生物信息学课程题目 (1)

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1、课程作业课程作业从下面三个题目中任选一个,运用所学的生物信息学知识,从下面三个题目中任选一个,运用所学的生物信息学知识,结合本研究领域,进行分析。结合本研究领域,进行分析。要求:要求:1 1)一定要结合本研究领域,写一个)一定要结合本研究领域,写一个 1 1 万字左右的研究报告,万字左右的研究报告,包括插图、表格和文字等。包括插图、表格和文字等。2 2)分析中使用的软件要写明版本号。)分析中使用的软件要写明版本号。3 3)报告内容:包括)报告内容:包括摘要摘要、研究背景及意义研究背景及意义、材料与方法材料与方法以以及及结果与讨论结果与讨论等部分,格式要规范。等部分,格式要规范。4 4)报告上应

2、注明:)报告上应注明:学号、姓名、所属学院以及研究专业学号、姓名、所属学院以及研究专业。5 5)提交时间:报告最后生成)提交时间:报告最后生成 pdfpdf 格式文件,于格式文件,于 10151015 年年 1212月月 3131 日前将报告同时发给以下邮箱:日前将报告同时发给以下邮箱:一、请利用核酸和蛋白质数据库下载“Homo sapiens apolipoprotein B mRNA editing enzyme, catalytic polypeptide-like 3B (APOBEC3B) ”的核 酸序列和蛋白质序列,在核酸水平上分析启动子序列及转录因子结合位点区,并进 一步对蛋白质的结构进行同源建模。二、结合本研究领域,利用核酸 (ncbi、embl和ddbj)和蛋白质数据库 (SwissProt)找出你所感兴趣的基因或蛋白, 找出与其它物种的同源基因或蛋白,并分 析其可能的进化历史。三、结合本研究领域,从网上数据库下载 基因芯片数据或RNA-seq数据(mRNA测序), 运用所学的生物信息学方法,筛选出差异 表达基因,并对其进行可视化等相关分析。

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