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1、蛋白质提取相关蛋白质提取相关浓缩胶和分离胶的 PH 值不同，前者主要表现为浓缩效用，后者表现为电荷效用和分子筛效用。 浓缩效应主要在浓缩胶中完成，浓缩胶的 pH6.8，在这个 pH 条件下，缓冲液中的 HCl 的 Cl 离子几乎全部解离，Gly 的等电点为 6.0，仅少数解离为负离子，在电场中移动速度很慢。酸性蛋白质在此 pH 下解离为负离子，三类离子的迁移速率为 Cl一般蛋白质Gly，电泳开始后，Cl 离子泳动快，在其后留下一个低离子浓度区。Gly 在电场中移动很慢，造成移动离子的缺乏，于是快慢离子间就形成了一个缺少离子的高压区，在高压区内所有的负离子都会加速移动，当移到 Cl 离子区域时，
2、高电压消失，蛋白质的移动速度慢下来，当以上稳定状态建立后，蛋白质样品在快慢离子间被浓缩形成一个狭小的之间层，并按蛋白质所带负电荷量的多少依次排列成带，浓缩样品，从浓缩胶进入分离胶后，胶的 pH 升高，Gly 的离解度增大，泳动率上升，又因为它分子小，故超过所有的蛋白质分子，紧跟在 Cl离子后，Cl 离子迁移后，低离子浓度不再存在，形成了恒定的电场强度，因此，蛋白质样品在分离胶中的分离主要取决于它的电荷性质，分子大小和形状，分离胶的孔径有一定大小，对不同相对质量的蛋白质来说，通过时收到的滞阻作用不同，即使静电荷相等的颗粒，也会由于这种分子筛的效应，把不同大小的蛋白质相互分开。Western bl
3、ot 实验步骤及注意事项2009-05-25 23:46:38 来源：易生物 浏览次数：0 网友评论 0 条关键词：Westernblot一.实验步骤1. 组织块称重2. 利用液氮、研钵粉碎组织块3. 加入 RIPA 缓冲液（每克组织 3 ml RIPA） ，PMSF（每克组织30l，10 mg/ml PMSF） ，利用 Polytron 进一步匀浆（15,000 转/分*1 分钟）维持 44. 加入 PMSF（每克组织 30l，10 mg/ml PMSF） ，冰上孵育 30 分钟5. 移入离心管 4 约 20,000 g（约 15,000 转）15 分钟6. 上清液为细胞裂解液可分装-20保
4、存7. 进行 Bradford 比色法测定蛋白质浓度8. 取相同质量的细胞裂解液（体积*蛋白质浓度） ，并加等体积的2电泳加样缓冲液9. 沸水浴中 3 分钟10. 上样11. 电泳（浓缩胶 20mA，分离胶 35mA）12. 电转膜仪转膜（100mA 40 分钟）13. 膜用丽春红染色，胶用考马斯亮蓝染色14. Westernblot 试剂盒显色15. 分析比较记录western blot 的实验步骤及注意事项的资料1. 把聚丙烯酰胺凝胶中的蛋白质电泳转移到硝酸纤维膜上。1）转移缓冲液洗涤凝胶和硝酸纤维素膜，将硝酸纤维素膜铺在凝胶上，用 5ml 移液管在凝胶上来回滚动去除所有的气泡。2）在凝胶
5、/滤膜外再包一张 3mm 滤纸（预先用转移缓冲液浸湿） ，将凝胶夹在中间，保持湿润和没有气泡。3）将此滤纸/凝胶/薄膜滤纸按照厂家建议方法放入电泳装置中，凝胶面向阴极。4）将上述装置放入缓冲液槽中，并灌满转移缓冲液以淹没凝胶。5）按照厂家所示接通电源开始电泳转移。6）转移结束后，取出薄膜和凝胶，弃去凝胶。2. 将薄膜漂在氨基黑中快速染色，直至分子量标准显现时取出，记录下标准位置。3. 用 100ml 水洗涤纤维素膜，必要时可用脱色缓冲液。4. 膜置印迹缓冲液中于 37保温 1 小时。5. 室温下，用 PBS-Tween 缓冲液洗涤薄膜。6. 用封口机将薄膜封入塑料袋中，尽可能不留空气。7袋的一
