跑至胶外;纯合子T T 显示1 1 0 b p 和1 1 7 b p两条条带,6 2 b p 、1 4 b p 、1 1 0 b p 、6 0 b p 、1 1 7 b p 、3 6 b p 电泳时跑至胶外,染色未显示( 图3 ) 。6 0 0 b D 一 5 0 0 b D 一4 0 0 b o 一 3 0 0 b p - -2 0 0 b p - -1 0 0 b p、11234j67S91 01 11 21 3 j 1 记r 一1 13 :C -一S o c图3r s 4 5 5 3 0 3 4 0 多态位点酶切产物电泳图M 为M
14、a r k e r ( 1 0 0 “0 0 b p ) 。1 、2 、4 、5 、6 、7 、8 泳道为杂合子C T , 9 、1 0 、1 1 、1 2 、1 4 泳道为纯合子C C 。1 3 号为纯合子T T 。r s l 4 9 1 9 4 2 多态的酶切产物有3 种基因型:C C 、C G 、G G ,C C 基因型显示2 7 6 b p和1 2 4 b p 条带;C G 基因型显示2 7 6 b p 、1 2 4 b p 和4 0 0 b p3 条条带;G G 基因型显示4 0 0 b p 的单一电泳条带( 图4 ) 。2 l徐州医学院硕士学位论文6 0 0 5 0 0 4 0 03 0 02 0 01 0 0M1234560 0 b p7 6 b p2 4 b p图4r s l 4 9 1 9 4 2 多态位点酶切产物电泳图M 为M a r k g r0 0 0 6 0 0 b p ) ,1 号为纯合子C C ,2 、4 、5 号为杂合子C G ,3 、6 号为纯合子G G 。5 两组问r s 4 5 5 3 0 3 4 0 、r s l 4 9 1 9 4 2 多态等位基因、基因型和遗传模型分布比较P I N K I 基因r s 4 5 5 3 0 3 4 0 多态位点的基因型在P D 组和对照均以C