《玉米抗丝黑穗病的全基因组关联分析》由会员分享，可在线阅读，更多相关《玉米抗丝黑穗病的全基因组关联分析（101页珍藏版）》请在金锄头文库上搜索。
1、分类号：华中农业大学博士学位论文玉米抗丝黑穗病的全基因组关联分析密级：G e n o m e - w i d eA s s o c i a t i o nS t u d y ( G W A S ) o fResistancedeA s s o c i a t i o nS t u d vW AR e s i s t a n c et oH e a dS m u ti nM a i z e ( Z E AM A Y SL )研究生：王明指导教师：郑用琏教授指导小组：柳俊教授徐尚忠教授林拥军教授周竹青教授专业：生物化学与分子生物学学位级别：理学博士研究方向：玉米抗病分子生物学获得学位时间：2 0
2、1 2 年0 5 月华中农业大学生命科学与技术学院 二。一二年五月华中农业大学学位论文独仓| | ：l 性声明及使用授权书学位论文否如需保密，解密时间年月日=楚否保密猁焖I 愀鼎本人声明所呈交的论文是我个人在导师指导下进行的研究工作及取得的研究成果。尽我所知，除了文中梅烈加以标注和致谢的她方外，论文孛不包含其他人已经发表或撰写过的研究成果，也不越含为获褥华中农业大学或其他教育桃构的学位或证书而使用过的材料，指导教癖对她进行了审定与栽一瞬工作的同志对本研究所做的任。1何贡献均已在论文中做了明确的说明，并表示了谢憨研究生签名：委鹏时闻：l 、年，月i t 日学位论文使用授权书本人完全了解华中农业大
3、学关于保存、使用学位论文的撬定，审学生必须按照学校要求提交学位论文的印刷本和电子版本；学校有权保存提交论文的印刷版和电予版，并提供目录检索和阅览服务，可以采用影印、缩印或扫描等复制手段保存、汇编学位论文。本人同意华中农业大学可以用不同方式在不圊媒体上发表、传播学位论文的全部或部分内容，为存在馆际合作关系姆兄劳高校用户提供文献传送和交换服务，同时本人保留在其他媒体发表论文的权力。注：保密学位论文( 雎涉及技术秘密、商业秘密或磅睾请专利等潜在需要提交保密赞论文) 在解密后适用于本授权书撇黼馘彭吗导绛獬：国。酽。签名日期：x 年f 月l 嘻日签名疆期：二p l 擗 月f 够霞 注：请将本袭离接装订在
4、学位论文的靡页和露录之闻玉米抗丝黑穗病全基因组关联分析目录摘要IA b s t r a c t I I I 缩略语表V第一章前言11 1 玉米丝黑穗病概述11 1 1 玉米丝黑穗病的危害11 1 2 玉米丝黑穗病的病原特征和发病症状11 1 3 丝黑穗病生理小种的分化21 1 4 玉米丝黑穗病的抗性鉴定31 1 5 玉米丝黑穗病的防治31 1 6 抗丝黑穗病Q T L 定位进展41 1 7 丝黑穗抗病机理研究进展41 2 植物抗病基因研究进展51 2 1 植病互作模型51 2 2 植物抗病基因的特征和分类61 2 3N B S 类抗病基因的功能和作用机制91 2 3 1L R R 的结构和功能
5、1 01 2 3 2N B S 类基因的进化1 01 2 4 植物抗病基因的克隆方法1 21 3 玉米种质与遗传多样性1 31 4 关联分析与连锁不平衡1 51 4 1 连锁不平衡和遗传连锁1 61 4 2 连锁不平衡的度量1 61 4 3 影响植物中的连锁不平衡的因素1 71 4 4 关联分析的一般方法1 81 4 4 1 关联群体的构建181 4 4 2 群体结构和亲缘关系的评估181 4 4 3 表型的检测2 01 4 4 4 基因型测定2 01 4 4 5 表型与基因型的关联分析2 l1 4 5 关联分析的研究进展2 l1 4 6 关联分析的挑战2 21 5 本研究的目的与意义2 3华
6、中农业大学2 0 1 2 届博士研究生学位论文第二章玉米全基因组N B S 类型抗病基因分析2 42 1 材料和方法一2 52 1 1 全基因组N B S 类型抗病基因的鉴定2 52 1 2N B S 类型基因的分类2 52 1 3N B S 基因特殊结构域的预测和转座元件的预测2 62 1 4 N B S 类型基因的染色体定位2 62 1 5N B S 类型基因系统进化树的构建2 62 1 6N B S 类型基因的表达2 62 2 结果与分析一2 62 2 1N B S 类型候选基因的确定和分类2 62 2 2N 端结构分析2 72 2 3N B S 区域序列分析2 72 2 4L R R
7、和C 末端结构分析2 82 2 5N B S 类型抗病基因的特殊结构2 82 2 6N B S 类型抗病基因中的转座元件2 92 2 7N B S 类型抗病基因的染色体物理定位3 02 2 8N B S 类型抗病基因的系统发生分析312 2 9N B S 类型基因与其它基因组的比较及进化分析3 32 2 1 0 玉米N B S 类抗病基因的表达分析3 32 3 讨论3 4第三章抗玉米丝黑穗病的全基因组关联分析3 73 1 材料与方法3 83 1 1 材料3 83 1 2 田间试验与性状调查3 83 1 2 1 田间种植3 83 1 2 2 病原菌接种3 83 1 2 3 丝黑穗病抗性鉴定：3
8、83 1 3S N P 基因型鉴定3 83 1 4 遗传多样性分析4 03 1 5 群体结构分析4 03 1 6 遗传率的计算4 03 1 7L D 的计算4 13 1 8 基因注释4 13 1 9 亲缘关系( K i n s h i p ) 的计算4 13 1 1 0 抗丝黑穗病性状和标记的关联分析4 1玉米抗丝黑穗病全基因组关联分析3 1 1 1 候选区段关联分析4 13 2 结果与分析4 l3 2 1 表型统计分析4 13 2 2 基因分型结果4 23 2 31 4 4 个自交系的遗传组成及种质类群的划分4 43 2 4L D 的分布4 93 2 5 亲缘关系的评估5 03 2 6 关联
9、分析5 03 2 6 1 关联分析模型的选取5 03 2 6 2 关联分析所揭示的候选基因5 l3 2 6 3 候选基因的关联分析5 13 3 讨论5 33 3 1 玉米抗丝黑穗病的抗性筛选5 33 3 1 1 玉米抗丝黑穗病抗性的鉴定5 33 3 1 2 玉米丝黑穗病抗源的鉴定5 43 3 2S N P ：枣片在遗传多样性分析中应用5 43 3 3S N P 标记与玉米杂种优势群的划分5 53 3 4 比较S S R 和S N P 标记在遗传多样性和遗传分析中的应用5 63 3 5 稀有等位基因5 63 3 6 玉米染色体上的L D 的分布5 73 3 7 关联S N P 标记与已知玉米抗丝黑穗病抗性Q T L 比较分析5 83 3 8 关联分析所揭示的抗病复杂性5 83 3 9 关联分析所揭示的复杂抗病网络6 13 3 1 0 候选区段基因关联分析6 33 3 11 关联分析的阈值选取6 33 3 1 2 育种的应用6 3参考文献6 5致谢9 0玉米抗丝黑穗病全基因