6、角剪一缓冲液的小口，用透析袋夹紧。8混合：NGS(100 微升)，印迹缓冲液中的抗体（10 毫升） ，加在装薄膜的袋中，于室温下摇动 2 小时（或 4过夜）9用总体积 300ml PBS-Tween 缓冲液，分 4 次在一浅盘中洗涤薄膜，每次 75ml。10. 将连接生物素的羊抗兔 IgG（40 微升溶于 10 毫升印迹缓冲液/100 微升 NGS）加在袋内，于室温下摇动 1 小时。11按步骤 9 洗涤。12加入抗生素蛋白-HRP（40 微升溶于 10 毫升印迹缓冲液/100 微升 NGS） ，于室温下摇动。注意事项：western blot 中转移在膜上的蛋白处于变性状态，空间结构改变，因此
7、那些识别空间表位的抗体不能用于 western blot 检测。这种情况可以将表达目的蛋白的细胞或细胞裂解液中的所有蛋白先生物素化，再用酶标记亲和素进行 western blot。实验中取胶和膜需带手套。Western 可以参考如下步骤进行操作。1.收集蛋白样品(Protein sample preparation)可以使用适当的裂解液，例如碧云天生产的 Western 及 IP 细胞裂解液，裂解贴壁细胞、悬浮细胞或组织样品。对于某些特定的亚细胞组份蛋白，例如细胞核蛋白、细胞浆蛋白、线粒体蛋白等，可以参考相关文献提取这些亚细胞组份蛋白，也可以使用试剂盒进行抽提，例如碧云天生产的细胞核蛋白与细胞
8、浆蛋白抽提试剂盒。收集完蛋白样品后，为确保每个蛋白样品的上样量一致，需要测定每个蛋白样品的蛋白浓度。根据所使用的裂解液的不同，需要采用适当的蛋白浓度测定方法。因为不同的蛋白浓度测定方法对于一些去垢剂和还原剂等的兼容性差别很大。如果使用碧云天生产的 Western 及 IP细胞裂解液，可以使用 BCA 蛋白浓度测定试剂盒。2. 电泳(Electrophoresis)(1) SDS-PAGE 凝胶配制SDS-PAGE 凝胶可以参考一些文献资料进行配制，也可以使用碧云天生产的 SDS-PAGE 凝胶配制试剂盒。该试剂盒提供了除水和配胶器具外的所有试剂以及配制各种浓度 SDS-PAGE 的配方。(2)
9、 样品处理在收集的蛋白样品中加入适量浓缩的 SDS-PAGE 蛋白上样缓冲液。例如 2X 或 5X 的 SDS-PAGE 蛋白上样缓冲液。使用 5X 的 SDS-PAGE 蛋白上样缓冲液可以减小上样体积，在相同体积的上样孔内可以上样更多的蛋白样品。5X 的 SDS-PAGE 蛋白上样缓冲液可以参考相关文献资料配制，也可以使用碧云天生产的 SDS-PAGE 蛋白上样缓冲液(5X)。100或沸水浴加热 3-5 分钟，以充分变性蛋白.(3) 上样与电泳冷却到室温后，把蛋白样品直接上样到 SDS-PAGE 胶加样孔内即可。为了便于观察电泳效果和转膜效果，以及判断蛋白分子量大小，最好使用预染蛋白质分子量
10、标准。电泳时通常推荐在上层胶时使用低电压恒压电泳，而在溴酚蓝进入下层胶时使用高电压恒压电泳。对于 Bio-Rad 的标准电泳装置或类似电泳装置，低电压可以设置在 80-100V，高电压可以设置在 120V左右。SDS-PAGE 可以采用普通的电泳仪就可以满足要求，也可以采用碧云天的多功能电泳仪(带定时)。为了电泳方便起见，也可以采用整个 SDS-PAGE 过程恒压的方式，通常把电压设置在 100V，然后设定定时时间为 90120 分钟。设置定时可以避免经常发生的电泳过头。通常电泳时溴酚蓝到达胶的底端处附近即可停止电泳，或者可以根据预染蛋白质分子量标准的电泳情况，预计目的蛋白已经被适当分离后即可
11、停止电泳。3. 转膜(Transfer)我们推荐在 Western 实验中选用 PVDF 膜。硝酸纤维素膜(NC 膜)也可以使用，但硝酸纤维素膜比较脆，在操作过程中特别是用镊子夹取等过程中容易裂开。膜的使用请参考生产商的推荐使用步骤。通常如果使用 Bio-Rad 的标准湿式转膜装置，可以设定转膜电流为300-400mA，转膜时间为 30-60 分钟。也可以在 15-20mA 转膜过夜。转膜时也可以使用碧云天的多功能电泳仪(带定时)。具体的转膜时间要根据目的蛋白的大小而定，目的蛋白的分子量越大，需要的转膜时间越长，目的蛋白的分子量越小，需要的转膜时间越短。在转膜过程中，特别是高电流快速转膜时，通
12、常会有非常严重的发热现象，最好把转膜槽放置在冰浴中进行转膜。转膜的效果可以观察所使用的预染蛋白质分子量标准，通常分子量最大的 1-2 条带较难全部转到膜上。转膜的效果也可以用丽春红染色液对膜进行染色，以观察实际的转膜效果。也可以用考马斯亮蓝快速染色液对完成转膜的 SDS-PAGE 胶进行染色，以观察蛋白的残留情况。4. 封闭(Blocking)转膜完毕后，立即把蛋白膜放置到预先准备好的 Western 洗涤液中，漂洗 1-2 分钟，以洗去膜上的转膜液。从转膜完毕后所有的步骤，一定要注意膜的保湿，避免膜的干燥，否则极易产生较高的背景。用微型台式真空泵吸尽洗涤液，加入 Western 封闭液，在摇
13、床上缓慢摇动,室温封闭 60 分钟。对于一些背景较高的抗体，可以在 4 封闭过夜。在整个 Western 过程中我们推荐使用碧云天生产的侧摆摇床，侧向摆动速度比较缓慢，而且也容易让溶液覆盖蛋白膜。5. 一抗孵育(Primary antibody incubation)参考一抗的说明书，按照适当比例用 Western 一抗稀释液稀释一抗。用微型台式真空泵吸尽封闭液，立即加入稀释好的一抗，室温或4在侧摆摇床上缓慢摇动孵育一小时。如果一抗孵育一小时效果不佳，可以在 4缓慢摇动孵育过夜。回收一抗。加入 Western 洗涤液，在侧摆摇床上缓慢摇动洗涤 5-10分钟。吸尽洗涤液后，再加入洗涤液，洗涤 5
14、-10 分钟。共洗涤 3 次。如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数。6. 二抗孵育(Secondary antibody inucubation)参考二抗的说明书，按照适当比例用 Western 二抗稀释液稀释辣根过氧化物酶(HRP)标记的二抗。用微型台式真空泵吸尽洗涤液，立即加入稀释好的二抗，室温或 4在侧摆摇床上缓慢摇动孵育一小时。回收二抗。加入 Western 洗涤液，在侧摆摇床上缓慢摇动洗涤 5-10分钟。吸尽洗涤液后，再加入洗涤液，洗涤 5-10 分钟。共洗涤 3 次。如果结果背景较高可以适当延长洗涤时间并增加洗涤次数。7. 蛋白检测(Detection of prot
15、eins)参考相关说明书，使用 BeyoECL, Western 荧光检测试剂等 ECL 类试剂来检测蛋白。洗片时可以使用 X 光片自动洗片机。如果没有自动洗片机，可以用显影定影试剂盒自行配制显影液和定影液进行手工洗片。8. 膜的重复利用(Membrane recovery)如果蛋白样品非常宝贵，可以使用 Western 一抗二抗去除液处理蛋白膜，以重复利用蛋白膜。更多内容尽在： Western Blotting 实验专题MiSeq 系统特有全新的射流结构，能使试剂循环时间缩短 5 倍。以Illumina 久经考验的边合成边测序技术为基础，通过专利的可逆终止试剂方法对数百万个片段进行大规模平行测序，在单个碱基掺入增长的 DNA 链时检测它们。当每个 dNTP 加入时对荧光标记的终止子成像，随后切割，允许下一个碱基的掺入。由于每个测序循环中四种可逆终止子结合的 dNTP 都存在，所以自然竞争让掺入偏差最小化。根据每个循环的信号强度测定直接检出碱基，与其他技术相比大大降低了原始错误率。最终结果是高度准确的 base-by-base 测序，避免了序列内容特异的误差，实现了可靠的碱基检出，即使是那些重复序列区和均聚物。由 TruSeq 技术推动的 Illumina 测序带来了最高的数据完整性，以及最高产量的无偏差读取和最多的Q30 碱基检出。革命性的测序流程
